MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA01

Total Repeats: 18996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009429	C	6	6	243	248	0 %	0 %	0 %	100 %	146279171
2	NC_009429	CCT	2	6	283	288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279171
3	NC_009429	GCCG	2	8	382	389	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
4	NC_009429	GGC	2	6	436	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
5	NC_009429	GAG	2	6	452	457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
6	NC_009429	CGC	2	6	464	469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
7	NC_009429	GCCC	2	8	499	506	0 %	0 %	25 %	75 %	146279171
8	NC_009429	TCGGG	2	10	537	546	0 %	20 %	60 %	20 %	146279171
9	NC_009429	CAA	2	6	580	585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279171
10	NC_009429	TGG	2	6	654	659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
11	NC_009429	TCG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279171
12	NC_009429	GAC	2	6	857	862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279171
13	NC_009429	CGC	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
14	NC_009429	GGT	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
15	NC_009429	TCT	2	6	954	959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279171
16	NC_009429	CG	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
17	NC_009429	G	6	6	1128	1133	0 %	0 %	100 %	0 %	146279171
18	NC_009429	GCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
19	NC_009429	TCA	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279171
20	NC_009429	CCG	2	6	1203	1208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
21	NC_009429	GAG	2	6	1274	1279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
22	NC_009429	CGC	2	6	1363	1368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
23	NC_009429	GCC	2	6	1370	1375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
24	NC_009429	GC	3	6	1392	1397	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
25	NC_009429	GTG	3	9	1472	1480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279171
26	NC_009429	CGG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279171
27	NC_009429	GAG	2	6	1538	1543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279171
28	NC_009429	CGC	2	6	1566	1571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
29	NC_009429	GC	3	6	1598	1603	0 %	0 %	50 %	50 %	146279171
30	NC_009429	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279171
31	NC_009429	CGC	2	6	1669	1674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279171
32	NC_009429	GC	3	6	1887	1892	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
33	NC_009429	CGG	2	6	1911	1916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
34	NC_009429	CGG	2	6	1954	1959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
35	NC_009429	GCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
36	NC_009429	GCG	2	6	1983	1988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
37	NC_009429	ACG	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
38	NC_009429	TCGG	2	8	2141	2148	0 %	25 %	50 %	25 %	146279172
39	NC_009429	CGA	2	6	2163	2168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
40	NC_009429	CAGC	2	8	2184	2191	25 %	0 %	25 %	50 %	146279172
41	NC_009429	CAC	2	6	2194	2199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
42	NC_009429	GAC	2	6	2203	2208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
43	NC_009429	ACG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
44	NC_009429	CGG	2	6	2229	2234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
45	NC_009429	GGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
46	NC_009429	ACG	2	6	2285	2290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
47	NC_009429	CGG	2	6	2301	2306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
48	NC_009429	CGGC	2	8	2331	2338	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
49	NC_009429	CAC	2	6	2341	2346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
50	NC_009429	CCGGG	2	10	2361	2370	0 %	0 %	60 %	40 %	146279172
51	NC_009429	CGG	2	6	2373	2378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
52	NC_009429	GGC	2	6	2401	2406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
53	NC_009429	CGG	2	6	2407	2412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
54	NC_009429	CGG	2	6	2421	2426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
55	NC_009429	AGC	2	6	2481	2486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
56	NC_009429	GCG	3	9	2490	2498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
57	NC_009429	CGG	2	6	2538	2543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
58	NC_009429	CAG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
59	NC_009429	GCG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279172
60	NC_009429	GCC	2	6	2567	2572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279172
61	NC_009429	CCA	2	6	2595	2600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279172
62	NC_009429	GAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279172
63	NC_009429	GC	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
64	NC_009429	CGA	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279172
65	NC_009429	GCC	2	6	2654	2659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279172
66	NC_009429	GC	4	8	2677	2684	0 %	0 %	50 %	50 %	146279172
67	NC_009429	CCG	2	6	3007	3012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
68	NC_009429	GGC	2	6	3056	3061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
69	NC_009429	GCC	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
70	NC_009429	TCC	2	6	3196	3201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279173
71	NC_009429	GCCCG	2	10	3209	3218	0 %	0 %	40 %	60 %	146279173
72	NC_009429	GCG	2	6	3219	3224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
