MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 chromosome

Total Repeats: 74614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009428	GCA	2	6	214825	214830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276277
5002	NC_009428	GCC	2	6	214891	214896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276277
5003	NC_009428	AGGA	2	8	214931	214938	50 %	0 %	50 %	0 %	146276277
5004	NC_009428	CCG	2	6	214974	214979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276277
5005	NC_009428	CG	3	6	214978	214983	0 %	0 %	50 %	50 %	146276277
5006	NC_009428	AGC	3	9	215021	215029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276277
5007	NC_009428	GCC	2	6	215039	215044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276277
5008	NC_009428	GCA	2	6	215061	215066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276277
5009	NC_009428	TGA	2	6	215130	215135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276277
5010	NC_009428	CGAGC	2	10	215152	215161	20 %	0 %	40 %	40 %	146276277
5011	NC_009428	GCCG	2	8	215394	215401	0 %	0 %	50 %	50 %	146276278
5012	NC_009428	CGA	2	6	215403	215408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276278
5013	NC_009428	TTC	2	6	215456	215461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276278
5014	NC_009428	CGG	2	6	215526	215531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5015	NC_009428	GCC	2	6	215547	215552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276278
5016	NC_009428	AGG	2	6	215618	215623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276278
5017	NC_009428	GGC	2	6	215683	215688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5018	NC_009428	GCG	2	6	215724	215729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5019	NC_009428	GAG	2	6	215738	215743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276278
5020	NC_009428	ATG	2	6	215744	215749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276278
5021	NC_009428	TCC	3	9	215792	215800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276278
5022	NC_009428	GCG	2	6	215808	215813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5023	NC_009428	GAA	2	6	215824	215829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276278
5024	NC_009428	GGT	2	6	215868	215873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276278
5025	NC_009428	GATGCC	2	12	215875	215886	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146276278
5026	NC_009428	GCGG	2	8	215938	215945	0 %	0 %	75 %	25 %	146276278
5027	NC_009428	CGG	2	6	216036	216041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5028	NC_009428	TGG	2	6	216072	216077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276278
5029	NC_009428	CCG	2	6	216087	216092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276278
5030	NC_009428	GC	3	6	216126	216131	0 %	0 %	50 %	50 %	146276278
5031	NC_009428	GC	3	6	216157	216162	0 %	0 %	50 %	50 %	146276278
5032	NC_009428	TGG	2	6	216171	216176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276278
5033	NC_009428	GCC	2	6	216275	216280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276278
5034	NC_009428	CGG	2	6	216309	216314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5035	NC_009428	CGG	2	6	216317	216322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5036	NC_009428	GAT	2	6	216379	216384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276278
5037	NC_009428	GTG	2	6	216386	216391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276278
5038	NC_009428	CGC	2	6	216393	216398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276278
5039	NC_009428	CCGCGG	2	12	216399	216410	0 %	0 %	50 %	50 %	146276278
5040	NC_009428	CCG	2	6	216417	216422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276278
5041	NC_009428	GCC	2	6	216502	216507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276278
5042	NC_009428	GGC	2	6	216533	216538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5043	NC_009428	GC	3	6	216543	216548	0 %	0 %	50 %	50 %	146276278
5044	NC_009428	CGG	2	6	216552	216557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276278
5045	NC_009428	GCCC	2	8	216564	216571	0 %	0 %	25 %	75 %	146276278
5046	NC_009428	CAG	2	6	216577	216582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276278
5047	NC_009428	CTCGGT	2	12	216589	216600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276278
5048	NC_009428	GGCG	2	8	216621	216628	0 %	0 %	75 %	25 %	146276278
5049	NC_009428	CGCGG	2	10	216663	216672	0 %	0 %	60 %	40 %	146276279
5050	NC_009428	GC	3	6	216682	216687	0 %	0 %	50 %	50 %	146276279
5051	NC_009428	AGA	2	6	216700	216705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276279
5052	NC_009428	GTC	2	6	216771	216776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276279
5053	NC_009428	TCC	2	6	216838	216843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276279
5054	NC_009428	GCA	2	6	216941	216946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276279
5055	NC_009428	TCA	2	6	216947	216952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276279
5056	NC_009428	CTT	2	6	216975	216980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276279
5057	NC_009428	GTC	2	6	216984	216989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276279
5058	NC_009428	CGG	2	6	217020	217025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276279
5059	NC_009428	GCG	2	6	217037	217042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276279
5060	NC_009428	GC	3	6	217092	217097	0 %	0 %	50 %	50 %	146276279
5061	NC_009428	CGC	2	6	217118	217123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276279
5062	NC_009428	GCG	2	6	217161	217166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276279
5063	NC_009428	AGC	2	6	217183	217188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276279
5064	NC_009428	GCC	2	6	217208	217213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276279
5065	NC_009428	CAG	2	6	217254	217259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276279
