MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_010168	GTTG	2	8	2407691	2407698	0 %	50 %	50 %	0 %	163841422
41002	NC_010168	CTCA	2	8	2407895	2407902	25 %	25 %	0 %	50 %	163841422
41003	NC_010168	GAC	2	6	2407952	2407957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841422
41004	NC_010168	A	6	6	2407971	2407976	100 %	0 %	0 %	0 %	163841422
41005	NC_010168	GCC	3	9	2408003	2408011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841422
41006	NC_010168	TTCG	2	8	2408073	2408080	0 %	50 %	25 %	25 %	163841423
41007	NC_010168	CCG	3	9	2408220	2408228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841423
41008	NC_010168	TCA	2	6	2408237	2408242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841423
41009	NC_010168	TTTC	2	8	2408316	2408323	0 %	75 %	0 %	25 %	163841423
41010	NC_010168	CCA	2	6	2408337	2408342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841423
41011	NC_010168	GCC	2	6	2408352	2408357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841423
41012	NC_010168	CGC	3	9	2408460	2408468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841423
41013	NC_010168	CAT	2	6	2408556	2408561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841423
41014	NC_010168	CTC	2	6	2408610	2408615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841423
41015	NC_010168	T	6	6	2408658	2408663	0 %	100 %	0 %	0 %	163841424
41016	NC_010168	AGC	2	6	2408666	2408671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841424
41017	NC_010168	TCG	2	6	2408690	2408695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841424
41018	NC_010168	CTG	2	6	2408701	2408706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841424
41019	NC_010168	ATTGC	2	10	2408711	2408720	20 %	40 %	20 %	20 %	163841424
41020	NC_010168	GCC	2	6	2408739	2408744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841424
41021	NC_010168	GCC	2	6	2408777	2408782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841424
41022	NC_010168	GCGA	2	8	2408791	2408798	25 %	0 %	50 %	25 %	163841424
41023	NC_010168	AGC	2	6	2408919	2408924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841424
41024	NC_010168	GCC	2	6	2408977	2408982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841424
41025	NC_010168	ACC	2	6	2408989	2408994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841424
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41027	NC_010168	CAT	2	6	2409011	2409016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841424
41028	NC_010168	CCG	2	6	2409035	2409040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841424
41029	NC_010168	ACC	2	6	2409061	2409066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841424
41030	NC_010168	CAGC	2	8	2409077	2409084	25 %	0 %	25 %	50 %	163841424
41031	NC_010168	CCG	2	6	2409433	2409438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841424
41032	NC_010168	CAC	2	6	2409444	2409449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841424
41033	NC_010168	CGG	2	6	2409452	2409457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841424
41034	NC_010168	CAG	2	6	2409561	2409566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841424
41035	NC_010168	GCC	2	6	2409720	2409725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841424
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41037	NC_010168	TGC	2	6	2409978	2409983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841425
41038	NC_010168	T	6	6	2410097	2410102	0 %	100 %	0 %	0 %	163841425
41039	NC_010168	CCTTG	2	10	2410105	2410114	0 %	40 %	20 %	40 %	163841425
41040	NC_010168	CAA	2	6	2410138	2410143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841425
41041	NC_010168	GCC	2	6	2410223	2410228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841425
41042	NC_010168	TCAA	2	8	2410266	2410273	50 %	25 %	0 %	25 %	163841425
41043	NC_010168	GAG	2	6	2410352	2410357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841425
41044	NC_010168	CCT	2	6	2410372	2410377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841425
41045	NC_010168	TCA	2	6	2410799	2410804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841426
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41049	NC_010168	CAA	2	6	2410981	2410986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841426
41050	NC_010168	ACG	2	6	2411044	2411049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841426
41051	NC_010168	CAG	2	6	2411137	2411142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841426
41052	NC_010168	GCA	2	6	2411153	2411158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841426
41053	NC_010168	TGG	2	6	2411202	2411207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841426
41054	NC_010168	TGG	2	6	2411468	2411473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841426
41055	NC_010168	CG	4	8	2411489	2411496	0 %	0 %	50 %	50 %	163841426
41056	NC_010168	GCG	2	6	2411542	2411547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841426
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41060	NC_010168	GAT	2	6	2411688	2411693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841426
