MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008435	ACA	2	6	427988	427993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522416
10002	NC_008435	GC	3	6	427996	428001	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10003	NC_008435	GGC	2	6	428010	428015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522416
10004	NC_008435	GCCT	2	8	428022	428029	0 %	25 %	25 %	50 %	115522416
10005	NC_008435	GATC	2	8	428063	428070	25 %	25 %	25 %	25 %	115522416
10006	NC_008435	GC	3	6	428098	428103	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10007	NC_008435	GCC	2	6	428107	428112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522416
10008	NC_008435	GCC	2	6	428200	428205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522416
10009	NC_008435	GCA	2	6	428210	428215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10010	NC_008435	GCG	2	6	428233	428238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522416
10011	NC_008435	ACC	2	6	428329	428334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522416
10012	NC_008435	CGT	2	6	428378	428383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10013	NC_008435	CGC	2	6	428456	428461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522416
10014	NC_008435	GCG	2	6	428470	428475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522416
10015	NC_008435	TCG	2	6	428527	428532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10016	NC_008435	CGT	2	6	428555	428560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10017	NC_008435	GC	3	6	428593	428598	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10018	NC_008435	GCG	2	6	428617	428622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522416
10019	NC_008435	CAC	2	6	428649	428654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522416
10020	NC_008435	CG	3	6	428733	428738	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10021	NC_008435	CCG	2	6	428743	428748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522416
10022	NC_008435	TCG	2	6	428770	428775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10023	NC_008435	CGG	2	6	428792	428797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522416
10024	NC_008435	GTC	2	6	428802	428807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10025	NC_008435	TCG	2	6	428845	428850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522416
10026	NC_008435	GC	3	6	428875	428880	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10027	NC_008435	AAC	2	6	428908	428913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522416
10028	NC_008435	GAT	2	6	428916	428921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522416
10029	NC_008435	GC	4	8	428925	428932	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10030	NC_008435	CCGG	2	8	428936	428943	0 %	0 %	50 %	50 %	115522416
10031	NC_008435	AGA	2	6	429000	429005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522417
10032	NC_008435	GCGCG	2	10	429045	429054	0 %	0 %	60 %	40 %	115522417
10033	NC_008435	GC	3	6	429074	429079	0 %	0 %	50 %	50 %	115522417
10034	NC_008435	CG	3	6	429083	429088	0 %	0 %	50 %	50 %	115522417
10035	NC_008435	CGT	2	6	429111	429116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10036	NC_008435	CG	3	6	429123	429128	0 %	0 %	50 %	50 %	115522417
10037	NC_008435	TGC	2	6	429135	429140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10038	NC_008435	CAC	2	6	429148	429153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522417
10039	NC_008435	AGG	2	6	429183	429188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522417
10040	NC_008435	CGA	2	6	429244	429249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10041	NC_008435	CGA	2	6	429256	429261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10042	NC_008435	CGG	2	6	429286	429291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522417
10043	NC_008435	TGGCC	2	10	429300	429309	0 %	20 %	40 %	40 %	115522417
10044	NC_008435	CGACGC	2	12	429342	429353	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522417
10045	NC_008435	ATCG	2	8	429379	429386	25 %	25 %	25 %	25 %	115522417
10046	NC_008435	CAG	2	6	429403	429408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10047	NC_008435	AGC	2	6	429462	429467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10048	NC_008435	CGG	2	6	429468	429473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522417
10049	NC_008435	GCC	2	6	429479	429484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522417
10050	NC_008435	AGC	2	6	429500	429505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522417
10051	NC_008435	GAT	3	9	429557	429565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522418
10052	NC_008435	CGC	2	6	429667	429672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522418
10053	NC_008435	CTT	2	6	429674	429679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522418
10054	NC_008435	CCG	2	6	429736	429741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522418
10055	NC_008435	TTC	2	6	429791	429796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522418
10056	NC_008435	CAT	2	6	429809	429814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522418
10057	NC_008435	GAT	2	6	429836	429841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522418
10058	NC_008435	GC	3	6	429988	429993	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10059	NC_008435	CCG	2	6	430036	430041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522418
10060	NC_008435	CGGC	2	8	430048	430055	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10061	NC_008435	CGT	2	6	430078	430083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10062	NC_008435	CTT	2	6	430132	430137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522418
10063	NC_008435	CGG	2	6	430160	430165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522418
10064	NC_008435	GC	3	6	430187	430192	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10065	NC_008435	GAT	2	6	430214	430219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522418
10066	NC_008435	GTC	2	6	430220	430225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10067	NC_008435	TCT	2	6	430258	430263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522418
10068	NC_008435	TC	3	6	430296	430301	0 %	50 %	0 %	50 %	115522418
10069	NC_008435	CGAT	2	8	430354	430361	25 %	25 %	25 %	25 %	115522418
10070	NC_008435	CGA	2	6	430416	430421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10071	NC_008435	CAC	2	6	430433	430438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522418
10072	NC_008435	TCG	2	6	430470	430475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10073	NC_008435	CG	3	6	430502	430507	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10074	NC_008435	GAA	2	6	430511	430516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522418
