MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010168	GCAGC	2	10	1105892	1105901	20 %	0 %	40 %	40 %	163840046
18502	NC_010168	ACG	2	6	1105948	1105953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840046
18503	NC_010168	CAC	2	6	1105986	1105991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840046
18504	NC_010168	CGG	2	6	1106036	1106041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840046
18505	NC_010168	CAA	2	6	1106078	1106083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840046
18506	NC_010168	CGG	2	6	1106127	1106132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840046
18507	NC_010168	ACG	2	6	1106137	1106142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840046
18508	NC_010168	CGC	2	6	1106195	1106200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840046
18509	NC_010168	TCG	2	6	1106275	1106280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840046
18510	NC_010168	GCC	2	6	1106298	1106303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840046
18511	NC_010168	CG	3	6	1106305	1106310	0 %	0 %	50 %	50 %	163840046
18512	NC_010168	CGTAC	2	10	1106371	1106380	20 %	20 %	20 %	40 %	163840046
18513	NC_010168	CTC	2	6	1106388	1106393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840046
18514	NC_010168	CGGCTT	2	12	1106411	1106422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840046
18515	NC_010168	CTT	2	6	1106498	1106503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840046
18516	NC_010168	GA	3	6	1106552	1106557	50 %	0 %	50 %	0 %	163840046
18517	NC_010168	CGG	2	6	1106591	1106596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840046
18518	NC_010168	GCA	2	6	1106624	1106629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840046
18519	NC_010168	GTA	2	6	1106652	1106657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840046
18520	NC_010168	CAG	2	6	1106741	1106746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840047
18521	NC_010168	CAT	2	6	1106760	1106765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840047
18522	NC_010168	GCAG	2	8	1106790	1106797	25 %	0 %	50 %	25 %	163840047
18523	NC_010168	CGA	2	6	1106921	1106926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840047
18524	NC_010168	CAC	2	6	1107166	1107171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840047
18525	NC_010168	TTC	2	6	1107686	1107691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840047
18526	NC_010168	ATC	2	6	1107709	1107714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840047
18527	NC_010168	GGC	2	6	1107775	1107780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840047
18528	NC_010168	GTT	2	6	1107784	1107789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840047
18529	NC_010168	A	6	6	1108023	1108028	100 %	0 %	0 %	0 %	163840048
18530	NC_010168	AAC	2	6	1108048	1108053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840048
18531	NC_010168	CA	3	6	1108152	1108157	50 %	0 %	0 %	50 %	163840048
18532	NC_010168	TCC	2	6	1108225	1108230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840048
18533	NC_010168	ATC	2	6	1108285	1108290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840048
18534	NC_010168	ATT	2	6	1108315	1108320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840048
18535	NC_010168	CGCT	2	8	1108344	1108351	0 %	25 %	25 %	50 %	163840048
18536	NC_010168	AAGCT	2	10	1108385	1108394	40 %	20 %	20 %	20 %	163840048
18537	NC_010168	GCA	2	6	1108407	1108412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840048
18538	NC_010168	CAT	2	6	1108431	1108436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840048
18539	NC_010168	CGC	2	6	1108444	1108449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840048
18540	NC_010168	ATC	2	6	1108453	1108458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840048
18541	NC_010168	GT	3	6	1108469	1108474	0 %	50 %	50 %	0 %	163840048
18542	NC_010168	ACG	2	6	1108532	1108537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840048
18543	NC_010168	TGG	2	6	1108547	1108552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840048
18544	NC_010168	GGC	2	6	1108579	1108584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840048
18545	NC_010168	GCG	2	6	1108664	1108669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840048
18546	NC_010168	CGG	2	6	1108674	1108679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840048
18547	NC_010168	GCT	2	6	1108840	1108845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840048
18548	NC_010168	GAA	2	6	1108867	1108872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840048
18549	NC_010168	CTA	2	6	1108882	1108887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840048
18550	NC_010168	ATT	2	6	1108903	1108908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840048
18551	NC_010168	TGC	2	6	1108926	1108931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840048
18552	NC_010168	AGT	2	6	1108998	1109003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840048
18553	NC_010168	CTG	2	6	1109051	1109056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840048
18554	NC_010168	TG	3	6	1109071	1109076	0 %	50 %	50 %	0 %	163840048
18555	NC_010168	GCG	2	6	1109098	1109103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840048
18556	NC_010168	CTG	2	6	1109226	1109231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840049
18557	NC_010168	CG	3	6	1109242	1109247	0 %	0 %	50 %	50 %	163840049
18558	NC_010168	GCT	2	6	1109267	1109272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840049
18559	NC_010168	ATTGAG	2	12	1109391	1109402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840049
18560	NC_010168	ATTTTG	2	12	1109422	1109433	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	163840049
18561	NC_010168	GCG	2	6	1109506	1109511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840049
