MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008435	GGC	2	6	300380	300385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7002	NC_008435	TCA	2	6	300421	300426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522289
7003	NC_008435	AGA	2	6	300441	300446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522289
7004	NC_008435	TCC	2	6	300450	300455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522289
7005	NC_008435	ACC	2	6	300456	300461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522289
7006	NC_008435	AGC	2	6	300462	300467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7007	NC_008435	GCC	2	6	300476	300481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7008	NC_008435	GAC	2	6	300485	300490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7009	NC_008435	GTC	2	6	300503	300508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7010	NC_008435	TGG	2	6	300553	300558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522289
7011	NC_008435	CCG	2	6	300594	300599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7012	NC_008435	TGG	2	6	300661	300666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522289
7013	NC_008435	CGC	2	6	300782	300787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7014	NC_008435	CGA	2	6	300796	300801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7015	NC_008435	AGC	2	6	300813	300818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7016	NC_008435	GCC	2	6	300824	300829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7017	NC_008435	TCGCG	2	10	300838	300847	0 %	20 %	40 %	40 %	115522289
7018	NC_008435	TCGATC	2	12	300933	300944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115522289
7019	NC_008435	GCA	2	6	300964	300969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7020	NC_008435	GCT	2	6	301024	301029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7021	NC_008435	GC	3	6	301031	301036	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
7022	NC_008435	CGC	2	6	301150	301155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7023	NC_008435	TGT	2	6	301174	301179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522289
7024	NC_008435	CGC	2	6	301195	301200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7025	NC_008435	GCC	2	6	301295	301300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7026	NC_008435	CG	3	6	301329	301334	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
7027	NC_008435	GGC	2	6	301337	301342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7028	NC_008435	ATG	2	6	301374	301379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522289
7029	NC_008435	CGC	3	9	301402	301410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7030	NC_008435	GC	3	6	301418	301423	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
7031	NC_008435	ATCGG	2	10	301457	301466	20 %	20 %	40 %	20 %	115522289
7032	NC_008435	GAA	2	6	301520	301525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522289
7033	NC_008435	GCC	3	9	301552	301560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7034	NC_008435	GCC	2	6	301638	301643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7035	NC_008435	GGC	2	6	301739	301744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7036	NC_008435	GCG	2	6	301758	301763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7037	NC_008435	GCGA	2	8	301785	301792	25 %	0 %	50 %	25 %	115522289
7038	NC_008435	GC	3	6	301793	301798	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
7039	NC_008435	CAG	2	6	301811	301816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7040	NC_008435	GC	3	6	301920	301925	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
7041	NC_008435	CCG	2	6	301929	301934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7042	NC_008435	CGG	3	9	301993	302001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7043	NC_008435	CGAG	2	8	302017	302024	25 %	0 %	50 %	25 %	115522289
7044	NC_008435	GTC	2	6	302042	302047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7045	NC_008435	GAT	2	6	302123	302128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522289
7046	NC_008435	GCGCG	2	10	302152	302161	0 %	0 %	60 %	40 %	115522289
7047	NC_008435	GAT	2	6	302201	302206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522289
7048	NC_008435	GTC	3	9	302223	302231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7049	NC_008435	CGT	3	9	302272	302280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7050	NC_008435	CTC	3	9	302357	302365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522289
7051	NC_008435	CCG	3	9	302383	302391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7052	NC_008435	GCC	2	6	302447	302452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7053	NC_008435	GCA	2	6	302479	302484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7054	NC_008435	GGC	2	6	302530	302535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7055	NC_008435	CTC	2	6	302558	302563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522289
7056	NC_008435	GCC	2	6	302573	302578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522289
7057	NC_008435	GC	3	6	302585	302590	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
7058	NC_008435	GCA	2	6	302653	302658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
7059	NC_008435	TGGTC	2	10	302686	302695	0 %	40 %	40 %	20 %	115522289
7060	NC_008435	CAC	2	6	302720	302725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522289
