MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009881	T	6	6	149386	149391	0 %	100 %	0 %	0 %	157825279
3002	NC_009881	GAT	2	6	149410	149415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825279
3003	NC_009881	TGC	2	6	149548	149553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825279
3004	NC_009881	GGT	2	6	149587	149592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825279
3005	NC_009881	TAGT	2	8	149619	149626	25 %	50 %	25 %	0 %	157825279
3006	NC_009881	ATATA	2	10	149667	149676	60 %	40 %	0 %	0 %	157825279
3007	NC_009881	TTAA	2	8	149741	149748	50 %	50 %	0 %	0 %	157825279
3008	NC_009881	TGCAG	2	10	149755	149764	20 %	20 %	40 %	20 %	157825279
3009	NC_009881	TGTT	2	8	149814	149821	0 %	75 %	25 %	0 %	157825279
3010	NC_009881	TAG	2	6	149880	149885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825279
3011	NC_009881	T	6	6	149887	149892	0 %	100 %	0 %	0 %	157825279
3012	NC_009881	AGA	2	6	149899	149904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825279
3013	NC_009881	T	6	6	149915	149920	0 %	100 %	0 %	0 %	157825279
3014	NC_009881	ATAC	2	8	149922	149929	50 %	25 %	0 %	25 %	157825279
3015	NC_009881	TAAC	2	8	149967	149974	50 %	25 %	0 %	25 %	157825279
3016	NC_009881	GTA	2	6	149975	149980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825279
3017	NC_009881	ATT	3	9	150061	150069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825279
3018	NC_009881	ATT	2	6	150076	150081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825279
3019	NC_009881	TAT	2	6	150112	150117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825279
3020	NC_009881	TTA	2	6	150132	150137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825279
3021	NC_009881	ATA	2	6	150164	150169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825279
3022	NC_009881	ATA	2	6	150227	150232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825279
3023	NC_009881	A	6	6	150246	150251	100 %	0 %	0 %	0 %	157825279
3024	NC_009881	ATT	2	6	150313	150318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825279
3025	NC_009881	AGC	2	6	150354	150359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825279
3026	NC_009881	AGT	3	9	150367	150375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825279
3027	NC_009881	TTG	2	6	150382	150387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825279
3028	NC_009881	TCT	2	6	150523	150528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825279
3029	NC_009881	TAC	2	6	150562	150567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825279
3030	NC_009881	TAT	2	6	150573	150578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825279
3031	NC_009881	TAG	2	6	150627	150632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825279
3032	NC_009881	AGATA	2	10	150778	150787	60 %	20 %	20 %	0 %	157825279
3033	NC_009881	AGG	2	6	150820	150825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825279
3034	NC_009881	ATG	2	6	150861	150866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825279
3035	NC_009881	GAA	2	6	150871	150876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825279
3036	NC_009881	AG	3	6	150883	150888	50 %	0 %	50 %	0 %	157825279
3037	NC_009881	ATT	2	6	151106	151111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825280
3038	NC_009881	TGC	2	6	151123	151128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825280
3039	NC_009881	TGA	2	6	151163	151168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825280
3040	NC_009881	TCT	2	6	151194	151199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825280
3041	NC_009881	AGA	2	6	151211	151216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825280
3042	NC_009881	GTA	2	6	151245	151250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825280
3043	NC_009881	TA	3	6	151317	151322	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3044	NC_009881	ACT	2	6	151392	151397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825280
3045	NC_009881	TCC	2	6	151505	151510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825280
3046	NC_009881	TGC	2	6	151550	151555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825280
3047	NC_009881	TAG	2	6	151664	151669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825280
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3049	NC_009881	ATA	2	6	151783	151788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825280
3050	NC_009881	TAA	2	6	151864	151869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825280
3051	NC_009881	TAT	2	6	151876	151881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825280
3052	NC_009881	CAA	2	6	151914	151919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825280
3053	NC_009881	TA	4	8	151969	151976	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3054	NC_009881	ATT	2	6	152069	152074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825280
3055	NC_009881	T	6	6	152097	152102	0 %	100 %	0 %	0 %	157825280
3056	NC_009881	ATT	2	6	152107	152112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825280
3057	NC_009881	T	6	6	152121	152126	0 %	100 %	0 %	0 %	157825280
3058	NC_009881	TAC	2	6	152146	152151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825280
