MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
123001	NC_008435	TGA	2	6	5408383	5408388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526814
123002	NC_008435	CCGG	2	8	5408425	5408432	0 %	0 %	50 %	50 %	115526814
123003	NC_008435	CAA	2	6	5408438	5408443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526814
123004	NC_008435	GCTG	2	8	5408467	5408474	0 %	25 %	50 %	25 %	115526814
123005	NC_008435	GC	4	8	5408505	5408512	0 %	0 %	50 %	50 %	115526814
123006	NC_008435	GCG	2	6	5408518	5408523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526814
123007	NC_008435	GCT	2	6	5408546	5408551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123008	NC_008435	CAG	3	9	5408589	5408597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123009	NC_008435	CAA	2	6	5408618	5408623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526814
123010	NC_008435	GC	3	6	5408677	5408682	0 %	0 %	50 %	50 %	115526814
123011	NC_008435	GCT	2	6	5408726	5408731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123012	NC_008435	GGC	3	9	5408822	5408830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526814
123013	NC_008435	ATC	2	6	5408853	5408858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526814
123014	NC_008435	ACG	2	6	5408869	5408874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123015	NC_008435	CAA	2	6	5408888	5408893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526814
123016	NC_008435	CGG	2	6	5408906	5408911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526814
123017	NC_008435	CTG	2	6	5408913	5408918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123018	NC_008435	GGT	2	6	5408921	5408926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526814
123019	NC_008435	ATC	2	6	5408964	5408969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526814
123020	NC_008435	CGG	2	6	5408971	5408976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526814
123021	NC_008435	CCG	2	6	5409001	5409006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526814
123022	NC_008435	CCGGCA	2	12	5409019	5409030	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115526814
123023	NC_008435	GC	3	6	5409052	5409057	0 %	0 %	50 %	50 %	115526814
123024	NC_008435	ACA	2	6	5409115	5409120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526814
123025	NC_008435	GTG	3	9	5409150	5409158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526814
123026	NC_008435	CGT	2	6	5409188	5409193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123027	NC_008435	CGC	2	6	5409202	5409207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526814
123028	NC_008435	CGA	2	6	5409254	5409259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526814
123029	NC_008435	CGC	2	6	5409272	5409277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526814
123030	NC_008435	CTA	2	6	5409335	5409340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526814
123031	NC_008435	CG	3	6	5409362	5409367	0 %	0 %	50 %	50 %	115526814
123032	NC_008435	CGC	2	6	5409395	5409400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526814
123033	NC_008435	ACC	2	6	5409483	5409488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526814
123034	NC_008435	GGA	2	6	5409497	5409502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115526814
123035	NC_008435	ACG	2	6	5409728	5409733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526815
123036	NC_008435	GGC	2	6	5409734	5409739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526815
123037	NC_008435	CGG	2	6	5409786	5409791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526815
123038	NC_008435	CGA	2	6	5409803	5409808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526815
123039	NC_008435	GC	3	6	5409813	5409818	0 %	0 %	50 %	50 %	115526815
123040	NC_008435	GC	3	6	5409875	5409880	0 %	0 %	50 %	50 %	115526815
123041	NC_008435	CGGC	2	8	5409887	5409894	0 %	0 %	50 %	50 %	115526815
123042	NC_008435	TCGATC	2	12	5409899	5409910	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115526815
123043	NC_008435	GGTC	2	8	5409947	5409954	0 %	25 %	50 %	25 %	115526815
123044	NC_008435	CGC	2	6	5409981	5409986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526815
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123047	NC_008435	CTT	2	6	5410260	5410265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526815
123048	NC_008435	CG	3	6	5410266	5410271	0 %	0 %	50 %	50 %	115526815
123049	NC_008435	GCG	2	6	5410286	5410291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526815
123050	NC_008435	GAC	2	6	5410320	5410325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526815
123051	NC_008435	ACGCCG	2	12	5410334	5410345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115526815
123052	NC_008435	CCG	2	6	5410370	5410375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526815
123053	NC_008435	GCT	2	6	5410455	5410460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526815
123054	NC_008435	CGGCG	2	10	5410526	5410535	0 %	0 %	60 %	40 %	115526816
123055	NC_008435	CG	3	6	5410556	5410561	0 %	0 %	50 %	50 %	115526816
123056	NC_008435	ACC	2	6	5410579	5410584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526816
123057	NC_008435	C	6	6	5410589	5410594	0 %	0 %	0 %	100 %	115526816
123058	NC_008435	GGC	2	6	5410669	5410674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526816
123059	NC_008435	CGG	2	6	5410799	5410804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526816
123060	NC_008435	GCGCGA	2	12	5410868	5410879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115526816
123061	NC_008435	CGGT	2	8	5410911	5410918	0 %	25 %	50 %	25 %	115526816
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123064	NC_008435	GTC	2	6	5410965	5410970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526816
123065	NC_008435	GCCG	2	8	5410992	5410999	0 %	0 %	50 %	50 %	115526816
123066	NC_008435	CCG	2	6	5411008	5411013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526816
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123069	NC_008435	GCG	2	6	5411188	5411193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526817
123070	NC_008435	GCG	2	6	5411203	5411208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526817
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123081	NC_008435	GC	3	6	5411572	5411577	0 %	0 %	50 %	50 %	115526817
