MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_009523	GTC	2	6	5560297	5560302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658513
113002	NC_009523	GT	3	6	5560382	5560387	0 %	50 %	50 %	0 %	148658513
113003	NC_009523	AACC	2	8	5560394	5560401	50 %	0 %	0 %	50 %	148658513
113004	NC_009523	TGCG	2	8	5560426	5560433	0 %	25 %	50 %	25 %	148658513
113005	NC_009523	AGAGAT	2	12	5560501	5560512	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148658514
113006	NC_009523	TGA	2	6	5560632	5560637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
113007	NC_009523	CGA	2	6	5560641	5560646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658514
113008	NC_009523	GACTTT	2	12	5560688	5560699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148658514
113009	NC_009523	GCCA	2	8	5560756	5560763	25 %	0 %	25 %	50 %	148658514
113010	NC_009523	CATGC	2	10	5560767	5560776	20 %	20 %	20 %	40 %	148658514
113011	NC_009523	GTA	2	6	5560799	5560804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
113012	NC_009523	CCG	2	6	5560850	5560855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658514
113013	NC_009523	CCG	2	6	5560898	5560903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658514
113014	NC_009523	CG	3	6	5560905	5560910	0 %	0 %	50 %	50 %	148658514
113015	NC_009523	CTG	2	6	5560919	5560924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658514
113016	NC_009523	ACA	2	6	5560927	5560932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658514
113017	NC_009523	GTC	2	6	5560939	5560944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658514
113018	NC_009523	CGAT	2	8	5560966	5560973	25 %	25 %	25 %	25 %	148658514
113019	NC_009523	CTGC	2	8	5561020	5561027	0 %	25 %	25 %	50 %	148658514
113020	NC_009523	CATC	2	8	5561031	5561038	25 %	25 %	0 %	50 %	148658514
113021	NC_009523	ATG	2	6	5561071	5561076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
113022	NC_009523	AGT	2	6	5561097	5561102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658514
113023	NC_009523	ATT	2	6	5561135	5561140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148658514
113024	NC_009523	CATC	2	8	5561265	5561272	25 %	25 %	0 %	50 %	148658514
113025	NC_009523	CGG	2	6	5561348	5561353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658514
113026	NC_009523	CCA	2	6	5561623	5561628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658515
113027	NC_009523	CAC	2	6	5561674	5561679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658515
113028	NC_009523	CGC	2	6	5561682	5561687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658515
113029	NC_009523	AG	3	6	5561730	5561735	50 %	0 %	50 %	0 %	148658515
113030	NC_009523	CTGC	2	8	5561746	5561753	0 %	25 %	25 %	50 %	148658515
113031	NC_009523	CAA	2	6	5561812	5561817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148658515
113032	NC_009523	AGC	2	6	5561844	5561849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
113033	NC_009523	GCCT	2	8	5561970	5561977	0 %	25 %	25 %	50 %	148658515
113034	NC_009523	AAT	2	6	5562104	5562109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148658515
113035	NC_009523	TCC	2	6	5562117	5562122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658515
113036	NC_009523	GAC	2	6	5562174	5562179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
113037	NC_009523	AGG	2	6	5562215	5562220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148658515
113038	NC_009523	GCA	2	6	5562246	5562251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
113039	NC_009523	CGA	2	6	5562255	5562260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
113040	NC_009523	GAC	2	6	5562269	5562274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658515
113041	NC_009523	TCG	2	6	5562292	5562297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658515
113042	NC_009523	AG	3	6	5562319	5562324	50 %	0 %	50 %	0 %	148658515
113043	NC_009523	GC	3	6	5562338	5562343	0 %	0 %	50 %	50 %	148658515
113044	NC_009523	TGA	2	6	5562350	5562355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658515
113045	NC_009523	AGA	2	6	5562412	5562417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148658515
113046	NC_009523	GCC	2	6	5562482	5562487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658515
113047	NC_009523	TGCCT	2	10	5562497	5562506	0 %	40 %	20 %	40 %	148658515
113048	NC_009523	GGC	2	6	5562595	5562600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658515
113049	NC_009523	ATCGG	2	10	5562647	5562656	20 %	20 %	40 %	20 %	148658515
113050	NC_009523	GGT	2	6	5562658	5562663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658515
113051	NC_009523	A	6	6	5562670	5562675	100 %	0 %	0 %	0 %	148658515
113052	NC_009523	C	6	6	5562713	5562718	0 %	0 %	0 %	100 %	148658516
113053	NC_009523	GCA	2	6	5562824	5562829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113054	NC_009523	CAG	2	6	5562840	5562845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113055	NC_009523	GC	3	6	5562862	5562867	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
113056	NC_009523	CGC	2	6	5562872	5562877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
113057	NC_009523	CG	3	6	5562917	5562922	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