73	NC_009429	CGC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
74	NC_009429	TCC	2	6	3272	3277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279173
75	NC_009429	GGC	2	6	3406	3411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
76	NC_009429	CGG	2	6	3445	3450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
77	NC_009429	GGC	2	6	3557	3562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
78	NC_009429	CCTGG	2	10	3617	3626	0 %	20 %	40 %	40 %	146279173
79	NC_009429	GGC	2	6	3692	3697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
80	NC_009429	GGGC	2	8	3719	3726	0 %	0 %	75 %	25 %	146279173
81	NC_009429	GAC	2	6	3755	3760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279173
82	NC_009429	CGCCCT	2	12	3761	3772	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	146279173
83	NC_009429	GCT	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
84	NC_009429	GC	3	6	3790	3795	0 %	0 %	50 %	50 %	146279173
85	NC_009429	CGGCC	2	10	3818	3827	0 %	0 %	40 %	60 %	146279173
86	NC_009429	GCT	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
87	NC_009429	GC	3	6	3880	3885	0 %	0 %	50 %	50 %	146279173
88	NC_009429	CGC	3	9	3913	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279173
89	NC_009429	TGG	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279173
90	NC_009429	GCT	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279173
91	NC_009429	CAT	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279173
92	NC_009429	GGC	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279173
93	NC_009429	ATC	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279174
94	NC_009429	CGA	2	6	4267	4272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279174
95	NC_009429	GAT	3	9	4370	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279174
96	NC_009429	CGGC	2	8	4459	4466	0 %	0 %	50 %	50 %	146279175
97	NC_009429	GAC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
98	NC_009429	AGCC	2	8	4602	4609	25 %	0 %	25 %	50 %	146279175
99	NC_009429	AGA	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279175
100	NC_009429	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
101	NC_009429	GAC	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
102	NC_009429	TGA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
103	NC_009429	CAG	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
104	NC_009429	CCG	2	6	4943	4948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279175
105	NC_009429	CTT	2	6	4979	4984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279175
106	NC_009429	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279175
107	NC_009429	AGG	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279175
108	NC_009429	GTG	3	9	5076	5084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279175
109	NC_009429	CCG	2	6	5107	5112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279175
110	NC_009429	CAT	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279175
111	NC_009429	CCGATC	2	12	5316	5327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	146279175
112	NC_009429	CAG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
113	NC_009429	ATC	2	6	5436	5441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279175
114	NC_009429	ATG	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279175
115	NC_009429	CGA	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279175
116	NC_009429	GGGC	2	8	5563	5570	0 %	0 %	75 %	25 %	146279175
117	NC_009429	CCGC	2	8	5858	5865	0 %	0 %	25 %	75 %	146279176
118	NC_009429	ATG	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279176
119	NC_009429	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279176
120	NC_009429	GC	3	6	6024	6029	0 %	0 %	50 %	50 %	146279176
121	NC_009429	GAT	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279176
122	NC_009429	CGG	2	6	6107	6112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279176
123	NC_009429	GCTGGC	2	12	6161	6172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146279176
124	NC_009429	CAG	2	6	6174	6179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279176
125	NC_009429	GACG	2	8	6365	6372	25 %	0 %	50 %	25 %	146279177
126	NC_009429	GCC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
127	NC_009429	GC	3	6	6388	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	146279177
128	NC_009429	CGGC	2	8	6407	6414	0 %	0 %	50 %	50 %	146279177
129	NC_009429	CGG	2	6	6450	6455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279177
130	NC_009429	CCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279177
131	NC_009429	CTG	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279177
132	NC_009429	GC	3	6	6617	6622	0 %	0 %	50 %	50 %	146279177
133	NC_009429	GAT	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279177
134	NC_009429	GA	3	6	6687	6692	50 %	0 %	50 %	0 %	146279177
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254	NC_009429	TGGA	2	8	12520	12527	25 %	25 %	50 %	0 %	146279183
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261	NC_009429	CAA	2	6	12735	12740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146279183
262	NC_009429	C	6	6	12742	12747	0 %	0 %	0 %	100 %	146279183
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264	NC_009429	TGCA	2	8	12826	12833	25 %	25 %	25 %	25 %	146279183
265	NC_009429	GCC	2	6	12931	12936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279183
266	NC_009429	GCC	2	6	13023	13028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279184
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272	NC_009429	CG	3	6	13400	13405	0 %	0 %	50 %	50 %	146279184
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393	NC_009429	TC	3	6	19544	19549	0 %	50 %	0 %	50 %	146279189
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500	NC_009429	TGGCGC	2	12	23354	23365	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146279192

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