MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_010168	GAT	2	6	2640424	2640429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841693
45002	NC_010168	AGCG	2	8	2640644	2640651	25 %	0 %	50 %	25 %	163841693
45003	NC_010168	TCG	2	6	2640735	2640740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841693
45004	NC_010168	CGC	2	6	2640781	2640786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841693
45005	NC_010168	GCT	2	6	2640831	2640836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841694
45006	NC_010168	ACCA	2	8	2640953	2640960	50 %	0 %	0 %	50 %	163841694
45007	NC_010168	CGC	2	6	2640964	2640969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841694
45008	NC_010168	GC	3	6	2640992	2640997	0 %	0 %	50 %	50 %	163841694
45009	NC_010168	GC	4	8	2641038	2641045	0 %	0 %	50 %	50 %	163841694
45010	NC_010168	CAC	2	6	2641067	2641072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841694
45011	NC_010168	AGCG	2	8	2641238	2641245	25 %	0 %	50 %	25 %	163841694
45012	NC_010168	CGG	2	6	2641345	2641350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841694
45013	NC_010168	AC	4	8	2641389	2641396	50 %	0 %	0 %	50 %	163841694
45014	NC_010168	CTGAC	2	10	2641413	2641422	20 %	20 %	20 %	40 %	163841694
45015	NC_010168	CTC	2	6	2641451	2641456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841694
45016	NC_010168	CGTGAA	2	12	2641479	2641490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163841694
45017	NC_010168	GGA	2	6	2641574	2641579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841694
45018	NC_010168	TCAG	2	8	2641674	2641681	25 %	25 %	25 %	25 %	163841694
45019	NC_010168	AAT	2	6	2641850	2641855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841694
45020	NC_010168	CGCA	2	8	2641949	2641956	25 %	0 %	25 %	50 %	163841694
45021	NC_010168	CCG	2	6	2641974	2641979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841694
45022	NC_010168	ACG	2	6	2642064	2642069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841694
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45024	NC_010168	AGC	2	6	2642135	2642140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841694
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45032	NC_010168	AAC	2	6	2642495	2642500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841695
45033	NC_010168	GCAA	2	8	2642510	2642517	50 %	0 %	25 %	25 %	163841695
45034	NC_010168	TCGG	2	8	2642570	2642577	0 %	25 %	50 %	25 %	163841695
45035	NC_010168	ATT	2	6	2642626	2642631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841695
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45039	NC_010168	ACCTC	2	10	2642790	2642799	20 %	20 %	0 %	60 %	163841695
45040	NC_010168	TCG	2	6	2642815	2642820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841695
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45042	NC_010168	GCCG	2	8	2643000	2643007	0 %	0 %	50 %	50 %	163841695
45043	NC_010168	GCC	2	6	2643054	2643059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841695
45044	NC_010168	CCGTT	2	10	2643070	2643079	0 %	40 %	20 %	40 %	163841695
45045	NC_010168	GCT	2	6	2643111	2643116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841695
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45049	NC_010168	GC	3	6	2643267	2643272	0 %	0 %	50 %	50 %	163841696
45050	NC_010168	TTGA	2	8	2643274	2643281	25 %	50 %	25 %	0 %	163841696
45051	NC_010168	CTT	2	6	2643287	2643292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841696
45052	NC_010168	GAT	2	6	2643295	2643300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841696
45053	NC_010168	CTG	2	6	2643302	2643307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841696
45054	NC_010168	GAT	2	6	2643318	2643323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841696
45055	NC_010168	TGC	2	6	2643393	2643398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841696
45056	NC_010168	GGGACC	2	12	2643402	2643413	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163841696
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45060	NC_010168	GCA	2	6	2643487	2643492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841696
45061	NC_010168	CCGC	2	8	2643504	2643511	0 %	0 %	25 %	75 %	163841696
45062	NC_010168	GC	3	6	2643510	2643515	0 %	0 %	50 %	50 %	163841696
45063	NC_010168	CGT	2	6	2643516	2643521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841696
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45066	NC_010168	TTGC	2	8	2643631	2643638	0 %	50 %	25 %	25 %	163841696
45067	NC_010168	GC	3	6	2643648	2643653	0 %	0 %	50 %	50 %	163841696
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45091	NC_010168	GC	3	6	2644888	2644893	0 %	0 %	50 %	50 %	163841696
