MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 74614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009428	GCC	2	6	148046	148051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276201
3502	NC_009428	GAG	2	6	148082	148087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276201
3503	NC_009428	GGC	2	6	148105	148110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276201
3504	NC_009428	GAG	2	6	148112	148117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276201
3505	NC_009428	CCGTGC	2	12	148120	148131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146276201
3506	NC_009428	GCC	3	9	148145	148153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276201
3507	NC_009428	GC	3	6	148165	148170	0 %	0 %	50 %	50 %	146276201
3508	NC_009428	AGG	2	6	148176	148181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276201
3509	NC_009428	GGCG	2	8	148204	148211	0 %	0 %	75 %	25 %	146276201
3510	NC_009428	GC	4	8	148223	148230	0 %	0 %	50 %	50 %	146276201
3511	NC_009428	GCC	2	6	148277	148282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276201
3512	NC_009428	CAG	2	6	148316	148321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3513	NC_009428	CG	3	6	148387	148392	0 %	0 %	50 %	50 %	146276201
3514	NC_009428	GC	3	6	148432	148437	0 %	0 %	50 %	50 %	146276201
3515	NC_009428	GATC	2	8	148492	148499	25 %	25 %	25 %	25 %	146276201
3516	NC_009428	GAG	2	6	148502	148507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276201
3517	NC_009428	GC	3	6	148522	148527	0 %	0 %	50 %	50 %	146276201
3518	NC_009428	GCT	2	6	148564	148569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3519	NC_009428	CGG	3	9	148624	148632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276201
3520	NC_009428	TGG	2	6	148650	148655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276201
3521	NC_009428	GAC	2	6	148661	148666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3522	NC_009428	GCC	2	6	148699	148704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276201
3523	NC_009428	AAG	2	6	148709	148714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276201
3524	NC_009428	GCT	2	6	148729	148734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3525	NC_009428	GCG	2	6	148740	148745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276201
3526	NC_009428	CGA	2	6	148816	148821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3527	NC_009428	CGA	2	6	148837	148842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3528	NC_009428	CTG	2	6	148868	148873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276201
3529	NC_009428	CGG	2	6	148886	148891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276201
3530	NC_009428	ATC	2	6	148910	148915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276201
3531	NC_009428	CAT	2	6	148919	148924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276201
3532	NC_009428	GC	3	6	148937	148942	0 %	0 %	50 %	50 %	146276201
3533	NC_009428	GAA	2	6	149008	149013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276201
3534	NC_009428	GCCA	2	8	149569	149576	25 %	0 %	25 %	50 %	146276202
3535	NC_009428	GGC	2	6	149599	149604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276202
3536	NC_009428	GC	3	6	149654	149659	0 %	0 %	50 %	50 %	146276202
3537	NC_009428	GGT	2	6	149670	149675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276202
3538	NC_009428	TGGCGG	2	12	149711	149722	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146276202
3539	NC_009428	GGT	2	6	149754	149759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276202
3540	NC_009428	GCC	2	6	149887	149892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276202
3541	NC_009428	TCAT	2	8	150001	150008	25 %	50 %	0 %	25 %	146276203
3542	NC_009428	CGC	2	6	150045	150050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276203
3543	NC_009428	CGG	2	6	150099	150104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276203
3544	NC_009428	TGC	2	6	150119	150124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276203
3545	NC_009428	GGT	2	6	150237	150242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276203
3546	NC_009428	CG	3	6	150274	150279	0 %	0 %	50 %	50 %	146276203
3547	NC_009428	GCC	2	6	150297	150302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276203
3548	NC_009428	GCAGGA	2	12	150315	150326	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	146276203
3549	NC_009428	GCC	2	6	150327	150332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276203
3550	NC_009428	CG	3	6	150347	150352	0 %	0 %	50 %	50 %	146276203
3551	NC_009428	AAG	2	6	150440	150445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276204
3552	NC_009428	CGC	2	6	150450	150455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276204
3553	NC_009428	GGC	2	6	150481	150486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276204
