MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_009523	GCAGC	2	10	338430	338439	20 %	0 %	40 %	40 %	148654447
7003	NC_009523	CAGGCG	2	12	338532	338543	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148654447
7004	NC_009523	GAT	2	6	338571	338576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654447
7005	NC_009523	TGA	2	6	338702	338707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654447
7006	NC_009523	CGT	2	6	338714	338719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654447
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7010	NC_009523	GATCG	2	10	339057	339066	20 %	20 %	40 %	20 %	148654447
7011	NC_009523	CAG	2	6	339093	339098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654447
7012	NC_009523	TGC	2	6	339103	339108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654447
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7014	NC_009523	CGG	2	6	339291	339296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654448
7015	NC_009523	TAT	2	6	339357	339362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654448
7016	NC_009523	TGA	2	6	339392	339397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654448
7017	NC_009523	GCT	2	6	339408	339413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654448
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7021	NC_009523	GGTT	2	8	339636	339643	0 %	50 %	50 %	0 %	148654448
7022	NC_009523	AGC	2	6	339692	339697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654448
7023	NC_009523	TGG	2	6	339719	339724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654448
7024	NC_009523	CGA	2	6	339747	339752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654448
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7053	NC_009523	GC	3	6	340797	340802	0 %	0 %	50 %	50 %	148654449
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7232	NC_009523	CA	3	6	352150	352155	50 %	0 %	0 %	50 %	148654456
7233	NC_009523	TCG	2	6	352242	352247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654456
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7237	NC_009523	GGA	2	6	352669	352674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654456
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7239	NC_009523	TGA	2	6	352819	352824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654456
7240	NC_009523	TGC	2	6	352860	352865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654456
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7242	NC_009523	TGA	2	6	353191	353196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654456
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7484	NC_009523	GCG	2	6	362313	362318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654461
7485	NC_009523	CCG	2	6	362353	362358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654461
7486	NC_009523	GCGCG	2	10	362369	362378	0 %	0 %	60 %	40 %	148654461
7487	NC_009523	CG	5	10	362375	362384	0 %	0 %	50 %	50 %	148654461
7488	NC_009523	TCG	2	6	362388	362393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654461
7489	NC_009523	CGCCAG	2	12	362480	362491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148654461
7490	NC_009523	AC	3	6	362507	362512	50 %	0 %	0 %	50 %	148654461
7491	NC_009523	CGG	2	6	362521	362526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654461
7492	NC_009523	TCCGC	2	10	362543	362552	0 %	20 %	20 %	60 %	148654461
7493	NC_009523	CG	3	6	362574	362579	0 %	0 %	50 %	50 %	148654461
7494	NC_009523	CAACG	2	10	362609	362618	40 %	0 %	20 %	40 %	148654461
7495	NC_009523	GTC	2	6	362624	362629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654461
7496	NC_009523	GC	3	6	362636	362641	0 %	0 %	50 %	50 %	148654461
7497	NC_009523	CG	3	6	362642	362647	0 %	0 %	50 %	50 %	148654461
7498	NC_009523	AT	3	6	362655	362660	50 %	50 %	0 %	0 %	148654461
7499	NC_009523	CAG	2	6	362663	362668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654461
7500	NC_009523	CTC	2	6	363507	363512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654462

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