MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009881	TGCTTG	2	12	563184	563195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	157825695
11002	NC_009881	TAC	2	6	563420	563425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825696
11003	NC_009881	ATG	2	6	563430	563435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825696
11004	NC_009881	T	6	6	563437	563442	0 %	100 %	0 %	0 %	157825696
11005	NC_009881	TAA	2	6	563475	563480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825696
11006	NC_009881	TATCAA	2	12	563484	563495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157825696
11007	NC_009881	ATT	2	6	563775	563780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825697
11008	NC_009881	TGTT	2	8	563787	563794	0 %	75 %	25 %	0 %	157825697
11009	NC_009881	TAA	2	6	563876	563881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825697
11010	NC_009881	CTG	2	6	563938	563943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825697
11011	NC_009881	TCTGC	2	10	563953	563962	0 %	40 %	20 %	40 %	157825697
11012	NC_009881	AAT	2	6	564034	564039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825697
11013	NC_009881	AACT	2	8	564526	564533	50 %	25 %	0 %	25 %	157825698
11014	NC_009881	TTG	2	6	564535	564540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825698
11015	NC_009881	TAA	2	6	564549	564554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825698
11016	NC_009881	AAC	2	6	564573	564578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825698
11017	NC_009881	TAGA	2	8	564654	564661	50 %	25 %	25 %	0 %	157825698
11018	NC_009881	T	6	6	564665	564670	0 %	100 %	0 %	0 %	157825698
11019	NC_009881	CAG	2	6	564683	564688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825698
11020	NC_009881	A	6	6	564830	564835	100 %	0 %	0 %	0 %	157825698
11021	NC_009881	A	6	6	564849	564854	100 %	0 %	0 %	0 %	157825698
11022	NC_009881	TTTATC	2	12	564855	564866	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157825698
11023	NC_009881	AATTA	2	10	564924	564933	60 %	40 %	0 %	0 %	157825698
11024	NC_009881	T	8	8	564978	564985	0 %	100 %	0 %	0 %	157825698
11025	NC_009881	TAA	2	6	565007	565012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825698
11026	NC_009881	T	6	6	565026	565031	0 %	100 %	0 %	0 %	157825698
11027	NC_009881	T	6	6	565153	565158	0 %	100 %	0 %	0 %	157825698
11028	NC_009881	TTC	2	6	565167	565172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825698
11029	NC_009881	ATG	2	6	565176	565181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825698
11030	NC_009881	TAA	2	6	565268	565273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825698
11031	NC_009881	TA	3	6	565338	565343	50 %	50 %	0 %	0 %	157825698
11032	NC_009881	ATTT	2	8	565419	565426	25 %	75 %	0 %	0 %	157825698
11033	NC_009881	AAG	2	6	565436	565441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825698
11034	NC_009881	T	6	6	565460	565465	0 %	100 %	0 %	0 %	157825698
11035	NC_009881	TTG	2	6	565500	565505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157825698
11036	NC_009881	ATA	2	6	565531	565536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825698
11037	NC_009881	T	6	6	565691	565696	0 %	100 %	0 %	0 %	157825699
11038	NC_009881	TTC	2	6	565698	565703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825699
11039	NC_009881	T	6	6	565736	565741	0 %	100 %	0 %	0 %	157825699
11040	NC_009881	CTT	2	6	565757	565762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825699
11041	NC_009881	AGCT	2	8	565769	565776	25 %	25 %	25 %	25 %	157825699
11042	NC_009881	T	6	6	565797	565802	0 %	100 %	0 %	0 %	157825699
11043	NC_009881	ATT	2	6	565804	565809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825699
11044	NC_009881	TCT	2	6	565837	565842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825699
11045	NC_009881	AG	3	6	565843	565848	50 %	0 %	50 %	0 %	157825699
11046	NC_009881	GAAA	2	8	565865	565872	75 %	0 %	25 %	0 %	157825699
11047	NC_009881	TTA	2	6	565915	565920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825699
11048	NC_009881	ATAAA	2	10	565942	565951	80 %	20 %	0 %	0 %	157825699
11049	NC_009881	TAT	2	6	565979	565984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825699
11050	NC_009881	TGATT	2	10	565996	566005	20 %	60 %	20 %	0 %	157825699