7061	NC_008435	GACC	2	8	302755	302762	25 %	0 %	25 %	50 %	115522289
7062	NC_008435	GCG	2	6	302763	302768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7063	NC_008435	CGG	2	6	302770	302775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522289
7064	NC_008435	ACA	2	6	302776	302781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522289
7065	NC_008435	ATT	2	6	302935	302940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115522290
7066	NC_008435	GGCA	2	8	302966	302973	25 %	0 %	50 %	25 %	115522290
7067	NC_008435	CCG	2	6	303007	303012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522290
7068	NC_008435	GATCG	2	10	303041	303050	20 %	20 %	40 %	20 %	115522290
7069	NC_008435	ATC	2	6	303054	303059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522290
7070	NC_008435	CTG	2	6	303116	303121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522290
7071	NC_008435	CAC	2	6	303158	303163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522290
7072	NC_008435	CCG	2	6	303168	303173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522290
7073	NC_008435	GGC	2	6	303209	303214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522290
7074	NC_008435	AATGG	2	10	303457	303466	40 %	20 %	40 %	0 %	115522291
7075	NC_008435	CGC	2	6	303477	303482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522291
7076	NC_008435	CCCG	2	8	303524	303531	0 %	0 %	25 %	75 %	115522291
7077	NC_008435	GC	3	6	303568	303573	0 %	0 %	50 %	50 %	115522291
7078	NC_008435	CGC	2	6	303588	303593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522291
7079	NC_008435	CGC	2	6	303621	303626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522291
7080	NC_008435	CGACC	2	10	303654	303663	20 %	0 %	20 %	60 %	115522291
7081	NC_008435	CTTT	2	8	303683	303690	0 %	75 %	0 %	25 %	115522291
7082	NC_008435	GTG	2	6	303700	303705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522291
7083	NC_008435	GGC	2	6	303721	303726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522291
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7085	NC_008435	CGG	4	12	303767	303778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522291
7086	NC_008435	GCC	2	6	303804	303809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522291
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7088	NC_008435	ACG	2	6	304006	304011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7089	NC_008435	CGC	2	6	304051	304056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
7090	NC_008435	TCG	2	6	304080	304085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7091	NC_008435	GCC	2	6	304101	304106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
7092	NC_008435	GAT	2	6	304115	304120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522292
7093	NC_008435	GAC	2	6	304170	304175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7094	NC_008435	CGC	2	6	304183	304188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
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7098	NC_008435	CGC	2	6	304319	304324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
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7100	NC_008435	GAA	2	6	304427	304432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522292
7101	NC_008435	ACG	2	6	304468	304473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7102	NC_008435	GCC	2	6	304524	304529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
7103	NC_008435	GAT	2	6	304532	304537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522292
7104	NC_008435	CCT	2	6	304549	304554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522292
7105	NC_008435	GACC	2	8	304562	304569	25 %	0 %	25 %	50 %	115522292
7106	NC_008435	CCG	2	6	304603	304608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
7107	NC_008435	TTC	2	6	304620	304625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522292
7108	NC_008435	CGC	2	6	304646	304651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
7109	NC_008435	AAG	2	6	304662	304667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522292
7110	NC_008435	TCG	2	6	304699	304704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7111	NC_008435	TCGG	2	8	304719	304726	0 %	25 %	50 %	25 %	115522292
7112	NC_008435	CCG	2	6	304741	304746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522292
7113	NC_008435	GAC	2	6	304815	304820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7114	NC_008435	CTACGG	2	12	304895	304906	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522292
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7116	NC_008435	TGA	2	6	304969	304974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522292
7117	NC_008435	CAA	2	6	305060	305065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522292
7118	NC_008435	GAT	2	6	305075	305080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522292
7119	NC_008435	ATC	2	6	305118	305123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522292
7120	NC_008435	GAC	2	6	305127	305132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522292
7121	NC_008435	GCG	2	6	305133	305138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522292
7122	NC_008435	CTG	2	6	305351	305356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522293
7123	NC_008435	GCC	2	6	305408	305413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522293
7124	NC_008435	ACC	2	6	305427	305432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522293
