MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_010168	CAC	2	6	3114020	3114025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842226
53003	NC_010168	CGA	3	9	3114037	3114045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842226
53004	NC_010168	CTG	2	6	3114152	3114157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842226
53005	NC_010168	GCC	2	6	3114161	3114166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842226
53006	NC_010168	GTCA	2	8	3114197	3114204	25 %	25 %	25 %	25 %	163842226
53007	NC_010168	TTAG	2	8	3114273	3114280	25 %	50 %	25 %	0 %	163842226
53008	NC_010168	CTT	2	6	3114319	3114324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842226
53009	NC_010168	TGC	2	6	3114336	3114341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842226
53010	NC_010168	CG	3	6	3114376	3114381	0 %	0 %	50 %	50 %	163842226
53011	NC_010168	CGT	2	6	3114517	3114522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842226
53012	NC_010168	AATCG	2	10	3114533	3114542	40 %	20 %	20 %	20 %	163842226
53013	NC_010168	CAA	2	6	3114584	3114589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842226
53014	NC_010168	CCA	2	6	3114627	3114632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842226
53015	NC_010168	ACG	2	6	3114705	3114710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842226
53016	NC_010168	TGCT	2	8	3114719	3114726	0 %	50 %	25 %	25 %	163842226
53017	NC_010168	GCC	2	6	3114730	3114735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842226
53018	NC_010168	AGT	2	6	3114740	3114745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842226
53019	NC_010168	ACG	4	12	3114768	3114779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842226
53020	NC_010168	CGG	2	6	3114811	3114816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842226
53021	NC_010168	GATG	2	8	3114914	3114921	25 %	25 %	50 %	0 %	163842227
53022	NC_010168	AAT	2	6	3114923	3114928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163842227
53023	NC_010168	CAT	2	6	3114947	3114952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842227
53024	NC_010168	GCAG	2	8	3114990	3114997	25 %	0 %	50 %	25 %	163842227
53025	NC_010168	CCGGA	2	10	3115020	3115029	20 %	0 %	40 %	40 %	163842227
53026	NC_010168	GAC	2	6	3115224	3115229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842227
53027	NC_010168	CG	3	6	3115248	3115253	0 %	0 %	50 %	50 %	163842227
53028	NC_010168	ATG	2	6	3115369	3115374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842227
53029	NC_010168	GTG	2	6	3115407	3115412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842227
53030	NC_010168	AGA	2	6	3115457	3115462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842227
53031	NC_010168	CTT	2	6	3115532	3115537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842227
53032	NC_010168	CGAG	2	8	3115553	3115560	25 %	0 %	50 %	25 %	163842227
53033	NC_010168	ATC	2	6	3115584	3115589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842227
53034	NC_010168	GATG	2	8	3116257	3116264	25 %	25 %	50 %	0 %	163842228
53035	NC_010168	CAG	2	6	3116314	3116319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842228
53036	NC_010168	GC	3	6	3116367	3116372	0 %	0 %	50 %	50 %	163842228
53037	NC_010168	GCC	2	6	3116397	3116402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842228
53038	NC_010168	GCG	2	6	3116424	3116429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842228
53039	NC_010168	CGC	2	6	3116593	3116598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842228
53040	NC_010168	GC	3	6	3116704	3116709	0 %	0 %	50 %	50 %	163842228
53041	NC_010168	CAAGT	2	10	3116741	3116750	40 %	20 %	20 %	20 %	163842228
53042	NC_010168	GCG	2	6	3116803	3116808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842228
53043	NC_010168	GTT	2	6	3116843	3116848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842228
53044	NC_010168	GCA	2	6	3117018	3117023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842228
53045	NC_010168	GAC	2	6	3117026	3117031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842228
53046	NC_010168	CGG	3	9	3117077	3117085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842229
53047	NC_010168	TTG	2	6	3117099	3117104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842229
53048	NC_010168	GAA	2	6	3117113	3117118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842229
53049	NC_010168	GCC	2	6	3117141	3117146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842229
53050	NC_010168	CGA	2	6	3117172	3117177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
53051	NC_010168	TGGAC	2	10	3117182	3117191	20 %	20 %	40 %	20 %	163842229
53052	NC_010168	CAC	2	6	3117209	3117214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
53053	NC_010168	TCAA	2	8	3117252	3117259	50 %	25 %	0 %	25 %	163842229
53054	NC_010168	TCGA	2	8	3117279	3117286	25 %	25 %	25 %	25 %	163842229
53055	NC_010168	TGG	2	6	3117323	3117328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842229
53056	NC_010168	GCC	2	6	3117344	3117349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842229
53057	NC_010168	GAT	2	6	3117374	3117379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842229
53058	NC_010168	CAG	2	6	3117401	3117406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
53059	NC_010168	ACC	2	6	3117423	3117428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
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53061	NC_010168	CCA	2	6	3117510	3117515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842229
