MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
119001	NC_008435	TTG	2	6	5237564	5237569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115526649
119002	NC_008435	GGT	2	6	5237602	5237607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526649
119003	NC_008435	GCG	2	6	5237690	5237695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526649
119004	NC_008435	CG	3	6	5237701	5237706	0 %	0 %	50 %	50 %	115526649
119005	NC_008435	GAT	2	6	5237894	5237899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526650
119006	NC_008435	GCA	2	6	5238008	5238013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526650
119007	NC_008435	ACG	2	6	5238033	5238038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526650
119008	NC_008435	CAT	2	6	5238113	5238118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526650
119009	NC_008435	GTG	2	6	5238132	5238137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526650
119010	NC_008435	GTCAT	2	10	5238174	5238183	20 %	40 %	20 %	20 %	115526650
119011	NC_008435	GCC	2	6	5238204	5238209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526650
119012	NC_008435	AGCC	2	8	5238217	5238224	25 %	0 %	25 %	50 %	115526650
119013	NC_008435	GCC	2	6	5238234	5238239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526650
119014	NC_008435	CCA	2	6	5238262	5238267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526650
119015	NC_008435	CGC	2	6	5238325	5238330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526650
119016	NC_008435	CGC	2	6	5238419	5238424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526651
119017	NC_008435	CG	3	6	5238433	5238438	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119018	NC_008435	TGC	2	6	5238465	5238470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119019	NC_008435	TGC	2	6	5238537	5238542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119020	NC_008435	CGC	2	6	5238641	5238646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526651
119021	NC_008435	CGC	2	6	5238706	5238711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526651
119022	NC_008435	ATC	2	6	5238714	5238719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115526651
119023	NC_008435	TGG	2	6	5238742	5238747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526651
119024	NC_008435	GTGG	2	8	5238782	5238789	0 %	25 %	75 %	0 %	115526651
119025	NC_008435	CG	3	6	5238792	5238797	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119026	NC_008435	GCG	2	6	5238804	5238809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526651
119027	NC_008435	ACTTC	2	10	5238814	5238823	20 %	40 %	0 %	40 %	115526651
119028	NC_008435	CCA	2	6	5238829	5238834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526651
119029	NC_008435	CGGC	2	8	5238846	5238853	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119030	NC_008435	CG	5	10	5238860	5238869	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119031	NC_008435	GGT	2	6	5239076	5239081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526651
119032	NC_008435	CGC	2	6	5239082	5239087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526651
119033	NC_008435	GGC	2	6	5239109	5239114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526651
119034	NC_008435	CTG	2	6	5239115	5239120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119035	NC_008435	GGC	2	6	5239124	5239129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526651
119036	NC_008435	GC	3	6	5239143	5239148	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119037	NC_008435	CG	3	6	5239150	5239155	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119038	NC_008435	CGA	2	6	5239211	5239216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119039	NC_008435	CAG	2	6	5239331	5239336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119040	NC_008435	ATA	2	6	5239370	5239375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115526651
119041	NC_008435	GTC	2	6	5239379	5239384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119042	NC_008435	CGAA	2	8	5239416	5239423	50 %	0 %	25 %	25 %	115526651
119043	NC_008435	CG	3	6	5239457	5239462	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119044	NC_008435	GC	3	6	5239505	5239510	0 %	0 %	50 %	50 %	115526651
119045	NC_008435	GAC	2	6	5239531	5239536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119046	NC_008435	CGT	2	6	5239544	5239549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119047	NC_008435	CAG	2	6	5239559	5239564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119048	NC_008435	AACC	2	8	5239577	5239584	50 %	0 %	0 %	50 %	115526651
119049	NC_008435	AGC	2	6	5239653	5239658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119050	NC_008435	CGA	2	6	5239663	5239668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526651
119051	NC_008435	CCAGG	2	10	5239694	5239703	20 %	0 %	40 %	40 %	115526651
119052	NC_008435	CCGA	2	8	5239704	5239711	25 %	0 %	25 %	50 %	115526651
119053	NC_008435	AG	3	6	5239718	5239723	50 %	0 %	50 %	0 %	115526651
119054	NC_008435	GAGGC	2	10	5239789	5239798	20 %	0 %	60 %	20 %	115526652
119055	NC_008435	CTC	2	6	5239824	5239829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115526652
119056	NC_008435	GCA	2	6	5239832	5239837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526652
