MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010168	CCG	3	9	238386	238394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839043
4002	NC_010168	GGC	2	6	238431	238436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839043
4003	NC_010168	TAC	2	6	238442	238447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839043
4004	NC_010168	CAC	2	6	238461	238466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839043
4005	NC_010168	CTA	2	6	238537	238542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839043
4006	NC_010168	GCG	2	6	238565	238570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839043
4007	NC_010168	TAT	2	6	238699	238704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839043
4008	NC_010168	GTT	2	6	238711	238716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839043
4009	NC_010168	CTCA	2	8	238741	238748	25 %	25 %	0 %	50 %	163839043
4010	NC_010168	CGC	2	6	238784	238789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839043
4011	NC_010168	TGGGT	2	10	238892	238901	0 %	40 %	60 %	0 %	163839044
4012	NC_010168	ACT	2	6	238956	238961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839044
4013	NC_010168	CTGG	2	8	239072	239079	0 %	25 %	50 %	25 %	163839044
4014	NC_010168	CT	3	6	239085	239090	0 %	50 %	0 %	50 %	163839044
4015	NC_010168	GCTC	2	8	239140	239147	0 %	25 %	25 %	50 %	163839044
4016	NC_010168	CCGG	2	8	239166	239173	0 %	0 %	50 %	50 %	163839044
4017	NC_010168	CT	3	6	239356	239361	0 %	50 %	0 %	50 %	163839044
4018	NC_010168	CGC	2	6	239425	239430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839044
4019	NC_010168	TATT	2	8	239458	239465	25 %	75 %	0 %	0 %	163839044
4020	NC_010168	CTG	2	6	239547	239552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839044
4021	NC_010168	TTGG	2	8	239680	239687	0 %	50 %	50 %	0 %	163839044
4022	NC_010168	CTA	2	6	239708	239713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839044
4023	NC_010168	TGA	2	6	239719	239724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839044
4024	NC_010168	ACC	3	9	239745	239753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839044
4025	NC_010168	GAT	2	6	239811	239816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839045
4026	NC_010168	CGT	2	6	239851	239856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839045
4027	NC_010168	GATA	2	8	239904	239911	50 %	25 %	25 %	0 %	163839045
4028	NC_010168	T	6	6	239936	239941	0 %	100 %	0 %	0 %	163839045
4029	NC_010168	ATT	2	6	239965	239970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839045
4030	NC_010168	CGATGA	2	12	239973	239984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163839045
4031	NC_010168	GCG	2	6	239989	239994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839045
4032	NC_010168	TCA	2	6	240000	240005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839045
4033	NC_010168	ACA	2	6	240078	240083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839045
4034	NC_010168	TCG	2	6	240113	240118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839045
4035	NC_010168	CGG	2	6	240197	240202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839045
4036	NC_010168	TTTG	2	8	240212	240219	0 %	75 %	25 %	0 %	163839045
4037	NC_010168	CTAT	2	8	240315	240322	25 %	50 %	0 %	25 %	163839046
4038	NC_010168	GAT	2	6	240326	240331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839046
4039	NC_010168	GCC	2	6	240403	240408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839046
4040	NC_010168	CAAT	2	8	240423	240430	50 %	25 %	0 %	25 %	163839046
4041	NC_010168	TTG	2	6	240456	240461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839046
4042	NC_010168	ACC	2	6	240522	240527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839046
4043	NC_010168	CGG	2	6	240552	240557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839046
4044	NC_010168	GCA	2	6	240671	240676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839047
4045	NC_010168	GGT	2	6	240682	240687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839047
4046	NC_010168	CGC	2	6	240780	240785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839047
4047	NC_010168	GCA	2	6	240847	240852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839047
4048	NC_010168	GTC	2	6	240857	240862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839047
4049	NC_010168	GGT	2	6	240868	240873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839047
4050	NC_010168	CTA	2	6	240918	240923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839047
