MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_010168	TCG	2	6	2438918	2438923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841459
41502	NC_010168	TCA	2	6	2439062	2439067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841459
41503	NC_010168	CAA	2	6	2439186	2439191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841459
41504	NC_010168	CGC	2	6	2439254	2439259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841459
41505	NC_010168	TGA	2	6	2439299	2439304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841459
41506	NC_010168	TGC	2	6	2439308	2439313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841459
41507	NC_010168	ATC	2	6	2439376	2439381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841459
41508	NC_010168	GGC	2	6	2439436	2439441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841459
41509	NC_010168	GCT	2	6	2439459	2439464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841459
41510	NC_010168	GGC	2	6	2439499	2439504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841459
41511	NC_010168	TGG	2	6	2439512	2439517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841459
41512	NC_010168	CCG	2	6	2439593	2439598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841459
41513	NC_010168	ACC	2	6	2439613	2439618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841459
41514	NC_010168	CTG	2	6	2439751	2439756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841459
41515	NC_010168	TGATCA	2	12	2439770	2439781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163841459
41516	NC_010168	GCG	2	6	2439782	2439787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841459
41517	NC_010168	CTG	2	6	2439895	2439900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841459
41518	NC_010168	AGA	2	6	2439981	2439986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841459
41519	NC_010168	AGC	2	6	2440086	2440091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841460
41520	NC_010168	CGT	2	6	2440171	2440176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841460
41521	NC_010168	AAC	2	6	2440190	2440195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841460
41522	NC_010168	CCG	2	6	2440236	2440241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841460
41523	NC_010168	CCGCG	2	10	2440408	2440417	0 %	0 %	40 %	60 %	163841460
41524	NC_010168	CCGG	2	8	2440428	2440435	0 %	0 %	50 %	50 %	163841460
41525	NC_010168	CGA	3	9	2440456	2440464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841460
41526	NC_010168	CACC	2	8	2440484	2440491	25 %	0 %	0 %	75 %	163841460
41527	NC_010168	TTG	2	6	2440554	2440559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841460
41528	NC_010168	TCC	2	6	2440613	2440618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841460
41529	NC_010168	TTA	2	6	2440652	2440657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841460
41530	NC_010168	TGC	2	6	2440666	2440671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841460
41531	NC_010168	CTG	2	6	2440718	2440723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841461
41532	NC_010168	GC	3	6	2440737	2440742	0 %	0 %	50 %	50 %	163841461
41533	NC_010168	CGG	2	6	2440745	2440750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841461
41534	NC_010168	CAC	2	6	2440767	2440772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841461
41535	NC_010168	GTG	2	6	2440816	2440821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841461
41536	NC_010168	CCGGA	2	10	2440994	2441003	20 %	0 %	40 %	40 %	163841461
41537	NC_010168	TTGC	2	8	2441021	2441028	0 %	50 %	25 %	25 %	163841461
41538	NC_010168	AAC	2	6	2441052	2441057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841461
41539	NC_010168	CGC	2	6	2441114	2441119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841461
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41541	NC_010168	CGC	2	6	2441135	2441140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841461
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41543	NC_010168	CAG	2	6	2441381	2441386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841461
41544	NC_010168	CG	3	6	2441415	2441420	0 %	0 %	50 %	50 %	163841461
41545	NC_010168	TCTGC	2	10	2441422	2441431	0 %	40 %	20 %	40 %	163841461
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41548	NC_010168	TGCCAT	2	12	2442145	2442156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163841462
41549	NC_010168	AGCG	2	8	2442189	2442196	25 %	0 %	50 %	25 %	163841462
41550	NC_010168	CAG	2	6	2442220	2442225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841462
41551	NC_010168	CGT	3	9	2442253	2442261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841462
41552	NC_010168	CT	3	6	2442396	2442401	0 %	50 %	0 %	50 %	163841462
41553	NC_010168	ACC	2	6	2442435	2442440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841462
41554	NC_010168	ACG	2	6	2442441	2442446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841462
41555	NC_010168	GGC	2	6	2442461	2442466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841462
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41557	NC_010168	CGCT	2	8	2442567	2442574	0 %	25 %	25 %	50 %	163841462
41558	NC_010168	GTT	2	6	2442611	2442616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841462
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41560	NC_010168	GCA	2	6	2442813	2442818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841463
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41563	NC_010168	AGCA	2	8	2442974	2442981	50 %	0 %	25 %	25 %	163841463
41564	NC_010168	CGC	2	6	2443089	2443094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841463
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41566	NC_010168	TCG	2	6	2443341	2443346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841463
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41573	NC_010168	GC	3	6	2443516	2443521	0 %	0 %	50 %	50 %	163841463