5066	NC_009428	CAC	2	6	217287	217292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276279
5067	NC_009428	GAG	2	6	217293	217298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276279
5068	NC_009428	GAG	2	6	217335	217340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276279
5069	NC_009428	CTT	2	6	217350	217355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276279
5070	NC_009428	TCA	2	6	217382	217387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276279
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5072	NC_009428	GCG	2	6	217503	217508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276279
5073	NC_009428	CGGAT	2	10	217544	217553	20 %	20 %	40 %	20 %	146276279
5074	NC_009428	GGC	2	6	217772	217777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276280
5075	NC_009428	CTGGC	2	10	217779	217788	0 %	20 %	40 %	40 %	146276280
5076	NC_009428	TGG	2	6	217846	217851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276280
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5080	NC_009428	GCC	3	9	217950	217958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276280
5081	NC_009428	CGAC	2	8	217960	217967	25 %	0 %	25 %	50 %	146276280
5082	NC_009428	GCC	2	6	217992	217997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276280
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5087	NC_009428	GCG	2	6	218106	218111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276280
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5089	NC_009428	GCGG	2	8	218129	218136	0 %	0 %	75 %	25 %	146276280
5090	NC_009428	GCT	2	6	218141	218146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276280
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5093	NC_009428	CGC	2	6	218236	218241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276280
5094	NC_009428	GAT	2	6	218273	218278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276280
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5099	NC_009428	CTG	2	6	218490	218495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276280
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5102	NC_009428	GC	4	8	218753	218760	0 %	0 %	50 %	50 %	146276281
5103	NC_009428	ACC	2	6	218820	218825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276281
5104	NC_009428	GCAG	2	8	218841	218848	25 %	0 %	50 %	25 %	146276281
5105	NC_009428	GGCA	2	8	218896	218903	25 %	0 %	50 %	25 %	146276281
5106	NC_009428	CGGGA	2	10	218935	218944	20 %	0 %	60 %	20 %	146276281
5107	NC_009428	GC	3	6	218974	218979	0 %	0 %	50 %	50 %	146276281
5108	NC_009428	CCG	2	6	218980	218985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276281
5109	NC_009428	CGGC	2	8	219013	219020	0 %	0 %	50 %	50 %	146276281
5110	NC_009428	TCTCGA	2	12	219091	219102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146276281
5111	NC_009428	GCA	2	6	219106	219111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276281
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5113	NC_009428	CG	4	8	219187	219194	0 %	0 %	50 %	50 %	146276281
5114	NC_009428	CGGG	2	8	219223	219230	0 %	0 %	75 %	25 %	146276281
5115	NC_009428	CAGCCG	2	12	219278	219289	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	146276281
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5118	NC_009428	CGGG	2	8	219355	219362	0 %	0 %	75 %	25 %	146276281
5119	NC_009428	AGCG	2	8	219408	219415	25 %	0 %	50 %	25 %	146276281
5120	NC_009428	CCG	2	6	219530	219535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276282
5121	NC_009428	GTC	2	6	219674	219679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276282
5122	NC_009428	CG	4	8	219735	219742	0 %	0 %	50 %	50 %	146276282
5123	NC_009428	CGG	2	6	219772	219777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276282
5124	NC_009428	GGGGA	2	10	219790	219799	20 %	0 %	80 %	0 %	146276282
5125	NC_009428	CGG	2	6	220011	220016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276282
5126	NC_009428	GAT	2	6	220034	220039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276282
5127	NC_009428	TGC	2	6	220059	220064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276282
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5129	NC_009428	GGTCG	2	10	220202	220211	0 %	20 %	60 %	20 %	146276283
5130	NC_009428	CG	3	6	220255	220260	0 %	0 %	50 %	50 %	146276283
5131	NC_009428	TGA	2	6	220315	220320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276283
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5134	NC_009428	GCGCC	2	10	220399	220408	0 %	0 %	40 %	60 %	146276283
5135	NC_009428	CGT	2	6	220418	220423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276283
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5142	NC_009428	CAG	2	6	220774	220779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276284
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5224	NC_009428	GA	3	6	224074	224079	50 %	0 %	50 %	0 %	146276288
5225	NC_009428	GAC	2	6	224097	224102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276288
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5227	NC_009428	CAG	2	6	224181	224186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276288
5228	NC_009428	AGCC	2	8	224188	224195	25 %	0 %	25 %	50 %	146276288
5229	NC_009428	C	6	6	224248	224253	0 %	0 %	0 %	100 %	146276288
5230	NC_009428	GAA	2	6	224256	224261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276288
5231	NC_009428	CGG	2	6	224273	224278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276288
5232	NC_009428	TGGCGA	2	12	224294	224305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146276288
5233	NC_009428	AGCC	2	8	224419	224426	25 %	0 %	25 %	50 %	146276288
5234	NC_009428	AGC	2	6	224452	224457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276288
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5236	NC_009428	CGC	3	9	224559	224567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276288
5237	NC_009428	CGA	2	6	224570	224575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276288