4051	NC_010168	TGG	2	6	240957	240962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839048
4052	NC_010168	TCA	2	6	240966	240971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839048
4053	NC_010168	CT	3	6	240988	240993	0 %	50 %	0 %	50 %	163839048
4054	NC_010168	GGCT	2	8	241016	241023	0 %	25 %	50 %	25 %	163839048
4055	NC_010168	TGC	2	6	241024	241029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839048
4056	NC_010168	TGG	2	6	241099	241104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839048
4057	NC_010168	ACG	2	6	241230	241235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839048
4058	NC_010168	CGT	2	6	241310	241315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839049
4059	NC_010168	GT	3	6	241330	241335	0 %	50 %	50 %	0 %	163839049
4060	NC_010168	CGT	3	9	241382	241390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839049
4061	NC_010168	GTC	2	6	241475	241480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839049
4062	NC_010168	TTG	2	6	241511	241516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839049
4063	NC_010168	CCG	2	6	241531	241536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839049
4064	NC_010168	ACCGA	2	10	241573	241582	40 %	0 %	20 %	40 %	163839049
4065	NC_010168	AG	3	6	241590	241595	50 %	0 %	50 %	0 %	163839049
4066	NC_010168	CGG	2	6	241619	241624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839049
4067	NC_010168	CGG	2	6	241634	241639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839049
4068	NC_010168	CG	3	6	241644	241649	0 %	0 %	50 %	50 %	163839049
4069	NC_010168	CAA	2	6	241700	241705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839049
4070	NC_010168	CCG	2	6	241823	241828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839049
4071	NC_010168	ATC	2	6	241909	241914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839049
4072	NC_010168	CAAG	2	8	241937	241944	50 %	0 %	25 %	25 %	163839049
4073	NC_010168	TGC	2	6	241958	241963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839049
4074	NC_010168	GAA	2	6	242142	242147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839050
4075	NC_010168	GC	3	6	242170	242175	0 %	0 %	50 %	50 %	163839050
4076	NC_010168	GCG	2	6	242180	242185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839050
4077	NC_010168	GC	3	6	242196	242201	0 %	0 %	50 %	50 %	163839050
4078	NC_010168	CCA	2	6	242290	242295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839050
4079	NC_010168	TTG	2	6	242436	242441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839051
4080	NC_010168	GT	3	6	242456	242461	0 %	50 %	50 %	0 %	163839051
4081	NC_010168	GGT	2	6	242468	242473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839051
4082	NC_010168	GC	3	6	242529	242534	0 %	0 %	50 %	50 %	163839051
4083	NC_010168	GGC	2	6	242574	242579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839051
4084	NC_010168	CGG	2	6	242698	242703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839051
4085	NC_010168	GCC	2	6	242744	242749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839051
4086	NC_010168	GTC	2	6	242775	242780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839051
4087	NC_010168	CCG	2	6	242803	242808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839051
4088	NC_010168	GGC	2	6	242825	242830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839051
4089	NC_010168	CAC	2	6	242868	242873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839052
4090	NC_010168	CG	3	6	242943	242948	0 %	0 %	50 %	50 %	163839052
4091	NC_010168	ATC	2	6	242962	242967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839052
4092	NC_010168	TCA	2	6	242995	243000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839052
4093	NC_010168	CGG	2	6	243082	243087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839053
4094	NC_010168	TTC	2	6	243210	243215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839053
4095	NC_010168	AGC	2	6	243228	243233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4096	NC_010168	TGAG	2	8	243264	243271	25 %	25 %	50 %	0 %	163839053
4097	NC_010168	CCT	2	6	243274	243279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839053
4098	NC_010168	CCA	2	6	243411	243416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839053
4099	NC_010168	GTTG	2	8	243419	243426	0 %	50 %	50 %	0 %	163839053
4100	NC_010168	ATC	2	6	243462	243467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839053
4101	NC_010168	TCGC	3	12	243625	243636	0 %	25 %	25 %	50 %	163839053
4102	NC_010168	GACT	2	8	243637	243644	25 %	25 %	25 %	25 %	163839053
