MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_008435	CGG	2	6	650820	650825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522615
15002	NC_008435	ATC	2	6	650836	650841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522615
15003	NC_008435	CG	5	10	650920	650929	0 %	0 %	50 %	50 %	115522615
15004	NC_008435	TTC	2	6	650965	650970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522615
15005	NC_008435	GATG	2	8	650980	650987	25 %	25 %	50 %	0 %	115522615
15006	NC_008435	AAT	2	6	651004	651009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522615
15007	NC_008435	CGA	2	6	651018	651023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522615
15008	NC_008435	GGC	2	6	651049	651054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522615
15009	NC_008435	CGG	2	6	651081	651086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522615
15010	NC_008435	CGG	2	6	651101	651106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522615
15011	NC_008435	ATC	2	6	651146	651151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522615
15012	NC_008435	GAT	2	6	651192	651197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522615
15013	NC_008435	AGC	2	6	651242	651247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522615
15014	NC_008435	CGCTG	2	10	651288	651297	0 %	20 %	40 %	40 %	115522615
15015	NC_008435	GCA	2	6	651410	651415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522615
15016	NC_008435	CGG	2	6	651601	651606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522616
15017	NC_008435	CGCGGC	2	12	651612	651623	0 %	0 %	50 %	50 %	115522616
15018	NC_008435	CGG	2	6	651628	651633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522616
15019	NC_008435	CGT	2	6	651651	651656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15020	NC_008435	TCGA	2	8	651691	651698	25 %	25 %	25 %	25 %	115522616
15021	NC_008435	GCA	2	6	651701	651706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15022	NC_008435	TCG	2	6	651712	651717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15023	NC_008435	GTC	2	6	651739	651744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15024	NC_008435	CGCACC	2	12	651865	651876	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	115522616
15025	NC_008435	GAC	2	6	651921	651926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15026	NC_008435	CGC	2	6	651994	651999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522616
15027	NC_008435	CGAGCA	2	12	652034	652045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15028	NC_008435	CGC	2	6	652061	652066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522616
15029	NC_008435	GGC	2	6	652071	652076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522616
15030	NC_008435	GCG	2	6	652094	652099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522616
15031	NC_008435	CGC	2	6	652115	652120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522616
15032	NC_008435	TTC	2	6	652123	652128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522616
15033	NC_008435	GGCGC	2	10	652143	652152	0 %	0 %	60 %	40 %	115522616
15034	NC_008435	GTA	2	6	652170	652175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522616
15035	NC_008435	GCC	2	6	652203	652208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522616
15036	NC_008435	GCC	2	6	652252	652257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522616
15037	NC_008435	GCGAT	2	10	652277	652286	20 %	20 %	40 %	20 %	115522616
15038	NC_008435	TGG	2	6	652295	652300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522616
15039	NC_008435	CCGTCG	2	12	652339	652350	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522616
15040	NC_008435	TTTG	2	8	652358	652365	0 %	75 %	25 %	0 %	115522616
15041	NC_008435	CAA	2	6	652392	652397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522616
15042	NC_008435	GCC	2	6	652443	652448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522616
15043	NC_008435	GCCGG	2	10	652506	652515	0 %	0 %	60 %	40 %	115522616
15044	NC_008435	CGT	2	6	652538	652543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522616
15045	NC_008435	CGG	3	9	652587	652595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15046	NC_008435	CGG	2	6	652682	652687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15047	NC_008435	GC	3	6	652699	652704	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15048	NC_008435	CGA	2	6	652753	652758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15049	NC_008435	CGG	2	6	652772	652777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15050	NC_008435	GGC	2	6	652823	652828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15051	NC_008435	TTC	2	6	652850	652855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522617
15052	NC_008435	GCCCAT	2	12	652868	652879	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522617
15053	NC_008435	GACC	2	8	652900	652907	25 %	0 %	25 %	50 %	115522617
15054	NC_008435	GTC	2	6	652982	652987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15055	NC_008435	ACC	2	6	653001	653006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522617
