MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_010168	GGC	2	6	2207355	2207360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841212
37503	NC_010168	TTC	2	6	2207604	2207609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841213
37504	NC_010168	GTC	2	6	2207672	2207677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841213
37505	NC_010168	AGCGA	2	10	2207705	2207714	40 %	0 %	40 %	20 %	163841213
37506	NC_010168	CGG	2	6	2207785	2207790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841213
37507	NC_010168	CTT	2	6	2207818	2207823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841213
37508	NC_010168	TGA	2	6	2207887	2207892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841213
37509	NC_010168	TGG	2	6	2207947	2207952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841213
37510	NC_010168	GTG	2	6	2207961	2207966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841213
37511	NC_010168	CGG	2	6	2208000	2208005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841213
37512	NC_010168	GAGC	2	8	2208236	2208243	25 %	0 %	50 %	25 %	163841214
37513	NC_010168	ATG	2	6	2208247	2208252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841214
37514	NC_010168	CTT	2	6	2208263	2208268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841214
37515	NC_010168	ATT	2	6	2208292	2208297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841214
37516	NC_010168	CCAGA	2	10	2208326	2208335	40 %	0 %	20 %	40 %	163841214
37517	NC_010168	GCC	2	6	2208343	2208348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841214
37518	NC_010168	CGA	2	6	2208408	2208413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841214
37519	NC_010168	AAG	2	6	2208421	2208426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841214
37520	NC_010168	CGG	2	6	2208494	2208499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841214
37521	NC_010168	CGG	2	6	2208524	2208529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841214
37522	NC_010168	CCA	2	6	2208539	2208544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841214
37523	NC_010168	ACG	2	6	2208547	2208552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841214
37524	NC_010168	CCG	2	6	2208565	2208570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841214
37525	NC_010168	GAC	2	6	2208615	2208620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841214
37526	NC_010168	GCT	2	6	2208623	2208628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841214
37527	NC_010168	CG	3	6	2208649	2208654	0 %	0 %	50 %	50 %	163841214
37528	NC_010168	ATCAG	2	10	2208706	2208715	40 %	20 %	20 %	20 %	163841214
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37532	NC_010168	CAA	2	6	2208824	2208829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841214
37533	NC_010168	GC	3	6	2208923	2208928	0 %	0 %	50 %	50 %	163841214
37534	NC_010168	CGG	2	6	2208968	2208973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841214
37535	NC_010168	GCG	3	9	2209013	2209021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841214
37536	NC_010168	GCCG	2	8	2209044	2209051	0 %	0 %	50 %	50 %	163841214
37537	NC_010168	TCA	2	6	2209070	2209075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841214
37538	NC_010168	C	6	6	2209101	2209106	0 %	0 %	0 %	100 %	163841214
37539	NC_010168	CGA	2	6	2209126	2209131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841214
37540	NC_010168	CG	3	6	2209218	2209223	0 %	0 %	50 %	50 %	163841214
37541	NC_010168	TTC	2	6	2209233	2209238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841214
37542	NC_010168	CTG	2	6	2209278	2209283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841214
37543	NC_010168	CGC	2	6	2209447	2209452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841214
37544	NC_010168	A	6	6	2209528	2209533	100 %	0 %	0 %	0 %	163841214
37545	NC_010168	A	6	6	2209606	2209611	100 %	0 %	0 %	0 %	163841215
37546	NC_010168	GCAA	2	8	2209621	2209628	50 %	0 %	25 %	25 %	163841215
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37549	NC_010168	TGC	2	6	2209933	2209938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841215
37550	NC_010168	ACC	2	6	2209941	2209946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841215
37551	NC_010168	ACA	2	6	2209947	2209952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841215
37552	NC_010168	GCT	3	9	2209970	2209978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841215
37553	NC_010168	GCA	2	6	2209995	2210000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841215
37554	NC_010168	ACG	2	6	2210001	2210006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841215
37555	NC_010168	GCG	2	6	2210010	2210015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841215
37556	NC_010168	GGT	2	6	2210020	2210025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841215
37557	NC_010168	TGT	2	6	2210054	2210059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841215
37558	NC_010168	GCCGT	2	10	2210060	2210069	0 %	20 %	40 %	40 %	163841215
37559	NC_010168	TGC	2	6	2210096	2210101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841215
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37566	NC_010168	GGC	2	6	2210411	2210416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841216
