MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 117978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009523	GC	3	6	242027	242032	0 %	0 %	50 %	50 %	148654377
5002	NC_009523	GCG	2	6	242193	242198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654377
5003	NC_009523	GTG	2	6	242235	242240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654377
5004	NC_009523	CAGA	2	8	242300	242307	50 %	0 %	25 %	25 %	148654377
5005	NC_009523	GCG	2	6	242320	242325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654377
5006	NC_009523	CGT	2	6	242411	242416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654377
5007	NC_009523	ATC	2	6	242439	242444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654377
5008	NC_009523	TGC	2	6	242481	242486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654377
5009	NC_009523	GCA	2	6	242494	242499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654377
5010	NC_009523	GC	3	6	242513	242518	0 %	0 %	50 %	50 %	148654377
5011	NC_009523	GCC	2	6	242535	242540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654377
5012	NC_009523	GAG	2	6	242558	242563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148654377
5013	NC_009523	CGC	2	6	242632	242637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654377
5014	NC_009523	GGC	2	6	242704	242709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654377
5015	NC_009523	TCG	2	6	242727	242732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654377
5016	NC_009523	CAG	2	6	242744	242749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654377
5017	NC_009523	CG	3	6	242773	242778	0 %	0 %	50 %	50 %	148654377
5018	NC_009523	CGC	2	6	242789	242794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654377
5019	NC_009523	TCA	2	6	242814	242819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654377
5020	NC_009523	GCA	2	6	242932	242937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654377
5021	NC_009523	GAT	2	6	243141	243146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654378
5022	NC_009523	GTT	2	6	243171	243176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654378
5023	NC_009523	ATC	2	6	243377	243382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654378
5024	NC_009523	GCG	2	6	243390	243395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654378
5025	NC_009523	GAA	2	6	243502	243507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654378
5026	NC_009523	GCCGC	2	10	243513	243522	0 %	0 %	40 %	60 %	148654378
5027	NC_009523	CGA	2	6	243536	243541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654378
5028	NC_009523	GC	3	6	243961	243966	0 %	0 %	50 %	50 %	148654379
5029	NC_009523	GCC	2	6	244037	244042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654379
5030	NC_009523	CGA	2	6	244043	244048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654379
5031	NC_009523	GGC	2	6	244074	244079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654379
5032	NC_009523	ACG	2	6	244148	244153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654379
5033	NC_009523	GC	3	6	244352	244357	0 %	0 %	50 %	50 %	148654380
5034	NC_009523	CA	3	6	244369	244374	50 %	0 %	0 %	50 %	148654380
5035	NC_009523	GAA	2	6	244443	244448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654380
5036	NC_009523	CGC	2	6	244535	244540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654380
5037	NC_009523	CCT	2	6	244588	244593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654380
5038	NC_009523	CG	3	6	244594	244599	0 %	0 %	50 %	50 %	148654380
5039	NC_009523	CTG	2	6	244611	244616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654380
5040	NC_009523	GTT	2	6	244637	244642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654380
5041	NC_009523	CAT	2	6	244703	244708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654380
5042	NC_009523	CAA	2	6	244712	244717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654380
5043	NC_009523	A	6	6	244752	244757	100 %	0 %	0 %	0 %	148654380
5044	NC_009523	GAT	2	6	244764	244769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654380
5045	NC_009523	AAC	2	6	244798	244803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148654380
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5047	NC_009523	GCTCG	2	10	244823	244832	0 %	20 %	40 %	40 %	148654380
5048	NC_009523	CCT	2	6	244865	244870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654380
5049	NC_009523	TGC	2	6	244963	244968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654381
5050	NC_009523	TAC	2	6	244994	244999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654381
5051	NC_009523	AAG	2	6	245058	245063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654381
5052	NC_009523	GTT	2	6	245074	245079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654381
5053	NC_009523	TTC	2	6	245111	245116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654381
5054	NC_009523	GCG	2	6	245226	245231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654381
5055	NC_009523	GTC	2	6	245240	245245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654381
5056	NC_009523	TCG	2	6	245247	245252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654381
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5058	NC_009523	CGA	2	6	245454	245459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654381
5059	NC_009523	GC	4	8	245521	245528	0 %	0 %	50 %	50 %	148654381
5060	NC_009523	ATT	2	6	245621	245626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654382
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5062	NC_009523	C	7	7	245753	245759	0 %	0 %	0 %	100 %	148654382
5063	NC_009523	GCG	2	6	245765	245770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654382
5064	NC_009523	CTT	2	6	245776	245781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654382
5065	NC_009523	CGA	2	6	245835	245840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654382
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5069	NC_009523	GC	3	6	246068	246073	0 %	0 %	50 %	50 %	148654382
5070	NC_009523	CCT	2	6	246094	246099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654382
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5073	NC_009523	CG	3	6	246197	246202	0 %	0 %	50 %	50 %	148654382
5074	NC_009523	CTG	2	6	246203	246208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654382
5075	NC_009523	GC	3	6	246223	246228	0 %	0 %	50 %	50 %	148654382
5076	NC_009523	GC	3	6	246320	246325	0 %	0 %	50 %	50 %	148654382
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5090	NC_009523	GC	3	6	247544	247549	0 %	0 %	50 %	50 %	148654384
5091	NC_009523	CTT	2	6	247586	247591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654384
5092	NC_009523	TTAT	2	8	247636	247643	25 %	75 %	0 %	0 %	148654384
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5101	NC_009523	GC	3	6	248363	248368	0 %	0 %	50 %	50 %	148654385
5102	NC_009523	ATC	2	6	248448	248453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654385