123082	NC_008435	GCC	2	6	5411579	5411584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526817
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123086	NC_008435	TCT	2	6	5411758	5411763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526817
123087	NC_008435	ACC	2	6	5411796	5411801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526817
123088	NC_008435	GCCA	2	8	5411805	5411812	25 %	0 %	25 %	50 %	115526817
123089	NC_008435	TGC	2	6	5411815	5411820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526817
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123091	NC_008435	TGA	2	6	5411845	5411850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526817
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123093	NC_008435	CCGG	2	8	5412005	5412012	0 %	0 %	50 %	50 %	115526818
123094	NC_008435	CGTC	2	8	5412030	5412037	0 %	25 %	25 %	50 %	115526818
123095	NC_008435	AGC	3	9	5412107	5412115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526818
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123098	NC_008435	TCG	2	6	5412146	5412151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123099	NC_008435	CGA	2	6	5412216	5412221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123100	NC_008435	CG	4	8	5412223	5412230	0 %	0 %	50 %	50 %	115526818
123101	NC_008435	CAC	2	6	5412250	5412255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526818
123102	NC_008435	CGG	2	6	5412300	5412305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526818
123103	NC_008435	TGC	2	6	5412309	5412314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123104	NC_008435	GCA	2	6	5412346	5412351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123105	NC_008435	CAG	2	6	5412427	5412432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123106	NC_008435	GGA	2	6	5412448	5412453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115526818
123107	NC_008435	CAGT	2	8	5412492	5412499	25 %	25 %	25 %	25 %	115526818
123108	NC_008435	CGA	2	6	5412564	5412569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123109	NC_008435	GCC	2	6	5412605	5412610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526818
123110	NC_008435	TCG	2	6	5412615	5412620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526818
123111	NC_008435	GCG	4	12	5412631	5412642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526818
123112	NC_008435	TGG	2	6	5412672	5412677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526818
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123114	NC_008435	CAG	2	6	5412932	5412937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526819
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123229	NC_008435	ACA	2	6	5417178	5417183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115526823
123230	NC_008435	CG	3	6	5417199	5417204	0 %	0 %	50 %	50 %	115526823
123231	NC_008435	CCGC	2	8	5417214	5417221	0 %	0 %	25 %	75 %	115526823
123232	NC_008435	GC	3	6	5417220	5417225	0 %	0 %	50 %	50 %	115526823
123233	NC_008435	CTA	2	6	5417293	5417298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526823
123234	NC_008435	CGA	2	6	5417308	5417313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526823
123235	NC_008435	CG	3	6	5417324	5417329	0 %	0 %	50 %	50 %	115526823
123236	NC_008435	CG	3	6	5417353	5417358	0 %	0 %	50 %	50 %	115526823
123237	NC_008435	GAT	2	6	5417359	5417364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526823
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123239	NC_008435	CGA	2	6	5417422	5417427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526823
123240	NC_008435	CGCGG	2	10	5417466	5417475	0 %	0 %	60 %	40 %	115526823
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123242	NC_008435	CG	3	6	5417513	5417518	0 %	0 %	50 %	50 %	115526823
123243	NC_008435	ACG	2	6	5417535	5417540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526823
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123251	NC_008435	GACCC	2	10	5417808	5417817	20 %	0 %	20 %	60 %	115526823
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123253	NC_008435	GCT	2	6	5417981	5417986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526824
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123255	NC_008435	GCTGGC	2	12	5418086	5418097	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115526824
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123258	NC_008435	CTG	2	6	5418138	5418143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526824
123259	NC_008435	CGC	2	6	5418202	5418207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526824
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123262	NC_008435	GCCG	2	8	5418256	5418263	0 %	0 %	50 %	50 %	115526824
123263	NC_008435	GCT	2	6	5418308	5418313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526824
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123327	NC_008435	GCCTT	2	10	5420958	5420967	0 %	40 %	20 %	40 %	115526826
123328	NC_008435	GCCG	2	8	5421004	5421011	0 %	0 %	50 %	50 %	115526826
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123330	NC_008435	CTG	2	6	5421155	5421160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123331	NC_008435	CTG	2	6	5421188	5421193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123332	NC_008435	TGC	3	9	5421288	5421296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123333	NC_008435	TCGCCG	2	12	5421339	5421350	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115526826
123334	NC_008435	CTG	2	6	5421389	5421394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123335	NC_008435	GGC	2	6	5421416	5421421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526826
123336	NC_008435	CTG	2	6	5421479	5421484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123337	NC_008435	GCA	2	6	5421487	5421492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123338	NC_008435	GCGG	2	8	5421511	5421518	0 %	0 %	75 %	25 %	115526826
123339	NC_008435	GCT	2	6	5421523	5421528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526826
123340	NC_008435	TTC	2	6	5421537	5421542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115526826
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123342	NC_008435	GCGCG	2	10	5421577	5421586	0 %	0 %	60 %	40 %	115526826
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