MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010168	CGG	2	6	211690	211695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839014
3502	NC_010168	CGC	2	6	211720	211725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839014
3503	NC_010168	CT	3	6	211759	211764	0 %	50 %	0 %	50 %	163839014
3504	NC_010168	CGT	2	6	211837	211842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839014
3505	NC_010168	CAA	2	6	212020	212025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839015
3506	NC_010168	GCT	2	6	212034	212039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3507	NC_010168	TCG	3	9	212042	212050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3508	NC_010168	CCA	2	6	212080	212085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839015
3509	NC_010168	ATC	2	6	212086	212091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839015
3510	NC_010168	ACT	2	6	212092	212097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839015
3511	NC_010168	CAA	2	6	212106	212111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839015
3512	NC_010168	TGG	2	6	212174	212179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839015
3513	NC_010168	GCA	2	6	212239	212244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3514	NC_010168	GCTGCG	2	12	212352	212363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163839015
3515	NC_010168	CAT	2	6	212424	212429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839015
3516	NC_010168	GGTT	2	8	212448	212455	0 %	50 %	50 %	0 %	163839015
3517	NC_010168	CGCC	2	8	212470	212477	0 %	0 %	25 %	75 %	163839015
3518	NC_010168	ATT	2	6	212557	212562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839015
3519	NC_010168	TGC	2	6	212564	212569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3520	NC_010168	GAAGAT	2	12	212626	212637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	163839015
3521	NC_010168	GCC	2	6	212638	212643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839015
3522	NC_010168	TTC	2	6	212683	212688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839015
3523	NC_010168	CGG	2	6	212706	212711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839015
3524	NC_010168	AAC	2	6	212752	212757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839015
3525	NC_010168	CAA	2	6	212820	212825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839015
3526	NC_010168	GGC	2	6	212842	212847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839015
3527	NC_010168	GGT	2	6	212850	212855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839015
3528	NC_010168	GCA	2	6	212914	212919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3529	NC_010168	TGC	2	6	212924	212929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3530	NC_010168	TGA	2	6	212930	212935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839015
3531	NC_010168	CGA	2	6	212989	212994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839015
3532	NC_010168	AGG	2	6	213077	213082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839015
3533	NC_010168	GGC	2	6	213378	213383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839016
3534	NC_010168	GTT	2	6	213471	213476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839016
3535	NC_010168	AG	3	6	213543	213548	50 %	0 %	50 %	0 %	163839016
3536	NC_010168	GCT	2	6	213578	213583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839016
3537	NC_010168	CGA	2	6	213770	213775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839016
3538	NC_010168	GTG	2	6	213840	213845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839016
3539	NC_010168	AAG	2	6	213858	213863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839016
3540	NC_010168	GC	3	6	213874	213879	0 %	0 %	50 %	50 %	163839016
3541	NC_010168	GCC	2	6	213912	213917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839016
3542	NC_010168	CTTG	2	8	213942	213949	0 %	50 %	25 %	25 %	163839016
3543	NC_010168	ACGG	2	8	213974	213981	25 %	0 %	50 %	25 %	163839017
3544	NC_010168	ATTG	2	8	214035	214042	25 %	50 %	25 %	0 %	163839017
3545	NC_010168	ACG	2	6	214066	214071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839017
3546	NC_010168	GCA	2	6	214109	214114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839017
3547	NC_010168	GGT	2	6	214161	214166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839017
3548	NC_010168	AAC	2	6	214328	214333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839017
3549	NC_010168	GGC	2	6	214336	214341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839017
3550	NC_010168	TGG	2	6	214350	214355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839017
3551	NC_010168	TTG	2	6	214405	214410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839017
3552	NC_010168	CAA	2	6	214482	214487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839017
3553	NC_010168	CAC	2	6	214494	214499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839017
3554	NC_010168	GTTT	2	8	214554	214561	0 %	75 %	25 %	0 %	163839017
3555	NC_010168	GCT	2	6	214602	214607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839017
3556	NC_010168	ATT	2	6	215001	215006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839018
3557	NC_010168	CCA	2	6	215072	215077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839018
3558	NC_010168	TCA	2	6	215084	215089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839018
3559	NC_010168	GCC	3	9	215100	215108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839018
3560	NC_010168	CCCAGA	2	12	215201	215212	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	163839018
