MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008435	CCAT	2	8	278469	278476	25 %	25 %	0 %	50 %	115522274
6502	NC_008435	GCC	2	6	278503	278508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6503	NC_008435	CGG	2	6	278512	278517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6504	NC_008435	GCG	2	6	278545	278550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6505	NC_008435	CGG	2	6	278554	278559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6506	NC_008435	GCA	2	6	278569	278574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522274
6507	NC_008435	GC	3	6	278665	278670	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6508	NC_008435	CGG	2	6	278689	278694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6509	NC_008435	CGC	2	6	278728	278733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6510	NC_008435	CG	4	8	278749	278756	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6511	NC_008435	CAG	2	6	278762	278767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522274
6512	NC_008435	GTT	2	6	278771	278776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522274
6513	NC_008435	AGC	2	6	278790	278795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522274
6514	NC_008435	CAC	2	6	278831	278836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522274
6515	NC_008435	CGC	2	6	278841	278846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6516	NC_008435	GCGGGC	2	12	278858	278869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6517	NC_008435	GGC	3	9	278867	278875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6518	NC_008435	CGC	2	6	278962	278967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522274
6519	NC_008435	GC	5	10	279022	279031	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6520	NC_008435	GAA	2	6	279050	279055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522274
6521	NC_008435	AACAGC	2	12	279084	279095	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	115522274
6522	NC_008435	GGC	2	6	279104	279109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6523	NC_008435	CAT	2	6	279131	279136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522274
6524	NC_008435	CG	3	6	279145	279150	0 %	0 %	50 %	50 %	115522274
6525	NC_008435	CGCGGG	2	12	279161	279172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522274
6526	NC_008435	GA	3	6	279186	279191	50 %	0 %	50 %	0 %	115522274
6527	NC_008435	CGA	2	6	279664	279669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6528	NC_008435	CCGC	2	8	279701	279708	0 %	0 %	25 %	75 %	115522275
6529	NC_008435	ATG	2	6	279758	279763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522275
6530	NC_008435	ATC	2	6	279767	279772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522275
6531	NC_008435	CCT	2	6	279816	279821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522275
6532	NC_008435	CGG	2	6	279870	279875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522275
6533	NC_008435	CGG	2	6	279886	279891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522275
6534	NC_008435	GAT	2	6	279919	279924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522275
6535	NC_008435	CGG	2	6	279955	279960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522275
6536	NC_008435	GCC	2	6	279965	279970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522275
6537	NC_008435	CAA	2	6	280078	280083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522275
6538	NC_008435	TGC	2	6	280137	280142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6539	NC_008435	GTG	2	6	280157	280162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522275
6540	NC_008435	CAA	2	6	280177	280182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522275
6541	NC_008435	CTGTT	2	10	280224	280233	0 %	60 %	20 %	20 %	115522275
6542	NC_008435	GCTC	2	8	280255	280262	0 %	25 %	25 %	50 %	115522275
6543	NC_008435	ATCC	2	8	280281	280288	25 %	25 %	0 %	50 %	115522275
6544	NC_008435	CCCCT	2	10	280369	280378	0 %	20 %	0 %	80 %	115522275
6545	NC_008435	CAA	2	6	280400	280405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522275
6546	NC_008435	GCA	2	6	280530	280535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6547	NC_008435	TGA	2	6	280552	280557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522275
6548	NC_008435	GCG	2	6	280631	280636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522275
6549	NC_008435	GC	3	6	280691	280696	0 %	0 %	50 %	50 %	115522275
6550	NC_008435	GAC	2	6	280697	280702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6551	NC_008435	CAG	2	6	280714	280719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6552	NC_008435	GCA	2	6	280722	280727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6553	NC_008435	AGG	2	6	280728	280733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522275
6554	NC_008435	CGT	2	6	280765	280770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6555	NC_008435	TGC	2	6	280827	280832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6556	NC_008435	CCG	2	6	280864	280869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522275
6557	NC_008435	TTC	2	6	280962	280967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522275
6558	NC_008435	CCG	2	6	280983	280988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522275
6559	NC_008435	CG	3	6	280987	280992	0 %	0 %	50 %	50 %	115522275
6560	NC_008435	ATC	2	6	281042	281047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522275
6561	NC_008435	CAA	2	6	281086	281091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522275
6562	NC_008435	CAA	2	6	281107	281112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522275
6563	NC_008435	ATC	2	6	281153	281158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522275
6564	NC_008435	TGG	2	6	281163	281168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522275