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37570	NC_010168	CGGCT	2	10	2210784	2210793	0 %	20 %	40 %	40 %	163841216
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37588	NC_010168	TCT	3	9	2211434	2211442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841216
37589	NC_010168	AGCC	2	8	2211485	2211492	25 %	0 %	25 %	50 %	163841216
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37592	NC_010168	GT	3	6	2211634	2211639	0 %	50 %	50 %	0 %	163841216
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37596	NC_010168	GT	3	6	2211764	2211769	0 %	50 %	50 %	0 %	163841216
37597	NC_010168	AGCA	2	8	2211777	2211784	50 %	0 %	25 %	25 %	163841216
37598	NC_010168	AAG	2	6	2211898	2211903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841216
37599	NC_010168	AGGCCT	2	12	2211916	2211927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163841216
37600	NC_010168	TGA	2	6	2211953	2211958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841216
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37602	NC_010168	CGG	2	6	2212203	2212208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841216
37603	NC_010168	ATC	2	6	2212309	2212314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841216
37604	NC_010168	TAA	2	6	2212352	2212357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841216
37605	NC_010168	CGC	2	6	2212361	2212366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841216
37606	NC_010168	CGA	2	6	2212369	2212374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841216
37607	NC_010168	TCGCA	2	10	2212473	2212482	20 %	20 %	20 %	40 %	163841216
37608	NC_010168	CGGCC	2	10	2212513	2212522	0 %	0 %	40 %	60 %	163841216
37609	NC_010168	GTT	2	6	2212536	2212541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841216
37610	NC_010168	TGA	2	6	2212553	2212558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841216
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37614	NC_010168	GT	4	8	2212956	2212963	0 %	50 %	50 %	0 %	163841216
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37616	NC_010168	CCA	2	6	2212982	2212987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841216
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37843	NC_010168	ACCA	2	8	2224857	2224864	50 %	0 %	0 %	50 %	163841230
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37960	NC_010168	GCC	2	6	2230328	2230333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841234
37961	NC_010168	ATT	3	9	2230414	2230422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841234
37962	NC_010168	TCA	2	6	2230547	2230552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841234
37963	NC_010168	CAGG	2	8	2230638	2230645	25 %	0 %	50 %	25 %	163841234
37964	NC_010168	CAC	2	6	2230852	2230857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841234
37965	NC_010168	TGC	2	6	2230866	2230871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841234
37966	NC_010168	CAC	2	6	2231026	2231031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841234
37967	NC_010168	CCA	2	6	2231061	2231066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841234
37968	NC_010168	GCT	2	6	2231155	2231160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841234
37969	NC_010168	GCC	2	6	2231171	2231176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841234
37970	NC_010168	CGG	2	6	2231334	2231339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841234
37971	NC_010168	TCAG	2	8	2231363	2231370	25 %	25 %	25 %	25 %	163841234
37972	NC_010168	CCG	2	6	2231394	2231399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841234
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37980	NC_010168	ATC	2	6	2232107	2232112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841235
37981	NC_010168	CTG	2	6	2232163	2232168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841235
37982	NC_010168	CGG	2	6	2232187	2232192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841235
37983	NC_010168	TGC	2	6	2232275	2232280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841235
37984	NC_010168	CAG	2	6	2232400	2232405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841235
37985	NC_010168	GGC	2	6	2232410	2232415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841235
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37987	NC_010168	CGC	2	6	2232457	2232462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841235
37988	NC_010168	GGC	2	6	2232536	2232541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841235
37989	NC_010168	ATT	2	6	2232553	2232558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841235
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37991	NC_010168	CAGC	2	8	2232579	2232586	25 %	0 %	25 %	50 %	163841235
37992	NC_010168	AAT	2	6	2232589	2232594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841235
37993	NC_010168	ACG	2	6	2232617	2232622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841235
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37996	NC_010168	GTAA	2	8	2232826	2232833	50 %	25 %	25 %	0 %	163841235
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37999	NC_010168	CGT	2	6	2233035	2233040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841235
38000	NC_010168	GTCTCG	2	12	2233097	2233108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841235

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