3561	NC_010168	C	6	6	215245	215250	0 %	0 %	0 %	100 %	163839018
3562	NC_010168	CG	3	6	215311	215316	0 %	0 %	50 %	50 %	163839018
3563	NC_010168	GCACA	2	10	215482	215491	40 %	0 %	20 %	40 %	163839018
3564	NC_010168	T	6	6	215625	215630	0 %	100 %	0 %	0 %	163839018
3565	NC_010168	TGC	2	6	215642	215647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839018
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3568	NC_010168	ATC	2	6	215890	215895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839020
3569	NC_010168	TGC	2	6	215927	215932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839020
3570	NC_010168	AAG	2	6	215933	215938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839020
3571	NC_010168	ATCA	2	8	215944	215951	50 %	25 %	0 %	25 %	163839020
3572	NC_010168	ATC	2	6	216020	216025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839020
3573	NC_010168	TGGA	2	8	216054	216061	25 %	25 %	50 %	0 %	163839020
3574	NC_010168	CGAG	2	8	216069	216076	25 %	0 %	50 %	25 %	163839019
3575	NC_010168	GTC	2	6	216150	216155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3576	NC_010168	TCG	2	6	216232	216237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3577	NC_010168	GGC	2	6	216245	216250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839019
3578	NC_010168	CAG	2	6	216297	216302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3579	NC_010168	GCG	2	6	216309	216314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839019
3580	NC_010168	CAG	2	6	216315	216320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3581	NC_010168	CAAG	2	8	216358	216365	50 %	0 %	25 %	25 %	163839019
3582	NC_010168	TGC	2	6	216427	216432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
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3584	NC_010168	GC	3	6	216511	216516	0 %	0 %	50 %	50 %	163839019
3585	NC_010168	CAA	2	6	216563	216568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839019
3586	NC_010168	TGC	2	6	216608	216613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
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3588	NC_010168	GCA	2	6	216695	216700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3589	NC_010168	GCG	2	6	216721	216726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839019
3590	NC_010168	GCCG	2	8	216773	216780	0 %	0 %	50 %	50 %	163839019
3591	NC_010168	TCG	2	6	216820	216825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3592	NC_010168	A	6	6	216836	216841	100 %	0 %	0 %	0 %	163839019
3593	NC_010168	TGC	2	6	216843	216848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839019
3594	NC_010168	CGG	2	6	216861	216866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839019
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3596	NC_010168	TTG	2	6	217265	217270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839022
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3598	NC_010168	TGA	2	6	217428	217433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839022
3599	NC_010168	CGG	2	6	217453	217458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839022
3600	NC_010168	TCGC	2	8	217478	217485	0 %	25 %	25 %	50 %	163839022
3601	NC_010168	GGTT	2	8	217504	217511	0 %	50 %	50 %	0 %	163839022
3602	NC_010168	GGAT	2	8	217521	217528	25 %	25 %	50 %	0 %	163839022
3603	NC_010168	TGG	2	6	217549	217554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839022
3604	NC_010168	TGA	2	6	217615	217620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839022
3605	NC_010168	TGA	2	6	217659	217664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839022
3606	NC_010168	TGG	2	6	217704	217709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839022
3607	NC_010168	TGC	2	6	217837	217842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3608	NC_010168	TGC	2	6	217887	217892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3609	NC_010168	GCA	2	6	217972	217977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3610	NC_010168	TGA	2	6	218071	218076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839022
3611	NC_010168	TCA	2	6	218142	218147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839022
3612	NC_010168	CAT	2	6	218194	218199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839022
3613	NC_010168	CAG	2	6	218215	218220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3614	NC_010168	TGC	2	6	218233	218238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3615	NC_010168	CGA	2	6	218239	218244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3616	NC_010168	ACG	2	6	218289	218294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3617	NC_010168	GTC	2	6	218301	218306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839022
3618	NC_010168	CAA	2	6	218314	218319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839022
3619	NC_010168	GGT	2	6	218362	218367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839023
3620	NC_010168	TGC	2	6	218530	218535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839023
3621	NC_010168	CCG	2	6	218553	218558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839023
3622	NC_010168	GGA	2	6	218565	218570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839023
3623	NC_010168	GCT	2	6	218611	218616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839023
3624	NC_010168	CTG	2	6	218663	218668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839023
3625	NC_010168	TGG	2	6	218737	218742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839023
