MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008435	ACG	2	6	557293	557298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522537
13002	NC_008435	TGG	2	6	557348	557353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522537
13003	NC_008435	TGC	2	6	557374	557379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522537
13004	NC_008435	GC	3	6	557417	557422	0 %	0 %	50 %	50 %	115522537
13005	NC_008435	GGT	2	6	557460	557465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522537
13006	NC_008435	CCG	3	9	557534	557542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
13007	NC_008435	GATC	2	8	557543	557550	25 %	25 %	25 %	25 %	115522537
13008	NC_008435	GAT	2	6	557613	557618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522537
13009	NC_008435	CGA	2	6	557624	557629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522537
13010	NC_008435	GCCG	2	8	557685	557692	0 %	0 %	50 %	50 %	115522537
13011	NC_008435	CCA	2	6	557693	557698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522537
13012	NC_008435	CGG	2	6	557702	557707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522537
13013	NC_008435	CAT	2	6	557724	557729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522537
13014	NC_008435	TGA	2	6	557801	557806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522537
13015	NC_008435	CGC	2	6	557817	557822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
13016	NC_008435	GCC	2	6	557932	557937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
13017	NC_008435	GAG	2	6	557944	557949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522537
13018	NC_008435	GC	3	6	557970	557975	0 %	0 %	50 %	50 %	115522537
13019	NC_008435	CCG	2	6	557999	558004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
13020	NC_008435	CCA	2	6	558014	558019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522537
13021	NC_008435	TCGG	2	8	558157	558164	0 %	25 %	50 %	25 %	115522537
13022	NC_008435	CCG	2	6	558178	558183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522537
13023	NC_008435	GTG	2	6	558204	558209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522537
13024	NC_008435	ATG	2	6	558219	558224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522537
13025	NC_008435	TGG	2	6	558253	558258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522537
13026	NC_008435	GGGC	2	8	558264	558271	0 %	0 %	75 %	25 %	115522537
13027	NC_008435	GTG	2	6	558696	558701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522538
13028	NC_008435	GCG	2	6	558892	558897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522538
13029	NC_008435	CGG	2	6	558903	558908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522538
13030	NC_008435	CGT	2	6	558909	558914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522538
13031	NC_008435	TGC	2	6	558923	558928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522538
13032	NC_008435	CGC	2	6	559009	559014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522539
13033	NC_008435	CCCG	2	8	559038	559045	0 %	0 %	25 %	75 %	115522539
13034	NC_008435	GCA	2	6	559067	559072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522539
13035	NC_008435	GCT	2	6	559097	559102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522539
13036	NC_008435	TCA	5	15	559114	559128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522539
13037	NC_008435	CGGCG	2	10	559154	559163	0 %	0 %	60 %	40 %	115522539
13038	NC_008435	TCG	2	6	559210	559215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522539
13039	NC_008435	GGT	2	6	559247	559252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522539
13040	NC_008435	CAT	2	6	559295	559300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522539
13041	NC_008435	CAA	2	6	559304	559309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522539
13042	NC_008435	TCT	2	6	559312	559317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522539
13043	NC_008435	CAT	2	6	559349	559354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522539
13044	NC_008435	TCC	2	6	559362	559367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522539
13045	NC_008435	AACGGC	2	12	559389	559400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13046	NC_008435	GC	3	6	559399	559404	0 %	0 %	50 %	50 %	115522540
13047	NC_008435	CGT	3	9	559451	559459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13048	NC_008435	CGG	2	6	559469	559474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13049	NC_008435	GC	3	6	559484	559489	0 %	0 %	50 %	50 %	115522540
13050	NC_008435	CTGC	2	8	559522	559529	0 %	25 %	25 %	50 %	115522540
13051	NC_008435	GGC	2	6	559565	559570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13052	NC_008435	CGG	2	6	559585	559590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13053	NC_008435	GAC	2	6	559611	559616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13054	NC_008435	CTGG	2	8	559655	559662	0 %	25 %	50 %	25 %	115522540