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5107	NC_009523	TCG	2	6	248936	248941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654385
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5109	NC_009523	GTC	2	6	249095	249100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654385
5110	NC_009523	CGA	2	6	249143	249148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654385
5111	NC_009523	TATC	2	8	249180	249187	25 %	50 %	0 %	25 %	148654385
5112	NC_009523	GGT	2	6	249203	249208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654385
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5117	NC_009523	CGAT	2	8	249427	249434	25 %	25 %	25 %	25 %	148654385
5118	NC_009523	GC	3	6	249446	249451	0 %	0 %	50 %	50 %	148654385
5119	NC_009523	AGA	2	6	249472	249477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148654385
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5121	NC_009523	GAT	3	9	249498	249506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654385
5122	NC_009523	ATT	2	6	249522	249527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148654385
5123	NC_009523	GCG	2	6	249577	249582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654385
5124	NC_009523	ATC	2	6	249624	249629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654385
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5128	NC_009523	GATG	2	8	249854	249861	25 %	25 %	50 %	0 %	148654385
5129	NC_009523	ATG	2	6	249916	249921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654386
5130	NC_009523	TGA	2	6	249974	249979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654386
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5133	NC_009523	GC	3	6	250140	250145	0 %	0 %	50 %	50 %	148654386
5134	NC_009523	GC	3	6	250158	250163	0 %	0 %	50 %	50 %	148654386
5135	NC_009523	GC	4	8	250210	250217	0 %	0 %	50 %	50 %	148654386
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5145	NC_009523	CGG	2	6	251224	251229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654387
5146	NC_009523	CGC	2	6	251245	251250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654387
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5154	NC_009523	GC	3	6	251497	251502	0 %	0 %	50 %	50 %	148654387
5155	NC_009523	CTT	2	6	251527	251532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654387
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5161	NC_009523	CGG	2	6	251734	251739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654387
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5233	NC_009523	CG	3	6	255356	255361	0 %	0 %	50 %	50 %	148654391
5234	NC_009523	ACC	2	6	255389	255394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654391
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5236	NC_009523	ATGA	2	8	255434	255441	50 %	25 %	25 %	0 %	148654391
5237	NC_009523	GCG	2	6	255603	255608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654392
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5241	NC_009523	TTG	2	6	255682	255687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654392
5242	NC_009523	CTG	2	6	255693	255698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654392
5243	NC_009523	TCA	2	6	255704	255709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654392
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5245	NC_009523	GAT	2	6	255786	255791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148654392
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5359	NC_009523	GC	3	6	261221	261226	0 %	0 %	50 %	50 %	148654397
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5363	NC_009523	GTC	2	6	261309	261314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654397
5364	NC_009523	GTT	2	6	261374	261379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148654397
5365	NC_009523	GAC	2	6	261407	261412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654397
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5368	NC_009523	CGG	2	6	261485	261490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654397
5369	NC_009523	GAC	2	6	261494	261499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654397
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5372	NC_009523	TGG	3	9	261730	261738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148654397
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5454	NC_009523	ATCGAT	2	12	266031	266042	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148654400
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5469	NC_009523	GC	3	6	266516	266521	0 %	0 %	50 %	50 %	148654401
5470	NC_009523	GC	3	6	266555	266560	0 %	0 %	50 %	50 %	148654401
5471	NC_009523	CGCC	2	8	266608	266615	0 %	0 %	25 %	75 %	148654401
5472	NC_009523	TCA	2	6	266632	266637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654401
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5475	NC_009523	GAC	2	6	266752	266757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654401
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5477	NC_009523	GCAG	2	8	266816	266823	25 %	0 %	50 %	25 %	148654401
5478	NC_009523	CCA	2	6	266890	266895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654401
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5482	NC_009523	CGGCG	2	10	266950	266959	0 %	0 %	60 %	40 %	148654401
5483	NC_009523	ATC	2	6	266990	266995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148654401
5484	NC_009523	AGC	2	6	267039	267044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148654401
5485	NC_009523	GCC	2	6	267077	267082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654401
5486	NC_009523	CGG	2	6	267154	267159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654402
5487	NC_009523	ACCA	2	8	267207	267214	50 %	0 %	0 %	50 %	148654402
5488	NC_009523	CTG	2	6	267243	267248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5489	NC_009523	CCA	2	6	267284	267289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148654402
5490	NC_009523	CGC	2	6	267296	267301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148654402
5491	NC_009523	GCGCT	2	10	267318	267327	0 %	20 %	40 %	40 %	148654402
5492	NC_009523	GC	3	6	267389	267394	0 %	0 %	50 %	50 %	148654402
5493	NC_009523	CG	3	6	267462	267467	0 %	0 %	50 %	50 %	148654402
5494	NC_009523	CTG	2	6	267468	267473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5495	NC_009523	TCC	2	6	267481	267486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148654402
5496	NC_009523	GCG	3	9	267502	267510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148654402
5497	NC_009523	CG	3	6	267509	267514	0 %	0 %	50 %	50 %	148654402
5498	NC_009523	TTC	2	6	267588	267593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148654402
5499	NC_009523	GCT	2	6	267608	267613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148654402
5500	NC_009523	ATCGT	2	10	267650	267659	20 %	40 %	20 %	20 %	148654402

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