MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_010168	TGGG	2	8	2551696	2551703	0 %	25 %	75 %	0 %	163841593
43503	NC_010168	TTG	2	6	2551774	2551779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841594
43504	NC_010168	GCTA	2	8	2551796	2551803	25 %	25 %	25 %	25 %	163841594
43505	NC_010168	TTTC	2	8	2551831	2551838	0 %	75 %	0 %	25 %	163841594
43506	NC_010168	GC	3	6	2551854	2551859	0 %	0 %	50 %	50 %	163841594
43507	NC_010168	GGT	2	6	2551869	2551874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841594
43508	NC_010168	CTCTG	2	10	2551892	2551901	0 %	40 %	20 %	40 %	163841594
43509	NC_010168	TGGTG	2	10	2551973	2551982	0 %	40 %	60 %	0 %	163841594
43510	NC_010168	GC	3	6	2551996	2552001	0 %	0 %	50 %	50 %	163841594
43511	NC_010168	CCTT	2	8	2552002	2552009	0 %	50 %	0 %	50 %	163841594
43512	NC_010168	CAA	2	6	2552030	2552035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841594
43513	NC_010168	CAA	2	6	2552069	2552074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841595
43514	NC_010168	ACAA	2	8	2552076	2552083	75 %	0 %	0 %	25 %	163841595
43515	NC_010168	TGA	2	6	2552095	2552100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841595
43516	NC_010168	GGC	2	6	2552170	2552175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841595
43517	NC_010168	GAT	2	6	2552254	2552259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841595
43518	NC_010168	GCT	2	6	2552398	2552403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841595
43519	NC_010168	TGG	2	6	2552448	2552453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841595
43520	NC_010168	CGG	2	6	2552458	2552463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841595
43521	NC_010168	GAC	3	9	2552504	2552512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841595
43522	NC_010168	GTG	2	6	2552562	2552567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841595
43523	NC_010168	GTCAGC	2	12	2552586	2552597	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163841595
43524	NC_010168	CAG	2	6	2552624	2552629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841595
43525	NC_010168	ACT	2	6	2552635	2552640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841595
43526	NC_010168	CGA	2	6	2552655	2552660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841595
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43528	NC_010168	TGC	2	6	2552812	2552817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841595
43529	NC_010168	TTTGG	2	10	2552867	2552876	0 %	60 %	40 %	0 %	163841595
43530	NC_010168	TGG	2	6	2552916	2552921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841595
43531	NC_010168	CG	3	6	2553286	2553291	0 %	0 %	50 %	50 %	163841596
43532	NC_010168	CGTG	2	8	2553311	2553318	0 %	25 %	50 %	25 %	163841596
43533	NC_010168	GCCC	2	8	2553321	2553328	0 %	0 %	25 %	75 %	163841596
43534	NC_010168	CGG	2	6	2553377	2553382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841596
43535	NC_010168	GGC	2	6	2553407	2553412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841596
43536	NC_010168	CTGATT	2	12	2553435	2553446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	163841596
43537	NC_010168	TTG	2	6	2553513	2553518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841596
43538	NC_010168	TGC	2	6	2553701	2553706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841596
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43542	NC_010168	GTG	2	6	2554250	2554255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841597
43543	NC_010168	GCA	2	6	2554316	2554321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841597
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43548	NC_010168	CGCGTT	2	12	2554691	2554702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841597
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43552	NC_010168	CGC	2	6	2554958	2554963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841597
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43554	NC_010168	GCT	2	6	2555011	2555016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841597
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43557	NC_010168	TGGT	2	8	2555673	2555680	0 %	50 %	50 %	0 %	163841598
43558	NC_010168	CAC	2	6	2555726	2555731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841598
43559	NC_010168	GCCA	2	8	2555733	2555740	25 %	0 %	25 %	50 %	163841598
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43564	NC_010168	GCA	2	6	2555914	2555919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841599
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43570	NC_010168	CGA	2	6	2556166	2556171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841599
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43574	NC_010168	CAC	2	6	2556296	2556301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841599
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43590	NC_010168	GC	3	6	2557264	2557269	0 %	0 %	50 %	50 %	163841600
43591	NC_010168	GCACG	2	10	2557376	2557385	20 %	0 %	40 %	40 %	163841600
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43598	NC_010168	CTTCG	2	10	2557933	2557942	0 %	40 %	20 %	40 %	163841601
43599	NC_010168	CGC	2	6	2557981	2557986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841601
43600	NC_010168	CGA	2	6	2557990	2557995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841601