11051	NC_009881	T	6	6	566013	566018	0 %	100 %	0 %	0 %	157825699
11052	NC_009881	AAATA	2	10	566025	566034	80 %	20 %	0 %	0 %	157825699
11053	NC_009881	AATT	2	8	566532	566539	50 %	50 %	0 %	0 %	157825700
11054	NC_009881	TTGTTA	2	12	566570	566581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157825700
11055	NC_009881	TTA	2	6	566593	566598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825700
11056	NC_009881	TAT	2	6	566670	566675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825700
11057	NC_009881	GAT	2	6	566703	566708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825700
11058	NC_009881	A	7	7	566793	566799	100 %	0 %	0 %	0 %	157825700
11059	NC_009881	A	6	6	566824	566829	100 %	0 %	0 %	0 %	157825700
11060	NC_009881	GGA	2	6	566844	566849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825700
11061	NC_009881	ATA	2	6	566855	566860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825700
11062	NC_009881	TGAT	2	8	566945	566952	25 %	50 %	25 %	0 %	157825700
11063	NC_009881	A	6	6	567026	567031	100 %	0 %	0 %	0 %	157825700
11064	NC_009881	ATT	2	6	567060	567065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825700
11065	NC_009881	ATA	2	6	567104	567109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825700
11066	NC_009881	CTTG	2	8	567151	567158	0 %	50 %	25 %	25 %	157825700
11067	NC_009881	TGC	2	6	567183	567188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825700
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11070	NC_009881	TAATA	2	10	567270	567279	60 %	40 %	0 %	0 %	157825700
11071	NC_009881	TAT	3	9	567316	567324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825700
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11075	NC_009881	ATA	2	6	567389	567394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825701
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11079	NC_009881	AAT	2	6	567506	567511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825701
11080	NC_009881	TTA	2	6	567614	567619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825701
11081	NC_009881	TAC	2	6	567626	567631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825701
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11083	NC_009881	AGTA	2	8	567697	567704	50 %	25 %	25 %	0 %	157825701
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11088	NC_009881	GATGA	2	10	568085	568094	40 %	20 %	40 %	0 %	157825701
11089	NC_009881	AATT	2	8	568245	568252	50 %	50 %	0 %	0 %	157825701
11090	NC_009881	GCA	2	6	568313	568318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825701
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11092	NC_009881	AAG	2	6	568406	568411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825701
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11094	NC_009881	AC	3	6	568491	568496	50 %	0 %	0 %	50 %	157825701
11095	NC_009881	AGA	2	6	568540	568545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825701
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11097	NC_009881	GT	4	8	568558	568565	0 %	50 %	50 %	0 %	157825701
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11101	NC_009881	A	6	6	568800	568805	100 %	0 %	0 %	0 %	157825702
11102	NC_009881	ATA	2	6	568881	568886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825702
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11105	NC_009881	GAG	2	6	569013	569018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825702
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11107	NC_009881	TTA	2	6	569181	569186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825702
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11109	NC_009881	T	6	6	569388	569393	0 %	100 %	0 %	0 %	157825702
11110	NC_009881	CTT	2	6	569429	569434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825702
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11113	NC_009881	T	6	6	569637	569642	0 %	100 %	0 %	0 %	157825702
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11118	NC_009881	AT	3	6	569863	569868	50 %	50 %	0 %	0 %	157825703
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11120	NC_009881	TAT	2	6	570043	570048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825703
11121	NC_009881	A	6	6	570057	570062	100 %	0 %	0 %	0 %	157825703
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