5238	NC_009428	CCA	2	6	224612	224617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276288
5239	NC_009428	AGC	2	6	224620	224625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276288
5240	NC_009428	GCC	2	6	224641	224646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276288
5241	NC_009428	GGC	2	6	224808	224813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276288
5242	NC_009428	CAT	2	6	224823	224828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146276288
5243	NC_009428	GCG	2	6	224852	224857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276288
5244	NC_009428	GCG	2	6	224878	224883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276288
5245	NC_009428	GCC	2	6	224925	224930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276288
5246	NC_009428	GGC	2	6	224991	224996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276288
5247	NC_009428	TGA	2	6	225014	225019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276288
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5262	NC_009428	GC	4	8	225522	225529	0 %	0 %	50 %	50 %	146276288
5263	NC_009428	CGGC	2	8	225535	225542	0 %	0 %	50 %	50 %	146276288
5264	NC_009428	GAAG	2	8	225569	225576	50 %	0 %	50 %	0 %	146276288
5265	NC_009428	GAG	2	6	225577	225582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276288
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5272	NC_009428	AGG	2	6	225766	225771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276288
5273	NC_009428	GAA	2	6	225786	225791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146276288
5274	NC_009428	CGC	2	6	225845	225850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276288
5275	NC_009428	CAG	2	6	225882	225887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276288
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5334	NC_009428	TCGA	2	8	228326	228333	25 %	25 %	25 %	25 %	146276290
5335	NC_009428	CGG	2	6	228334	228339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276290
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5341	NC_009428	TCGA	2	8	228539	228546	25 %	25 %	25 %	25 %	146276290
5342	NC_009428	CGCGG	2	10	228554	228563	0 %	0 %	60 %	40 %	146276290
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5344	NC_009428	CGCAG	2	10	228752	228761	20 %	0 %	40 %	40 %	146276291
5345	NC_009428	ACA	2	6	228771	228776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146276291
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5347	NC_009428	CTCG	2	8	228804	228811	0 %	25 %	25 %	50 %	146276291
5348	NC_009428	GTC	2	6	228829	228834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276291
5349	NC_009428	TCGATC	2	12	228835	228846	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	146276291
5350	NC_009428	TTC	2	6	228871	228876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276291
5351	NC_009428	ACGCTG	2	12	228886	228897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	146276291
5352	NC_009428	GCA	2	6	228903	228908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146276291
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5355	NC_009428	GTCCT	2	10	228994	229003	0 %	40 %	20 %	40 %	146276291
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5359	NC_009428	GCC	2	6	229128	229133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276291
5360	NC_009428	GGC	2	6	229170	229175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276291
5361	NC_009428	TTC	2	6	229246	229251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146276291
5362	NC_009428	GGCC	2	8	229281	229288	0 %	0 %	50 %	50 %	146276291
5363	NC_009428	GCG	2	6	229292	229297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276291
5364	NC_009428	TGC	2	6	229337	229342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276291
5365	NC_009428	TGC	2	6	229355	229360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146276291
5366	NC_009428	GCC	2	6	229376	229381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276291
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5372	NC_009428	CGG	2	6	229532	229537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276291
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5477	NC_009428	TGG	2	6	233257	233262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276295
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5480	NC_009428	CGG	2	6	233516	233521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276295
5481	NC_009428	GC	3	6	233522	233527	0 %	0 %	50 %	50 %	146276295
5482	NC_009428	GGCGC	2	10	233557	233566	0 %	0 %	60 %	40 %	146276295
5483	NC_009428	ACC	2	6	233590	233595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146276295
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5485	NC_009428	GCC	2	6	233640	233645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146276295
5486	NC_009428	GGC	2	6	233681	233686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146276295
5487	NC_009428	GGGC	2	8	233723	233730	0 %	0 %	75 %	25 %	146276295
5488	NC_009428	TGA	2	6	233731	233736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276295
5489	NC_009428	GAG	2	6	233751	233756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276295
5490	NC_009428	TGG	2	6	233770	233775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146276295
5491	NC_009428	CG	4	8	233789	233796	0 %	0 %	50 %	50 %	146276295
5492	NC_009428	GGA	2	6	233813	233818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146276295
5493	NC_009428	TCC	2	6	233824	233829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146276295
5494	NC_009428	ACCG	2	8	233874	233881	25 %	0 %	25 %	50 %	146276295
5495	NC_009428	CGTGGA	2	12	233888	233899	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146276295
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5498	NC_009428	GTA	2	6	233988	233993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146276296
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