6565	NC_008435	GGA	2	6	281173	281178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522275
6566	NC_008435	ACC	2	6	281226	281231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522275
6567	NC_008435	AGC	2	6	281282	281287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6568	NC_008435	GC	3	6	281319	281324	0 %	0 %	50 %	50 %	115522275
6569	NC_008435	TAC	2	6	281327	281332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522275
6570	NC_008435	GA	3	6	281440	281445	50 %	0 %	50 %	0 %	115522275
6571	NC_008435	TCG	2	6	281454	281459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6572	NC_008435	TAC	2	6	281492	281497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522275
6573	NC_008435	CGAG	2	8	281512	281519	25 %	0 %	50 %	25 %	115522275
6574	NC_008435	CTG	2	6	281573	281578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522275
6575	NC_008435	CCA	2	6	281583	281588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522275
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6577	NC_008435	GC	3	6	281683	281688	0 %	0 %	50 %	50 %	115522275
6578	NC_008435	A	6	6	281753	281758	100 %	0 %	0 %	0 %	115522275
6579	NC_008435	TGA	2	6	281818	281823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522275
6580	NC_008435	GC	3	6	281828	281833	0 %	0 %	50 %	50 %	115522275
6581	NC_008435	CTT	2	6	281837	281842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522275
6582	NC_008435	CGG	2	6	282107	282112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
6583	NC_008435	CGA	2	6	282134	282139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522276
6584	NC_008435	GGC	3	9	282143	282151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
6585	NC_008435	GCT	2	6	282164	282169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522276
6586	NC_008435	CGA	2	6	282203	282208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522276
6587	NC_008435	T	6	6	282211	282216	0 %	100 %	0 %	0 %	115522276
6588	NC_008435	GCT	3	9	282269	282277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522276
6589	NC_008435	CG	3	6	282360	282365	0 %	0 %	50 %	50 %	115522276
6590	NC_008435	GATC	2	8	282380	282387	25 %	25 %	25 %	25 %	115522276
6591	NC_008435	CGG	2	6	282398	282403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
6592	NC_008435	TCA	2	6	282502	282507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522276
6593	NC_008435	TGA	2	6	282514	282519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522276
6594	NC_008435	CGATG	2	10	282536	282545	20 %	20 %	40 %	20 %	115522276
6595	NC_008435	CG	3	6	282586	282591	0 %	0 %	50 %	50 %	115522276
6596	NC_008435	CAG	2	6	282621	282626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522276
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6598	NC_008435	GCG	2	6	282636	282641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
6599	NC_008435	TCG	2	6	282643	282648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522276
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6602	NC_008435	GGCCG	2	10	282698	282707	0 %	0 %	60 %	40 %	115522276
6603	NC_008435	CCG	2	6	282802	282807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522276
6604	NC_008435	CGGCG	2	10	282830	282839	0 %	0 %	60 %	40 %	115522276
6605	NC_008435	GAT	2	6	282842	282847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522276
6606	NC_008435	CGG	2	6	282862	282867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
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6608	NC_008435	CGC	2	6	282886	282891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522276
6609	NC_008435	GC	3	6	282894	282899	0 %	0 %	50 %	50 %	115522276
6610	NC_008435	CCG	2	6	282916	282921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522276
6611	NC_008435	GCC	2	6	282926	282931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522276
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6613	NC_008435	CGG	2	6	283103	283108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
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6616	NC_008435	GCG	2	6	283186	283191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522276
6617	NC_008435	CTCGCC	2	12	283197	283208	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	115522276
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6619	NC_008435	TGGCGA	2	12	283237	283248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115522276
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6733	NC_008435	GCCGG	2	10	288630	288639	0 %	0 %	60 %	40 %	115522280
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6983	NC_008435	CAA	2	6	299760	299765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522288
6984	NC_008435	CCGG	2	8	299811	299818	0 %	0 %	50 %	50 %	115522288
6985	NC_008435	GCT	2	6	299820	299825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522288
6986	NC_008435	CAC	2	6	299835	299840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522288
6987	NC_008435	CTCAAC	2	12	299854	299865	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	115522288
6988	NC_008435	GC	3	6	299898	299903	0 %	0 %	50 %	50 %	115522288
6989	NC_008435	CG	3	6	299977	299982	0 %	0 %	50 %	50 %	115522288
6990	NC_008435	CGCCGA	2	12	299997	300008	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115522288
6991	NC_008435	CGC	2	6	300009	300014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522288
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6993	NC_008435	GC	3	6	300150	300155	0 %	0 %	50 %	50 %	115522289
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6996	NC_008435	TCG	2	6	300273	300278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522289
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6999	NC_008435	CAG	2	6	300326	300331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522289
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