15056	NC_008435	GCG	2	6	653010	653015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15057	NC_008435	TGG	2	6	653029	653034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522617
15058	NC_008435	GCC	2	6	653060	653065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15059	NC_008435	CGG	2	6	653075	653080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15060	NC_008435	GCC	2	6	653130	653135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15061	NC_008435	ACC	2	6	653136	653141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522617
15062	NC_008435	GC	3	6	653164	653169	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15063	NC_008435	GCC	2	6	653235	653240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15064	NC_008435	GCG	2	6	653241	653246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15065	NC_008435	ATCG	2	8	653276	653283	25 %	25 %	25 %	25 %	115522617
15066	NC_008435	CGA	2	6	653312	653317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15067	NC_008435	CCA	2	6	653413	653418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522617
15068	NC_008435	GAG	2	6	653424	653429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522617
15069	NC_008435	CGG	2	6	653443	653448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15070	NC_008435	CGC	2	6	653467	653472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15071	NC_008435	ACC	2	6	653496	653501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522617
15072	NC_008435	CGG	2	6	653582	653587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15073	NC_008435	GC	3	6	653692	653697	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15074	NC_008435	GC	3	6	653709	653714	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15075	NC_008435	AGC	2	6	653760	653765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15076	NC_008435	CGC	2	6	653812	653817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15077	NC_008435	GGC	2	6	653820	653825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15078	NC_008435	CGT	2	6	653848	653853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15079	NC_008435	GCA	2	6	653884	653889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15080	NC_008435	GC	3	6	653890	653895	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15081	NC_008435	GCC	2	6	653936	653941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15082	NC_008435	CAC	2	6	653948	653953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522617
15083	NC_008435	TTCGCA	2	12	653954	653965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522617
15084	NC_008435	CG	3	6	654052	654057	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15085	NC_008435	TGA	2	6	654106	654111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522617
15086	NC_008435	CG	4	8	654133	654140	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15087	NC_008435	CCG	3	9	654147	654155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15088	NC_008435	ATA	2	6	654224	654229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522617
15089	NC_008435	CAGG	2	8	654287	654294	25 %	0 %	50 %	25 %	115522617
15090	NC_008435	TGAT	2	8	654315	654322	25 %	50 %	25 %	0 %	115522617
15091	NC_008435	CCG	2	6	654358	654363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15092	NC_008435	CGG	2	6	654373	654378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15093	NC_008435	CG	3	6	654404	654409	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15094	NC_008435	CAA	2	6	654437	654442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522617
15095	NC_008435	AGTTCG	2	12	654498	654509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115522617
15096	NC_008435	GATC	2	8	654514	654521	25 %	25 %	25 %	25 %	115522617
15097	NC_008435	CCG	2	6	654529	654534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15098	NC_008435	GCG	2	6	654537	654542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522617
15099	NC_008435	CGC	2	6	654571	654576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522617
15100	NC_008435	CG	3	6	654592	654597	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15101	NC_008435	ATTC	2	8	654607	654614	25 %	50 %	0 %	25 %	115522617
15102	NC_008435	GCA	2	6	654625	654630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15103	NC_008435	CGA	2	6	654670	654675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522617
15104	NC_008435	CGAGCG	2	12	654682	654693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522617
15105	NC_008435	GC	3	6	654791	654796	0 %	0 %	50 %	50 %	115522617
15106	NC_008435	GCCC	2	8	654850	654857	0 %	0 %	25 %	75 %	115522617
15107	NC_008435	GCC	2	6	654896	654901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522618
15108	NC_008435	CAA	2	6	655000	655005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522618
15109	NC_008435	CTG	2	6	655075	655080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522618
15110	NC_008435	CAA	2	6	655149	655154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522618
15111	NC_008435	ACGGC	2	10	655167	655176	20 %	0 %	40 %	40 %	115522618
