MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_010168	TGG	2	6	1249221	1249226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840202
21003	NC_010168	CAC	2	6	1249245	1249250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840202
21004	NC_010168	CGT	2	6	1249261	1249266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840202
21005	NC_010168	GC	4	8	1249316	1249323	0 %	0 %	50 %	50 %	163840202
21006	NC_010168	CGT	2	6	1249381	1249386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840202
21007	NC_010168	GCT	2	6	1249465	1249470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840202
21008	NC_010168	GGA	2	6	1249528	1249533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840202
21009	NC_010168	GCC	2	6	1249543	1249548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840202
21010	NC_010168	TGACC	2	10	1249585	1249594	20 %	20 %	20 %	40 %	163840202
21011	NC_010168	GCGCA	2	10	1249723	1249732	20 %	0 %	40 %	40 %	163840202
21012	NC_010168	GCC	2	6	1249733	1249738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840202
21013	NC_010168	AGC	2	6	1249740	1249745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840202
21014	NC_010168	CGA	2	6	1249747	1249752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840202
21015	NC_010168	CGG	2	6	1249792	1249797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840202
21016	NC_010168	AGT	2	6	1249822	1249827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840202
21017	NC_010168	GC	3	6	1249943	1249948	0 %	0 %	50 %	50 %	163840202
21018	NC_010168	CGGC	2	8	1250130	1250137	0 %	0 %	50 %	50 %	163840203
21019	NC_010168	AGC	2	6	1250140	1250145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840203
21020	NC_010168	CAG	2	6	1250166	1250171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840203
21021	NC_010168	TTG	2	6	1250247	1250252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840203
21022	NC_010168	AGCA	2	8	1250320	1250327	50 %	0 %	25 %	25 %	163840203
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21059	NC_010168	CGGGG	2	10	1251895	1251904	0 %	0 %	80 %	20 %	163840204
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21063	NC_010168	AT	3	6	1252003	1252008	50 %	50 %	0 %	0 %	163840205
21064	NC_010168	TGA	2	6	1252019	1252024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840205
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21069	NC_010168	GCT	3	9	1252206	1252214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840205
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21082	NC_010168	ATC	2	6	1252850	1252855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840206
21083	NC_010168	TCTT	2	8	1252923	1252930	0 %	75 %	0 %	25 %	163840206
21084	NC_010168	CG	3	6	1253024	1253029	0 %	0 %	50 %	50 %	163840207
21085	NC_010168	CTTGG	2	10	1253156	1253165	0 %	40 %	40 %	20 %	163840207
21086	NC_010168	CCAGG	2	10	1253229	1253238	20 %	0 %	40 %	40 %	163840207
21087	NC_010168	CTG	2	6	1253315	1253320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840207
21088	NC_010168	GCTA	2	8	1253329	1253336	25 %	25 %	25 %	25 %	163840207
21089	NC_010168	TTA	2	6	1253381	1253386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840207
21090	NC_010168	GTC	2	6	1253586	1253591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840208
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21092	NC_010168	GCTG	2	8	1253621	1253628	0 %	25 %	50 %	25 %	163840208
21093	NC_010168	CGCA	2	8	1253662	1253669	25 %	0 %	25 %	50 %	163840208
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21096	NC_010168	TGC	2	6	1253891	1253896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840208
21097	NC_010168	GCGG	2	8	1253946	1253953	0 %	0 %	75 %	25 %	163840208
21098	NC_010168	CCTTGG	2	12	1253969	1253980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840208
21099	NC_010168	CG	3	6	1254146	1254151	0 %	0 %	50 %	50 %	163840208
21100	NC_010168	GTG	2	6	1254156	1254161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840208
21101	NC_010168	GCC	2	6	1254186	1254191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840208
21102	NC_010168	TGC	2	6	1254244	1254249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840208
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21105	NC_010168	CCA	2	6	1254437	1254442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840209
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21107	NC_010168	A	6	6	1254573	1254578	100 %	0 %	0 %	0 %	163840209
21108	NC_010168	GCG	2	6	1254597	1254602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840209
21109	NC_010168	TG	3	6	1254618	1254623	0 %	50 %	50 %	0 %	163840209
21110	NC_010168	AAG	2	6	1254722	1254727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840209
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21112	NC_010168	GC	3	6	1254894	1254899	0 %	0 %	50 %	50 %	163840210
21113	NC_010168	CTG	2	6	1254998	1255003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840210
21114	NC_010168	ACC	2	6	1255061	1255066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840210
21115	NC_010168	CGC	2	6	1255086	1255091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840210
21116	NC_010168	TCA	2	6	1255241	1255246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840210
21117	NC_010168	CAC	2	6	1255258	1255263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840210
21118	NC_010168	CTACGG	2	12	1255431	1255442	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163840210
21119	NC_010168	GCC	2	6	1255534	1255539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840210
21120	NC_010168	CGG	2	6	1255619	1255624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840210
21121	NC_010168	GACG	2	8	1255661	1255668	25 %	0 %	50 %	25 %	163840210
21122	NC_010168	A	6	6	1255738	1255743	100 %	0 %	0 %	0 %	163840210
21123	NC_010168	ATT	2	6	1255765	1255770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840210
21124	NC_010168	GAT	2	6	1255777	1255782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840210
21125	NC_010168	GGC	2	6	1255783	1255788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840210
21126	NC_010168	GAT	2	6	1255804	1255809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840210
21127	NC_010168	TAC	2	6	1255821	1255826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840210
21128	NC_010168	GTT	2	6	1255917	1255922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840210
21129	NC_010168	GC	3	6	1255950	1255955	0 %	0 %	50 %	50 %	163840210
21130	NC_010168	GAA	2	6	1256086	1256091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840210
21131	NC_010168	GAA	2	6	1256119	1256124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840210
21132	NC_010168	CGG	2	6	1256202	1256207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840210
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21134	NC_010168	CTT	2	6	1256253	1256258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840210
21135	NC_010168	CGC	2	6	1256335	1256340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840210
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21139	NC_010168	CTGA	2	8	1256392	1256399	25 %	25 %	25 %	25 %	163840210
