MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008435	CCG	2	6	595710	595715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522572
14002	NC_008435	CTA	2	6	595723	595728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522572
14003	NC_008435	TAC	2	6	595787	595792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522572
14004	NC_008435	CGC	2	6	595810	595815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522572
14005	NC_008435	GGC	2	6	595831	595836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522572
14006	NC_008435	GC	4	8	595890	595897	0 %	0 %	50 %	50 %	115522572
14007	NC_008435	CAC	2	6	595906	595911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522572
14008	NC_008435	CGG	2	6	595990	595995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522572
14009	NC_008435	GGT	3	9	596026	596034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522572
14010	NC_008435	CCA	2	6	596097	596102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522572
14011	NC_008435	TCG	2	6	596150	596155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522572
14012	NC_008435	CG	3	6	596162	596167	0 %	0 %	50 %	50 %	115522572
14013	NC_008435	TC	3	6	596173	596178	0 %	50 %	0 %	50 %	115522572
14014	NC_008435	TGC	2	6	596208	596213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522572
14015	NC_008435	GC	3	6	596235	596240	0 %	0 %	50 %	50 %	115522572
14016	NC_008435	CAT	2	6	596251	596256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522572
14017	NC_008435	CGG	2	6	596257	596262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522572
14018	NC_008435	GCCG	2	8	596286	596293	0 %	0 %	50 %	50 %	115522572
14019	NC_008435	GAG	2	6	596297	596302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522572
14020	NC_008435	TTC	2	6	596321	596326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522572
14021	NC_008435	GGC	2	6	596353	596358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522572
14022	NC_008435	CGC	2	6	596395	596400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522572
14023	NC_008435	CGCA	2	8	596414	596421	25 %	0 %	25 %	50 %	115522572
14024	NC_008435	TCGA	2	8	596456	596463	25 %	25 %	25 %	25 %	115522572
14025	NC_008435	CCGA	2	8	596483	596490	25 %	0 %	25 %	50 %	115522572
14026	NC_008435	AAG	2	6	596573	596578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522572
14027	NC_008435	GGC	2	6	596587	596592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522572
14028	NC_008435	GCG	2	6	596600	596605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522572
14029	NC_008435	GC	3	6	596641	596646	0 %	0 %	50 %	50 %	115522572
14030	NC_008435	CGGC	2	8	596756	596763	0 %	0 %	50 %	50 %	115522573
14031	NC_008435	CGG	2	6	596844	596849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522573
14032	NC_008435	TGC	2	6	596913	596918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522573
14033	NC_008435	AG	3	6	597026	597031	50 %	0 %	50 %	0 %	115522573
14034	NC_008435	CCG	2	6	597271	597276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14035	NC_008435	CGC	2	6	597286	597291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14036	NC_008435	CGCGC	2	10	597295	597304	0 %	0 %	40 %	60 %	115522574
14037	NC_008435	CGC	3	9	597329	597337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14038	NC_008435	TGC	2	6	597394	597399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14039	NC_008435	GCT	2	6	597452	597457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14040	NC_008435	GATC	2	8	597458	597465	25 %	25 %	25 %	25 %	115522574
14041	NC_008435	GCG	2	6	597469	597474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522574
14042	NC_008435	CGG	2	6	597482	597487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522574
14043	NC_008435	TTC	2	6	597498	597503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522574
14044	NC_008435	CGA	3	9	597512	597520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14045	NC_008435	GGTC	2	8	597560	597567	0 %	25 %	50 %	25 %	115522574
14046	NC_008435	GTG	2	6	597582	597587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522574
14047	NC_008435	GC	3	6	597633	597638	0 %	0 %	50 %	50 %	115522574
14048	NC_008435	GC	3	6	597700	597705	0 %	0 %	50 %	50 %	115522574
14049	NC_008435	CCG	2	6	597751	597756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14050	NC_008435	CGT	2	6	597788	597793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14051	NC_008435	CCG	2	6	597814	597819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14052	NC_008435	CGA	2	6	597821	597826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14053	NC_008435	GAT	2	6	597827	597832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522574
14054	NC_008435	CGC	2	6	597833	597838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14055	NC_008435	GGC	2	6	597864	597869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522574
14056	NC_008435	TCG	2	6	597874	597879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14057	NC_008435	TTC	2	6	597966	597971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522574
14058	NC_008435	CGG	3	9	597974	597982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522574
14059	NC_008435	CGC	2	6	598007	598012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522574
14060	NC_008435	AGGCG	2	10	598082	598091	20 %	0 %	60 %	20 %	115522574
14061	NC_008435	CAC	2	6	598106	598111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522574
14062	NC_008435	CGA	2	6	598124	598129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522574
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14064	NC_008435	ACG	2	6	598216	598221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14065	NC_008435	GCT	2	6	598229	598234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522574
14066	NC_008435	GC	3	6	598247	598252	0 %	0 %	50 %	50 %	115522574
14067	NC_008435	CGG	2	6	598256	598261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522574
14068	NC_008435	GC	3	6	598272	598277	0 %	0 %	50 %	50 %	115522574
14069	NC_008435	GGC	3	9	598298	598306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522574
14070	NC_008435	CAA	2	6	598340	598345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522574
14071	NC_008435	ATCT	2	8	598368	598375	25 %	50 %	0 %	25 %	115522574
14072	NC_008435	TGG	2	6	598405	598410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522574
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14074	NC_008435	TGA	2	6	598626	598631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522575
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14077	NC_008435	TTC	2	6	598787	598792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522575
