MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA03

Total Repeats: 2700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009431	GGA	2	6	116239	116244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280348
2502	NC_009431	CGA	2	6	116344	116349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280348
2503	NC_009431	GAG	2	6	116354	116359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280348
2504	NC_009431	CTGC	2	8	116371	116378	0 %	25 %	25 %	50 %	146280348
2505	NC_009431	ACA	2	6	116388	116393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146280348
2506	NC_009431	CGT	2	6	116434	116439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280348
2507	NC_009431	CGG	2	6	116497	116502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280348
2508	NC_009431	CGGG	2	8	116523	116530	0 %	0 %	75 %	25 %	146280348
2509	NC_009431	GAG	2	6	116564	116569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280348
2510	NC_009431	AGGCGC	2	12	116590	116601	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280349
2511	NC_009431	GAA	2	6	116612	116617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280349
2512	NC_009431	CGC	2	6	116629	116634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2513	NC_009431	CCG	2	6	116681	116686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2514	NC_009431	GCG	2	6	116714	116719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2515	NC_009431	GTG	2	6	116739	116744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2516	NC_009431	CCG	2	6	116791	116796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2517	NC_009431	CCGG	2	8	116863	116870	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2518	NC_009431	GCT	2	6	116878	116883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2519	NC_009431	GGT	2	6	116909	116914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2520	NC_009431	CGA	2	6	116921	116926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2521	NC_009431	GCGG	2	8	116936	116943	0 %	0 %	75 %	25 %	146280349
2522	NC_009431	TGG	2	6	116977	116982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2523	NC_009431	GAG	3	9	116994	117002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280349
2524	NC_009431	TCGA	2	8	117084	117091	25 %	25 %	25 %	25 %	146280349
2525	NC_009431	GCT	2	6	117092	117097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2526	NC_009431	GC	3	6	117100	117105	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2527	NC_009431	CGG	3	9	117127	117135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2528	NC_009431	CTT	2	6	117155	117160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280349
2529	NC_009431	TGC	2	6	117181	117186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2530	NC_009431	GCCG	2	8	117191	117198	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2531	NC_009431	CCG	2	6	117201	117206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2532	NC_009431	CTG	2	6	117219	117224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2533	NC_009431	CCG	2	6	117278	117283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2534	NC_009431	TGC	2	6	117289	117294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2535	NC_009431	GGT	2	6	117302	117307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2536	NC_009431	GCC	2	6	117362	117367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2537	NC_009431	GGT	3	9	117383	117391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2538	NC_009431	GCC	2	6	117395	117400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2539	NC_009431	C	6	6	117411	117416	0 %	0 %	0 %	100 %	146280349
2540	NC_009431	GCC	2	6	117425	117430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2541	NC_009431	CGA	2	6	117449	117454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2542	NC_009431	TGG	2	6	117469	117474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2543	NC_009431	TGC	2	6	117499	117504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2544	NC_009431	CGG	2	6	117565	117570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2545	NC_009431	CGA	2	6	117605	117610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2546	NC_009431	CGC	2	6	117726	117731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2547	NC_009431	ATC	2	6	117732	117737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280349
2548	NC_009431	CGG	2	6	117835	117840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2549	NC_009431	GC	3	6	117856	117861	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2550	NC_009431	CGG	2	6	117892	117897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2551	NC_009431	GC	4	8	117903	117910	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2552	NC_009431	GGC	2	6	117911	117916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2553	NC_009431	AGG	2	6	117934	117939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280349
2554	NC_009431	GTG	2	6	117942	117947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280349
2555	NC_009431	GCG	2	6	117953	117958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2556	NC_009431	GGC	2	6	117998	118003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2557	NC_009431	CTG	2	6	118014	118019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2558	NC_009431	GGCG	2	8	118055	118062	0 %	0 %	75 %	25 %	146280349
