MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_009523	GTA	2	6	593574	593579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654636
12002	NC_009523	TTTC	2	8	593639	593646	0 %	75 %	0 %	25 %	148654636
12003	NC_009523	TCC	2	6	593653	593658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654636
12004	NC_009523	TTG	2	6	593708	593713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654636
12005	NC_009523	ACGA	2	8	593733	593740	50 %	0 %	25 %	25 %	148654636
12006	NC_009523	GTT	2	6	593825	593830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654636
12007	NC_009523	GC	3	6	593845	593850	0 %	0 %	50 %	50 %	148654636
12008	NC_009523	TCT	2	6	593926	593931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654636
12009	NC_009523	CGA	2	6	593942	593947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654636
12010	NC_009523	TGCG	2	8	593949	593956	0 %	25 %	50 %	25 %	148654636
12011	NC_009523	TGC	2	6	594001	594006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654636
12012	NC_009523	CTAT	2	8	594040	594047	25 %	50 %	0 %	25 %	148654636
12013	NC_009523	TCGC	2	8	594086	594093	0 %	25 %	25 %	50 %	148654636
12014	NC_009523	CAA	2	6	594111	594116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654636
12015	NC_009523	GCA	3	9	594127	594135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654636
12016	NC_009523	CAT	2	6	594219	594224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654637
12017	NC_009523	AGA	2	6	594225	594230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654637
12018	NC_009523	TGCG	2	8	594308	594315	0 %	25 %	50 %	25 %	148654637
12019	NC_009523	GATC	2	8	594345	594352	25 %	25 %	25 %	25 %	148654637
12020	NC_009523	T	7	7	594390	594396	0 %	100 %	0 %	0 %	148654637
12021	NC_009523	CTG	2	6	594403	594408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654637
12022	NC_009523	TCA	2	6	594411	594416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654637
12023	NC_009523	TTG	2	6	594431	594436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654637
12024	NC_009523	TCCG	2	8	594482	594489	0 %	25 %	25 %	50 %	148654637
12025	NC_009523	CAG	2	6	594520	594525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654637
12026	NC_009523	TTCG	2	8	594588	594595	0 %	50 %	25 %	25 %	148654637
12027	NC_009523	TCTTG	2	10	594597	594606	0 %	60 %	20 %	20 %	148654637
12028	NC_009523	TGG	2	6	594681	594686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654637
12029	NC_009523	CCGAC	2	10	594750	594759	20 %	0 %	20 %	60 %	148654637
12030	NC_009523	TCA	2	6	594795	594800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654637
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12032	NC_009523	TTG	2	6	594931	594936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654637
12033	NC_009523	GAT	2	6	595048	595053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654637
12034	NC_009523	GAGG	2	8	595085	595092	25 %	0 %	75 %	0 %	148654637
12035	NC_009523	ACA	2	6	595112	595117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654638
12036	NC_009523	TGC	2	6	595131	595136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654638
12037	NC_009523	GC	3	6	595160	595165	0 %	0 %	50 %	50 %	148654638
12038	NC_009523	CTT	2	6	595170	595175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654638
12039	NC_009523	GAAC	2	8	595186	595193	50 %	0 %	25 %	25 %	148654638
12040	NC_009523	TG	3	6	595282	595287	0 %	50 %	50 %	0 %	148654638
12041	NC_009523	GCC	2	6	595293	595298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654638
12042	NC_009523	CCCTC	2	10	595321	595330	0 %	20 %	0 %	80 %	148654638
12043	NC_009523	TG	3	6	595339	595344	0 %	50 %	50 %	0 %	148654638
12044	NC_009523	CTC	2	6	595387	595392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654638
12045	NC_009523	TGC	2	6	595437	595442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654638
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12048	NC_009523	TCT	2	6	595527	595532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654638
12049	NC_009523	G	6	6	595585	595590	0 %	0 %	100 %	0 %	148654638
12050	NC_009523	TCG	2	6	595632	595637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654638
12051	NC_009523	GCG	2	6	595765	595770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654638
12052	NC_009523	GCGTT	2	10	595784	595793	0 %	40 %	40 %	20 %	148654638
12053	NC_009523	CCG	2	6	595795	595800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654638
12054	NC_009523	GGC	2	6	595808	595813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654638
12055	NC_009523	TGC	2	6	595826	595831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654638
12056	NC_009523	GTAT	2	8	595874	595881	25 %	50 %	25 %	0 %	148654638
12057	NC_009523	CCG	2	6	595900	595905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654638