15112	NC_008435	CGC	2	6	655212	655217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522618
15113	NC_008435	CGA	2	6	655248	655253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522618
15114	NC_008435	TC	3	6	655256	655261	0 %	50 %	0 %	50 %	115522618
15115	NC_008435	CAT	2	6	655276	655281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522618
15116	NC_008435	GCG	2	6	655554	655559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
15117	NC_008435	GCG	3	9	655656	655664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522619
15118	NC_008435	GGTC	2	8	655667	655674	0 %	25 %	50 %	25 %	115522619
15119	NC_008435	TGC	2	6	655723	655728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522619
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15229	NC_008435	CTCG	2	8	660209	660216	0 %	25 %	25 %	50 %	115522622
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15235	NC_008435	CGT	2	6	660386	660391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
15236	NC_008435	CAT	2	6	660515	660520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522622
15237	NC_008435	ACC	2	6	660543	660548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522622
15238	NC_008435	CTG	2	6	660558	660563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
15239	NC_008435	GC	3	6	660568	660573	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
15240	NC_008435	CGGC	2	8	660583	660590	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
15241	NC_008435	CGA	2	6	660602	660607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522622
15242	NC_008435	GC	3	6	660712	660717	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
15243	NC_008435	GCC	2	6	660783	660788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522622
15244	NC_008435	GGCC	2	8	660812	660819	0 %	0 %	50 %	50 %	115522622
15245	NC_008435	CGGA	2	8	660845	660852	25 %	0 %	50 %	25 %	115522622
15246	NC_008435	GCG	2	6	660901	660906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522622
15247	NC_008435	CTG	2	6	660912	660917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
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15250	NC_008435	GCT	2	6	660974	660979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522622
15251	NC_008435	CGTCAT	2	12	661004	661015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522622
15252	NC_008435	CGC	2	6	661040	661045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522622
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15254	NC_008435	GCG	2	6	661245	661250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522623
15255	NC_008435	GTCG	2	8	661262	661269	0 %	25 %	50 %	25 %	115522623
15256	NC_008435	CTG	2	6	661286	661291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522623
15257	NC_008435	GCT	2	6	661318	661323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522623
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15260	NC_008435	CTG	2	6	661481	661486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522623
15261	NC_008435	CGG	2	6	661597	661602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522623
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15265	NC_008435	ATCGTC	2	12	661748	661759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522623
15266	NC_008435	CGA	2	6	661771	661776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522623
15267	NC_008435	GTG	2	6	661823	661828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522623
15268	NC_008435	TCCG	2	8	661961	661968	0 %	25 %	25 %	50 %	115522624
15269	NC_008435	TGC	2	6	661970	661975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522624
15270	NC_008435	GATC	2	8	662001	662008	25 %	25 %	25 %	25 %	115522624
15271	NC_008435	ACA	2	6	662012	662017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522624
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15274	NC_008435	GGC	2	6	662055	662060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522624
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15276	NC_008435	CGCT	2	8	662090	662097	0 %	25 %	25 %	50 %	115522624
15277	NC_008435	CGG	2	6	662157	662162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522624
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15281	NC_008435	AGC	2	6	662405	662410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522624
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15294	NC_008435	GTC	2	6	663137	663142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522625
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15302	NC_008435	GC	3	6	663630	663635	0 %	0 %	50 %	50 %	115522626
15303	NC_008435	CGG	2	6	663663	663668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522626
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15305	NC_008435	ATC	2	6	663715	663720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522626
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15308	NC_008435	CG	3	6	663784	663789	0 %	0 %	50 %	50 %	115522626
15309	NC_008435	TGC	2	6	663800	663805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522626