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53067	NC_010168	CGA	2	6	3117967	3117972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
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53069	NC_010168	CAG	2	6	3117996	3118001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842229
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53071	NC_010168	CACCGG	2	12	3118018	3118029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	163842229
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53082	NC_010168	CAAT	2	8	3118826	3118833	50 %	25 %	0 %	25 %	163842230
53083	NC_010168	GTG	2	6	3118970	3118975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842230
53084	NC_010168	CAA	2	6	3119011	3119016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842230
53085	NC_010168	TCC	3	9	3119085	3119093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842230
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53088	NC_010168	CGT	2	6	3119413	3119418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842230
53089	NC_010168	CGT	2	6	3119699	3119704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842231
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53098	NC_010168	GCA	2	6	3120135	3120140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842232
53099	NC_010168	ATG	2	6	3120244	3120249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842232
53100	NC_010168	GCC	2	6	3120307	3120312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842232
53101	NC_010168	TCA	2	6	3120366	3120371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842232
53102	NC_010168	CGG	2	6	3120390	3120395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842232
53103	NC_010168	GTC	2	6	3120454	3120459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842232
53104	NC_010168	ACCC	2	8	3120532	3120539	25 %	0 %	0 %	75 %	163842232
53105	NC_010168	GCC	2	6	3120593	3120598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842232
53106	NC_010168	TTGA	2	8	3120626	3120633	25 %	50 %	25 %	0 %	163842232
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53110	NC_010168	CCTG	2	8	3120951	3120958	0 %	25 %	25 %	50 %	163842233
53111	NC_010168	TTC	2	6	3120991	3120996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842233
53112	NC_010168	A	6	6	3121128	3121133	100 %	0 %	0 %	0 %	163842233
53113	NC_010168	ATC	2	6	3121218	3121223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842233
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53115	NC_010168	CGC	3	9	3121372	3121380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842233
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53118	NC_010168	GCT	2	6	3121489	3121494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842233
53119	NC_010168	GCT	3	9	3121556	3121564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842233
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53231	NC_010168	TGC	2	6	3127977	3127982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842242
53232	NC_010168	CAG	2	6	3127989	3127994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842242
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53345	NC_010168	CG	4	8	3134685	3134692	0 %	0 %	50 %	50 %	163842252
53346	NC_010168	GCA	2	6	3134703	3134708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842252
53347	NC_010168	CGG	2	6	3134862	3134867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842253
53348	NC_010168	GTA	2	6	3134890	3134895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842253
53349	NC_010168	TGG	2	6	3134914	3134919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842253
53350	NC_010168	GGT	2	6	3134949	3134954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842253
53351	NC_010168	CTT	2	6	3134991	3134996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842253
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53353	NC_010168	TGA	3	9	3135170	3135178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842253
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53362	NC_010168	GGT	2	6	3135682	3135687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842253
53363	NC_010168	TCGAC	2	10	3135719	3135728	20 %	20 %	20 %	40 %	163842253
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53446	NC_010168	TGTGA	2	10	3141377	3141386	20 %	40 %	40 %	0 %	163842261
53447	NC_010168	CCT	2	6	3141396	3141401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842261
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53452	NC_010168	CCT	2	6	3141554	3141559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842261
53453	NC_010168	GCA	2	6	3141561	3141566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842261
53454	NC_010168	GAA	2	6	3141619	3141624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842261
53455	NC_010168	CAA	2	6	3141648	3141653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842261
53456	NC_010168	TGCC	2	8	3142121	3142128	0 %	25 %	25 %	50 %	163842262
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53459	NC_010168	CCA	2	6	3142206	3142211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842262
53460	NC_010168	CGT	2	6	3142314	3142319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842262
53461	NC_010168	CGA	2	6	3142410	3142415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842262
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53463	NC_010168	CGA	2	6	3142448	3142453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842262
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