MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia akari str. Hartford chromosome

Total Repeats: 23665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009881	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825126
2	NC_009881	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825126
3	NC_009881	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825126
4	NC_009881	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825126
5	NC_009881	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	157825126
6	NC_009881	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825126
7	NC_009881	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825126
8	NC_009881	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825126
9	NC_009881	TAAT	2	8	587	594	50 %	50 %	0 %	0 %	157825126
10	NC_009881	A	7	7	719	725	100 %	0 %	0 %	0 %	157825126
11	NC_009881	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	157825126
12	NC_009881	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825126
13	NC_009881	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825126
14	NC_009881	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	157825126
15	NC_009881	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	157825126
16	NC_009881	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825126
17	NC_009881	A	6	6	959	964	100 %	0 %	0 %	0 %	157825127
18	NC_009881	ATTA	2	8	976	983	50 %	50 %	0 %	0 %	157825127
19	NC_009881	ACA	2	6	1026	1031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825127
20	NC_009881	CAT	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825127
21	NC_009881	TAACG	2	10	1074	1083	40 %	20 %	20 %	20 %	157825127
22	NC_009881	ATA	2	6	1180	1185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825127
23	NC_009881	AAAGTA	2	12	1213	1224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157825127
24	NC_009881	TGA	2	6	1239	1244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825127
25	NC_009881	TTC	2	6	1257	1262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825127
26	NC_009881	GTA	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825127
27	NC_009881	GCA	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825127
28	NC_009881	A	7	7	1343	1349	100 %	0 %	0 %	0 %	157825127
29	NC_009881	CT	3	6	1350	1355	0 %	50 %	0 %	50 %	157825127
30	NC_009881	TAA	2	6	1368	1373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825127
31	NC_009881	T	6	6	1481	1486	0 %	100 %	0 %	0 %	157825128
32	NC_009881	A	6	6	1491	1496	100 %	0 %	0 %	0 %	157825128
33	NC_009881	AAG	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825128
34	NC_009881	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	157825128
35	NC_009881	CT	3	6	1601	1606	0 %	50 %	0 %	50 %	157825128
36	NC_009881	AT	3	6	1626	1631	50 %	50 %	0 %	0 %	157825128
37	NC_009881	TGC	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825128
38	NC_009881	TA	3	6	1744	1749	50 %	50 %	0 %	0 %	157825128
39	NC_009881	ATA	3	9	1747	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825128
40	NC_009881	TAA	2	6	1814	1819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825128
41	NC_009881	A	6	6	1835	1840	100 %	0 %	0 %	0 %	157825128
42	NC_009881	TGA	2	6	1913	1918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825128
43	NC_009881	GCA	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825128
44	NC_009881	TTAAT	2	10	1960	1969	40 %	60 %	0 %	0 %	157825128
45	NC_009881	AAT	2	6	2000	2005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825128
46	NC_009881	TCA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825128
47	NC_009881	AGA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825128
48	NC_009881	GA	3	6	2043	2048	50 %	0 %	50 %	0 %	157825128
49	NC_009881	CAA	3	9	2118	2126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157825128
50	NC_009881	T	8	8	2150	2157	0 %	100 %	0 %	0 %	157825129
51	NC_009881	A	6	6	2160	2165	100 %	0 %	0 %	0 %	157825129
52	NC_009881	T	6	6	2225	2230	0 %	100 %	0 %	0 %	157825129
53	NC_009881	T	6	6	2285	2290	0 %	100 %	0 %	0 %	157825129
54	NC_009881	T	6	6	2294	2299	0 %	100 %	0 %	0 %	157825129
55	NC_009881	GA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	50 %	0 %	157825129
56	NC_009881	CGG	2	6	2339	2344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157825129
57	NC_009881	AGC	2	6	2370	2375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825129
58	NC_009881	ATA	2	6	2415	2420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825129
59	NC_009881	A	7	7	2420	2426	100 %	0 %	0 %	0 %	157825129
60	NC_009881	T	7	7	2444	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	157825129
61	NC_009881	TA	3	6	2476	2481	50 %	50 %	0 %	0 %	157825129
62	NC_009881	TTTTA	2	10	2516	2525	20 %	80 %	0 %	0 %	157825129
63	NC_009881	TAA	2	6	2584	2589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825129
64	NC_009881	TG	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	157825129
65	NC_009881	TTAT	2	8	2677	2684	25 %	75 %	0 %	0 %	157825129
66	NC_009881	A	7	7	2730	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	157825129
67	NC_009881	TTC	2	6	2757	2762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825129
68	NC_009881	ATG	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825129
69	NC_009881	CATT	2	8	2845	2852	25 %	50 %	0 %	25 %	157825129