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21141	NC_010168	CGT	2	6	1256482	1256487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840210
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21143	NC_010168	CG	3	6	1256684	1256689	0 %	0 %	50 %	50 %	163840211
21144	NC_010168	CT	3	6	1256723	1256728	0 %	50 %	0 %	50 %	163840211
21145	NC_010168	ACG	2	6	1256738	1256743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840211
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21148	NC_010168	CGG	2	6	1256826	1256831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840211
21149	NC_010168	GC	3	6	1256841	1256846	0 %	0 %	50 %	50 %	163840211
21150	NC_010168	GCT	2	6	1256864	1256869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840211
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21152	NC_010168	TGG	2	6	1256917	1256922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840211
21153	NC_010168	CAT	2	6	1256995	1257000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840211
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21155	NC_010168	TCT	2	6	1257089	1257094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840211
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21185	NC_010168	CGT	2	6	1258992	1258997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840213
21186	NC_010168	GCCG	2	8	1259029	1259036	0 %	0 %	50 %	50 %	163840213
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21192	NC_010168	GCT	2	6	1259483	1259488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840213
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21204	NC_010168	CGGT	2	8	1259945	1259952	0 %	25 %	50 %	25 %	163840213
21205	NC_010168	GGGC	2	8	1259981	1259988	0 %	0 %	75 %	25 %	163840213
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21212	NC_010168	CGAG	2	8	1260465	1260472	25 %	0 %	50 %	25 %	163840215
21213	NC_010168	GCG	2	6	1260488	1260493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840215
21214	NC_010168	GCT	2	6	1260538	1260543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840215
21215	NC_010168	CGA	3	9	1260571	1260579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840215
21216	NC_010168	TGC	2	6	1260646	1260651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840215
21217	NC_010168	AGCTG	2	10	1260697	1260706	20 %	20 %	40 %	20 %	163840215
21218	NC_010168	ACG	2	6	1260723	1260728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840215
21219	NC_010168	CCG	2	6	1260765	1260770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840215
21220	NC_010168	GAA	2	6	1260806	1260811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840215
21221	NC_010168	CAA	2	6	1260908	1260913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840215
21222	NC_010168	CG	3	6	1261105	1261110	0 %	0 %	50 %	50 %	163840216
21223	NC_010168	TGG	2	6	1261136	1261141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840216
21224	NC_010168	CAG	2	6	1261259	1261264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840216
21225	NC_010168	GCA	2	6	1261279	1261284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840216
21226	NC_010168	CTA	2	6	1261322	1261327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840216
21227	NC_010168	CG	3	6	1261334	1261339	0 %	0 %	50 %	50 %	163840216
21228	NC_010168	TCG	2	6	1261403	1261408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840216
21229	NC_010168	TCG	2	6	1261412	1261417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840216
21230	NC_010168	GCT	2	6	1261443	1261448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840216
21231	NC_010168	GGA	2	6	1261458	1261463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840216
21232	NC_010168	GAG	2	6	1261588	1261593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840216
21233	NC_010168	GCA	2	6	1261659	1261664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840216
21234	NC_010168	GCC	2	6	1261750	1261755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840216
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21236	NC_010168	TAG	2	6	1261864	1261869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840217
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21238	NC_010168	GCCG	2	8	1262112	1262119	0 %	0 %	50 %	50 %	163840217
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21243	NC_010168	GCC	2	6	1262403	1262408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840217
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21334	NC_010168	CTGC	2	8	1267869	1267876	0 %	25 %	25 %	50 %	163840224
21335	NC_010168	CGT	2	6	1267920	1267925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840224
21336	NC_010168	TGC	2	6	1267930	1267935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840224
21337	NC_010168	CGT	2	6	1268037	1268042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840224
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21340	NC_010168	TGAT	2	8	1268286	1268293	25 %	50 %	25 %	0 %	163840225
21341	NC_010168	AATC	2	8	1268410	1268417	50 %	25 %	0 %	25 %	163840225
21342	NC_010168	ACG	2	6	1268473	1268478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840225
21343	NC_010168	GAT	2	6	1268617	1268622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840225
21344	NC_010168	GACC	2	8	1268644	1268651	25 %	0 %	25 %	50 %	163840225
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21346	NC_010168	GAC	2	6	1268957	1268962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840226
21347	NC_010168	TCT	2	6	1268997	1269002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840226
21348	NC_010168	CTG	2	6	1269099	1269104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840226
21349	NC_010168	CGA	2	6	1269151	1269156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840226
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21353	NC_010168	TCT	2	6	1269440	1269445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840226
21354	NC_010168	GCT	2	6	1269488	1269493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840226
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21365	NC_010168	CCA	2	6	1269947	1269952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840227
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21374	NC_010168	GCA	2	6	1270444	1270449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840228
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21447	NC_010168	GGCTGG	2	12	1275010	1275021	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	163840235
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21450	NC_010168	GGC	2	6	1275192	1275197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840235
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21453	NC_010168	CTT	2	6	1275315	1275320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840235
21454	NC_010168	CAG	2	6	1275394	1275399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840235
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21457	NC_010168	CCT	2	6	1275683	1275688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840236
21458	NC_010168	CGT	2	6	1275713	1275718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840236
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