MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 23966

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009900	GAA	2	6	280431	280436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964270
5003	NC_009900	CTA	2	6	280486	280491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964270
5004	NC_009900	ACT	2	6	280494	280499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964270
5005	NC_009900	AAAAT	2	10	280591	280600	80 %	20 %	0 %	0 %	157964270
5006	NC_009900	TAA	2	6	280615	280620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964270
5007	NC_009900	GCT	2	6	280724	280729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964270
5008	NC_009900	ATA	2	6	280846	280851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964270
5009	NC_009900	AGT	2	6	280886	280891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964270
5010	NC_009900	GTA	2	6	280894	280899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964270
5011	NC_009900	CGA	2	6	280915	280920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964270
5012	NC_009900	GCTT	2	8	280927	280934	0 %	50 %	25 %	25 %	157964270
5013	NC_009900	GCA	2	6	281000	281005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964270
5014	NC_009900	TA	3	6	281063	281068	50 %	50 %	0 %	0 %	157964270
5015	NC_009900	ACA	2	6	281071	281076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964270
5016	NC_009900	TAA	2	6	281087	281092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964270
5017	NC_009900	GCA	2	6	281094	281099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964270
5018	NC_009900	AGC	2	6	281117	281122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964270
5019	NC_009900	TTA	2	6	281149	281154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964270
5020	NC_009900	GA	3	6	281190	281195	50 %	0 %	50 %	0 %	157964270
5021	NC_009900	ATTGCA	2	12	281229	281240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157964270
5022	NC_009900	A	6	6	281252	281257	100 %	0 %	0 %	0 %	157964270
5023	NC_009900	AT	3	6	281265	281270	50 %	50 %	0 %	0 %	157964270
5024	NC_009900	TGA	2	6	281276	281281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964270
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5026	NC_009900	CAAG	2	8	281322	281329	50 %	0 %	25 %	25 %	157964270
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5029	NC_009900	TA	3	6	281427	281432	50 %	50 %	0 %	0 %	157964270
5030	NC_009900	TAT	2	6	281475	281480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964270
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5033	NC_009900	AGATG	2	10	281922	281931	40 %	20 %	40 %	0 %	157964271
5034	NC_009900	TATCT	2	10	281936	281945	20 %	60 %	0 %	20 %	157964271
5035	NC_009900	AGTA	2	8	281967	281974	50 %	25 %	25 %	0 %	157964271
5036	NC_009900	CATG	2	8	282033	282040	25 %	25 %	25 %	25 %	157964271
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5041	NC_009900	CGGT	2	8	282404	282411	0 %	25 %	50 %	25 %	157964271
5042	NC_009900	TA	4	8	282467	282474	50 %	50 %	0 %	0 %	157964271
5043	NC_009900	ATA	2	6	282476	282481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964271
5044	NC_009900	GTA	2	6	282593	282598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964271
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5053	NC_009900	TGA	2	6	282908	282913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964271
5054	NC_009900	AAG	2	6	282920	282925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157964271
5055	NC_009900	AGT	2	6	282954	282959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964271
5056	NC_009900	TA	3	6	282975	282980	50 %	50 %	0 %	0 %	157964271
5057	NC_009900	ATA	2	6	283054	283059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964271
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5059	NC_009900	GTTG	2	8	283152	283159	0 %	50 %	50 %	0 %	157964271
5060	NC_009900	TTAAAG	2	12	283370	283381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157964271
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5065	NC_009900	TGA	2	6	283569	283574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964271
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5101	NC_009900	TCA	2	6	287859	287864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964274
5102	NC_009900	ACTTA	2	10	287913	287922	40 %	40 %	0 %	20 %	157964274
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5105	NC_009900	TAAT	2	8	288008	288015	50 %	50 %	0 %	0 %	157964274
5106	NC_009900	GTT	2	6	288037	288042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964274
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5113	NC_009900	AT	3	6	288227	288232	50 %	50 %	0 %	0 %	157964274
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5119	NC_009900	CGGAG	2	10	288303	288312	20 %	0 %	60 %	20 %	157964274
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5493	NC_009900	AAT	2	6	316295	316300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964291
5494	NC_009900	GAG	2	6	316301	316306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157964291
5495	NC_009900	GCT	2	6	316313	316318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964291
5496	NC_009900	ATA	2	6	316407	316412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964291
5497	NC_009900	ATA	2	6	316422	316427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964291
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