70	NC_009881	ATTTA	2	10	2869	2878	40 %	60 %	0 %	0 %	157825129
71	NC_009881	A	6	6	2892	2897	100 %	0 %	0 %	0 %	157825129
72	NC_009881	TTAT	2	8	2899	2906	25 %	75 %	0 %	0 %	157825129
73	NC_009881	A	6	6	2963	2968	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
74	NC_009881	CTC	2	6	3045	3050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157825130
75	NC_009881	TAT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
76	NC_009881	ATT	2	6	3069	3074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
77	NC_009881	T	6	6	3112	3117	0 %	100 %	0 %	0 %	157825130
78	NC_009881	ATT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
79	NC_009881	A	7	7	3226	3232	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
80	NC_009881	A	6	6	3243	3248	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
81	NC_009881	CTAA	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	157825130
82	NC_009881	ATT	2	6	3335	3340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
83	NC_009881	AGA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
84	NC_009881	CCA	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157825130
85	NC_009881	GAT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
86	NC_009881	A	7	7	3591	3597	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
87	NC_009881	GA	3	6	3599	3604	50 %	0 %	50 %	0 %	157825130
88	NC_009881	T	6	6	3628	3633	0 %	100 %	0 %	0 %	157825130
89	NC_009881	ATT	2	6	3663	3668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
90	NC_009881	TATT	2	8	3670	3677	25 %	75 %	0 %	0 %	157825130
91	NC_009881	GAT	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
92	NC_009881	A	6	6	3771	3776	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
93	NC_009881	AGA	2	6	3955	3960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
94	NC_009881	AT	3	6	3989	3994	50 %	50 %	0 %	0 %	157825130
95	NC_009881	CTT	2	6	3998	4003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157825130
96	NC_009881	CTA	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825130
97	NC_009881	TAT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
98	NC_009881	TTA	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
99	NC_009881	TGG	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825130
100	NC_009881	AT	3	6	4299	4304	50 %	50 %	0 %	0 %	157825130
101	NC_009881	AG	3	6	4318	4323	50 %	0 %	50 %	0 %	157825130
102	NC_009881	ATA	2	6	4326	4331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
103	NC_009881	A	6	6	4376	4381	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
104	NC_009881	CTAATA	2	12	4536	4547	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157825130
105	NC_009881	ATA	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
106	NC_009881	GGT	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157825130
107	NC_009881	GCA	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157825130
108	NC_009881	TA	3	6	4658	4663	50 %	50 %	0 %	0 %	157825130
109	NC_009881	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
110	NC_009881	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
111	NC_009881	AAG	2	6	4731	4736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
112	NC_009881	AAT	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
113	NC_009881	GAA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
114	NC_009881	GGA	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157825130
115	NC_009881	TAT	2	6	4793	4798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
116	NC_009881	TAAAT	2	10	4828	4837	60 %	40 %	0 %	0 %	157825130
117	NC_009881	AT	3	6	4850	4855	50 %	50 %	0 %	0 %	157825130
118	NC_009881	AAG	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
119	NC_009881	TAA	2	6	4993	4998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
120	NC_009881	AAAT	2	8	5104	5111	75 %	25 %	0 %	0 %	157825130
121	NC_009881	GTAGT	2	10	5148	5157	20 %	40 %	40 %	0 %	157825130
122	NC_009881	AAG	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157825130
123	NC_009881	ATG	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
124	NC_009881	ATA	2	6	5214	5219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
125	NC_009881	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
126	NC_009881	TAA	2	6	5287	5292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
127	NC_009881	AATA	2	8	5293	5300	75 %	25 %	0 %	0 %	157825130
128	NC_009881	GAT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
129	NC_009881	CGC	2	6	5337	5342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157825130
130	NC_009881	TGC	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157825130
131	NC_009881	T	6	6	5372	5377	0 %	100 %	0 %	0 %	157825130
132	NC_009881	ATT	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
133	NC_009881	CTA	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157825130
134	NC_009881	AGT	2	6	5533	5538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157825130
135	NC_009881	A	7	7	5582	5588	100 %	0 %	0 %	0 %	157825130
136	NC_009881	ATT	2	6	5591	5596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
137	NC_009881	TTA	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157825130
138	NC_009881	ATA	2	6	5646	5651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157825130
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