MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
114001	NC_009523	TCCA	2	8	5607744	5607751	25 %	25 %	0 %	50 %	148658548
114002	NC_009523	CGC	2	6	5607752	5607757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658548
114003	NC_009523	CACC	2	8	5607785	5607792	25 %	0 %	0 %	75 %	148658548
114004	NC_009523	CGA	2	6	5607803	5607808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658548
114005	NC_009523	GCG	2	6	5607829	5607834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658548
114006	NC_009523	GCGCCG	2	12	5607847	5607858	0 %	0 %	50 %	50 %	148658548
114007	NC_009523	ACC	2	6	5607864	5607869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658548
114008	NC_009523	GAA	2	6	5607919	5607924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658548
114009	NC_009523	GGC	2	6	5608090	5608095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658548
114010	NC_009523	ATG	2	6	5608195	5608200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658549
114011	NC_009523	CAG	2	6	5608202	5608207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114012	NC_009523	GA	3	6	5608225	5608230	50 %	0 %	50 %	0 %	148658549
114013	NC_009523	GC	3	6	5608261	5608266	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114014	NC_009523	GC	3	6	5608304	5608309	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114015	NC_009523	GAA	2	6	5608368	5608373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658549
114016	NC_009523	GC	3	6	5608399	5608404	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114017	NC_009523	GC	3	6	5608421	5608426	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114018	NC_009523	AAC	2	6	5608429	5608434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658549
114019	NC_009523	TGC	2	6	5608462	5608467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114020	NC_009523	TGGC	2	8	5608471	5608478	0 %	25 %	50 %	25 %	148658549
114021	NC_009523	CCG	2	6	5608505	5608510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114022	NC_009523	GGTG	2	8	5608511	5608518	0 %	25 %	75 %	0 %	148658549
114023	NC_009523	CAG	2	6	5608538	5608543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114024	NC_009523	CTG	2	6	5608554	5608559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114025	NC_009523	GC	3	6	5608677	5608682	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114026	NC_009523	CGC	2	6	5608691	5608696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114027	NC_009523	CCG	2	6	5608714	5608719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114028	NC_009523	TCG	2	6	5608727	5608732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114029	NC_009523	TGC	2	6	5608771	5608776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114030	NC_009523	GCC	2	6	5608822	5608827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114031	NC_009523	CAG	2	6	5608893	5608898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114032	NC_009523	CG	4	8	5608976	5608983	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114033	NC_009523	CAG	2	6	5609001	5609006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658549
114034	NC_009523	CATA	2	8	5609018	5609025	50 %	25 %	0 %	25 %	148658549
114035	NC_009523	CGC	2	6	5609031	5609036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114036	NC_009523	GC	3	6	5609044	5609049	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114037	NC_009523	GGCGCG	2	12	5609050	5609061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658549
114038	NC_009523	CAC	2	6	5609066	5609071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658549
114039	NC_009523	GCG	2	6	5609072	5609077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658549
114040	NC_009523	TGCC	2	8	5609078	5609085	0 %	25 %	25 %	50 %	148658549
114041	NC_009523	CGC	2	6	5609094	5609099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114042	NC_009523	GCC	2	6	5609107	5609112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114043	NC_009523	CGCGCC	2	12	5609133	5609144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114044	NC_009523	GGC	2	6	5609175	5609180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658549
114045	NC_009523	GCC	2	6	5609245	5609250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658549
114046	NC_009523	GC	4	8	5609318	5609325	0 %	0 %	50 %	50 %	148658549
114047	NC_009523	TGCA	2	8	5609331	5609338	25 %	25 %	25 %	25 %	148658549
114048	NC_009523	GTCTG	2	10	5609342	5609351	0 %	40 %	40 %	20 %	148658549
114049	NC_009523	ATC	2	6	5609370	5609375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658549
114050	NC_009523	ATC	2	6	5609645	5609650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658550
114051	NC_009523	GAG	2	6	5609666	5609671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658550
114052	NC_009523	A	6	6	5609678	5609683	100 %	0 %	0 %	0 %	148658550
114053	NC_009523	CTC	2	6	5609760	5609765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658550
114054	NC_009523	CCAC	2	8	5609838	5609845	25 %	0 %	0 %	75 %	148658550
114055	NC_009523	GCT	2	6	5609911	5609916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
114056	NC_009523	CGC	2	6	5610080	5610085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658550
114057	NC_009523	ATC	2	6	5610125	5610130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658550
114058	NC_009523	CCG	2	6	5610131	5610136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658550
114059	NC_009523	CGC	2	6	5610141	5610146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658550
114060	NC_009523	CCG	2	6	5610173	5610178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658550
114061	NC_009523	GTGC	2	8	5610217	5610224	0 %	25 %	50 %	25 %	148658550
114062	NC_009523	TGC	2	6	5610267	5610272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
114063	NC_009523	GAT	2	6	5610301	5610306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658550
114064	NC_009523	TGC	2	6	5610314	5610319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
114065	NC_009523	GCGCA	2	10	5610321	5610330	20 %	0 %	40 %	40 %	148658550
114066	NC_009523	TGC	2	6	5610352	5610357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
114067	NC_009523	GC	5	10	5610356	5610365	0 %	0 %	50 %	50 %	148658550
114068	NC_009523	CTG	2	6	5610464	5610469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
114069	NC_009523	ATC	2	6	5610546	5610551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658550
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114072	NC_009523	CG	3	6	5610642	5610647	0 %	0 %	50 %	50 %	148658550
114073	NC_009523	CTG	2	6	5610650	5610655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
114074	NC_009523	TGC	2	6	5610704	5610709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
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114077	NC_009523	CGT	2	6	5610886	5610891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658550
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114081	NC_009523	CG	3	6	5611346	5611351	0 %	0 %	50 %	50 %	148658551
114082	NC_009523	AGG	2	6	5611354	5611359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658551