4103	NC_010168	TTG	2	6	243680	243685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839053
4104	NC_010168	TTG	2	6	243701	243706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839053
4105	NC_010168	CT	3	6	243709	243714	0 %	50 %	0 %	50 %	163839053
4106	NC_010168	TGT	3	9	243735	243743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839053
4107	NC_010168	CAC	2	6	243762	243767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839053
4108	NC_010168	ACG	2	6	243786	243791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4109	NC_010168	TGA	2	6	244006	244011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839053
4110	NC_010168	ATC	2	6	244014	244019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839053
4111	NC_010168	CAG	2	6	244053	244058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4112	NC_010168	CAA	4	12	244061	244072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839053
4113	NC_010168	CAAA	2	8	244120	244127	75 %	0 %	0 %	25 %	163839053
4114	NC_010168	GCCA	2	8	244202	244209	25 %	0 %	25 %	50 %	163839053
4115	NC_010168	ATC	2	6	244230	244235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839053
4116	NC_010168	CTG	2	6	244251	244256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4117	NC_010168	CCA	2	6	244278	244283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839053
4118	NC_010168	TCC	2	6	244287	244292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839053
4119	NC_010168	CTC	2	6	244307	244312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839053
4120	NC_010168	CGC	2	6	244381	244386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839053
4121	NC_010168	AGCT	2	8	244465	244472	25 %	25 %	25 %	25 %	163839054
4122	NC_010168	TCGA	2	8	244484	244491	25 %	25 %	25 %	25 %	163839054
4123	NC_010168	GCA	2	6	244574	244579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839054
4124	NC_010168	AGG	2	6	244602	244607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839054
4125	NC_010168	GAA	2	6	244610	244615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839054
4126	NC_010168	AATG	2	8	244617	244624	50 %	25 %	25 %	0 %	163839054
4127	NC_010168	TCG	2	6	244652	244657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839055
4128	NC_010168	GTG	2	6	244690	244695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839055
4129	NC_010168	GCC	2	6	244759	244764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839055
4130	NC_010168	CGAT	2	8	244802	244809	25 %	25 %	25 %	25 %	163839055
4131	NC_010168	GCC	3	9	244846	244854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839055
4132	NC_010168	TAT	2	6	244855	244860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839055
4133	NC_010168	GCGG	2	8	244930	244937	0 %	0 %	75 %	25 %	163839055
4134	NC_010168	CCAAA	2	10	244952	244961	60 %	0 %	0 %	40 %	163839055
4135	NC_010168	GTG	2	6	245008	245013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839055
4136	NC_010168	GCC	2	6	245017	245022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839055
4137	NC_010168	GCA	2	6	245079	245084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839055
4138	NC_010168	TGG	2	6	245092	245097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839055
4139	NC_010168	GAT	2	6	245148	245153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839055
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4141	NC_010168	CTT	2	6	245221	245226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839055
4142	NC_010168	GA	3	6	245228	245233	50 %	0 %	50 %	0 %	163839055
4143	NC_010168	CAG	2	6	245260	245265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839056
4144	NC_010168	GCC	2	6	245293	245298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839056
4145	NC_010168	ATC	2	6	245308	245313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839056
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4149	NC_010168	GAC	2	6	245509	245514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839056
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4153	NC_010168	CGGG	2	8	245715	245722	0 %	0 %	75 %	25 %	163839056
4154	NC_010168	GGGCA	2	10	245737	245746	20 %	0 %	60 %	20 %	163839056
4155	NC_010168	A	6	6	245868	245873	100 %	0 %	0 %	0 %	163839057
4156	NC_010168	GCC	2	6	245955	245960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839057
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4161	NC_010168	CGT	2	6	246212	246217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839057
4162	NC_010168	CA	3	6	246316	246321	50 %	0 %	0 %	50 %	163839057