3059	NC_009881	TAAT	2	8	152155	152162	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3060	NC_009881	CTC	2	6	152215	152220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825280
3061	NC_009881	ATT	2	6	152234	152239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825280
3062	NC_009881	TTG	2	6	152251	152256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825280
3063	NC_009881	TA	4	8	152270	152277	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3064	NC_009881	TCTT	2	8	152311	152318	0 %	75 %	0 %	25 %	157825280
3065	NC_009881	CTA	2	6	152329	152334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825280
3066	NC_009881	TATC	2	8	152336	152343	25 %	50 %	0 %	25 %	157825280
3067	NC_009881	ATTT	2	8	152390	152397	25 %	75 %	0 %	0 %	157825280
3068	NC_009881	TGT	2	6	152404	152409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825280
3069	NC_009881	TCGT	2	8	152420	152427	0 %	50 %	25 %	25 %	157825280
3070	NC_009881	ATC	2	6	152511	152516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825280
3071	NC_009881	AT	3	6	152526	152531	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3072	NC_009881	TGG	2	6	152649	152654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825280
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3075	NC_009881	CAAAG	2	10	152693	152702	60 %	0 %	20 %	20 %	157825280
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3079	NC_009881	TATT	2	8	152909	152916	25 %	75 %	0 %	0 %	157825280
3080	NC_009881	ATTT	2	8	152957	152964	25 %	75 %	0 %	0 %	157825280
3081	NC_009881	ATGCA	2	10	153097	153106	40 %	20 %	20 %	20 %	157825280
3082	NC_009881	ATG	3	9	153147	153155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825280
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3086	NC_009881	AATG	2	8	153251	153258	50 %	25 %	25 %	0 %	157825280
3087	NC_009881	GAAT	2	8	153314	153321	50 %	25 %	25 %	0 %	157825280
3088	NC_009881	TGC	2	6	153374	153379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825280
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3093	NC_009881	GAA	2	6	153843	153848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825280
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3096	NC_009881	AT	3	6	153892	153897	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3097	NC_009881	TAT	2	6	153954	153959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825280
3098	NC_009881	ATG	2	6	153988	153993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825280
3099	NC_009881	ATG	2	6	154029	154034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825280
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3101	NC_009881	AT	3	6	154133	154138	50 %	50 %	0 %	0 %	157825280
3102	NC_009881	TCG	2	6	154139	154144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825280
3103	NC_009881	AGATC	2	10	154229	154238	40 %	20 %	20 %	20 %	157825280
3104	NC_009881	TAA	2	6	154328	154333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825280
3105	NC_009881	TAAA	2	8	154378	154385	75 %	25 %	0 %	0 %	157825280
3106	NC_009881	AAGC	2	8	154398	154405	50 %	0 %	25 %	25 %	157825280
3107	NC_009881	GATC	2	8	154430	154437	25 %	25 %	25 %	25 %	157825280
3108	NC_009881	TAA	2	6	154442	154447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825280
3109	NC_009881	AGA	2	6	154520	154525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825280
3110	NC_009881	AAG	2	6	154693	154698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825281
3111	NC_009881	TAA	2	6	154891	154896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825282
3112	NC_009881	ATA	2	6	154914	154919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825282
3113	NC_009881	A	6	6	154936	154941	100 %	0 %	0 %	0 %	157825282
3114	NC_009881	A	6	6	155006	155011	100 %	0 %	0 %	0 %	157825282
3115	NC_009881	T	7	7	155037	155043	0 %	100 %	0 %	0 %	157825282
3116	NC_009881	ATA	2	6	155057	155062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825282
3117	NC_009881	TAT	2	6	155082	155087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825282
3118	NC_009881	TACG	2	8	155095	155102	25 %	25 %	25 %	25 %	157825282
3119	NC_009881	GAA	2	6	155371	155376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825283
3120	NC_009881	ACA	2	6	155377	155382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825283
3121	NC_009881	TAA	2	6	155385	155390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825283
3122	NC_009881	T	6	6	155398	155403	0 %	100 %	0 %	0 %	157825283
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3493	NC_009881	GAAT	2	8	171337	171344	50 %	25 %	25 %	0 %	157825302
3494	NC_009881	GCT	2	6	171383	171388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825302
3495	NC_009881	GTT	2	6	171431	171436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825302
3496	NC_009881	CAA	2	6	171444	171449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825302
3497	NC_009881	ATTA	2	8	171521	171528	50 %	50 %	0 %	0 %	157825302
3498	NC_009881	T	6	6	171529	171534	0 %	100 %	0 %	0 %	157825302
3499	NC_009881	GAA	2	6	171563	171568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825302
3500	NC_009881	TAT	2	6	171610	171615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825302

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