MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_008435	GCGA	2	8	671598	671605	25 %	0 %	50 %	25 %	115522634
15502	NC_008435	GCGG	2	8	671611	671618	0 %	0 %	75 %	25 %	115522634
15503	NC_008435	GCC	2	6	671651	671656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522634
15504	NC_008435	ACG	2	6	671682	671687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15505	NC_008435	TCG	2	6	671694	671699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15506	NC_008435	CGG	2	6	671738	671743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522634
15507	NC_008435	GCT	2	6	671821	671826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15508	NC_008435	GC	3	6	671835	671840	0 %	0 %	50 %	50 %	115522634
15509	NC_008435	GTA	2	6	671849	671854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522634
15510	NC_008435	CGT	2	6	671863	671868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15511	NC_008435	GCC	2	6	671912	671917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522634
15512	NC_008435	GCA	2	6	671959	671964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15513	NC_008435	GTC	2	6	671975	671980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15514	NC_008435	GCT	2	6	672079	672084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15515	NC_008435	ATG	2	6	672147	672152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522634
15516	NC_008435	AGC	2	6	672225	672230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15517	NC_008435	GTCCGG	2	12	672233	672244	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522634
15518	NC_008435	CGG	2	6	672249	672254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522634
15519	NC_008435	CAT	2	6	672281	672286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522634
15520	NC_008435	TTG	2	6	672408	672413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522634
15521	NC_008435	CAA	2	6	672431	672436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522634
15522	NC_008435	CGC	2	6	672478	672483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522634
15523	NC_008435	TTGGCG	2	12	672489	672500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115522634
15524	NC_008435	GGC	2	6	672557	672562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522634
15525	NC_008435	CGG	2	6	672566	672571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522634
15526	NC_008435	CGA	2	6	672586	672591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15527	NC_008435	TGT	2	6	672705	672710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522635
15528	NC_008435	GCT	2	6	672711	672716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15529	NC_008435	GCA	2	6	672729	672734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15530	NC_008435	CTT	2	6	672832	672837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522635
15531	NC_008435	TCG	2	6	672842	672847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15532	NC_008435	CGG	2	6	672859	672864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522635
15533	NC_008435	TCG	3	9	672965	672973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15534	NC_008435	AGC	2	6	672981	672986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15535	NC_008435	TCGA	2	8	672995	673002	25 %	25 %	25 %	25 %	115522635
15536	NC_008435	GCG	2	6	673017	673022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522635
15537	NC_008435	GCT	2	6	673023	673028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15538	NC_008435	CAC	2	6	673048	673053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522635
15539	NC_008435	GCT	2	6	673077	673082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15540	NC_008435	GCG	2	6	673094	673099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522635
15541	NC_008435	AGC	2	6	673157	673162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15542	NC_008435	GGA	2	6	673174	673179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522635
15543	NC_008435	CG	3	6	673201	673206	0 %	0 %	50 %	50 %	115522635
15544	NC_008435	CGG	2	6	673232	673237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522635
15545	NC_008435	GGT	2	6	673276	673281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522635
15546	NC_008435	CGC	2	6	673347	673352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522635
15547	NC_008435	GTC	2	6	673357	673362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15548	NC_008435	GC	4	8	673390	673397	0 %	0 %	50 %	50 %	115522635
15549	NC_008435	CAT	2	6	673465	673470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522635
15550	NC_008435	CGA	2	6	673476	673481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15551	NC_008435	GCCG	2	8	673488	673495	0 %	0 %	50 %	50 %	115522635
15552	NC_008435	ATA	2	6	673546	673551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522635
15553	NC_008435	CGC	3	9	673581	673589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522635
15554	NC_008435	CGG	2	6	673614	673619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522635
15555	NC_008435	TAA	2	6	673643	673648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522635
15556	NC_008435	CG	3	6	673697	673702	0 %	0 %	50 %	50 %	115522635
15557	NC_008435	CGA	2	6	673743	673748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522635
15558	NC_008435	GC	3	6	673765	673770	0 %	0 %	50 %	50 %	115522635
15559	NC_008435	TCG	2	6	674212	674217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522636
15560	NC_008435	TCG	2	6	674287	674292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522636
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15564	NC_008435	CGC	2	6	674468	674473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522636
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15566	NC_008435	CGG	2	6	674498	674503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522636
15567	NC_008435	CGGC	2	8	674513	674520	0 %	0 %	50 %	50 %	115522636
15568	NC_008435	CGC	2	6	674529	674534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522636
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15570	NC_008435	CG	3	6	674596	674601	0 %	0 %	50 %	50 %	115522636
15571	NC_008435	GCC	2	6	674605	674610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522636
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15573	NC_008435	TTTGC	2	10	674686	674695	0 %	60 %	20 %	20 %	115522636
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15577	NC_008435	GCG	2	6	675095	675100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522636
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15585	NC_008435	GC	3	6	675549	675554	0 %	0 %	50 %	50 %	115522637
15586	NC_008435	GTG	2	6	675625	675630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522637
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15589	NC_008435	GCG	4	12	675939	675950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522638
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15595	NC_008435	CGG	2	6	676060	676065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522638
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15599	NC_008435	CCG	2	6	676212	676217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522638
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15601	NC_008435	GTC	2	6	676310	676315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522638
15602	NC_008435	CG	4	8	676333	676340	0 %	0 %	50 %	50 %	115522638
15603	NC_008435	CTC	2	6	676345	676350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522638
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15606	NC_008435	GC	3	6	676409	676414	0 %	0 %	50 %	50 %	115522638
15607	NC_008435	CGT	2	6	676444	676449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522638
15608	NC_008435	CCGA	2	8	676460	676467	25 %	0 %	25 %	50 %	115522638
15609	NC_008435	GC	3	6	676497	676502	0 %	0 %	50 %	50 %	115522638
15610	NC_008435	GGC	2	6	676551	676556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522638
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15619	NC_008435	GCCGGC	2	12	676858	676869	0 %	0 %	50 %	50 %	115522639
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15738	NC_008435	ACG	2	6	681096	681101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522642
15739	NC_008435	ATGC	2	8	681135	681142	25 %	25 %	25 %	25 %	115522642
15740	NC_008435	CGT	2	6	681378	681383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522643
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15852	NC_008435	CTC	2	6	685374	685379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522645
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15976	NC_008435	AGA	2	6	690171	690176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522649
15977	NC_008435	GAA	2	6	690344	690349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522650
15978	NC_008435	CGG	2	6	690380	690385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522650
15979	NC_008435	GCGAGC	2	12	690388	690399	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522650
15980	NC_008435	CGCC	2	8	690423	690430	0 %	0 %	25 %	75 %	115522650
15981	NC_008435	AAT	2	6	690458	690463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522650
15982	NC_008435	ACG	2	6	690469	690474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522650
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15984	NC_008435	GGC	2	6	690489	690494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522650
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15986	NC_008435	ACG	3	9	690580	690588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522650
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15988	NC_008435	CGCGGG	2	12	690712	690723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522651
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15990	NC_008435	GCA	2	6	690769	690774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522651
15991	NC_008435	GAA	2	6	690806	690811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522651
15992	NC_008435	CG	3	6	690835	690840	0 %	0 %	50 %	50 %	115522651
15993	NC_008435	ATC	2	6	690845	690850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522651
15994	NC_008435	CGA	2	6	690859	690864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522651
15995	NC_008435	CG	3	6	690918	690923	0 %	0 %	50 %	50 %	115522651
15996	NC_008435	CG	4	8	690958	690965	0 %	0 %	50 %	50 %	115522651
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15999	NC_008435	AGC	2	6	691086	691091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522651
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