4163	NC_010168	CAC	2	6	246362	246367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839057
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4178	NC_010168	TGG	2	6	246967	246972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839058
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4189	NC_010168	CGT	2	6	247914	247919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839059
4190	NC_010168	GCT	2	6	247966	247971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839059
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4194	NC_010168	ACG	2	6	248276	248281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839059
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4199	NC_010168	CTGCT	2	10	248460	248469	0 %	40 %	20 %	40 %	163839060
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4230	NC_010168	TTG	2	6	250157	250162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839062
4231	NC_010168	TCGA	2	8	250175	250182	25 %	25 %	25 %	25 %	163839062
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4235	NC_010168	GACG	2	8	250446	250453	25 %	0 %	50 %	25 %	163839063
4236	NC_010168	TGA	2	6	250526	250531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839063
4237	NC_010168	GCGG	2	8	250610	250617	0 %	0 %	75 %	25 %	163839063
4238	NC_010168	CGG	2	6	250630	250635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839063
4239	NC_010168	CGG	2	6	250637	250642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839063
4240	NC_010168	ACA	2	6	250729	250734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839063
4241	NC_010168	GCG	2	6	250864	250869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839064
4242	NC_010168	AT	3	6	250932	250937	50 %	50 %	0 %	0 %	163839064
4243	NC_010168	CCAC	2	8	250954	250961	25 %	0 %	0 %	75 %	163839064
4244	NC_010168	ATGC	2	8	250989	250996	25 %	25 %	25 %	25 %	163839064
4245	NC_010168	CCACT	2	10	250998	251007	20 %	20 %	0 %	60 %	163839064
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4363	NC_010168	CGA	2	6	258426	258431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839071
4364	NC_010168	CGT	2	6	258432	258437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839071
4365	NC_010168	CGC	2	6	258447	258452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839071
4366	NC_010168	AC	3	6	258480	258485	50 %	0 %	0 %	50 %	163839071
4367	NC_010168	GCGTG	2	10	258486	258495	0 %	20 %	60 %	20 %	163839071
4368	NC_010168	CCG	2	6	258496	258501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839071
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4382	NC_010168	AAGC	2	8	259071	259078	50 %	0 %	25 %	25 %	163839072
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4481	NC_010168	CAAC	2	8	265974	265981	50 %	0 %	0 %	50 %	163839082
4482	NC_010168	GTT	2	6	266020	266025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839082
4483	NC_010168	TGCA	2	8	266046	266053	25 %	25 %	25 %	25 %	163839082
4484	NC_010168	TGG	2	6	266090	266095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839082
4485	NC_010168	CCA	2	6	266109	266114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839082
4486	NC_010168	TCGCG	2	10	266180	266189	0 %	20 %	40 %	40 %	163839082
4487	NC_010168	TTC	2	6	266347	266352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839082
4488	NC_010168	GGT	2	6	266383	266388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839082
4489	NC_010168	GTG	2	6	266389	266394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839082
4490	NC_010168	CCG	2	6	266470	266475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839083
4491	NC_010168	AGAA	2	8	266506	266513	75 %	0 %	25 %	0 %	163839083
4492	NC_010168	AAG	2	6	266521	266526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839083
4493	NC_010168	GAA	2	6	266651	266656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839084
4494	NC_010168	TGG	2	6	266716	266721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839084
4495	NC_010168	GAA	2	6	266753	266758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839084
4496	NC_010168	CGG	2	6	266789	266794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839084
4497	NC_010168	CTT	2	6	266819	266824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839084
4498	NC_010168	TTA	2	6	266925	266930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839084
4499	NC_010168	CGT	2	6	266939	266944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839084
4500	NC_010168	GCTT	2	8	266947	266954	0 %	50 %	25 %	25 %	163839084

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