MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_010168	GGC	2	6	656163	656168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839539
11003	NC_010168	GC	4	8	656192	656199	0 %	0 %	50 %	50 %	163839539
11004	NC_010168	GCG	2	6	656206	656211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839539
11005	NC_010168	AGC	2	6	656357	656362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839539
11006	NC_010168	CAA	2	6	656528	656533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839539
11007	NC_010168	GAC	2	6	656546	656551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839539
11008	NC_010168	TCGA	2	8	656568	656575	25 %	25 %	25 %	25 %	163839539
11009	NC_010168	CCA	2	6	656635	656640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839539
11010	NC_010168	CCCG	2	8	656675	656682	0 %	0 %	25 %	75 %	163839539
11011	NC_010168	CGT	2	6	656813	656818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839539
11012	NC_010168	GCG	2	6	657049	657054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839539
11013	NC_010168	TGC	2	6	657067	657072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839539
11014	NC_010168	ACT	2	6	657219	657224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839539
11015	NC_010168	CGA	2	6	657227	657232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839539
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11017	NC_010168	GGC	2	6	657328	657333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839540
11018	NC_010168	TGC	2	6	657505	657510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839540
11019	NC_010168	CGA	2	6	657517	657522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839540
11020	NC_010168	CGC	2	6	657619	657624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839540
11021	NC_010168	CTG	2	6	657695	657700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839540
11022	NC_010168	CAC	2	6	657716	657721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839540
11023	NC_010168	GCA	2	6	657751	657756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839540
11024	NC_010168	GTT	2	6	657769	657774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839540
11025	NC_010168	TCA	2	6	657778	657783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839540
11026	NC_010168	GCT	2	6	657805	657810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839540
11027	NC_010168	CGC	2	6	657842	657847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839540
11028	NC_010168	CGG	2	6	657939	657944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839540
11029	NC_010168	CGC	2	6	658003	658008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839540
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11031	NC_010168	GAT	2	6	658088	658093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839540
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11034	NC_010168	CGC	2	6	658270	658275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839540
11035	NC_010168	TGC	2	6	658290	658295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839540
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11039	NC_010168	TGC	2	6	658447	658452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839540
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11041	NC_010168	CG	3	6	658470	658475	0 %	0 %	50 %	50 %	163839540
11042	NC_010168	CGC	2	6	658521	658526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839540
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11044	NC_010168	GCCGCG	2	12	658843	658854	0 %	0 %	50 %	50 %	163839541
11045	NC_010168	TCGC	2	8	658924	658931	0 %	25 %	25 %	50 %	163839541
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11049	NC_010168	CGG	2	6	659388	659393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839542
11050	NC_010168	CTGC	2	8	659478	659485	0 %	25 %	25 %	50 %	163839542
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11053	NC_010168	GGC	2	6	659654	659659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839542
11054	NC_010168	GCA	2	6	659698	659703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839542
11055	NC_010168	TAGC	2	8	659739	659746	25 %	25 %	25 %	25 %	163839542
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11061	NC_010168	GGCTT	2	10	660061	660070	0 %	40 %	40 %	20 %	163839542
11062	NC_010168	CGG	2	6	660153	660158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839542
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11065	NC_010168	CCA	2	6	660424	660429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839543
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11092	NC_010168	ACG	2	6	661718	661723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839545
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11102	NC_010168	TTG	2	6	662054	662059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839545
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11105	NC_010168	AG	3	6	662223	662228	50 %	0 %	50 %	0 %	163839546
11106	NC_010168	GCT	2	6	662259	662264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839546
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11109	NC_010168	AAT	2	6	662549	662554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163839546
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11111	NC_010168	CGC	3	9	662622	662630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839546
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11117	NC_010168	GC	3	6	662929	662934	0 %	0 %	50 %	50 %	163839546
11118	NC_010168	CAT	2	6	663020	663025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839546