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45108	NC_010168	TCT	2	6	2645764	2645769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841698
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45111	NC_010168	CAT	2	6	2646606	2646611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841699
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45117	NC_010168	GCC	2	6	2646815	2646820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841699
45118	NC_010168	TGA	2	6	2646856	2646861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841699
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45222	NC_010168	CGCT	2	8	2652333	2652340	0 %	25 %	25 %	50 %	163841705
45223	NC_010168	GTG	2	6	2652372	2652377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841705
45224	NC_010168	CTT	2	6	2652562	2652567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841705
45225	NC_010168	CCGAG	2	10	2652623	2652632	20 %	0 %	40 %	40 %	163841705
45226	NC_010168	GC	3	6	2652674	2652679	0 %	0 %	50 %	50 %	163841705
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45230	NC_010168	GTT	2	6	2652904	2652909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841705
45231	NC_010168	CGC	3	9	2652925	2652933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841705
45232	NC_010168	CGT	2	6	2652960	2652965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841705
45233	NC_010168	CGG	3	9	2653078	2653086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841705
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45328	NC_010168	GAC	2	6	2657867	2657872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841708
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45330	NC_010168	AAGC	2	8	2657897	2657904	50 %	0 %	25 %	25 %	163841708
45331	NC_010168	GTC	2	6	2657919	2657924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841708
45332	NC_010168	GC	4	8	2657952	2657959	0 %	0 %	50 %	50 %	163841708
45333	NC_010168	GGC	3	9	2657996	2658004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841708
45334	NC_010168	CGT	2	6	2658022	2658027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841708
45335	NC_010168	AC	3	6	2658139	2658144	50 %	0 %	0 %	50 %	163841709
45336	NC_010168	CAG	3	9	2658158	2658166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841709
45337	NC_010168	CGG	2	6	2658179	2658184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841709
45338	NC_010168	CCG	2	6	2658193	2658198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841709
45339	NC_010168	CGT	2	6	2658225	2658230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841709
45340	NC_010168	GTT	2	6	2658359	2658364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841709
45341	NC_010168	GCCA	2	8	2658489	2658496	25 %	0 %	25 %	50 %	163841709
45342	NC_010168	AGC	2	6	2658534	2658539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841709
45343	NC_010168	GC	3	6	2658587	2658592	0 %	0 %	50 %	50 %	163841709
45344	NC_010168	TCA	2	6	2659305	2659310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841710
45345	NC_010168	GCT	2	6	2659317	2659322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841710
45346	NC_010168	GAT	2	6	2659361	2659366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841710
45347	NC_010168	AGC	2	6	2659429	2659434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841710
45348	NC_010168	GTT	2	6	2659545	2659550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841710
45349	NC_010168	CAC	2	6	2659605	2659610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841710
45350	NC_010168	ACA	2	6	2659621	2659626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841710
45351	NC_010168	AGA	2	6	2659705	2659710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841710
45352	NC_010168	CCA	2	6	2659765	2659770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841710
45353	NC_010168	AAG	2	6	2659816	2659821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841710
45354	NC_010168	ACC	2	6	2659850	2659855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841710
45355	NC_010168	TGC	2	6	2659873	2659878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841710
45356	NC_010168	AGCT	2	8	2659896	2659903	25 %	25 %	25 %	25 %	163841710
45357	NC_010168	GTC	3	9	2659921	2659929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841710
45358	NC_010168	A	6	6	2659955	2659960	100 %	0 %	0 %	0 %	163841711
45359	NC_010168	GCG	2	6	2659992	2659997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841711
45360	NC_010168	CAC	2	6	2660011	2660016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841711
45361	NC_010168	AGCAC	2	10	2660020	2660029	40 %	0 %	20 %	40 %	163841711
45362	NC_010168	GGCT	2	8	2660055	2660062	0 %	25 %	50 %	25 %	163841711
