MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 113938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009767	TGC	2	6	647297	647302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740520
13002	NC_009767	CGT	2	6	647317	647322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740520
13003	NC_009767	TTC	2	6	647366	647371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156740520
13004	NC_009767	CTG	2	6	647398	647403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740520
13005	NC_009767	TCA	2	6	647406	647411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740520
13006	NC_009767	GGT	2	6	647464	647469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740520
13007	NC_009767	CGA	2	6	647523	647528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740520
13008	NC_009767	CCG	2	6	647531	647536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740520
13009	NC_009767	CTGC	2	8	647557	647564	0 %	25 %	25 %	50 %	156740520
13010	NC_009767	TGA	2	6	648414	648419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740521
13011	NC_009767	CTC	2	6	648449	648454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740521
13012	NC_009767	CAGC	2	8	648463	648470	25 %	0 %	25 %	50 %	156740521
13013	NC_009767	CGC	2	6	648486	648491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740521
13014	NC_009767	CTGCGC	2	12	648495	648506	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	156740521
13015	NC_009767	GTC	2	6	648515	648520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740521
13016	NC_009767	CGC	2	6	648531	648536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740521
13017	NC_009767	GC	3	6	648562	648567	0 %	0 %	50 %	50 %	156740521
13018	NC_009767	GC	3	6	648634	648639	0 %	0 %	50 %	50 %	156740521
13019	NC_009767	ACAG	2	8	648679	648686	50 %	0 %	25 %	25 %	156740521
13020	NC_009767	CGA	2	6	648706	648711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740521
13021	NC_009767	CCG	2	6	648735	648740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740521
13022	NC_009767	CGG	2	6	648789	648794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740521
13023	NC_009767	GGC	2	6	648919	648924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740521
13024	NC_009767	CGA	2	6	648928	648933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740521
13025	NC_009767	GCG	2	6	648974	648979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740521
13026	NC_009767	GCC	2	6	649024	649029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740521
13027	NC_009767	CAG	2	6	649046	649051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740521
13028	NC_009767	CTGC	2	8	649080	649087	0 %	25 %	25 %	50 %	156740521
13029	NC_009767	TCG	2	6	649152	649157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740521
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13031	NC_009767	AGA	2	6	649275	649280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156740521
13032	NC_009767	CTG	2	6	649316	649321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740521
13033	NC_009767	CGGCAG	2	12	649467	649478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	156740521
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13037	NC_009767	CGGGG	2	10	649866	649875	0 %	0 %	80 %	20 %	156740521
13038	NC_009767	GGCG	2	8	649889	649896	0 %	0 %	75 %	25 %	156740521
13039	NC_009767	CGTG	2	8	649921	649928	0 %	25 %	50 %	25 %	156740521
13040	NC_009767	CGA	2	6	649942	649947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740521
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13044	NC_009767	CTG	2	6	650107	650112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740521
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13050	NC_009767	TGC	2	6	650279	650284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740522
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13053	NC_009767	GAT	2	6	650337	650342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740522
13054	NC_009767	CCCG	2	8	650378	650385	0 %	0 %	25 %	75 %	156740522
13055	NC_009767	CGG	2	6	650397	650402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740522
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13060	NC_009767	CGT	2	6	650564	650569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740522
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13089	NC_009767	CTG	2	6	654017	654022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740524
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13092	NC_009767	GC	3	6	654100	654105	0 %	0 %	50 %	50 %	156740524
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13475	NC_009767	C	6	6	671945	671950	0 %	0 %	0 %	100 %	156740535
13476	NC_009767	GAT	2	6	671965	671970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156740535
13477	NC_009767	TCCGA	2	10	672017	672026	20 %	20 %	20 %	40 %	156740535
13478	NC_009767	GCG	2	6	672050	672055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740535
13479	NC_009767	GGC	2	6	672106	672111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740535
13480	NC_009767	CGG	2	6	672175	672180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740535
13481	NC_009767	ATC	2	6	672206	672211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740535
13482	NC_009767	CTG	2	6	672229	672234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740535
13483	NC_009767	CG	3	6	672278	672283	0 %	0 %	50 %	50 %	156740535
13484	NC_009767	CTG	2	6	672312	672317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156740535
13485	NC_009767	AGC	3	9	672378	672386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740535
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13487	NC_009767	CCG	2	6	672413	672418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740535
13488	NC_009767	TAC	2	6	672443	672448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156740535
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13490	NC_009767	CCT	2	6	672577	672582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740535
13491	NC_009767	CTC	2	6	672632	672637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156740535
13492	NC_009767	GCA	2	6	672834	672839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156740536
13493	NC_009767	GTG	2	6	672847	672852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156740536
13494	NC_009767	CT	3	6	672857	672862	0 %	50 %	0 %	50 %	156740536
13495	NC_009767	GCG	2	6	672872	672877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740536
13496	NC_009767	GCC	2	6	672946	672951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156740536
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13498	NC_009767	CG	3	6	673017	673022	0 %	0 %	50 %	50 %	156740536
13499	NC_009767	GCG	2	6	673198	673203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156740536
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