MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009523	CGA	2	6	640694	640699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13002	NC_009523	GCG	2	6	640704	640709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654675
13003	NC_009523	CAC	2	6	640764	640769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654675
13004	NC_009523	GATC	2	8	640772	640779	25 %	25 %	25 %	25 %	148654675
13005	NC_009523	CGA	2	6	640820	640825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13006	NC_009523	TGT	2	6	640861	640866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654675
13007	NC_009523	GTTC	2	8	640876	640883	0 %	50 %	25 %	25 %	148654675
13008	NC_009523	CAG	2	6	640899	640904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13009	NC_009523	GAT	2	6	640925	640930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654675
13010	NC_009523	TTG	2	6	640972	640977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654675
13011	NC_009523	GCC	2	6	640985	640990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654675
13012	NC_009523	CGCA	2	8	641046	641053	25 %	0 %	25 %	50 %	148654675
13013	NC_009523	GTC	2	6	641148	641153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13014	NC_009523	GCCA	2	8	641233	641240	25 %	0 %	25 %	50 %	148654675
13015	NC_009523	CGCGGA	2	12	641318	641329	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654675
13016	NC_009523	CGT	2	6	641386	641391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13017	NC_009523	GCC	2	6	641401	641406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654675
13018	NC_009523	GTC	2	6	641447	641452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13019	NC_009523	GCA	2	6	641471	641476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13020	NC_009523	GCG	2	6	641477	641482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654675
13021	NC_009523	GTC	2	6	641632	641637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13022	NC_009523	GCC	2	6	641661	641666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654675
13023	NC_009523	GAC	2	6	641685	641690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654675
13024	NC_009523	GC	3	6	641691	641696	0 %	0 %	50 %	50 %	148654675
13025	NC_009523	GCCGC	2	10	641805	641814	0 %	0 %	40 %	60 %	148654676
13026	NC_009523	CCG	2	6	641829	641834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
13027	NC_009523	TGA	2	6	641886	641891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654676
13028	NC_009523	GATC	2	8	641964	641971	25 %	25 %	25 %	25 %	148654676
13029	NC_009523	CCG	2	6	641996	642001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
13030	NC_009523	CGA	2	6	642018	642023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654676
13031	NC_009523	GC	3	6	642060	642065	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
13032	NC_009523	GTC	2	6	642094	642099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654676
13033	NC_009523	GCC	2	6	642142	642147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
13034	NC_009523	CAT	2	6	642177	642182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654676
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13036	NC_009523	TCGC	2	8	642220	642227	0 %	25 %	25 %	50 %	148654676
13037	NC_009523	GC	3	6	642244	642249	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
13038	NC_009523	GATC	2	8	642288	642295	25 %	25 %	25 %	25 %	148654676
13039	NC_009523	CGC	2	6	642321	642326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
13040	NC_009523	CG	3	6	642355	642360	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
13041	NC_009523	TGC	3	9	642375	642383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654676
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13043	NC_009523	CGC	2	6	642486	642491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
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13045	NC_009523	TTC	2	6	642535	642540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654676
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13049	NC_009523	GC	3	6	642627	642632	0 %	0 %	50 %	50 %	148654676
13050	NC_009523	TGG	2	6	642645	642650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654676
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13052	NC_009523	CCG	2	6	642723	642728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654676
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13054	NC_009523	GCA	2	6	642795	642800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654676
13055	NC_009523	GCAT	2	8	642815	642822	25 %	25 %	25 %	25 %	148654676
13056	NC_009523	AACC	2	8	642840	642847	50 %	0 %	0 %	50 %	148654676
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13060	NC_009523	GCA	3	9	642934	642942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654677
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13062	NC_009523	CCG	2	6	643019	643024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654677
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13069	NC_009523	GCA	2	6	643445	643450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654678
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13104	NC_009523	GC	3	6	645431	645436	0 %	0 %	50 %	50 %	148654680
13105	NC_009523	GCT	2	6	645494	645499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654680
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13109	NC_009523	GC	3	6	645547	645552	0 %	0 %	50 %	50 %	148654680
13110	NC_009523	CGG	2	6	645554	645559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654680
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13113	NC_009523	CGT	2	6	645624	645629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654680
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13117	NC_009523	ACG	2	6	645757	645762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654680
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13239	NC_009523	CCG	2	6	651170	651175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654687
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13242	NC_009523	GCA	2	6	651276	651281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654687
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13345	NC_009523	ATC	2	6	655921	655926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654690
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13354	NC_009523	ACG	2	6	656307	656312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654691
13355	NC_009523	GAT	2	6	656314	656319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654691
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13357	NC_009523	TGC	2	6	656415	656420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654691
13358	NC_009523	GCG	2	6	656502	656507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654691
13359	NC_009523	TCG	2	6	656600	656605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654691
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13470	NC_009523	CGCCC	2	10	662394	662403	0 %	0 %	20 %	80 %	148654697
13471	NC_009523	CCCG	2	8	662415	662422	0 %	0 %	25 %	75 %	148654697
13472	NC_009523	GCAACC	2	12	662458	662469	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148654697
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13475	NC_009523	ATC	2	6	662672	662677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654697
13476	NC_009523	TGG	2	6	662721	662726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654697
13477	NC_009523	CCG	2	6	662783	662788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654697
13478	NC_009523	GCG	3	9	662802	662810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654697
13479	NC_009523	ATC	2	6	662816	662821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654697
13480	NC_009523	GCG	2	6	662844	662849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654697
13481	NC_009523	GA	3	6	662929	662934	50 %	0 %	50 %	0 %	148654697
13482	NC_009523	CGA	2	6	662941	662946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654697
13483	NC_009523	GATC	2	8	662986	662993	25 %	25 %	25 %	25 %	148654697
13484	NC_009523	CCG	2	6	662994	662999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654697
13485	NC_009523	CT	3	6	663003	663008	0 %	50 %	0 %	50 %	148654697
13486	NC_009523	CGTC	2	8	663018	663025	0 %	25 %	25 %	50 %	148654697
13487	NC_009523	CGA	2	6	663049	663054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654697
13488	NC_009523	CTC	2	6	663076	663081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654697
13489	NC_009523	TAC	2	6	663146	663151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654697
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13491	NC_009523	ACT	2	6	663276	663281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654697
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13496	NC_009523	CAGG	2	8	663524	663531	25 %	0 %	50 %	25 %	148654697
13497	NC_009523	GC	3	6	663714	663719	0 %	0 %	50 %	50 %	148654698
13498	NC_009523	GCT	2	6	663754	663759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654698
13499	NC_009523	TTG	2	6	663788	663793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654698
13500	NC_009523	AC	3	6	663836	663841	50 %	0 %	0 %	50 %	148654698

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