3554	NC_009428	CGG	2	6	150509	150514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276204
3555	NC_009428	TCG	2	6	150617	150622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276204
3556	NC_009428	GC	3	6	150627	150632	0 %	0 %	50 %	50 %	146276204
3557	NC_009428	GCCG	2	8	150691	150698	0 %	0 %	50 %	50 %	146276204
3558	NC_009428	CG	3	6	150763	150768	0 %	0 %	50 %	50 %	146276204
3559	NC_009428	ATG	2	6	150785	150790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276204
3560	NC_009428	GTG	2	6	150919	150924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276204
3561	NC_009428	CGCA	2	8	150956	150963	25 %	0 %	25 %	50 %	146276204
3562	NC_009428	GCC	2	6	151006	151011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276204
3563	NC_009428	GCG	2	6	151020	151025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276204
3564	NC_009428	CGC	2	6	151138	151143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276204
3565	NC_009428	CG	3	6	151152	151157	0 %	0 %	50 %	50 %	146276204
3566	NC_009428	CAC	2	6	151186	151191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276204
3567	NC_009428	CCGG	2	8	151200	151207	0 %	0 %	50 %	50 %	146276204
3568	NC_009428	TCCA	2	8	151298	151305	25 %	25 %	0 %	50 %	146276204
3569	NC_009428	GTC	2	6	151333	151338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276204
3570	NC_009428	GCC	2	6	151364	151369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276204
3571	NC_009428	GGC	2	6	151393	151398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276204
3572	NC_009428	CGG	2	6	151399	151404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276204
3573	NC_009428	CCAC	2	8	151422	151429	25 %	0 %	0 %	75 %	146276204
3574	NC_009428	CAT	2	6	151471	151476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276204
3575	NC_009428	CGG	2	6	151502	151507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276204
3576	NC_009428	TCG	2	6	151517	151522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276204
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3578	NC_009428	GCG	2	6	151812	151817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276205
3579	NC_009428	GCG	2	6	151835	151840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276205
3580	NC_009428	GTG	2	6	151845	151850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276205
3581	NC_009428	CAA	2	6	151859	151864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276205
3582	NC_009428	GAT	2	6	151895	151900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276205
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3584	NC_009428	GGA	2	6	151925	151930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276205
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3586	NC_009428	GAG	2	6	151944	151949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276205
3587	NC_009428	GAG	4	12	152034	152045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276205
3588	NC_009428	GCA	2	6	152075	152080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276205
3589	NC_009428	GAT	2	6	152141	152146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276205
3590	NC_009428	GTCC	2	8	152213	152220	0 %	25 %	25 %	50 %	146276206
3591	NC_009428	CCG	2	6	152265	152270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276206
3592	NC_009428	CCA	2	6	152313	152318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276206
3593	NC_009428	GCG	2	6	152345	152350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276206
3594	NC_009428	GCCG	2	8	152407	152414	0 %	0 %	50 %	50 %	146276206
3595	NC_009428	CG	3	6	152519	152524	0 %	0 %	50 %	50 %	146276206
3596	NC_009428	AGG	2	6	152568	152573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276206
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3598	NC_009428	GCC	2	6	152591	152596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276206
3599	NC_009428	GC	3	6	152663	152668	0 %	0 %	50 %	50 %	146276206
3600	NC_009428	GCC	2	6	152740	152745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276207
3601	NC_009428	CGA	2	6	152766	152771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276207
3602	NC_009428	GAC	2	6	152788	152793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276207
3603	NC_009428	TGC	2	6	152855	152860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276207
3604	NC_009428	TCC	2	6	152924	152929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276207
3605	NC_009428	GAG	2	6	152956	152961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276207
3606	NC_009428	CG	3	6	153005	153010	0 %	0 %	50 %	50 %	146276207
3607	NC_009428	GAA	2	6	153049	153054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276207
3608	NC_009428	ACC	2	6	153101	153106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276207
3609	NC_009428	GTC	2	6	153274	153279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276208