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3627	NC_010168	GGT	2	6	218773	218778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839023
3628	NC_010168	GGC	2	6	218812	218817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839023
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3630	NC_010168	TGCGG	2	10	218966	218975	0 %	20 %	60 %	20 %	163839023
3631	NC_010168	TGAT	2	8	218983	218990	25 %	50 %	25 %	0 %	163839023
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3633	NC_010168	GAT	2	6	219098	219103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839024
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3639	NC_010168	TGG	2	6	219647	219652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839025
3640	NC_010168	GCTC	2	8	219677	219684	0 %	25 %	25 %	50 %	163839025
3641	NC_010168	CTTTT	2	10	219946	219955	0 %	80 %	0 %	20 %	163839026
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3648	NC_010168	T	6	6	220314	220319	0 %	100 %	0 %	0 %	163839026
3649	NC_010168	AGG	2	6	220340	220345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839026
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3726	NC_010168	ATTC	2	8	223920	223927	25 %	50 %	0 %	25 %	163839029
3727	NC_010168	AGC	2	6	223955	223960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839029
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3729	NC_010168	TTGC	2	8	224002	224009	0 %	50 %	25 %	25 %	163839029
3730	NC_010168	ATC	2	6	224041	224046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839029
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3733	NC_010168	TGG	2	6	224183	224188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839029
3734	NC_010168	ATG	2	6	224189	224194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839029
3735	NC_010168	CGC	2	6	224203	224208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839029
3736	NC_010168	CTTTG	2	10	224241	224250	0 %	60 %	20 %	20 %	163839029
3737	NC_010168	TCA	2	6	224304	224309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839029
3738	NC_010168	CGC	2	6	224334	224339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839029
3739	NC_010168	AGC	2	6	224443	224448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839029
3740	NC_010168	CTGA	2	8	224459	224466	25 %	25 %	25 %	25 %	163839029
3741	NC_010168	GCCGC	2	10	224646	224655	0 %	0 %	40 %	60 %	163839030
3742	NC_010168	CTCGG	2	10	224663	224672	0 %	20 %	40 %	40 %	163839030
3743	NC_010168	GAC	2	6	224682	224687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839030
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3832	NC_010168	ACTG	2	8	229725	229732	25 %	25 %	25 %	25 %	163839034
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3862	NC_010168	TGG	2	6	231976	231981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839037
3863	NC_010168	CGA	2	6	231983	231988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839037
3864	NC_010168	CCAG	2	8	231994	232001	25 %	0 %	25 %	50 %	163839037
3865	NC_010168	CGT	2	6	232048	232053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839037
3866	NC_010168	CCG	2	6	232069	232074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839037
3867	NC_010168	TGA	2	6	232106	232111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839037
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3890	NC_010168	TGCG	2	8	233176	233183	0 %	25 %	50 %	25 %	163839038
3891	NC_010168	TGA	2	6	233185	233190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839038
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3977	NC_010168	TAC	2	6	237091	237096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839042
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3980	NC_010168	GCT	2	6	237252	237257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839042
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3982	NC_010168	CAT	2	6	237336	237341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839042
3983	NC_010168	GTG	2	6	237391	237396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839042
3984	NC_010168	GCA	2	6	237399	237404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839042
3985	NC_010168	GGC	2	6	237562	237567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839042
3986	NC_010168	TCA	2	6	237599	237604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839042
3987	NC_010168	TTG	2	6	237619	237624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839042
3988	NC_010168	CGA	2	6	237635	237640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839042
3989	NC_010168	AAC	2	6	237746	237751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839042
3990	NC_010168	CGAC	2	8	237756	237763	25 %	0 %	25 %	50 %	163839042
3991	NC_010168	TGG	2	6	237770	237775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839042
3992	NC_010168	CAT	2	6	237786	237791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839042
3993	NC_010168	GGT	2	6	237840	237845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839042
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3995	NC_010168	GAG	2	6	238056	238061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839042
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3997	NC_010168	GCC	2	6	238232	238237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839043
3998	NC_010168	CGC	2	6	238251	238256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839043
3999	NC_010168	CGT	2	6	238290	238295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839043
4000	NC_010168	CAGT	2	8	238315	238322	25 %	25 %	25 %	25 %	163839043

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