14078	NC_008435	CCGCAT	2	12	598844	598855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522575
14079	NC_008435	TGA	2	6	598953	598958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522575
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14082	NC_008435	CAG	2	6	599018	599023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522575
14083	NC_008435	GGA	2	6	599065	599070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522575
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14085	NC_008435	CG	3	6	599137	599142	0 %	0 %	50 %	50 %	115522575
14086	NC_008435	ATC	2	6	599144	599149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522575
14087	NC_008435	GAG	2	6	599258	599263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522575
14088	NC_008435	ATCT	2	8	599270	599277	25 %	50 %	0 %	25 %	115522575
14089	NC_008435	GC	3	6	599362	599367	0 %	0 %	50 %	50 %	115522575
14090	NC_008435	CGG	2	6	599373	599378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522575
14091	NC_008435	GAT	2	6	599383	599388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522575
14092	NC_008435	CGG	2	6	599395	599400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522575
14093	NC_008435	TGG	2	6	599429	599434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522575
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14100	NC_008435	TGG	2	6	599797	599802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522576
14101	NC_008435	GTG	2	6	599821	599826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522576
14102	NC_008435	CAT	2	6	599859	599864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522576
14103	NC_008435	CGA	2	6	599865	599870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522576
14104	NC_008435	CG	3	6	599893	599898	0 %	0 %	50 %	50 %	115522576
14105	NC_008435	CAC	2	6	599931	599936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522576
14106	NC_008435	GGAA	2	8	599987	599994	50 %	0 %	50 %	0 %	115522576
14107	NC_008435	GCC	2	6	599998	600003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522576
14108	NC_008435	GTG	2	6	600139	600144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522576
14109	NC_008435	CGA	2	6	600147	600152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522576
14110	NC_008435	CG	3	6	600181	600186	0 %	0 %	50 %	50 %	115522576
14111	NC_008435	CG	4	8	600210	600217	0 %	0 %	50 %	50 %	115522576
14112	NC_008435	CAT	3	9	600225	600233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522576
14113	NC_008435	CAT	2	6	600276	600281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522576
14114	NC_008435	CGA	2	6	600288	600293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522576
14115	NC_008435	TGA	2	6	600296	600301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522576
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14117	NC_008435	AGC	2	6	600371	600376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522576
14118	NC_008435	GCGCC	2	10	600402	600411	0 %	0 %	40 %	60 %	115522576
14119	NC_008435	CGC	3	9	600434	600442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522576
14120	NC_008435	CCA	2	6	600467	600472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522576
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14122	NC_008435	GTC	2	6	600602	600607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522577
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14126	NC_008435	CGA	2	6	600706	600711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522577
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14144	NC_008435	CGG	2	6	601261	601266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522577
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14152	NC_008435	CG	3	6	601495	601500	0 %	0 %	50 %	50 %	115522577
14153	NC_008435	GAC	2	6	601539	601544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522577
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14158	NC_008435	GCCG	2	8	601625	601632	0 %	0 %	50 %	50 %	115522577
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14222	NC_008435	GCCGAG	2	12	603946	603957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522579
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14224	NC_008435	CG	3	6	604250	604255	0 %	0 %	50 %	50 %	115522580
14225	NC_008435	GC	3	6	604256	604261	0 %	0 %	50 %	50 %	115522580
14226	NC_008435	CGT	2	6	604333	604338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522580
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14228	NC_008435	GCCG	2	8	604785	604792	0 %	0 %	50 %	50 %	115522581
14229	NC_008435	GGCG	2	8	604802	604809	0 %	0 %	75 %	25 %	115522581
14230	NC_008435	GGC	2	6	604815	604820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522581
14231	NC_008435	CCG	2	6	604822	604827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522581
14232	NC_008435	GGC	2	6	604832	604837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522581
14233	NC_008435	GCG	2	6	604849	604854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522581
14234	NC_008435	GCC	2	6	604859	604864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522581
14235	NC_008435	CGA	2	6	604900	604905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522581
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14237	NC_008435	GGC	2	6	604937	604942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522581
14238	NC_008435	TGT	2	6	604948	604953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522581
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14351	NC_008435	CGCAT	2	10	611860	611869	20 %	20 %	20 %	40 %	115522588
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14353	NC_008435	CGA	2	6	611886	611891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522588
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14355	NC_008435	A	7	7	611940	611946	100 %	0 %	0 %	0 %	115522588
14356	NC_008435	TGA	2	6	612042	612047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522588
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14359	NC_008435	CGT	2	6	612127	612132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522588
14360	NC_008435	GTC	2	6	612351	612356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522588
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14479	NC_008435	AAAGT	2	10	619009	619018	60 %	20 %	20 %	0 %	115522591
14480	NC_008435	CGC	2	6	619040	619045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522591
14481	NC_008435	GTTTC	2	10	619052	619061	0 %	60 %	20 %	20 %	115522591
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