41061	NC_010168	CAG	2	6	2411710	2411715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841426
41062	NC_010168	AGCA	2	8	2411731	2411738	50 %	0 %	25 %	25 %	163841426
41063	NC_010168	GCC	2	6	2411754	2411759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841426
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41066	NC_010168	GCC	2	6	2411860	2411865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841426
41067	NC_010168	TCG	2	6	2411891	2411896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841426
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41077	NC_010168	GTCAA	2	10	2412173	2412182	40 %	20 %	20 %	20 %	163841426
41078	NC_010168	GGCT	2	8	2412240	2412247	0 %	25 %	50 %	25 %	163841426
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41083	NC_010168	ATT	2	6	2412612	2412617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841427
41084	NC_010168	GTC	2	6	2412621	2412626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841427
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41087	NC_010168	CG	3	6	2412741	2412746	0 %	0 %	50 %	50 %	163841427
41088	NC_010168	GCCAA	2	10	2412889	2412898	40 %	0 %	20 %	40 %	163841428
41089	NC_010168	AT	3	6	2412911	2412916	50 %	50 %	0 %	0 %	163841428
41090	NC_010168	TCA	2	6	2412977	2412982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841428
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41099	NC_010168	TCA	2	6	2413379	2413384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841428
41100	NC_010168	TCTGT	2	10	2413569	2413578	0 %	60 %	20 %	20 %	163841428
41101	NC_010168	CTG	2	6	2413628	2413633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841428
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41103	NC_010168	GAA	2	6	2413829	2413834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841428
41104	NC_010168	ATG	2	6	2414233	2414238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841430
41105	NC_010168	ATC	2	6	2414239	2414244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841430
41106	NC_010168	TCAGG	2	10	2414246	2414255	20 %	20 %	40 %	20 %	163841430
41107	NC_010168	TCGCT	2	10	2414316	2414325	0 %	40 %	20 %	40 %	163841430
41108	NC_010168	GC	3	6	2414330	2414335	0 %	0 %	50 %	50 %	163841430
41109	NC_010168	GATA	2	8	2414373	2414380	50 %	25 %	25 %	0 %	163841429
41110	NC_010168	TGG	2	6	2414407	2414412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841429
41111	NC_010168	TGGC	2	8	2414424	2414431	0 %	25 %	50 %	25 %	163841429
41112	NC_010168	CGA	2	6	2414445	2414450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841429
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41114	NC_010168	TCTGG	2	10	2414520	2414529	0 %	40 %	40 %	20 %	163841429
41115	NC_010168	GCG	2	6	2414539	2414544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841429
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41117	NC_010168	A	6	6	2414622	2414627	100 %	0 %	0 %	0 %	163841429
41118	NC_010168	CA	3	6	2414732	2414737	50 %	0 %	0 %	50 %	163841429
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41233	NC_010168	ACCA	2	8	2421705	2421712	50 %	0 %	0 %	50 %	163841439
41234	NC_010168	GCA	2	6	2421768	2421773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841439
41235	NC_010168	ACC	2	6	2421774	2421779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841439
41236	NC_010168	AAG	2	6	2421813	2421818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841439
41237	NC_010168	GTA	2	6	2421876	2421881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841439
41238	NC_010168	CAG	2	6	2421916	2421921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841439
41239	NC_010168	ACT	2	6	2421957	2421962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841439
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41245	NC_010168	GTC	2	6	2422209	2422214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841439
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41252	NC_010168	CCA	2	6	2422727	2422732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841440
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41264	NC_010168	CTT	2	6	2423544	2423549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841440
41265	NC_010168	CTGG	2	8	2423612	2423619	0 %	25 %	50 %	25 %	163841440
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41306	NC_010168	CA	3	6	2426437	2426442	50 %	0 %	0 %	50 %	163841444
41307	NC_010168	ACGGCA	2	12	2426508	2426519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841444
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41309	NC_010168	TCC	2	6	2426580	2426585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841444
41310	NC_010168	GCG	2	6	2426617	2426622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841444
41311	NC_010168	CTT	2	6	2426624	2426629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841444
41312	NC_010168	ACC	2	6	2426814	2426819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841444
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41325	NC_010168	CTG	2	6	2427482	2427487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841445
