MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_009523	TTC	2	6	388851	388856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654479
8003	NC_009523	ACG	2	6	388859	388864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654479
8004	NC_009523	TTC	2	6	388866	388871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654479
8005	NC_009523	TCGCC	2	10	388878	388887	0 %	20 %	20 %	60 %	148654479
8006	NC_009523	GTC	2	6	388890	388895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654479
8007	NC_009523	GC	3	6	388902	388907	0 %	0 %	50 %	50 %	148654479
8008	NC_009523	GTTTT	2	10	389025	389034	0 %	80 %	20 %	0 %	148654479
8009	NC_009523	TCT	2	6	389062	389067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654479
8010	NC_009523	GCG	2	6	389078	389083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654479
8011	NC_009523	CGA	2	6	389104	389109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654479
8012	NC_009523	GCG	2	6	389161	389166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654479
8013	NC_009523	GCA	2	6	389896	389901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654480
8014	NC_009523	CTG	3	9	390020	390028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654480
8015	NC_009523	CCCT	2	8	390099	390106	0 %	25 %	0 %	75 %	148654480
8016	NC_009523	CAA	2	6	390189	390194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654480
8017	NC_009523	TAA	2	6	390469	390474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654480
8018	NC_009523	CTG	2	6	390476	390481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654480
8019	NC_009523	AG	3	6	390521	390526	50 %	0 %	50 %	0 %	148654480
8020	NC_009523	CCT	2	6	390620	390625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654480
8021	NC_009523	TGC	2	6	390676	390681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654480
8022	NC_009523	GAT	2	6	390743	390748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654480
8023	NC_009523	TGG	2	6	391341	391346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654481
8024	NC_009523	T	7	7	391379	391385	0 %	100 %	0 %	0 %	148654481
8025	NC_009523	TG	3	6	391478	391483	0 %	50 %	50 %	0 %	148654481
8026	NC_009523	TTG	2	6	391492	391497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654481
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8031	NC_009523	GAT	2	6	391972	391977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654481
8032	NC_009523	CGC	2	6	392002	392007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654481
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8038	NC_009523	AAT	2	6	392463	392468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148654482
8039	NC_009523	A	6	6	392495	392500	100 %	0 %	0 %	0 %	148654482
8040	NC_009523	GAA	3	9	392685	392693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654482
8041	NC_009523	AG	3	6	392771	392776	50 %	0 %	50 %	0 %	148654482
8042	NC_009523	TGA	2	6	392782	392787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654482
8043	NC_009523	AGA	2	6	392789	392794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654482
8044	NC_009523	GAT	2	6	392886	392891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654482
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8046	NC_009523	CTT	2	6	392915	392920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654482
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8051	NC_009523	CTG	2	6	393143	393148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654483
8052	NC_009523	GC	3	6	393164	393169	0 %	0 %	50 %	50 %	148654483
8053	NC_009523	GCG	2	6	393179	393184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654483
8054	NC_009523	CGC	2	6	393185	393190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654483
8055	NC_009523	GCGCG	2	10	393205	393214	0 %	0 %	60 %	40 %	148654483
8056	NC_009523	CTG	2	6	393237	393242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654483
8057	NC_009523	GTGC	2	8	393301	393308	0 %	25 %	50 %	25 %	148654483
8058	NC_009523	CGG	2	6	393326	393331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654483
8059	NC_009523	CTG	2	6	393337	393342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654483
8060	NC_009523	GAT	2	6	393401	393406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654483
8061	NC_009523	CGA	2	6	393407	393412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654483
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8069	NC_009523	CAG	2	6	393692	393697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654483
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8071	NC_009523	GA	3	6	393750	393755	50 %	0 %	50 %	0 %	148654483
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8075	NC_009523	CATCGC	2	12	393940	393951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148654483
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8087	NC_009523	CGC	3	9	394160	394168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654483
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8113	NC_009523	AGCGT	2	10	395112	395121	20 %	20 %	40 %	20 %	148654484
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8487	NC_009523	CGG	2	6	413451	413456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654500
8488	NC_009523	GC	3	6	413465	413470	0 %	0 %	50 %	50 %	148654500
8489	NC_009523	TCGTT	2	10	413530	413539	0 %	60 %	20 %	20 %	148654500
8490	NC_009523	CGAT	2	8	413543	413550	25 %	25 %	25 %	25 %	148654500
8491	NC_009523	GAGC	2	8	413555	413562	25 %	0 %	50 %	25 %	148654500
8492	NC_009523	TTC	2	6	413573	413578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654500
8493	NC_009523	T	6	6	413608	413613	0 %	100 %	0 %	0 %	148654500
8494	NC_009523	CAG	2	6	413648	413653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654500
8495	NC_009523	CAG	2	6	413773	413778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654500
8496	NC_009523	CGC	2	6	413779	413784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654500
8497	NC_009523	AGG	2	6	413814	413819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654500
8498	NC_009523	CGA	2	6	413824	413829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654500
8499	NC_009523	GAC	2	6	413899	413904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654500
8500	NC_009523	GAT	2	6	413915	413920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654500

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