18562	NC_010168	TGC	2	6	1109575	1109580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840049
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18565	NC_010168	CGG	2	6	1109747	1109752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840049
18566	NC_010168	ACG	2	6	1109947	1109952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840050
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18573	NC_010168	TTGC	2	8	1110596	1110603	0 %	50 %	25 %	25 %	163840051
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18584	NC_010168	TGA	2	6	1111247	1111252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840052
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18587	NC_010168	GCC	2	6	1111288	1111293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840052
18588	NC_010168	CGG	2	6	1111349	1111354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840052
18589	NC_010168	TGGTG	2	10	1111431	1111440	0 %	40 %	60 %	0 %	163840052
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18599	NC_010168	GCA	2	6	1111968	1111973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840052
18600	NC_010168	ATG	2	6	1111987	1111992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840052
18601	NC_010168	TTC	2	6	1112116	1112121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840053
18602	NC_010168	TCGC	2	8	1112148	1112155	0 %	25 %	25 %	50 %	163840053
18603	NC_010168	GGA	2	6	1112168	1112173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840053
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18605	NC_010168	TGA	2	6	1112340	1112345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840053
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18607	NC_010168	CGC	2	6	1112520	1112525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840053
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18610	NC_010168	TGT	2	6	1112634	1112639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840053
18611	NC_010168	AACCA	2	10	1112834	1112843	60 %	0 %	0 %	40 %	163840053
18612	NC_010168	CT	3	6	1112921	1112926	0 %	50 %	0 %	50 %	163840053
18613	NC_010168	GCA	2	6	1112939	1112944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840053
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18615	NC_010168	GCT	2	6	1113056	1113061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840053
18616	NC_010168	ATC	2	6	1113110	1113115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840053
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18731	NC_010168	CAC	2	6	1119943	1119948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840060
18732	NC_010168	AG	3	6	1119959	1119964	50 %	0 %	50 %	0 %	163840060
18733	NC_010168	CAT	2	6	1120055	1120060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840060
18734	NC_010168	CCT	2	6	1120090	1120095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840060
18735	NC_010168	TTG	2	6	1120149	1120154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840060
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18738	NC_010168	TGG	2	6	1120358	1120363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840060
18739	NC_010168	GTT	2	6	1120388	1120393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840060
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18741	NC_010168	CTG	2	6	1120420	1120425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840060
18742	NC_010168	CAG	2	6	1120766	1120771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840061
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18750	NC_010168	TGT	2	6	1121043	1121048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840061
18751	NC_010168	GA	3	6	1121053	1121058	50 %	0 %	50 %	0 %	163840061
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18757	NC_010168	GA	3	6	1121484	1121489	50 %	0 %	50 %	0 %	163840062
18758	NC_010168	CG	3	6	1121506	1121511	0 %	0 %	50 %	50 %	163840062
18759	NC_010168	TGCG	2	8	1121577	1121584	0 %	25 %	50 %	25 %	163840062
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18830	NC_010168	GCTG	2	8	1125957	1125964	0 %	25 %	50 %	25 %	163840067
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18839	NC_010168	TCCG	2	8	1126676	1126683	0 %	25 %	25 %	50 %	163840068
18840	NC_010168	CGGA	2	8	1126699	1126706	25 %	0 %	50 %	25 %	163840068
18841	NC_010168	CCG	2	6	1126725	1126730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840068
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18845	NC_010168	AAG	2	6	1126890	1126895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840068
18846	NC_010168	TCG	2	6	1126914	1126919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840068
18847	NC_010168	AG	3	6	1126987	1126992	50 %	0 %	50 %	0 %	163840068
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18960	NC_010168	GCCG	2	8	1134109	1134116	0 %	0 %	50 %	50 %	163840072
18961	NC_010168	AAACC	2	10	1134151	1134160	60 %	0 %	0 %	40 %	163840072
18962	NC_010168	ATC	2	6	1134194	1134199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840072
18963	NC_010168	GGT	2	6	1134212	1134217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840072
18964	NC_010168	CAAC	2	8	1134314	1134321	50 %	0 %	0 %	50 %	163840072
18965	NC_010168	GTC	2	6	1134360	1134365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840072
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18988	NC_010168	TCA	2	6	1135431	1135436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840074
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18991	NC_010168	GTT	2	6	1135648	1135653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840074
18992	NC_010168	CTT	2	6	1135691	1135696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840074
18993	NC_010168	GTT	2	6	1135751	1135756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840074
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