13055	NC_008435	CGC	2	6	559699	559704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522540
13056	NC_008435	CGG	2	6	559781	559786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13057	NC_008435	GCGCA	2	10	559815	559824	20 %	0 %	40 %	40 %	115522540
13058	NC_008435	GCC	3	9	559830	559838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522540
13059	NC_008435	TGC	2	6	559858	559863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13060	NC_008435	TTC	2	6	559914	559919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522540
13061	NC_008435	CGA	2	6	559979	559984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13062	NC_008435	ACC	2	6	560013	560018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522540
13063	NC_008435	CGG	2	6	560030	560035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13064	NC_008435	CGT	2	6	560053	560058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13065	NC_008435	CGG	2	6	560087	560092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13066	NC_008435	GC	3	6	560105	560110	0 %	0 %	50 %	50 %	115522540
13067	NC_008435	GC	4	8	560191	560198	0 %	0 %	50 %	50 %	115522540
13068	NC_008435	GGC	2	6	560205	560210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13069	NC_008435	CG	3	6	560278	560283	0 %	0 %	50 %	50 %	115522540
13070	NC_008435	GTG	2	6	560286	560291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522540
13071	NC_008435	CG	4	8	560293	560300	0 %	0 %	50 %	50 %	115522540
13072	NC_008435	AAG	3	9	560337	560345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522540
13073	NC_008435	CCG	2	6	560380	560385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522540
13074	NC_008435	GAT	2	6	560465	560470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522540
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13076	NC_008435	GGC	2	6	560493	560498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13077	NC_008435	GTC	2	6	560523	560528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13078	NC_008435	AAG	2	6	560532	560537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522540
13079	NC_008435	CGA	2	6	560543	560548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13080	NC_008435	GCC	2	6	560586	560591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522540
13081	NC_008435	CGGCT	2	10	560616	560625	0 %	20 %	40 %	40 %	115522540
13082	NC_008435	GTG	2	6	560646	560651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522540
13083	NC_008435	GCCGC	2	10	560656	560665	0 %	0 %	40 %	60 %	115522540
13084	NC_008435	GCGCT	2	10	560667	560676	0 %	20 %	40 %	40 %	115522540
13085	NC_008435	AGC	2	6	560704	560709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13086	NC_008435	CGG	2	6	560719	560724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13087	NC_008435	GGC	2	6	560775	560780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522540
13088	NC_008435	GCA	2	6	560810	560815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13089	NC_008435	AAT	2	6	560826	560831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522540
13090	NC_008435	TGC	2	6	560857	560862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13091	NC_008435	ACCG	2	8	560919	560926	25 %	0 %	25 %	50 %	115522540
13092	NC_008435	TGG	2	6	560950	560955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522540
13093	NC_008435	GGT	2	6	560990	560995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522540
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13095	NC_008435	CGA	2	6	561065	561070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522540
13096	NC_008435	GATC	2	8	561101	561108	25 %	25 %	25 %	25 %	115522540
13097	NC_008435	CAC	3	9	561116	561124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522540
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13100	NC_008435	CGC	2	6	561239	561244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522541
13101	NC_008435	GCC	2	6	561303	561308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522541
13102	NC_008435	CGC	2	6	561310	561315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522541
13103	NC_008435	CG	3	6	561363	561368	0 %	0 %	50 %	50 %	115522541
13104	NC_008435	CCG	2	6	561372	561377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522541
13105	NC_008435	GACCG	2	10	561378	561387	20 %	0 %	40 %	40 %	115522541
13106	NC_008435	CCGC	2	8	561413	561420	0 %	0 %	25 %	75 %	115522541
13107	NC_008435	CGGC	2	8	561422	561429	0 %	0 %	50 %	50 %	115522541
13108	NC_008435	CGG	2	6	561461	561466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522541
13109	NC_008435	CCG	2	6	561482	561487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522541
13110	NC_008435	ACG	2	6	561538	561543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522541
13111	NC_008435	GGT	2	6	561584	561589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522541
13112	NC_008435	CGTT	2	8	561637	561644	0 %	50 %	25 %	25 %	115522541
