MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia bellii OSU 85-389 chromosome

Total Repeats: 31813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_009883	TGT	2	6	1514895	1514900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157827843
31503	NC_009883	TAT	2	6	1514927	1514932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827843
31504	NC_009883	T	6	6	1514941	1514946	0 %	100 %	0 %	0 %	157827843
31505	NC_009883	ACT	2	6	1515093	1515098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827843
31506	NC_009883	ATA	2	6	1515102	1515107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827843
31507	NC_009883	GCT	2	6	1515125	1515130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157827843
31508	NC_009883	AAT	2	6	1515154	1515159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827843
31509	NC_009883	ATC	2	6	1515162	1515167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827843
31510	NC_009883	ATT	2	6	1515180	1515185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827843
31511	NC_009883	TTA	2	6	1515194	1515199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827843
31512	NC_009883	ATT	2	6	1515207	1515212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827843
31513	NC_009883	GGCTTT	2	12	1515213	1515224	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	157827843
31514	NC_009883	AAG	2	6	1515236	1515241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157827843
31515	NC_009883	AAT	2	6	1515267	1515272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827843
31516	NC_009883	CTA	2	6	1515287	1515292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827843
31517	NC_009883	AGC	2	6	1515303	1515308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157827843
31518	NC_009883	CAT	2	6	1515332	1515337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827843
31519	NC_009883	ATG	2	6	1515338	1515343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827843
31520	NC_009883	CAT	2	6	1515368	1515373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827843
31521	NC_009883	CAA	2	6	1515410	1515415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157827843
31522	NC_009883	T	8	8	1515470	1515477	0 %	100 %	0 %	0 %	157827843
31523	NC_009883	TCT	2	6	1515493	1515498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157827843
31524	NC_009883	GAT	2	6	1515514	1515519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827843
31525	NC_009883	A	7	7	1515533	1515539	100 %	0 %	0 %	0 %	157827843
31526	NC_009883	ATA	2	6	1515580	1515585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827843
31527	NC_009883	TAC	2	6	1515587	1515592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827844
31528	NC_009883	TA	3	6	1515626	1515631	50 %	50 %	0 %	0 %	157827844
31529	NC_009883	A	6	6	1515690	1515695	100 %	0 %	0 %	0 %	157827844
31530	NC_009883	TGA	2	6	1515792	1515797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827844
31531	NC_009883	TAA	2	6	1515824	1515829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827844
31532	NC_009883	CTAC	2	8	1515985	1515992	25 %	25 %	0 %	50 %	157827844
31533	NC_009883	TAA	2	6	1516109	1516114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827844
31534	NC_009883	TTA	2	6	1516120	1516125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827844
31535	NC_009883	ATA	2	6	1516238	1516243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827844
31536	NC_009883	ACAAGA	2	12	1516284	1516295	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157827844
31537	NC_009883	ACT	3	9	1516363	1516371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157827844
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31539	NC_009883	AT	3	6	1516417	1516422	50 %	50 %	0 %	0 %	157827844
31540	NC_009883	A	7	7	1516555	1516561	100 %	0 %	0 %	0 %	157827845
31541	NC_009883	TTA	2	6	1516601	1516606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827845
31542	NC_009883	AAG	2	6	1516637	1516642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157827845
31543	NC_009883	T	6	6	1516674	1516679	0 %	100 %	0 %	0 %	157827845
31544	NC_009883	CAG	2	6	1516813	1516818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157827845
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31547	NC_009883	TAAA	2	8	1517090	1517097	75 %	25 %	0 %	0 %	157827846
31548	NC_009883	AAAG	2	8	1517133	1517140	75 %	0 %	25 %	0 %	157827846
31549	NC_009883	TAA	2	6	1517159	1517164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827846
31550	NC_009883	TGA	2	6	1517172	1517177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827846
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31553	NC_009883	ATG	2	6	1517299	1517304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157827846
31554	NC_009883	ATA	2	6	1517332	1517337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157827846
31555	NC_009883	GAA	2	6	1517359	1517364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157827846
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31557	NC_009883	TTA	2	6	1517438	1517443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157827847
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31559	NC_009883	TGT	2	6	1517470	1517475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157827847
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31562	NC_009883	CCTGC	2	10	1517518	1517527	0 %	20 %	20 %	60 %	157827847
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31602	NC_009883	A	8	8	1520074	1520081	100 %	0 %	0 %	0 %	157827849
31603	NC_009883	AAG	2	6	1520199	1520204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157827850
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31607	NC_009883	CTAC	2	8	1520354	1520361	25 %	25 %	0 %	50 %	157827851
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31613	NC_009883	AT	3	6	1520626	1520631	50 %	50 %	0 %	0 %	157827851
31614	NC_009883	T	6	6	1520670	1520675	0 %	100 %	0 %	0 %	157827851
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.