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15315	NC_008435	CGG	2	6	663981	663986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522627
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15321	NC_008435	GC	3	6	664164	664169	0 %	0 %	50 %	50 %	115522627
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15326	NC_008435	GCC	2	6	664269	664274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522627
15327	NC_008435	TCG	2	6	664306	664311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522627
15328	NC_008435	GCC	2	6	664330	664335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522627
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15333	NC_008435	CGGT	2	8	664553	664560	0 %	25 %	50 %	25 %	115522628
15334	NC_008435	TCA	2	6	664600	664605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522628
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15338	NC_008435	CTG	2	6	664679	664684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522628
15339	NC_008435	CGA	2	6	664753	664758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522628
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15341	NC_008435	CAG	2	6	664832	664837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522628
15342	NC_008435	GCC	2	6	664862	664867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522628
15343	NC_008435	AGGTC	2	10	664957	664966	20 %	20 %	40 %	20 %	115522628
15344	NC_008435	GCC	2	6	665000	665005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522628
15345	NC_008435	CCGTCG	2	12	665016	665027	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115522628
15346	NC_008435	GCGA	2	8	665085	665092	25 %	0 %	50 %	25 %	115522628
15347	NC_008435	CGA	2	6	665144	665149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522628
15348	NC_008435	CGG	2	6	665183	665188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522628
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15350	NC_008435	TGC	2	6	665326	665331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522628
15351	NC_008435	GGCCT	2	10	665356	665365	0 %	20 %	40 %	40 %	115522629
15352	NC_008435	CAC	2	6	665401	665406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522629
15353	NC_008435	GTC	2	6	665407	665412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522629
15354	NC_008435	GC	3	6	665429	665434	0 %	0 %	50 %	50 %	115522629
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15356	NC_008435	GC	4	8	665573	665580	0 %	0 %	50 %	50 %	115522629
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15473	NC_008435	CAT	2	6	670493	670498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522633
15474	NC_008435	GC	3	6	670501	670506	0 %	0 %	50 %	50 %	115522633
15475	NC_008435	ATC	2	6	670626	670631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522633
15476	NC_008435	GC	3	6	670682	670687	0 %	0 %	50 %	50 %	115522633
15477	NC_008435	CGG	2	6	670695	670700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522633
15478	NC_008435	CGC	2	6	670717	670722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522633
15479	NC_008435	CGG	2	6	670724	670729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522633
15480	NC_008435	GAT	2	6	670745	670750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522633
15481	NC_008435	CG	4	8	670798	670805	0 %	0 %	50 %	50 %	115522633
15482	NC_008435	GAA	2	6	670850	670855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522633
15483	NC_008435	TCGT	2	8	670968	670975	0 %	50 %	25 %	25 %	115522633
15484	NC_008435	TCG	2	6	671004	671009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522633
15485	NC_008435	GCC	2	6	671052	671057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522633
15486	NC_008435	GC	3	6	671101	671106	0 %	0 %	50 %	50 %	115522633
15487	NC_008435	TCC	2	6	671142	671147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522633
15488	NC_008435	CG	3	6	671157	671162	0 %	0 %	50 %	50 %	115522633
15489	NC_008435	TCG	2	6	671220	671225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522633
15490	NC_008435	AGC	2	6	671226	671231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522633
15491	NC_008435	TGG	3	9	671239	671247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522633
15492	NC_008435	CAT	2	6	671279	671284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522633
15493	NC_008435	CTC	2	6	671287	671292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522634
15494	NC_008435	GCCGC	2	10	671295	671304	0 %	0 %	40 %	60 %	115522634
15495	NC_008435	GC	3	6	671313	671318	0 %	0 %	50 %	50 %	115522634
15496	NC_008435	ATC	2	6	671328	671333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522634
15497	NC_008435	GGC	2	6	671366	671371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522634
15498	NC_008435	CAT	2	6	671447	671452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522634
15499	NC_008435	CAG	2	6	671453	671458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522634
15500	NC_008435	GGCC	2	8	671461	671468	0 %	0 %	50 %	50 %	115522634

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