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41328	NC_010168	ATCTG	2	10	2427581	2427590	20 %	40 %	20 %	20 %	163841445
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41330	NC_010168	CAT	2	6	2427720	2427725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841445
41331	NC_010168	ATC	2	6	2427733	2427738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841445
41332	NC_010168	GTG	3	9	2427742	2427750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841445
41333	NC_010168	AAG	2	6	2427785	2427790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841445
41334	NC_010168	TCA	2	6	2427839	2427844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841445
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41336	NC_010168	AGC	2	6	2428039	2428044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841446
41337	NC_010168	CAAG	2	8	2428056	2428063	50 %	0 %	25 %	25 %	163841446
41338	NC_010168	CAG	2	6	2428087	2428092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841446
41339	NC_010168	GCC	2	6	2428135	2428140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841446
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41341	NC_010168	AGC	2	6	2428158	2428163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841446
41342	NC_010168	GCC	2	6	2428245	2428250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841446
41343	NC_010168	CAA	3	9	2428255	2428263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841446
41344	NC_010168	CAG	2	6	2428291	2428296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841446
41345	NC_010168	TTGC	2	8	2428453	2428460	0 %	50 %	25 %	25 %	163841446
41346	NC_010168	AAAC	2	8	2428528	2428535	75 %	0 %	0 %	25 %	163841446
41347	NC_010168	TGT	2	6	2428572	2428577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841446
41348	NC_010168	T	6	6	2428604	2428609	0 %	100 %	0 %	0 %	163841446
41349	NC_010168	GCT	2	6	2428707	2428712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841446
41350	NC_010168	CTG	2	6	2428779	2428784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841446
41351	NC_010168	GCT	2	6	2428823	2428828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841447
41352	NC_010168	CA	3	6	2428981	2428986	50 %	0 %	0 %	50 %	163841447
41353	NC_010168	CAC	2	6	2429018	2429023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841447
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41355	NC_010168	CAA	2	6	2429101	2429106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841447
41356	NC_010168	CGA	2	6	2429131	2429136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841447
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41368	NC_010168	CAC	2	6	2430254	2430259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841449
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41404	NC_010168	TG	3	6	2433614	2433619	0 %	50 %	50 %	0 %	163841453
41405	NC_010168	GCCT	2	8	2433687	2433694	0 %	25 %	25 %	50 %	163841453
41406	NC_010168	ATC	2	6	2433743	2433748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841453
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41415	NC_010168	ATC	2	6	2434232	2434237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841454
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41421	NC_010168	CAGC	2	8	2434452	2434459	25 %	0 %	25 %	50 %	163841454
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41424	NC_010168	CGG	2	6	2434927	2434932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841455
41425	NC_010168	TCC	2	6	2434977	2434982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841455
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41430	NC_010168	TAA	2	6	2435179	2435184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841455
41431	NC_010168	GCT	2	6	2435347	2435352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841455
41432	NC_010168	TGA	2	6	2435376	2435381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841455
41433	NC_010168	GGA	2	6	2435462	2435467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841456
41434	NC_010168	C	6	6	2435481	2435486	0 %	0 %	0 %	100 %	163841456
41435	NC_010168	TGA	2	6	2435531	2435536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841456
41436	NC_010168	CTCGC	2	10	2435567	2435576	0 %	20 %	20 %	60 %	163841456
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41438	NC_010168	GCC	3	9	2435854	2435862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841456
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41440	NC_010168	TGC	2	6	2435922	2435927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841456
41441	NC_010168	ACGCG	2	10	2435963	2435972	20 %	0 %	40 %	40 %	163841456
41442	NC_010168	GCC	2	6	2436010	2436015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841456
41443	NC_010168	GGC	2	6	2436058	2436063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841456
41444	NC_010168	TGG	2	6	2436151	2436156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841456
41445	NC_010168	TTC	2	6	2436189	2436194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841456