114083	NC_009523	GC	3	6	5611372	5611377	0 %	0 %	50 %	50 %	148658551
114084	NC_009523	TGC	2	6	5611387	5611392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658551
114085	NC_009523	CAT	2	6	5611414	5611419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658551
114086	NC_009523	GTC	2	6	5611424	5611429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658551
114087	NC_009523	GCT	2	6	5611465	5611470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658551
114088	NC_009523	GC	3	6	5611496	5611501	0 %	0 %	50 %	50 %	148658551
114089	NC_009523	ACA	2	6	5611535	5611540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658551
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114091	NC_009523	GC	4	8	5611697	5611704	0 %	0 %	50 %	50 %	148658551
114092	NC_009523	CAT	2	6	5611714	5611719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658551
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114097	NC_009523	CAG	2	6	5611930	5611935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658551
114098	NC_009523	ATC	2	6	5611936	5611941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658551
114099	NC_009523	GTC	2	6	5611943	5611948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658551
114100	NC_009523	GGTC	2	8	5611986	5611993	0 %	25 %	50 %	25 %	148658551
114101	NC_009523	GC	4	8	5612018	5612025	0 %	0 %	50 %	50 %	148658551
114102	NC_009523	TGAA	2	8	5612062	5612069	50 %	25 %	25 %	0 %	148658551
114103	NC_009523	CGC	2	6	5612088	5612093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658551
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114105	NC_009523	CCTG	2	8	5612255	5612262	0 %	25 %	25 %	50 %	148658551
114106	NC_009523	TGCG	2	8	5612290	5612297	0 %	25 %	50 %	25 %	148658551
114107	NC_009523	GCC	2	6	5612326	5612331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658551
114108	NC_009523	GA	3	6	5612372	5612377	50 %	0 %	50 %	0 %	148658551
114109	NC_009523	GGC	2	6	5612408	5612413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658551
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114111	NC_009523	ATG	2	6	5612514	5612519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658551
114112	NC_009523	TGC	2	6	5612780	5612785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658552
114113	NC_009523	TCG	2	6	5612843	5612848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658552
114114	NC_009523	ATG	2	6	5612872	5612877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658552
114115	NC_009523	GC	3	6	5612965	5612970	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
114116	NC_009523	GC	3	6	5613025	5613030	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
114117	NC_009523	CAT	2	6	5613054	5613059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658552
114118	NC_009523	CG	3	6	5613065	5613070	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
114119	NC_009523	CCG	2	6	5613118	5613123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658552
114120	NC_009523	AGC	2	6	5613138	5613143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658552
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114123	NC_009523	GAT	2	6	5613262	5613267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658552
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114127	NC_009523	TG	3	6	5613447	5613452	0 %	50 %	50 %	0 %	148658552
114128	NC_009523	GC	3	6	5613457	5613462	0 %	0 %	50 %	50 %	148658552
114129	NC_009523	CTG	2	6	5613472	5613477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658552
114130	NC_009523	TTC	2	6	5613499	5613504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658552
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114133	NC_009523	CG	3	6	5613875	5613880	0 %	0 %	50 %	50 %	148658553
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114146	NC_009523	GC	3	6	5614556	5614561	0 %	0 %	50 %	50 %	148658554
114147	NC_009523	GAT	2	6	5614612	5614617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658554
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114153	NC_009523	ATG	2	6	5614837	5614842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658554
114154	NC_009523	ATG	2	6	5614846	5614851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658554
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114221	NC_009523	TGA	2	6	5619078	5619083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658558
114222	NC_009523	GAA	2	6	5619104	5619109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658558
114223	NC_009523	CGA	2	6	5619315	5619320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658558
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114226	NC_009523	ACA	2	6	5619406	5619411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658558
114227	NC_009523	TCG	2	6	5619432	5619437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658558
114228	NC_009523	CATGA	2	10	5619458	5619467	40 %	20 %	20 %	20 %	148658558
114229	NC_009523	AG	3	6	5619489	5619494	50 %	0 %	50 %	0 %	148658558
114230	NC_009523	TCA	2	6	5619505	5619510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658558
114231	NC_009523	CGT	2	6	5619593	5619598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658558
114232	NC_009523	TGCCG	2	10	5619627	5619636	0 %	20 %	40 %	40 %	148658558
114233	NC_009523	GTC	2	6	5619656	5619661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658558
114234	NC_009523	GAT	2	6	5619766	5619771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658558
114235	NC_009523	CAG	2	6	5619782	5619787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658558
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114238	NC_009523	TGC	2	6	5619977	5619982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658558
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114241	NC_009523	CTG	2	6	5620281	5620286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658559
114242	NC_009523	CCAGAC	2	12	5620295	5620306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148658559
114243	NC_009523	TTG	2	6	5620312	5620317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148658559
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114337	NC_009523	GAG	2	6	5624241	5624246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658562
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114339	NC_009523	TGA	2	6	5624279	5624284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658562
114340	NC_009523	TGG	2	6	5624287	5624292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658562
114341	NC_009523	TCA	2	6	5624326	5624331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658562
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114343	NC_009523	CAT	2	6	5624474	5624479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658562
114344	NC_009523	GAT	2	6	5624489	5624494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658562
114345	NC_009523	GAG	2	6	5624550	5624555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658563
114346	NC_009523	ATC	2	6	5624556	5624561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658563
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