13113	NC_008435	TCG	2	6	561717	561722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522542
13114	NC_008435	GAC	2	6	561794	561799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522542
13115	NC_008435	CTA	2	6	561823	561828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522542
13116	NC_008435	AAC	2	6	561884	561889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522542
13117	NC_008435	GGT	2	6	562045	562050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522542
13118	NC_008435	ACGCCG	2	12	562124	562135	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522542
13119	NC_008435	GCA	2	6	562167	562172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522542
13120	NC_008435	CTG	2	6	562207	562212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522542
13121	NC_008435	TGG	2	6	562235	562240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522542
13122	NC_008435	CGC	2	6	562264	562269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522542
13123	NC_008435	GCT	2	6	562270	562275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522542
13124	NC_008435	CGA	2	6	562306	562311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522542
13125	NC_008435	CAT	2	6	562372	562377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522542
13126	NC_008435	AAGCTG	2	12	562436	562447	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115522542
13127	NC_008435	CGAT	2	8	562610	562617	25 %	25 %	25 %	25 %	115522543
13128	NC_008435	CAAC	2	8	562626	562633	50 %	0 %	0 %	50 %	115522543
13129	NC_008435	TGA	2	6	562662	562667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522543
13130	NC_008435	AGA	2	6	562668	562673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522543
13131	NC_008435	CG	3	6	562695	562700	0 %	0 %	50 %	50 %	115522543
13132	NC_008435	GGC	2	6	562729	562734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522543
13133	NC_008435	CCG	2	6	562780	562785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522543
13134	NC_008435	GAG	2	6	562796	562801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522543
13135	NC_008435	ATC	2	6	562812	562817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522543
13136	NC_008435	GTG	2	6	562936	562941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522543
13137	NC_008435	GAT	2	6	562952	562957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522543
13138	NC_008435	TGGCGG	2	12	563040	563051	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	115522543
13139	NC_008435	GCC	2	6	563127	563132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522544
13140	NC_008435	CCGA	2	8	563176	563183	25 %	0 %	25 %	50 %	115522544
13141	NC_008435	GCC	2	6	563184	563189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522544
13142	NC_008435	AGC	2	6	563195	563200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522544
13143	NC_008435	GCC	3	9	563226	563234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522544
13144	NC_008435	GC	3	6	563249	563254	0 %	0 %	50 %	50 %	115522544
13145	NC_008435	CGC	3	9	563252	563260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522544
13146	NC_008435	GGA	2	6	563265	563270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522544
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13148	NC_008435	GCCGC	2	10	563712	563721	0 %	0 %	40 %	60 %	115522545
13149	NC_008435	GGA	2	6	563723	563728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522545
13150	NC_008435	GCC	2	6	563747	563752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13151	NC_008435	AGC	2	6	563755	563760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522545
13152	NC_008435	GCC	3	9	563771	563779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13153	NC_008435	CGC	2	6	563783	563788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13154	NC_008435	GCC	2	6	563804	563809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13155	NC_008435	GCCGC	2	10	563811	563820	0 %	0 %	40 %	60 %	115522545
13156	NC_008435	GCCG	2	8	563822	563829	0 %	0 %	50 %	50 %	115522545
13157	NC_008435	C	6	6	563830	563835	0 %	0 %	0 %	100 %	115522545
13158	NC_008435	GCC	2	6	563843	563848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
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13162	NC_008435	CCG	2	6	563901	563906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13163	NC_008435	CGC	3	9	563944	563952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13164	NC_008435	GCCGC	2	10	563967	563976	0 %	0 %	40 %	60 %	115522545
13165	NC_008435	CTCCGC	2	12	563977	563988	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	115522545
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13178	NC_008435	CGC	2	6	564304	564309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
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13180	NC_008435	GC	3	6	564421	564426	0 %	0 %	50 %	50 %	115522545
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13184	NC_008435	GCCC	2	8	564515	564522	0 %	0 %	25 %	75 %	115522545