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10076	NC_008435	CAT	2	6	430577	430582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522418
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10078	NC_008435	ACG	2	6	430590	430595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10079	NC_008435	CGA	2	6	430660	430665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10080	NC_008435	GCC	2	6	430700	430705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522418
10081	NC_008435	TGA	2	6	430740	430745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522418
10082	NC_008435	TCC	2	6	430779	430784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522418
10083	NC_008435	GCA	2	6	430786	430791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10084	NC_008435	CCGGCA	2	12	430810	430821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522418
10085	NC_008435	GC	3	6	430930	430935	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10086	NC_008435	CTT	2	6	430969	430974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522418
10087	NC_008435	GGC	2	6	431023	431028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522418
10088	NC_008435	TGA	2	6	431053	431058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522418
10089	NC_008435	ACC	2	6	431091	431096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522418
10090	NC_008435	TTG	2	6	431118	431123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522418
10091	NC_008435	CG	3	6	431246	431251	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10092	NC_008435	CGG	2	6	431278	431283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522418
10093	NC_008435	CTT	2	6	431312	431317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522418
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10099	NC_008435	GCT	2	6	431632	431637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522418
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10102	NC_008435	CG	3	6	431818	431823	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10103	NC_008435	CGC	2	6	431867	431872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522418
10104	NC_008435	TGT	2	6	431875	431880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522418
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10107	NC_008435	CG	3	6	431980	431985	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10108	NC_008435	GC	3	6	431996	432001	0 %	0 %	50 %	50 %	115522418
10109	NC_008435	CAC	2	6	432002	432007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522418
10110	NC_008435	GTA	2	6	432080	432085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522418
10111	NC_008435	TCG	2	6	432099	432104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522418
10112	NC_008435	TCG	2	6	432126	432131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522418
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10115	NC_008435	CGC	2	6	432416	432421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522419
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10118	NC_008435	CGG	2	6	432488	432493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522419
10119	NC_008435	CAG	2	6	432498	432503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522419
10120	NC_008435	GC	3	6	432533	432538	0 %	0 %	50 %	50 %	115522419
10121	NC_008435	CTGGT	2	10	432577	432586	0 %	40 %	40 %	20 %	115522419
10122	NC_008435	CGG	2	6	432635	432640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522419
10123	NC_008435	GTG	2	6	432652	432657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522419
10124	NC_008435	GCA	3	9	432662	432670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522419
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10224	NC_008435	CGA	2	6	436833	436838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522423
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10226	NC_008435	TCGCG	2	10	437149	437158	0 %	20 %	40 %	40 %	115522424
10227	NC_008435	CACC	2	8	437233	437240	25 %	0 %	0 %	75 %	115522424
10228	NC_008435	CGG	2	6	437248	437253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522424
10229	NC_008435	CCA	2	6	437264	437269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522424
10230	NC_008435	CG	4	8	437302	437309	0 %	0 %	50 %	50 %	115522424
10231	NC_008435	TGC	2	6	437331	437336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522424
10232	NC_008435	ACC	2	6	437376	437381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522424
10233	NC_008435	GAG	2	6	437384	437389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522424
10234	NC_008435	CGT	2	6	437407	437412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522424
10235	NC_008435	GCG	2	6	437419	437424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522424
10236	NC_008435	CGCCT	2	10	437456	437465	0 %	20 %	20 %	60 %	115522424
10237	NC_008435	TCG	2	6	437496	437501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522424
10238	NC_008435	TCGGGA	2	12	437538	437549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115522424
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10240	NC_008435	GCA	2	6	437581	437586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522424
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10348	NC_008435	TCA	2	6	441569	441574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522427
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10351	NC_008435	ACG	2	6	441701	441706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522427
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10355	NC_008435	GCC	2	6	441787	441792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522427
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10357	NC_008435	GAT	2	6	441823	441828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522427
10358	NC_008435	TCG	2	6	441887	441892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522427
10359	NC_008435	GGC	2	6	441898	441903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522427
10360	NC_008435	TGC	2	6	441914	441919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522427
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10362	NC_008435	TGC	2	6	441940	441945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522427
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10476	NC_008435	CCGC	2	8	446709	446716	0 %	0 %	25 %	75 %	115522432
10477	NC_008435	ACG	2	6	446724	446729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522432
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10479	NC_008435	CCGA	2	8	446799	446806	25 %	0 %	25 %	50 %	115522432
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10481	NC_008435	CCA	2	6	446854	446859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522432
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