11119	NC_010168	GCTT	2	8	663147	663154	0 %	50 %	25 %	25 %	163839546
11120	NC_010168	CAGAGC	2	12	663199	663210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839546
11121	NC_010168	AGCA	2	8	663252	663259	50 %	0 %	25 %	25 %	163839546
11122	NC_010168	CGG	2	6	663262	663267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839546
11123	NC_010168	GGT	2	6	663312	663317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839546
11124	NC_010168	GAT	2	6	663324	663329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839546
11125	NC_010168	CGA	2	6	663497	663502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839546
11126	NC_010168	GGC	2	6	663621	663626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839546
11127	NC_010168	CCA	2	6	663638	663643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839546
11128	NC_010168	GTC	2	6	663777	663782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839546
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11130	NC_010168	ACG	2	6	663867	663872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839546
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11132	NC_010168	TTC	2	6	664015	664020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839547
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11134	NC_010168	GCA	2	6	664094	664099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839547
11135	NC_010168	GGCCG	2	10	664127	664136	0 %	0 %	60 %	40 %	163839547
11136	NC_010168	CTG	2	6	664247	664252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839547
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11139	NC_010168	TCG	3	9	664381	664389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839547
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11141	NC_010168	CGA	3	9	664494	664502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839547
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11144	NC_010168	TTCG	2	8	664654	664661	0 %	50 %	25 %	25 %	163839547
11145	NC_010168	TGC	2	6	664663	664668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839547
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11147	NC_010168	CGG	2	6	664743	664748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839547
11148	NC_010168	GGCTG	2	10	664777	664786	0 %	20 %	60 %	20 %	163839547
11149	NC_010168	GC	4	8	664812	664819	0 %	0 %	50 %	50 %	163839547
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11213	NC_010168	GCGG	2	8	668036	668043	0 %	0 %	75 %	25 %	163839553
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11222	NC_010168	TCGA	2	8	668283	668290	25 %	25 %	25 %	25 %	163839553
11223	NC_010168	GTT	2	6	668302	668307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839553
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11225	NC_010168	TCT	2	6	668354	668359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839553
11226	NC_010168	CGGA	2	8	668394	668401	25 %	0 %	50 %	25 %	163839553
11227	NC_010168	GAT	2	6	668408	668413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839553
11228	NC_010168	TTGC	2	8	668426	668433	0 %	50 %	25 %	25 %	163839553
11229	NC_010168	GAT	2	6	668450	668455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839553
11230	NC_010168	TGGAC	2	10	668475	668484	20 %	20 %	40 %	20 %	163839553
11231	NC_010168	TAG	2	6	668529	668534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839553
11232	NC_010168	CTG	2	6	668613	668618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839553
11233	NC_010168	GAC	2	6	668651	668656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839553
11234	NC_010168	GGC	2	6	668674	668679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839553
11235	NC_010168	GCA	2	6	668712	668717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839554
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11237	NC_010168	TAG	2	6	668763	668768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839554
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11475	NC_010168	TCGG	2	8	689291	689298	0 %	25 %	50 %	25 %	163839568
11476	NC_010168	GGT	2	6	689322	689327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839568
11477	NC_010168	TCG	2	6	689459	689464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839568
11478	NC_010168	TGAAGT	2	12	689484	689495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839568
11479	NC_010168	TGG	2	6	689501	689506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839568
11480	NC_010168	TG	3	6	689615	689620	0 %	50 %	50 %	0 %	163839568
11481	NC_010168	TG	3	6	689668	689673	0 %	50 %	50 %	0 %	163839568
11482	NC_010168	TCC	2	6	689824	689829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839568
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11484	NC_010168	TCG	2	6	689891	689896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839568
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11487	NC_010168	CGGCAC	2	12	690004	690015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163839568
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11493	NC_010168	CTG	2	6	690498	690503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839569
11494	NC_010168	CTA	2	6	690506	690511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839569
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11497	NC_010168	AC	3	6	690688	690693	50 %	0 %	0 %	50 %	163839569
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11499	NC_010168	GGC	2	6	690754	690759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839569
11500	NC_010168	CCG	2	6	690786	690791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839569

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