MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 6107

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009430	CTT	2	6	283765	283770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280238
6002	NC_009430	GCCG	2	8	283795	283802	0 %	0 %	50 %	50 %	146280238
6003	NC_009430	CAG	2	6	283804	283809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280238
6004	NC_009430	GGTC	2	8	283812	283819	0 %	25 %	50 %	25 %	146280238
6005	NC_009430	GGC	2	6	283821	283826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280238
6006	NC_009430	GCC	2	6	283865	283870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280238
6007	NC_009430	CGTC	2	8	283896	283903	0 %	25 %	25 %	50 %	146280238
6008	NC_009430	TCG	2	6	283922	283927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280238
6009	NC_009430	CGA	2	6	283987	283992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280238
6010	NC_009430	GC	3	6	284043	284048	0 %	0 %	50 %	50 %	146280238
6011	NC_009430	CAT	2	6	284071	284076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280238
6012	NC_009430	TGA	2	6	284115	284120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280238
6013	NC_009430	CGC	2	6	284988	284993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280239
6014	NC_009430	GGC	2	6	285018	285023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280239
6015	NC_009430	CCA	2	6	285080	285085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280239
6016	NC_009430	GC	3	6	285115	285120	0 %	0 %	50 %	50 %	146280239
6017	NC_009430	CTC	2	6	285210	285215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280239
6018	NC_009430	AGA	2	6	285220	285225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280239
6019	NC_009430	ATC	2	6	285262	285267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280239
6020	NC_009430	GCG	2	6	285284	285289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280239
6021	NC_009430	CTT	2	6	285303	285308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280239
6022	NC_009430	TGG	2	6	285343	285348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280239
6023	NC_009430	GC	3	6	285360	285365	0 %	0 %	50 %	50 %	146280239
6024	NC_009430	CCG	2	6	285378	285383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280239
6025	NC_009430	C	6	6	285495	285500	0 %	0 %	0 %	100 %	146280239
6026	NC_009430	GCG	2	6	285507	285512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280239
6027	NC_009430	GTG	2	6	285547	285552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280239
6028	NC_009430	TGG	2	6	285578	285583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280239
6029	NC_009430	GGTG	2	8	285653	285660	0 %	25 %	75 %	0 %	146280239
6030	NC_009430	TCA	2	6	285665	285670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146280239
6031	NC_009430	GC	3	6	285706	285711	0 %	0 %	50 %	50 %	146280239
6032	NC_009430	GCTG	2	8	285734	285741	0 %	25 %	50 %	25 %	146280239
6033	NC_009430	GTC	2	6	285894	285899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280239
6034	NC_009430	GAA	2	6	285930	285935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146280239
6035	NC_009430	G	7	7	285948	285954	0 %	0 %	100 %	0 %	146280239
6036	NC_009430	CGC	2	6	285957	285962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280239
6037	NC_009430	GCC	2	6	285982	285987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280239
6038	NC_009430	CCG	2	6	286675	286680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6039	NC_009430	GCC	2	6	286709	286714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6040	NC_009430	CG	4	8	286715	286722	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6041	NC_009430	TGCCGC	2	12	286732	286743	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146280240
6042	NC_009430	ACC	2	6	286797	286802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146280240
6043	NC_009430	GC	3	6	286857	286862	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6044	NC_009430	CGA	2	6	286868	286873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6045	NC_009430	CCG	2	6	286952	286957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6046	NC_009430	CGA	2	6	287030	287035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6047	NC_009430	TGC	2	6	287038	287043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6048	NC_009430	GC	3	6	287048	287053	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6049	NC_009430	CGG	2	6	287062	287067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280240
6050	NC_009430	CGAAGG	2	12	287074	287085	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146280240
6051	NC_009430	CCGCC	2	10	287099	287108	0 %	0 %	20 %	80 %	146280240
6052	NC_009430	TGG	2	6	287125	287130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146280240
6053	NC_009430	CGA	2	6	287276	287281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6054	NC_009430	CTC	2	6	287301	287306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146280240