13185	NC_008435	CGC	2	6	564600	564605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
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13189	NC_008435	GC	4	8	564718	564725	0 %	0 %	50 %	50 %	115522545
13190	NC_008435	ATC	2	6	564792	564797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522545
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13192	NC_008435	TCG	2	6	564833	564838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522545
13193	NC_008435	CGG	2	6	564845	564850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522545
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13196	NC_008435	GCC	3	9	564920	564928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13197	NC_008435	TCG	2	6	564958	564963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522545
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13201	NC_008435	CG	3	6	565204	565209	0 %	0 %	50 %	50 %	115522545
13202	NC_008435	CTGTCG	2	12	565263	565274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522545
13203	NC_008435	CGC	2	6	565278	565283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
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13207	NC_008435	CCG	2	6	565403	565408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
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13210	NC_008435	CGG	2	6	565442	565447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522545
13211	NC_008435	CCG	2	6	565450	565455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13212	NC_008435	GCC	4	12	565460	565471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522545
13213	NC_008435	GAGC	2	8	565492	565499	25 %	0 %	50 %	25 %	115522545
13214	NC_008435	GCA	2	6	565759	565764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522546
13215	NC_008435	GC	3	6	565786	565791	0 %	0 %	50 %	50 %	115522546
13216	NC_008435	CGC	2	6	565808	565813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522546
13217	NC_008435	GGC	2	6	565850	565855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522546
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13219	NC_008435	GAT	2	6	565877	565882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522546
13220	NC_008435	CGA	2	6	565888	565893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522546
13221	NC_008435	CG	4	8	566064	566071	0 %	0 %	50 %	50 %	115522546
13222	NC_008435	TCCC	2	8	566269	566276	0 %	25 %	0 %	75 %	115522547
13223	NC_008435	CAG	2	6	566332	566337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522547
13224	NC_008435	AGG	2	6	566364	566369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522547
13225	NC_008435	GTG	2	6	566396	566401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522547
13226	NC_008435	CGGT	2	8	566403	566410	0 %	25 %	50 %	25 %	115522547
13227	NC_008435	CGGC	2	8	566427	566434	0 %	0 %	50 %	50 %	115522547
13228	NC_008435	GCC	2	6	566485	566490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522547
13229	NC_008435	GGCT	2	8	566582	566589	0 %	25 %	50 %	25 %	115522547
13230	NC_008435	TCCA	2	8	566603	566610	25 %	25 %	0 %	50 %	115522547
13231	NC_008435	GCTG	2	8	566676	566683	0 %	25 %	50 %	25 %	115522547
13232	NC_008435	TAA	2	6	566687	566692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115522547
13233	NC_008435	GCA	2	6	566739	566744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522547
13234	NC_008435	GTG	2	6	566759	566764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522547
13235	NC_008435	CGG	2	6	566793	566798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522547
13236	NC_008435	GCG	2	6	566811	566816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522547
13237	NC_008435	CGC	2	6	566824	566829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522547
13238	NC_008435	ATCG	2	8	566830	566837	25 %	25 %	25 %	25 %	115522547
13239	NC_008435	CCGCG	2	10	566869	566878	0 %	0 %	40 %	60 %	115522547
13240	NC_008435	TGC	2	6	566934	566939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522547
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13243	NC_008435	GCT	2	6	566989	566994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522547
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13478	NC_008435	CGGC	2	8	576424	576431	0 %	0 %	50 %	50 %	115522555
13479	NC_008435	TCG	2	6	576447	576452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522555
13480	NC_008435	CGG	2	6	576469	576474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522555
13481	NC_008435	TGG	2	6	576513	576518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522555
13482	NC_008435	CGC	2	6	576519	576524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522555
13483	NC_008435	GCT	2	6	576562	576567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522555
13484	NC_008435	GC	3	6	576576	576581	0 %	0 %	50 %	50 %	115522555
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