119057	NC_008435	CGC	2	6	5239839	5239844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526652
119058	NC_008435	GCC	2	6	5239861	5239866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526652
119059	NC_008435	CCG	2	6	5239887	5239892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526652
119060	NC_008435	ACC	2	6	5239909	5239914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526652
119061	NC_008435	ACG	2	6	5239931	5239936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526652
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119064	NC_008435	GAT	2	6	5240070	5240075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526652
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119066	NC_008435	GGTC	2	8	5240162	5240169	0 %	25 %	50 %	25 %	115526652
119067	NC_008435	GAT	2	6	5240178	5240183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526652
119068	NC_008435	GTC	2	6	5240184	5240189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526652
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119070	NC_008435	CCG	2	6	5240464	5240469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526653
119071	NC_008435	ACAGC	2	10	5240484	5240493	40 %	0 %	20 %	40 %	115526653
119072	NC_008435	CAG	2	6	5240503	5240508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
119073	NC_008435	GCC	2	6	5240510	5240515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526653
119074	NC_008435	CAG	2	6	5240596	5240601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
119075	NC_008435	ATG	2	6	5240603	5240608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526653
119076	NC_008435	CG	3	6	5240634	5240639	0 %	0 %	50 %	50 %	115526653
119077	NC_008435	GCA	2	6	5240670	5240675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
119078	NC_008435	TCAGCA	2	12	5240679	5240690	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115526653
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119081	NC_008435	GCACCG	2	12	5240802	5240813	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115526653
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119083	NC_008435	CAG	2	6	5240836	5240841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
119084	NC_008435	AGC	2	6	5240858	5240863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
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119086	NC_008435	GCGCC	2	10	5240967	5240976	0 %	0 %	40 %	60 %	115526653
119087	NC_008435	ACC	2	6	5241033	5241038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115526653
119088	NC_008435	TTG	2	6	5241041	5241046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115526653
119089	NC_008435	AACCGC	2	12	5241059	5241070	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	115526653
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119091	NC_008435	CGAT	2	8	5241141	5241148	25 %	25 %	25 %	25 %	115526653
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119098	NC_008435	CGC	2	6	5241406	5241411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526653
119099	NC_008435	GCA	2	6	5241501	5241506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526653
119100	NC_008435	ATG	2	6	5241536	5241541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526653
119101	NC_008435	GCA	3	9	5241575	5241583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526654
119102	NC_008435	GCG	2	6	5241605	5241610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526654
119103	NC_008435	ACG	2	6	5241632	5241637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526654
119104	NC_008435	CG	3	6	5241677	5241682	0 %	0 %	50 %	50 %	115526654
119105	NC_008435	GGT	2	6	5241699	5241704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526654
119106	NC_008435	CGA	2	6	5241744	5241749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115526654
119107	NC_008435	GATC	2	8	5241755	5241762	25 %	25 %	25 %	25 %	115526654
119108	NC_008435	GGC	2	6	5241816	5241821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115526654
119109	NC_008435	GCT	2	6	5241828	5241833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526654
119110	NC_008435	CCAGCC	2	12	5241851	5241862	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	115526654
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119112	NC_008435	GC	3	6	5241887	5241892	0 %	0 %	50 %	50 %	115526654
119113	NC_008435	TTGC	2	8	5241999	5242006	0 %	50 %	25 %	25 %	115526654
119114	NC_008435	TGA	2	6	5242049	5242054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115526654
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119225	NC_008435	GGCCG	2	10	5246689	5246698	0 %	0 %	60 %	40 %	115526657
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119343	NC_008435	TCG	2	6	5251441	5251446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115526661
119344	NC_008435	GGT	2	6	5251461	5251466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526661
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119450	NC_008435	TGG	2	6	5255609	5255614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115526664
119451	NC_008435	CGC	2	6	5255625	5255630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526664
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119453	NC_008435	CGC	2	6	5255673	5255678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115526664
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