3610	NC_009428	GCC	2	6	153294	153299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276208
3611	NC_009428	CGGGG	2	10	153308	153317	0 %	0 %	80 %	20 %	146276208
3612	NC_009428	GAA	2	6	153318	153323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276208
3613	NC_009428	GGT	2	6	153444	153449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276208
3614	NC_009428	GCT	2	6	153525	153530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276208
3615	NC_009428	G	6	6	153542	153547	0 %	0 %	100 %	0 %	146276208
3616	NC_009428	CG	3	6	153562	153567	0 %	0 %	50 %	50 %	146276208
3617	NC_009428	CAT	2	6	153600	153605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276208
3618	NC_009428	CGA	2	6	153747	153752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276208
3619	NC_009428	GCCGCA	2	12	153759	153770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146276208
3620	NC_009428	GCG	2	6	153905	153910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276208
3621	NC_009428	GCT	2	6	153966	153971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276208
3622	NC_009428	CGA	2	6	154053	154058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276208
3623	NC_009428	GCG	3	9	154201	154209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276209
3624	NC_009428	CAT	2	6	154227	154232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276209
3625	NC_009428	CGA	2	6	154253	154258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276209
3626	NC_009428	GGGCG	2	10	154275	154284	0 %	0 %	80 %	20 %	146276209
3627	NC_009428	GCTG	2	8	154292	154299	0 %	25 %	50 %	25 %	146276209
3628	NC_009428	TGC	2	6	154367	154372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276209
3629	NC_009428	TCTGGC	2	12	154376	154387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276209
3630	NC_009428	GGC	2	6	154440	154445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276210
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3632	NC_009428	CCT	2	6	154475	154480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276210
3633	NC_009428	CAT	2	6	154512	154517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276210
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3635	NC_009428	GC	3	6	154585	154590	0 %	0 %	50 %	50 %	146276210
3636	NC_009428	GCC	2	6	154639	154644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276210
3637	NC_009428	GGCG	2	8	154665	154672	0 %	0 %	75 %	25 %	146276210
3638	NC_009428	GCG	2	6	154684	154689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276210
3639	NC_009428	GCC	3	9	154699	154707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276210
3640	NC_009428	GCC	2	6	154735	154740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276210
3641	NC_009428	CG	3	6	154754	154759	0 %	0 %	50 %	50 %	146276210
3642	NC_009428	CG	3	6	154967	154972	0 %	0 %	50 %	50 %	146276211
3643	NC_009428	CG	3	6	154985	154990	0 %	0 %	50 %	50 %	146276211
3644	NC_009428	GAC	2	6	155033	155038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276211
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3646	NC_009428	GCG	2	6	155055	155060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276211
3647	NC_009428	TTC	2	6	155085	155090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276211
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3649	NC_009428	TTC	2	6	155157	155162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276211
3650	NC_009428	TCGG	2	8	155193	155200	0 %	25 %	50 %	25 %	146276211
3651	NC_009428	CGC	2	6	155228	155233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276211
3652	NC_009428	GTT	2	6	155249	155254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146276211
3653	NC_009428	GGT	2	6	155255	155260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276211
3654	NC_009428	C	6	6	155271	155276	0 %	0 %	0 %	100 %	146276211
3655	NC_009428	ACC	2	6	155295	155300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276211
3656	NC_009428	TGG	2	6	155479	155484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276212
3657	NC_009428	TCCG	2	8	155542	155549	0 %	25 %	25 %	50 %	146276212
3658	NC_009428	CCGCC	2	10	155599	155608	0 %	0 %	20 %	80 %	146276212
3659	NC_009428	CCCG	2	8	155626	155633	0 %	0 %	25 %	75 %	146276212
3660	NC_009428	GC	3	6	155645	155650	0 %	0 %	50 %	50 %	146276212
3661	NC_009428	GCT	2	6	155653	155658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276212
3662	NC_009428	GAG	2	6	155673	155678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276212
3663	NC_009428	GCACC	2	10	155710	155719	20 %	0 %	20 %	60 %	146276212
3664	NC_009428	CG	3	6	155733	155738	0 %	0 %	50 %	50 %	146276212
3665	NC_009428	TCGGCC	2	12	155745	155756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146276212
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3674	NC_009428	CTG	2	6	156076	156081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276213