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12061	NC_009523	TC	3	6	596192	596197	0 %	50 %	0 %	50 %	148654639
12062	NC_009523	TGGG	2	8	596198	596205	0 %	25 %	75 %	0 %	148654639
12063	NC_009523	ACT	2	6	596214	596219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654639
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12065	NC_009523	ATT	2	6	596329	596334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654639
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12088	NC_009523	TGGG	2	8	597331	597338	0 %	25 %	75 %	0 %	148654639
12089	NC_009523	GC	3	6	597386	597391	0 %	0 %	50 %	50 %	148654639
12090	NC_009523	ACG	2	6	597426	597431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654639
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12102	NC_009523	GCA	2	6	598169	598174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654640
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12110	NC_009523	AT	3	6	598596	598601	50 %	50 %	0 %	0 %	148654640
12111	NC_009523	TCG	2	6	598633	598638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654640
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12115	NC_009523	GCAC	2	8	598864	598871	25 %	0 %	25 %	50 %	148654640
12116	NC_009523	CGC	2	6	598925	598930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654640
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12248	NC_009523	GCAG	2	8	605594	605601	25 %	0 %	50 %	25 %	148654645
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12351	NC_009523	GCG	2	6	610746	610751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654651
12352	NC_009523	CG	3	6	610753	610758	0 %	0 %	50 %	50 %	148654651
12353	NC_009523	CTC	2	6	610788	610793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654651
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12355	NC_009523	CGG	2	6	610967	610972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654651
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12359	NC_009523	GGT	2	6	611099	611104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654651
12360	NC_009523	GTT	2	6	611114	611119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654651
12361	NC_009523	CGA	2	6	611124	611129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654651
12362	NC_009523	GC	3	6	611134	611139	0 %	0 %	50 %	50 %	148654651
12363	NC_009523	CGC	2	6	611152	611157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654651
12364	NC_009523	CTT	2	6	611335	611340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654652
12365	NC_009523	CTCACA	2	12	611341	611352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148654652
12366	NC_009523	CTC	2	6	611362	611367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654652
12367	NC_009523	CTC	2	6	611389	611394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654652
12368	NC_009523	CGAC	2	8	611425	611432	25 %	0 %	25 %	50 %	148654652
12369	NC_009523	GA	3	6	611441	611446	50 %	0 %	50 %	0 %	148654652
12370	NC_009523	CG	3	6	611478	611483	0 %	0 %	50 %	50 %	148654652
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12434	NC_009523	GC	3	6	614344	614349	0 %	0 %	50 %	50 %	148654653
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12465	NC_009523	CAG	2	6	615427	615432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654653
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12471	NC_009523	GCGCG	2	10	615609	615618	0 %	0 %	60 %	40 %	148654653
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12479	NC_009523	AGC	2	6	615994	615999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654654
12480	NC_009523	TGG	2	6	616015	616020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654654
12481	NC_009523	GATC	2	8	616041	616048	25 %	25 %	25 %	25 %	148654654
12482	NC_009523	TGC	2	6	616055	616060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654654
12483	NC_009523	TGCGC	2	10	616079	616088	0 %	20 %	40 %	40 %	148654654
12484	NC_009523	GTATG	2	10	616164	616173	20 %	40 %	40 %	0 %	148654654
12485	NC_009523	TGC	2	6	616179	616184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654654
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12487	NC_009523	GCT	2	6	616254	616259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654654
12488	NC_009523	GCGAC	2	10	616297	616306	20 %	0 %	40 %	40 %	148654654
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12490	NC_009523	C	6	6	616343	616348	0 %	0 %	0 %	100 %	148654654
12491	NC_009523	GAA	2	6	616372	616377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654654
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12495	NC_009523	GC	4	8	616595	616602	0 %	0 %	50 %	50 %	148654654
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12499	NC_009523	CGA	2	6	616820	616825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654654
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