41574	NC_010168	CAA	2	6	2443559	2443564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841463
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41583	NC_010168	GC	3	6	2444169	2444174	0 %	0 %	50 %	50 %	163841464
41584	NC_010168	TCG	2	6	2444181	2444186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841464
41585	NC_010168	GAGC	2	8	2444248	2444255	25 %	0 %	50 %	25 %	163841464
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41587	NC_010168	CGG	2	6	2444346	2444351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841464
41588	NC_010168	A	6	6	2444380	2444385	100 %	0 %	0 %	0 %	163841464
41589	NC_010168	CGGTG	2	10	2444388	2444397	0 %	20 %	60 %	20 %	163841464
41590	NC_010168	AAG	2	6	2444402	2444407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841464
41591	NC_010168	CGA	2	6	2444517	2444522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841464
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41598	NC_010168	TGA	2	6	2444831	2444836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841464
41599	NC_010168	GC	3	6	2444845	2444850	0 %	0 %	50 %	50 %	163841464
41600	NC_010168	CTGGT	2	10	2444872	2444881	0 %	40 %	40 %	20 %	163841464
41601	NC_010168	TGC	2	6	2444906	2444911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841464
41602	NC_010168	GC	3	6	2444910	2444915	0 %	0 %	50 %	50 %	163841464
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41605	NC_010168	AC	3	6	2445077	2445082	50 %	0 %	0 %	50 %	163841464
41606	NC_010168	CTT	2	6	2445133	2445138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841464
41607	NC_010168	GCC	2	6	2445218	2445223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841465
41608	NC_010168	GCTG	2	8	2445436	2445443	0 %	25 %	50 %	25 %	163841466
41609	NC_010168	CTTGC	2	10	2445466	2445475	0 %	40 %	20 %	40 %	163841466
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41613	NC_010168	CATC	2	8	2445591	2445598	25 %	25 %	0 %	50 %	163841466
41614	NC_010168	CATCGA	2	12	2445607	2445618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163841466
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41869	NC_010168	GGA	2	6	2460663	2460668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841481
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41957	NC_010168	CAC	2	6	2464816	2464821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841488
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41960	NC_010168	CAG	2	6	2465063	2465068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841489
41961	NC_010168	GCA	2	6	2465095	2465100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841489
41962	NC_010168	ATC	2	6	2465121	2465126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841489
41963	NC_010168	GTTC	2	8	2465140	2465147	0 %	50 %	25 %	25 %	163841489
41964	NC_010168	AGC	2	6	2465184	2465189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841489
41965	NC_010168	CCA	2	6	2465235	2465240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841489
41966	NC_010168	CGA	2	6	2465254	2465259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841489
41967	NC_010168	CAT	2	6	2465269	2465274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841489
41968	NC_010168	CGG	2	6	2465304	2465309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841489
41969	NC_010168	CGT	2	6	2465370	2465375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841489
41970	NC_010168	GACCAA	2	12	2465449	2465460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	163841489
41971	NC_010168	GCT	2	6	2465484	2465489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841489
41972	NC_010168	CGA	2	6	2465630	2465635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41973	NC_010168	CCAA	2	8	2465756	2465763	50 %	0 %	0 %	50 %	163841490
41974	NC_010168	GAC	2	6	2465817	2465822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841490
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41976	NC_010168	GCA	2	6	2465856	2465861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41977	NC_010168	CTG	3	9	2465889	2465897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41978	NC_010168	CAAA	2	8	2465902	2465909	75 %	0 %	0 %	25 %	163841490
41979	NC_010168	CCGA	2	8	2465956	2465963	25 %	0 %	25 %	50 %	163841490
41980	NC_010168	CAAT	2	8	2465973	2465980	50 %	25 %	0 %	25 %	163841490
41981	NC_010168	AGC	2	6	2465995	2466000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41982	NC_010168	CTG	2	6	2466034	2466039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41983	NC_010168	GCC	2	6	2466041	2466046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841490
41984	NC_010168	GCC	2	6	2466050	2466055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841490
41985	NC_010168	TGC	2	6	2466110	2466115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41986	NC_010168	GCAA	2	8	2466260	2466267	50 %	0 %	25 %	25 %	163841490
41987	NC_010168	CGC	2	6	2466271	2466276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841490
41988	NC_010168	CGA	2	6	2466315	2466320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841490
41989	NC_010168	CCAA	2	8	2466366	2466373	50 %	0 %	0 %	50 %	163841490
41990	NC_010168	CCA	2	6	2466459	2466464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841490
41991	NC_010168	TGA	2	6	2466482	2466487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841490
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41994	NC_010168	CAGCCA	2	12	2466591	2466602	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	163841490
41995	NC_010168	CCG	2	6	2466603	2466608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841490
41996	NC_010168	TTG	2	6	2466690	2466695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841490
41997	NC_010168	GCA	2	6	2466886	2466891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841491
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42000	NC_010168	GCT	2	6	2466965	2466970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841491

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