3675	NC_009428	CGA	2	6	156127	156132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276213
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3677	NC_009428	GCA	2	6	156240	156245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276213
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3679	NC_009428	GTTC	2	8	156273	156280	0 %	50 %	25 %	25 %	146276213
3680	NC_009428	GCCG	2	8	156296	156303	0 %	0 %	50 %	50 %	146276213
3681	NC_009428	GTC	2	6	156347	156352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276213
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3683	NC_009428	CAGGG	2	10	156490	156499	20 %	0 %	60 %	20 %	146276214
3684	NC_009428	AGT	2	6	156518	156523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276214
3685	NC_009428	CG	4	8	156551	156558	0 %	0 %	50 %	50 %	146276214
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3689	NC_009428	CAT	2	6	156717	156722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276214
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3694	NC_009428	CGT	2	6	157274	157279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276215
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3696	NC_009428	GC	4	8	157388	157395	0 %	0 %	50 %	50 %	146276215
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3700	NC_009428	GTC	2	6	157608	157613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276215
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3720	NC_009428	GGC	2	6	158582	158587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276215
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3730	NC_009428	GGA	2	6	159101	159106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276216
3731	NC_009428	CAC	2	6	159161	159166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276216
3732	NC_009428	CCG	2	6	159206	159211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276216
3733	NC_009428	TGA	2	6	159220	159225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276216
3734	NC_009428	CGA	2	6	159233	159238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276216
3735	NC_009428	GGC	2	6	159263	159268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276216
3736	NC_009428	GGC	2	6	159287	159292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276216
3737	NC_009428	GACG	2	8	159559	159566	25 %	0 %	50 %	25 %	146276217
3738	NC_009428	GGCG	2	8	159580	159587	0 %	0 %	75 %	25 %	146276217
3739	NC_009428	GC	3	6	159595	159600	0 %	0 %	50 %	50 %	146276217
3740	NC_009428	TCG	2	6	159606	159611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276217
3741	NC_009428	TTC	2	6	159615	159620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276217
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3743	NC_009428	TGG	2	6	159672	159677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276217
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3745	NC_009428	TCG	2	6	159711	159716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276217
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3856	NC_009428	GCC	2	6	166504	166509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276223
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3860	NC_009428	GTCGG	2	10	166718	166727	0 %	20 %	60 %	20 %	146276223
3861	NC_009428	AGC	2	6	166729	166734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276223
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3986	NC_009428	GCC	2	6	173144	173149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276232
3987	NC_009428	CGA	2	6	173157	173162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276232
3988	NC_009428	CG	3	6	173207	173212	0 %	0 %	50 %	50 %	146276232
3989	NC_009428	GCT	2	6	173217	173222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276232
3990	NC_009428	GGT	2	6	173223	173228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276232
3991	NC_009428	GTG	2	6	173299	173304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276232
3992	NC_009428	GACGGC	2	12	173317	173328	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146276232
3993	NC_009428	CGG	2	6	173331	173336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276232
3994	NC_009428	TGC	2	6	173337	173342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276232
3995	NC_009428	GC	3	6	173352	173357	0 %	0 %	50 %	50 %	146276232
3996	NC_009428	GCCG	2	8	173437	173444	0 %	0 %	50 %	50 %	146276232
3997	NC_009428	TCG	2	6	173474	173479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276232
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3999	NC_009428	GAT	2	6	173520	173525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276232
4000	NC_009428	GGC	2	6	173596	173601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276232

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