45363	NC_010168	TTG	2	6	2660081	2660086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841711
45364	NC_010168	CACC	2	8	2660140	2660147	25 %	0 %	0 %	75 %	163841711
45365	NC_010168	GCA	2	6	2660182	2660187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841711
45366	NC_010168	GCC	2	6	2660298	2660303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841711
45367	NC_010168	TTC	2	6	2660328	2660333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841711
45368	NC_010168	GCG	2	6	2660421	2660426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841711
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45370	NC_010168	TCG	2	6	2660585	2660590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841712
45371	NC_010168	CGTAA	2	10	2660728	2660737	40 %	20 %	20 %	20 %	163841712
45372	NC_010168	AGC	2	6	2660746	2660751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841712
45373	NC_010168	ATTG	2	8	2660764	2660771	25 %	50 %	25 %	0 %	163841712
45374	NC_010168	GAA	2	6	2660909	2660914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841712
45375	NC_010168	TTG	2	6	2660990	2660995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841712
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45377	NC_010168	CAG	2	6	2661028	2661033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841712
45378	NC_010168	CGG	2	6	2661051	2661056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841712
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45382	NC_010168	TCA	2	6	2661355	2661360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841713
45383	NC_010168	CTGAAG	2	12	2661409	2661420	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163841713
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45400	NC_010168	GC	3	6	2662305	2662310	0 %	0 %	50 %	50 %	163841714
45401	NC_010168	CGT	3	9	2662437	2662445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841714
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45407	NC_010168	GCT	2	6	2662770	2662775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841714
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45414	NC_010168	GCTG	2	8	2663361	2663368	0 %	25 %	50 %	25 %	163841715
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45422	NC_010168	TGA	2	6	2663687	2663692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841715
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45442	NC_010168	GGC	2	6	2664652	2664657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841716
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45444	NC_010168	GCC	2	6	2664732	2664737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841716
45445	NC_010168	CCA	2	6	2664742	2664747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841716
45446	NC_010168	CCA	2	6	2664992	2664997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841716
45447	NC_010168	TGC	2	6	2665103	2665108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841717
45448	NC_010168	CAG	2	6	2665144	2665149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841717
45449	NC_010168	CAA	2	6	2665214	2665219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841717
45450	NC_010168	GAT	2	6	2665451	2665456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841717
45451	NC_010168	CAAGG	2	10	2665490	2665499	40 %	0 %	40 %	20 %	163841717
45452	NC_010168	CGG	2	6	2665615	2665620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841717
45453	NC_010168	CGG	2	6	2665644	2665649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841717
45454	NC_010168	TGC	2	6	2665682	2665687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841717
45455	NC_010168	AGTTT	2	10	2665689	2665698	20 %	60 %	20 %	0 %	163841717
45456	NC_010168	GAC	2	6	2665739	2665744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841717
45457	NC_010168	AGG	2	6	2665959	2665964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841718
45458	NC_010168	CAG	2	6	2666115	2666120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841718
45459	NC_010168	GCA	2	6	2666147	2666152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841718
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45461	NC_010168	CAA	2	6	2666265	2666270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841718
45462	NC_010168	CTTG	2	8	2666271	2666278	0 %	50 %	25 %	25 %	163841718
45463	NC_010168	TTGG	2	8	2666287	2666294	0 %	50 %	50 %	0 %	163841718
45464	NC_010168	CAC	2	6	2666337	2666342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841718
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45466	NC_010168	GCAA	2	8	2666441	2666448	50 %	0 %	25 %	25 %	163841718
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