6055	NC_009430	CG	4	8	287354	287361	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6056	NC_009430	CCG	2	6	287367	287372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6057	NC_009430	CGA	2	6	287381	287386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6058	NC_009430	CG	3	6	287412	287417	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6059	NC_009430	GC	3	6	287464	287469	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6060	NC_009430	C	7	7	287608	287614	0 %	0 %	0 %	100 %	146280240
6061	NC_009430	GCC	2	6	287649	287654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6062	NC_009430	CTG	2	6	287661	287666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6063	NC_009430	TCGAC	2	10	287695	287704	20 %	20 %	20 %	40 %	146280240
6064	NC_009430	CTT	2	6	287711	287716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146280240
6065	NC_009430	TCGA	2	8	287742	287749	25 %	25 %	25 %	25 %	146280240
6066	NC_009430	CGC	2	6	287765	287770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6067	NC_009430	GC	5	10	287769	287778	0 %	0 %	50 %	50 %	146280240
6068	NC_009430	GAG	2	6	287787	287792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280240
6069	NC_009430	TGCGG	2	10	287810	287819	0 %	20 %	60 %	20 %	146280240
6070	NC_009430	ACG	2	6	287836	287841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6071	NC_009430	GCA	2	6	287846	287851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6072	NC_009430	GGC	2	6	287861	287866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280240
6073	NC_009430	GGCG	2	8	287936	287943	0 %	0 %	75 %	25 %	146280240
6074	NC_009430	CGC	2	6	288032	288037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280240
6075	NC_009430	GCT	2	6	288047	288052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280240
6076	NC_009430	GGC	2	6	288064	288069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280240
6077	NC_009430	GGC	3	9	288080	288088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280240
6078	NC_009430	GGC	2	6	288092	288097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280240
6079	NC_009430	CAAGCG	2	12	288336	288347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280241
6080	NC_009430	TGC	2	6	288356	288361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280241
6081	NC_009430	CGG	2	6	288366	288371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6082	NC_009430	CGG	2	6	288383	288388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6083	NC_009430	GAT	2	6	288405	288410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280241
6084	NC_009430	GGC	3	9	288456	288464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6085	NC_009430	CCG	2	6	288467	288472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280241
6086	NC_009430	TGC	2	6	288527	288532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146280241
6087	NC_009430	GCTGGA	2	12	288534	288545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146280241
6088	NC_009430	GAG	2	6	288553	288558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280241
6089	NC_009430	GGCT	2	8	288559	288566	0 %	25 %	50 %	25 %	146280241
6090	NC_009430	TGA	2	6	288611	288616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146280241
6091	NC_009430	GCC	2	6	288719	288724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280241
6092	NC_009430	GC	3	6	288745	288750	0 %	0 %	50 %	50 %	146280241
6093	NC_009430	GCC	2	6	288776	288781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146280241
6094	NC_009430	CGG	2	6	288788	288793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6095	NC_009430	GAG	2	6	288817	288822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280241
6096	NC_009430	CAG	2	6	288919	288924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146280241
6097	NC_009430	GC	3	6	288998	289003	0 %	0 %	50 %	50 %	146280241
6098	NC_009430	GGCTGG	2	12	289031	289042	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146280241
6099	NC_009430	GCG	2	6	289050	289055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6100	NC_009430	GAG	3	9	289060	289068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146280241
6101	NC_009430	CG	3	6	289080	289085	0 %	0 %	50 %	50 %	146280241
6102	NC_009430	GGC	2	6	289092	289097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6103	NC_009430	GGCCGA	2	12	289122	289133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280241
6104	NC_009430	GGC	2	6	289158	289163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241
6105	NC_009430	CGAGGC	2	12	289185	289196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146280241
6106	NC_009430	CG	3	6	289302	289307	0 %	0 %	50 %	50 %	146280241
6107	NC_009430	CGG	2	6	289331	289336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146280241

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.