MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia bellii OSU 85-389 chromosome

Total Repeats: 31813

< Previous12...678910111213141516...6364Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009883	TAT	2	6	233662	233667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826610
5003	NC_009883	AT	3	6	233669	233674	50 %	50 %	0 %	0 %	157826610
5004	NC_009883	TTG	2	6	233675	233680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826610
5005	NC_009883	ATG	2	6	233681	233686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826610
5006	NC_009883	AT	3	6	233701	233706	50 %	50 %	0 %	0 %	157826610
5007	NC_009883	ATT	3	9	233756	233764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826610
5008	NC_009883	TCA	2	6	233787	233792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826610
5009	NC_009883	TTA	2	6	234280	234285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826611
5010	NC_009883	CCA	2	6	234301	234306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157826611
5011	NC_009883	TTG	2	6	234311	234316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826611
5012	NC_009883	TAGTTT	2	12	234335	234346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157826611
5013	NC_009883	TC	3	6	234361	234366	0 %	50 %	0 %	50 %	157826611
5014	NC_009883	TA	3	6	234371	234376	50 %	50 %	0 %	0 %	157826611
5015	NC_009883	TTACC	2	10	234461	234470	20 %	40 %	0 %	40 %	157826611
5016	NC_009883	ATCAGG	2	12	234480	234491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157826611
5017	NC_009883	T	6	6	234506	234511	0 %	100 %	0 %	0 %	157826611
5018	NC_009883	GCA	2	6	234523	234528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826611
5019	NC_009883	ACCAGC	2	12	234534	234545	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157826611
5020	NC_009883	TAA	2	6	234591	234596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826611
5021	NC_009883	T	7	7	234660	234666	0 %	100 %	0 %	0 %	157826611
5022	NC_009883	ATA	2	6	234718	234723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826611
5023	NC_009883	TGA	2	6	234867	234872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826611
5024	NC_009883	TCA	2	6	234902	234907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826611
5025	NC_009883	AGC	2	6	234930	234935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826611
5026	NC_009883	TTA	2	6	234977	234982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826611
5027	NC_009883	T	6	6	234990	234995	0 %	100 %	0 %	0 %	157826611
5028	NC_009883	TTGT	2	8	235203	235210	0 %	75 %	25 %	0 %	157826612
5029	NC_009883	AAAT	2	8	235221	235228	75 %	25 %	0 %	0 %	157826612
5030	NC_009883	GAA	2	6	235306	235311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826612
5031	NC_009883	AGTT	2	8	235320	235327	25 %	50 %	25 %	0 %	157826612
5032	NC_009883	AAG	2	6	235361	235366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826612
5033	NC_009883	CAC	2	6	235379	235384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157826612
5034	NC_009883	TTTC	2	8	235409	235416	0 %	75 %	0 %	25 %	157826612
5035	NC_009883	TAGA	2	8	235469	235476	50 %	25 %	25 %	0 %	157826612
5036	NC_009883	TAA	2	6	235490	235495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826612
5037	NC_009883	CTC	2	6	235538	235543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157826612
5038	NC_009883	CTT	2	6	235566	235571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826612
5039	NC_009883	GTA	2	6	235588	235593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826612
5040	NC_009883	TTTAA	2	10	235672	235681	40 %	60 %	0 %	0 %	157826612
5041	NC_009883	AGC	2	6	235803	235808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157826612
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5043	NC_009883	AT	3	6	236006	236011	50 %	50 %	0 %	0 %	157826613
5044	NC_009883	TTA	2	6	236012	236017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826613
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5046	NC_009883	TAA	2	6	236076	236081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826613
5047	NC_009883	GCTC	2	8	236114	236121	0 %	25 %	25 %	50 %	157826613
5048	NC_009883	AATT	2	8	236131	236138	50 %	50 %	0 %	0 %	157826613
5049	NC_009883	TCA	2	6	236297	236302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157826613
5050	NC_009883	T	7	7	236319	236325	0 %	100 %	0 %	0 %	157826613
5051	NC_009883	TTG	2	6	236340	236345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826614
5052	NC_009883	ATA	2	6	236368	236373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826614
5053	NC_009883	A	6	6	236379	236384	100 %	0 %	0 %	0 %	157826614
5054	NC_009883	TATAA	2	10	236385	236394	60 %	40 %	0 %	0 %	157826614
5055	NC_009883	TGA	2	6	236429	236434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826614
5056	NC_009883	GCTG	2	8	236469	236476	0 %	25 %	50 %	25 %	157826614
5057	NC_009883	TAT	2	6	236510	236515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826614
5058	NC_009883	TAA	2	6	236524	236529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826614
5059	NC_009883	AAT	2	6	236543	236548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826614
5060	NC_009883	TCT	2	6	236577	236582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157826614
5061	NC_009883	TAT	2	6	236594	236599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157826614
5062	NC_009883	TAG	2	6	236615	236620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826614
5063	NC_009883	AAT	2	6	236622	236627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826614
5064	NC_009883	CCA	2	6	236660	236665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157826614
5065	NC_009883	TAGC	2	8	236736	236743	25 %	25 %	25 %	25 %	157826614
5066	NC_009883	GCAA	2	8	236751	236758	50 %	0 %	25 %	25 %	157826614
5067	NC_009883	TAG	2	6	236767	236772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826614
5068	NC_009883	AGGC	2	8	236839	236846	25 %	0 %	50 %	25 %	157826614
5069	NC_009883	ACAT	2	8	236853	236860	50 %	25 %	0 %	25 %	157826614
5070	NC_009883	TACG	2	8	236863	236870	25 %	25 %	25 %	25 %	157826614
5071	NC_009883	TTG	2	6	236879	236884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157826614
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5074	NC_009883	AAT	2	6	236989	236994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826614
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5093	NC_009883	TGA	2	6	238408	238413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157826615
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5104	NC_009883	AATG	2	8	239026	239033	50 %	25 %	25 %	0 %	157826616
5105	NC_009883	AT	3	6	239045	239050	50 %	50 %	0 %	0 %	157826616
5106	NC_009883	AT	3	6	239068	239073	50 %	50 %	0 %	0 %	157826616
5107	NC_009883	AGA	2	6	239077	239082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157826616
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5109	NC_009883	ATA	2	6	239157	239162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157826616
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5115	NC_009883	TA	3	6	239436	239441	50 %	50 %	0 %	0 %	157826616
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5121	NC_009883	AT	5	10	239585	239594	50 %	50 %	0 %	0 %	157826616
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