41446	NC_010168	GGCA	2	8	2436388	2436395	25 %	0 %	50 %	25 %	163841456
41447	NC_010168	ATG	2	6	2436469	2436474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841456
41448	NC_010168	GGT	2	6	2436493	2436498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841456
41449	NC_010168	ATT	2	6	2436502	2436507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841456
41450	NC_010168	GCG	2	6	2436521	2436526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841456
41451	NC_010168	CGG	2	6	2436573	2436578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841456
41452	NC_010168	GC	3	6	2436592	2436597	0 %	0 %	50 %	50 %	163841456
41453	NC_010168	GCT	2	6	2436639	2436644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841456
41454	NC_010168	TCAA	2	8	2436683	2436690	50 %	25 %	0 %	25 %	163841456
41455	NC_010168	AGTT	2	8	2436734	2436741	25 %	50 %	25 %	0 %	163841457
41456	NC_010168	GCG	2	6	2436754	2436759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841457
41457	NC_010168	GCC	2	6	2436791	2436796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841457
41458	NC_010168	TTG	2	6	2436798	2436803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841457
41459	NC_010168	ACC	2	6	2436960	2436965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841457
41460	NC_010168	GTG	2	6	2437014	2437019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841457
41461	NC_010168	CGT	2	6	2437040	2437045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841457
41462	NC_010168	GC	3	6	2437055	2437060	0 %	0 %	50 %	50 %	163841457
41463	NC_010168	TTC	2	6	2437129	2437134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841457
41464	NC_010168	CGC	2	6	2437187	2437192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841457
41465	NC_010168	ATCA	2	8	2437267	2437274	50 %	25 %	0 %	25 %	163841458
41466	NC_010168	ATA	2	6	2437323	2437328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841458
41467	NC_010168	CCA	2	6	2437376	2437381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841458
41468	NC_010168	CAT	2	6	2437390	2437395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841458
41469	NC_010168	CTT	2	6	2437414	2437419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841458
41470	NC_010168	AGC	2	6	2437427	2437432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41471	NC_010168	GGCC	2	8	2437482	2437489	0 %	0 %	50 %	50 %	163841458
41472	NC_010168	CCA	2	6	2437501	2437506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841458
41473	NC_010168	GCC	2	6	2437547	2437552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841458
41474	NC_010168	CCG	2	6	2437554	2437559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841458
41475	NC_010168	GCA	2	6	2437599	2437604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41476	NC_010168	GGC	2	6	2437613	2437618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841458
41477	NC_010168	AGT	2	6	2437637	2437642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841458
41478	NC_010168	ACC	2	6	2437734	2437739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841458
41479	NC_010168	CAAC	2	8	2437754	2437761	50 %	0 %	0 %	50 %	163841458
41480	NC_010168	GGCAA	2	10	2437782	2437791	40 %	0 %	40 %	20 %	163841458
41481	NC_010168	TGCCG	2	10	2437799	2437808	0 %	20 %	40 %	40 %	163841458
41482	NC_010168	CCGC	2	8	2437810	2437817	0 %	0 %	25 %	75 %	163841458
41483	NC_010168	CCA	2	6	2437821	2437826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841458
41484	NC_010168	CGT	2	6	2438008	2438013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41485	NC_010168	CCG	2	6	2438061	2438066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841458
41486	NC_010168	CACGC	2	10	2438075	2438084	20 %	0 %	20 %	60 %	163841458
41487	NC_010168	GCT	2	6	2438112	2438117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41488	NC_010168	CCA	2	6	2438127	2438132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841458
41489	NC_010168	CATG	2	8	2438152	2438159	25 %	25 %	25 %	25 %	163841458
41490	NC_010168	TCA	2	6	2438175	2438180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841458
41491	NC_010168	CTGA	2	8	2438223	2438230	25 %	25 %	25 %	25 %	163841458
41492	NC_010168	AT	3	6	2438244	2438249	50 %	50 %	0 %	0 %	163841458
41493	NC_010168	CGT	2	6	2438254	2438259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41494	NC_010168	CAG	2	6	2438267	2438272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41495	NC_010168	GCT	2	6	2438335	2438340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841458
41496	NC_010168	CTGG	2	8	2438618	2438625	0 %	25 %	50 %	25 %	163841459
41497	NC_010168	GCTTT	2	10	2438648	2438657	0 %	60 %	20 %	20 %	163841459
41498	NC_010168	CAC	2	6	2438751	2438756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841459
41499	NC_010168	GCT	2	6	2438757	2438762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841459
41500	NC_010168	TTC	2	6	2438884	2438889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841459

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