7125	NC_008435	CGGG	2	8	305461	305468	0 %	0 %	75 %	25 %	115522293
7126	NC_008435	CGG	2	6	305514	305519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522293
7127	NC_008435	TCC	2	6	305523	305528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522293
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7129	NC_008435	CAT	2	6	305741	305746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522294
7130	NC_008435	GC	3	6	305817	305822	0 %	0 %	50 %	50 %	115522294
7131	NC_008435	AGA	2	6	305860	305865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522294
7132	NC_008435	CGG	2	6	305908	305913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522294
7133	NC_008435	CGC	2	6	305921	305926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522294
7134	NC_008435	GCTGAC	2	12	305987	305998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	115522294
7135	NC_008435	CGC	2	6	306011	306016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522294
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7140	NC_008435	CCGCG	2	10	306332	306341	0 %	0 %	40 %	60 %	115522294
7141	NC_008435	CG	3	6	306391	306396	0 %	0 %	50 %	50 %	115522294
7142	NC_008435	TGG	2	6	306409	306414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522294
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7144	NC_008435	CGG	2	6	306559	306564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522294
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7146	NC_008435	CCGCG	2	10	306581	306590	0 %	0 %	40 %	60 %	115522294
7147	NC_008435	GCT	2	6	306611	306616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522294
7148	NC_008435	ATC	2	6	306732	306737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522294
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7151	NC_008435	GTT	2	6	306770	306775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522294
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7157	NC_008435	CGG	2	6	306905	306910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522294
7158	NC_008435	TTCGGC	2	12	306915	306926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522294
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7169	NC_008435	ATC	2	6	307312	307317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522295
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7242	NC_008435	CAT	2	6	310527	310532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522299
7243	NC_008435	CGA	3	9	310542	310550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522299
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7246	NC_008435	CGA	2	6	310716	310721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522299
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7273	NC_008435	CGG	2	6	311852	311857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522300
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7334	NC_008435	ACG	2	6	314341	314346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522302
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7337	NC_008435	TCGA	2	8	314410	314417	25 %	25 %	25 %	25 %	115522302
7338	NC_008435	CAGG	2	8	314451	314458	25 %	0 %	50 %	25 %	115522302
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7341	NC_008435	ACG	2	6	314751	314756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522303
7342	NC_008435	GCG	2	6	314768	314773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522303
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7344	NC_008435	GC	3	6	314888	314893	0 %	0 %	50 %	50 %	115522303
7345	NC_008435	ACG	2	6	314915	314920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522303
7346	NC_008435	CGA	2	6	314946	314951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522303
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7348	NC_008435	CCA	2	6	315089	315094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522303
7349	NC_008435	ACG	2	6	315179	315184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522303
7350	NC_008435	GC	3	6	315192	315197	0 %	0 %	50 %	50 %	115522303
7351	NC_008435	TTC	2	6	315211	315216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522303
7352	NC_008435	ACC	2	6	315221	315226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522303
7353	NC_008435	GTG	2	6	315304	315309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522303
7354	NC_008435	TGA	2	6	315422	315427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522303
7355	NC_008435	CGA	2	6	315558	315563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522303
7356	NC_008435	GC	3	6	315595	315600	0 %	0 %	50 %	50 %	115522303
7357	NC_008435	CGT	2	6	315680	315685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522303
7358	NC_008435	CGC	2	6	315863	315868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522304
7359	NC_008435	GAC	2	6	315929	315934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522304
7360	NC_008435	ATC	2	6	315944	315949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522304
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7362	NC_008435	TGGC	2	8	316079	316086	0 %	25 %	50 %	25 %	115522304
7363	NC_008435	ATG	2	6	316104	316109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522304
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7484	NC_008435	CGG	2	6	321315	321320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522309
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