113058	NC_009523	GCGG	2	8	5562931	5562938	0 %	0 %	75 %	25 %	148658516
113059	NC_009523	TGCC	2	8	5562979	5562986	0 %	25 %	25 %	50 %	148658516
113060	NC_009523	TCA	2	6	5563036	5563041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658516
113061	NC_009523	GCAC	2	8	5563051	5563058	25 %	0 %	25 %	50 %	148658516
113062	NC_009523	CGGT	2	8	5563084	5563091	0 %	25 %	50 %	25 %	148658516
113063	NC_009523	CGCC	2	8	5563106	5563113	0 %	0 %	25 %	75 %	148658516
113064	NC_009523	GCA	2	6	5563159	5563164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113065	NC_009523	TCG	2	6	5563171	5563176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113066	NC_009523	TCG	2	6	5563304	5563309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113067	NC_009523	TCC	2	6	5563354	5563359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658516
113068	NC_009523	GCT	2	6	5563393	5563398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113069	NC_009523	GCA	2	6	5563445	5563450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
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113071	NC_009523	CGC	2	6	5563502	5563507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
113072	NC_009523	GCC	2	6	5563564	5563569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
113073	NC_009523	CGG	2	6	5563628	5563633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658516
113074	NC_009523	GGTC	2	8	5563655	5563662	0 %	25 %	50 %	25 %	148658516
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113076	NC_009523	GC	3	6	5563745	5563750	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
113077	NC_009523	GAT	2	6	5563776	5563781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658516
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113079	NC_009523	GC	3	6	5563866	5563871	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
113080	NC_009523	CCA	2	6	5563926	5563931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658516
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113082	NC_009523	GTG	2	6	5564046	5564051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148658516
113083	NC_009523	GAT	2	6	5564138	5564143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658516
113084	NC_009523	CCA	2	6	5564145	5564150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658516
113085	NC_009523	TTC	2	6	5564161	5564166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148658516
113086	NC_009523	CG	4	8	5564177	5564184	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
113087	NC_009523	AGC	2	6	5564185	5564190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113088	NC_009523	CAT	2	6	5564252	5564257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148658516
113089	NC_009523	GCT	2	6	5564324	5564329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113090	NC_009523	CTG	2	6	5564401	5564406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113091	NC_009523	CGC	2	6	5564420	5564425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658516
113092	NC_009523	GAT	2	6	5564433	5564438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658516
113093	NC_009523	ATGA	2	8	5564505	5564512	50 %	25 %	25 %	0 %	148658516
113094	NC_009523	GC	3	6	5564514	5564519	0 %	0 %	50 %	50 %	148658516
113095	NC_009523	GCA	2	6	5564531	5564536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658516
113096	NC_009523	GC	4	8	5564638	5564645	0 %	0 %	50 %	50 %	148658517
113097	NC_009523	CCGC	2	8	5564665	5564672	0 %	0 %	25 %	75 %	148658517
113098	NC_009523	GCTC	2	8	5564673	5564680	0 %	25 %	25 %	50 %	148658517
113099	NC_009523	CCGC	2	8	5564686	5564693	0 %	0 %	25 %	75 %	148658517
113100	NC_009523	CCGCT	2	10	5564696	5564705	0 %	20 %	20 %	60 %	148658517
113101	NC_009523	TCCC	2	8	5564789	5564796	0 %	25 %	0 %	75 %	148658517
113102	NC_009523	TCC	2	6	5564820	5564825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148658517
113103	NC_009523	AGCC	2	8	5564826	5564833	25 %	0 %	25 %	50 %	148658517
113104	NC_009523	C	6	6	5564832	5564837	0 %	0 %	0 %	100 %	148658517
113105	NC_009523	CCGC	2	8	5564855	5564862	0 %	0 %	25 %	75 %	148658517
113106	NC_009523	GCA	2	6	5564878	5564883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148658517
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113108	NC_009523	GTA	2	6	5564921	5564926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148658517
113109	NC_009523	C	6	6	5564973	5564978	0 %	0 %	0 %	100 %	148658517
113110	NC_009523	CCA	2	6	5564998	5565003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148658517
113111	NC_009523	CGG	2	6	5565011	5565016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148658517
113112	NC_009523	CCG	2	6	5565067	5565072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658517
113113	NC_009523	CGC	3	9	5565149	5565157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148658517
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113115	NC_009523	GTC	2	6	5565166	5565171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148658517
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113231	NC_009523	CCGCT	2	10	5568292	5568301	0 %	20 %	20 %	60 %	148658521
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