MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008435	CGG	3	9	534840	534848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522513
12502	NC_008435	GAC	2	6	534853	534858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522513
12503	NC_008435	TCCCA	2	10	534915	534924	20 %	20 %	0 %	60 %	115522514
12504	NC_008435	GC	3	6	534967	534972	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12505	NC_008435	GC	3	6	534985	534990	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12506	NC_008435	GGCAC	2	10	534994	535003	20 %	0 %	40 %	40 %	115522514
12507	NC_008435	CG	5	10	535043	535052	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12508	NC_008435	GGC	2	6	535058	535063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522514
12509	NC_008435	CG	3	6	535097	535102	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12510	NC_008435	CAG	2	6	535118	535123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522514
12511	NC_008435	CAC	2	6	535163	535168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522514
12512	NC_008435	GC	3	6	535185	535190	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12513	NC_008435	GT	3	6	535198	535203	0 %	50 %	50 %	0 %	115522514
12514	NC_008435	GCG	2	6	535222	535227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522514
12515	NC_008435	GGC	2	6	535232	535237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522514
12516	NC_008435	TCG	2	6	535239	535244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522514
12517	NC_008435	GC	5	10	535253	535262	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12518	NC_008435	TCC	2	6	535296	535301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522514
12519	NC_008435	CAC	2	6	535352	535357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522514
12520	NC_008435	AGCGC	2	10	535390	535399	20 %	0 %	40 %	40 %	115522514
12521	NC_008435	CGC	3	9	535408	535416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522514
12522	NC_008435	GCCG	2	8	535468	535475	0 %	0 %	50 %	50 %	115522514
12523	NC_008435	GCG	2	6	535500	535505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522514
12524	NC_008435	AAC	2	6	535602	535607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522514
12525	NC_008435	GCT	2	6	535663	535668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522514
12526	NC_008435	GCG	2	6	535700	535705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522514
12527	NC_008435	GCC	2	6	535728	535733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522514
12528	NC_008435	CGGGC	2	10	535739	535748	0 %	0 %	60 %	40 %	115522514
12529	NC_008435	TCA	2	6	535780	535785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522514
12530	NC_008435	GTT	2	6	535947	535952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522515
12531	NC_008435	CAGA	2	8	535962	535969	50 %	0 %	25 %	25 %	115522515
12532	NC_008435	CG	3	6	536051	536056	0 %	0 %	50 %	50 %	115522515
12533	NC_008435	CGC	2	6	536065	536070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522515
12534	NC_008435	TCC	2	6	536101	536106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522515
12535	NC_008435	CAG	2	6	536154	536159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522515
12536	NC_008435	CCA	2	6	536199	536204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522515
12537	NC_008435	GCG	2	6	536285	536290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522515
12538	NC_008435	CAG	2	6	536292	536297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522515
12539	NC_008435	CGG	2	6	536543	536548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522516
12540	NC_008435	GCT	2	6	536669	536674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522516
12541	NC_008435	GTG	2	6	536682	536687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522516
12542	NC_008435	CGC	2	6	536755	536760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522516
12543	NC_008435	AGA	2	6	536761	536766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522516
12544	NC_008435	TCA	2	6	536800	536805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522516
12545	NC_008435	CAA	2	6	536825	536830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522516
12546	NC_008435	GC	3	6	536832	536837	0 %	0 %	50 %	50 %	115522516
12547	NC_008435	CGC	2	6	537040	537045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522516
12548	NC_008435	GCGCAT	2	12	537093	537104	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522516
12549	NC_008435	CCTG	2	8	537163	537170	0 %	25 %	25 %	50 %	115522516
12550	NC_008435	CG	3	6	537442	537447	0 %	0 %	50 %	50 %	115522517
12551	NC_008435	CGCGG	2	10	537472	537481	0 %	0 %	60 %	40 %	115522517
12552	NC_008435	AAC	2	6	537525	537530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522517
12553	NC_008435	GTG	2	6	537597	537602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522517
12554	NC_008435	CGC	2	6	537653	537658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522517
12555	NC_008435	AGC	2	6	537681	537686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522517
12556	NC_008435	GAA	2	6	537701	537706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522517
12557	NC_008435	CCA	2	6	537748	537753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522517
12558	NC_008435	GAC	2	6	537758	537763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522517
12559	NC_008435	GCA	2	6	537793	537798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522517
12560	NC_008435	CGT	2	6	537871	537876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522517
12561	NC_008435	CGA	2	6	537877	537882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522517
12562	NC_008435	CGT	2	6	537899	537904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522517
12563	NC_008435	CCG	2	6	537907	537912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522517
12564	NC_008435	CAC	2	6	537935	537940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522517
12565	NC_008435	CGG	2	6	537949	537954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522517
12566	NC_008435	CAGGA	2	10	537969	537978	40 %	0 %	40 %	20 %	115522517
12567	NC_008435	GC	4	8	538054	538061	0 %	0 %	50 %	50 %	115522517
12568	NC_008435	ATC	2	6	538086	538091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522517
12569	NC_008435	GCCAGC	2	12	538092	538103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522517
12570	NC_008435	GATC	2	8	538121	538128	25 %	25 %	25 %	25 %	115522517
12571	NC_008435	CGG	2	6	538133	538138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522517
12572	NC_008435	GGC	2	6	538166	538171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522517
12573	NC_008435	GACGCG	2	12	538341	538352	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115522518
12574	NC_008435	CGG	2	6	538370	538375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522518
12575	NC_008435	CGGC	2	8	538379	538386	0 %	0 %	50 %	50 %	115522518
12576	NC_008435	GGC	2	6	538411	538416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522518
12577	NC_008435	CGT	2	6	538424	538429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522518
12578	NC_008435	GAT	2	6	538512	538517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522518