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43602	NC_010168	GC	3	6	2558012	2558017	0 %	0 %	50 %	50 %	163841601
43603	NC_010168	TGC	2	6	2558039	2558044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841601
43604	NC_010168	CGT	2	6	2558050	2558055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841601
43605	NC_010168	GAT	2	6	2558075	2558080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841601
43606	NC_010168	TTCC	2	8	2558110	2558117	0 %	50 %	0 %	50 %	163841601
43607	NC_010168	GA	3	6	2558118	2558123	50 %	0 %	50 %	0 %	163841601
43608	NC_010168	CGAG	2	8	2558182	2558189	25 %	0 %	50 %	25 %	163841602
43609	NC_010168	GC	3	6	2558199	2558204	0 %	0 %	50 %	50 %	163841602
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43612	NC_010168	CAT	2	6	2558395	2558400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841602
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43615	NC_010168	CGG	2	6	2558468	2558473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841602
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43718	NC_010168	GGGT	2	8	2563821	2563828	0 %	25 %	75 %	0 %	163841612
43719	NC_010168	GGA	2	6	2563861	2563866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841612
43720	NC_010168	TCA	3	9	2563976	2563984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841612
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43724	NC_010168	CCA	2	6	2564235	2564240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841612
43725	NC_010168	ACT	2	6	2564257	2564262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841612
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43727	NC_010168	GCG	2	6	2564595	2564600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841613
43728	NC_010168	CCTT	2	8	2564742	2564749	0 %	50 %	0 %	50 %	163841613
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43842	NC_010168	TGCC	2	8	2571755	2571762	0 %	25 %	25 %	50 %	163841619
43843	NC_010168	CTC	2	6	2571828	2571833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841619
43844	NC_010168	GCA	2	6	2572054	2572059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841619
43845	NC_010168	TTGACC	2	12	2572093	2572104	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163841620
43846	NC_010168	TTG	2	6	2572123	2572128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841620
43847	NC_010168	GCC	2	6	2572254	2572259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841620
43848	NC_010168	GC	3	6	2572261	2572266	0 %	0 %	50 %	50 %	163841620
43849	NC_010168	CAA	2	6	2572267	2572272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841620
43850	NC_010168	TCA	2	6	2572275	2572280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841620
43851	NC_010168	TTG	2	6	2572283	2572288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841620
43852	NC_010168	GCC	2	6	2572397	2572402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841620
43853	NC_010168	GTT	2	6	2572410	2572415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841620
43854	NC_010168	CAA	2	6	2572480	2572485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841620
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43857	NC_010168	GGGC	2	8	2572682	2572689	0 %	0 %	75 %	25 %	163841621
43858	NC_010168	TGG	2	6	2572694	2572699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841621
43859	NC_010168	GCT	2	6	2572808	2572813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841621
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43861	NC_010168	CGC	2	6	2573008	2573013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841621
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43863	NC_010168	TGA	2	6	2573047	2573052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841621
43864	NC_010168	GTG	2	6	2573178	2573183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841621
43865	NC_010168	CAT	2	6	2573194	2573199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841621
43866	NC_010168	GGT	2	6	2573264	2573269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841621
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43873	NC_010168	TTA	2	6	2573798	2573803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841621
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43884	NC_010168	CGA	3	9	2574445	2574453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841622
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43942	NC_010168	CTG	2	6	2577916	2577921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841624
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43946	NC_010168	GGTTG	2	10	2578172	2578181	0 %	40 %	60 %	0 %	163841624
43947	NC_010168	ATC	2	6	2578212	2578217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841624
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43951	NC_010168	ACG	2	6	2578341	2578346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841624
43952	NC_010168	CCG	2	6	2578347	2578352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841624
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43954	NC_010168	CCTT	2	8	2578399	2578406	0 %	50 %	0 %	50 %	163841624
43955	NC_010168	CGA	2	6	2578478	2578483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841624
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43957	NC_010168	GGC	2	6	2578637	2578642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841624
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