2559	NC_009431	CG	3	6	118066	118071	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2560	NC_009431	GCA	2	6	118076	118081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2561	NC_009431	GGC	2	6	118106	118111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2562	NC_009431	CG	3	6	118125	118130	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2563	NC_009431	CGGGC	2	10	118136	118145	0 %	0 %	60 %	40 %	146280349
2564	NC_009431	CGC	2	6	118199	118204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2565	NC_009431	CG	4	8	118262	118269	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2566	NC_009431	CCG	2	6	118276	118281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2567	NC_009431	GC	3	6	118290	118295	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2568	NC_009431	GGC	2	6	118304	118309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2569	NC_009431	GCC	2	6	118314	118319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2570	NC_009431	GC	5	10	118323	118332	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2571	NC_009431	CTG	2	6	118335	118340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2572	NC_009431	GCG	2	6	118344	118349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2573	NC_009431	CGC	2	6	118360	118365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2574	NC_009431	GGA	2	6	118367	118372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280349
2575	NC_009431	AGG	2	6	118390	118395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280349
2576	NC_009431	GCC	3	9	118403	118411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2577	NC_009431	CCG	2	6	118423	118428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2578	NC_009431	CGC	2	6	118436	118441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2579	NC_009431	ACC	2	6	118455	118460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280349
2580	NC_009431	CTG	2	6	118467	118472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2581	NC_009431	GCGGG	2	10	118475	118484	0 %	0 %	80 %	20 %	146280349
2582	NC_009431	GCT	2	6	118505	118510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2583	NC_009431	TGGCGG	2	12	118513	118524	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146280349
2584	NC_009431	GC	3	6	118544	118549	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2585	NC_009431	CG	3	6	118550	118555	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2586	NC_009431	GGC	3	9	118604	118612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2587	NC_009431	GGC	3	9	118616	118624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2588	NC_009431	GCG	2	6	118635	118640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2589	NC_009431	ACG	2	6	118650	118655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2590	NC_009431	CTG	2	6	118662	118667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2591	NC_009431	GCCC	2	8	118677	118684	0 %	0 %	25 %	75 %	146280349
2592	NC_009431	CGC	2	6	118697	118702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2593	NC_009431	GGA	2	6	118706	118711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280349
2594	NC_009431	GAC	2	6	118712	118717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2595	NC_009431	CGC	2	6	118727	118732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2596	NC_009431	GC	4	8	118748	118755	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2597	NC_009431	CGG	2	6	118762	118767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
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2599	NC_009431	CGGG	2	8	118794	118801	0 %	0 %	75 %	25 %	146280349
2600	NC_009431	GCT	2	6	118808	118813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2601	NC_009431	CTG	2	6	118827	118832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2602	NC_009431	GC	3	6	118927	118932	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2603	NC_009431	TGC	2	6	118942	118947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2604	NC_009431	CG	3	6	118957	118962	0 %	0 %	50 %	50 %	146280349
2605	NC_009431	GGC	2	6	118973	118978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2606	NC_009431	CGCC	2	8	119057	119064	0 %	0 %	25 %	75 %	146280349
2607	NC_009431	GCT	2	6	119075	119080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2608	NC_009431	GCC	2	6	119098	119103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280349
2609	NC_009431	C	8	8	119125	119132	0 %	0 %	0 %	100 %	146280349
2610	NC_009431	GCG	2	6	119138	119143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280349
2611	NC_009431	CTG	2	6	119226	119231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280349
2612	NC_009431	GC	3	6	119327	119332	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
2613	NC_009431	CTGG	2	8	119353	119360	0 %	25 %	50 %	25 %	146280350
2614	NC_009431	GC	3	6	119364	119369	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
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2617	NC_009431	GCCGAG	2	12	119471	119482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280350
2618	NC_009431	CGGG	2	8	119520	119527	0 %	0 %	75 %	25 %	146280350
2619	NC_009431	GGC	2	6	119551	119556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280350
2620	NC_009431	GCC	2	6	119570	119575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280350
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2622	NC_009431	GGCCGA	2	12	119632	119643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280350
2623	NC_009431	CTG	2	6	119651	119656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280350
2624	NC_009431	CGGCGC	2	12	119667	119678	0 %	0 %	50 %	50 %	146280350
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.