12579	NC_008435	CG	3	6	538559	538564	0 %	0 %	50 %	50 %	115522518
12580	NC_008435	CGA	2	6	538575	538580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522518
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12582	NC_008435	GGT	2	6	538626	538631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522518
12583	NC_008435	GAT	2	6	538692	538697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522518
12584	NC_008435	ATC	2	6	538726	538731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522518
12585	NC_008435	AGCCGA	2	12	538805	538816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522518
12586	NC_008435	GGC	2	6	538874	538879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522518
12587	NC_008435	GCG	2	6	538913	538918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522518
12588	NC_008435	TGA	2	6	539045	539050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522518
12589	NC_008435	CAG	2	6	539079	539084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522518
12590	NC_008435	GAT	2	6	539100	539105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522518
12591	NC_008435	GAT	2	6	539252	539257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522518
12592	NC_008435	CGC	2	6	539408	539413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522519
12593	NC_008435	GC	3	6	539475	539480	0 %	0 %	50 %	50 %	115522519
12594	NC_008435	CG	3	6	539487	539492	0 %	0 %	50 %	50 %	115522519
12595	NC_008435	CGG	3	9	539512	539520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522519
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12598	NC_008435	GCCG	2	8	539558	539565	0 %	0 %	50 %	50 %	115522519
12599	NC_008435	GTGATC	2	12	539570	539581	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115522519
12600	NC_008435	CGG	2	6	539599	539604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522519
12601	NC_008435	CGCGG	2	10	539648	539657	0 %	0 %	60 %	40 %	115522519
12602	NC_008435	GAT	2	6	539686	539691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522519
12603	NC_008435	GC	3	6	539699	539704	0 %	0 %	50 %	50 %	115522519
12604	NC_008435	GCC	2	6	539757	539762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522519
12605	NC_008435	GCCCG	2	10	539768	539777	0 %	0 %	40 %	60 %	115522519
12606	NC_008435	GTG	2	6	539804	539809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522519
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12608	NC_008435	GGC	2	6	539833	539838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522519
12609	NC_008435	GC	3	6	539837	539842	0 %	0 %	50 %	50 %	115522519
12610	NC_008435	CGC	3	9	539854	539862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522519
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12614	NC_008435	GAC	2	6	540112	540117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522519
12615	NC_008435	GC	4	8	540134	540141	0 %	0 %	50 %	50 %	115522519
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12618	NC_008435	CTCG	2	8	540238	540245	0 %	25 %	25 %	50 %	115522519
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12620	NC_008435	CGG	2	6	540361	540366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522519
12621	NC_008435	TCG	2	6	540368	540373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522519
12622	NC_008435	GGC	2	6	540430	540435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522519
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12625	NC_008435	CGG	3	9	540555	540563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522519
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12726	NC_008435	TCG	2	6	544330	544335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522523
12727	NC_008435	TGAG	2	8	544372	544379	25 %	25 %	50 %	0 %	115522523
12728	NC_008435	T	6	6	544380	544385	0 %	100 %	0 %	0 %	115522523
12729	NC_008435	CGT	2	6	544388	544393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522523
12730	NC_008435	ATGCCC	2	12	544553	544564	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115522524
12731	NC_008435	GC	3	6	544604	544609	0 %	0 %	50 %	50 %	115522524
12732	NC_008435	CCTCGC	2	12	544656	544667	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	115522524
12733	NC_008435	CGG	2	6	544691	544696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522524
12734	NC_008435	GAA	2	6	544735	544740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522524
12735	NC_008435	GAA	2	6	544777	544782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522524
12736	NC_008435	TGG	2	6	544859	544864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522524
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12738	NC_008435	GTGC	2	8	544975	544982	0 %	25 %	50 %	25 %	115522524
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12853	NC_008435	TCG	2	6	550954	550959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522531
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12856	NC_008435	GCG	2	6	551053	551058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522531
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12858	NC_008435	GGCG	2	8	551120	551127	0 %	0 %	75 %	25 %	115522531
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12863	NC_008435	CTG	2	6	551436	551441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522532
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12977	NC_008435	CGC	2	6	556123	556128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
12978	NC_008435	CAG	2	6	556184	556189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
12979	NC_008435	CGC	4	12	556195	556206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
12980	NC_008435	GAT	2	6	556222	556227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522536
12981	NC_008435	CGG	2	6	556258	556263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
12982	NC_008435	CGG	3	9	556305	556313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
12983	NC_008435	GGC	2	6	556405	556410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
12984	NC_008435	GCC	2	6	556449	556454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522536
12985	NC_008435	CG	3	6	556513	556518	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
12986	NC_008435	GGC	2	6	556537	556542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
12987	NC_008435	CTG	2	6	556598	556603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522536
12988	NC_008435	CCA	2	6	556614	556619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522536
12989	NC_008435	GGC	2	6	556624	556629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522536
12990	NC_008435	GTG	2	6	556661	556666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522536
12991	NC_008435	GCGA	2	8	556667	556674	25 %	0 %	50 %	25 %	115522536
12992	NC_008435	GC	3	6	556722	556727	0 %	0 %	50 %	50 %	115522536
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12998	NC_008435	GCGCCA	2	12	556938	556949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522536
12999	NC_008435	CAG	2	6	557014	557019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522536
13000	NC_008435	GCGG	2	8	557047	557054	0 %	0 %	75 %	25 %	115522536

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