MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisA53 chromosome

Total Repeats: 125232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008435	GTG	2	6	235328	235333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522239
5502	NC_008435	ACC	2	6	235346	235351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522239
5503	NC_008435	TAG	2	6	235355	235360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522239
5504	NC_008435	ATCG	2	8	235378	235385	25 %	25 %	25 %	25 %	115522239
5505	NC_008435	GC	3	6	235398	235403	0 %	0 %	50 %	50 %	115522239
5506	NC_008435	GCG	2	6	235422	235427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522239
5507	NC_008435	GTG	2	6	235445	235450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522239
5508	NC_008435	ACC	2	6	235457	235462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522239
5509	NC_008435	CGG	2	6	235470	235475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522239
5510	NC_008435	CG	4	8	235488	235495	0 %	0 %	50 %	50 %	115522239
5511	NC_008435	GGT	2	6	235537	235542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522239
5512	NC_008435	GCG	2	6	235562	235567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522239
5513	NC_008435	AACC	2	8	235569	235576	50 %	0 %	0 %	50 %	115522239
5514	NC_008435	TGC	2	6	235649	235654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522239
5515	NC_008435	GTG	2	6	235664	235669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522239
5516	NC_008435	CGG	2	6	235689	235694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522239
5517	NC_008435	ACC	2	6	235875	235880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522240
5518	NC_008435	CAG	2	6	235898	235903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522240
5519	NC_008435	TGC	2	6	235917	235922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522240
5520	NC_008435	GAT	2	6	236003	236008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522240
5521	NC_008435	CGC	2	6	236011	236016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522240
5522	NC_008435	CCG	2	6	236029	236034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522240
5523	NC_008435	TGA	2	6	236062	236067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522240
5524	NC_008435	ACG	2	6	236070	236075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522240
5525	NC_008435	GAA	2	6	236096	236101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115522240
5526	NC_008435	TCG	2	6	236103	236108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522240
5527	NC_008435	TCC	2	6	236109	236114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522240
5528	NC_008435	ATG	2	6	236178	236183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522240
5529	NC_008435	TGC	2	6	236208	236213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522240
5530	NC_008435	GCC	2	6	236313	236318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522240
5531	NC_008435	GCG	2	6	236319	236324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522240
5532	NC_008435	CCGG	2	8	236363	236370	0 %	0 %	50 %	50 %	115522240
5533	NC_008435	GGGT	2	8	236398	236405	0 %	25 %	75 %	0 %	115522240
5534	NC_008435	CTG	2	6	236552	236557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5535	NC_008435	CGGA	2	8	236561	236568	25 %	0 %	50 %	25 %	115522241
5536	NC_008435	CGG	2	6	236584	236589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5537	NC_008435	TGAC	2	8	236623	236630	25 %	25 %	25 %	25 %	115522241
5538	NC_008435	CAG	2	6	236634	236639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5539	NC_008435	GAT	2	6	236696	236701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522241
5540	NC_008435	CAG	2	6	236721	236726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5541	NC_008435	GCC	2	6	236742	236747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
5542	NC_008435	CGCA	2	8	236766	236773	25 %	0 %	25 %	50 %	115522241
5543	NC_008435	CCG	2	6	236782	236787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
5544	NC_008435	CGA	2	6	236798	236803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5545	NC_008435	GCG	2	6	236812	236817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5546	NC_008435	GCGCG	2	10	236843	236852	0 %	0 %	60 %	40 %	115522241
5547	NC_008435	TCG	2	6	236863	236868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5548	NC_008435	CTG	2	6	236931	236936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5549	NC_008435	GCCG	2	8	236990	236997	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5550	NC_008435	ACA	2	6	237008	237013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522241
5551	NC_008435	CGA	2	6	237089	237094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5552	NC_008435	CGAT	2	8	237100	237107	25 %	25 %	25 %	25 %	115522241
5553	NC_008435	GCC	3	9	237114	237122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
5554	NC_008435	GGC	2	6	237150	237155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5555	NC_008435	CTG	2	6	237228	237233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5556	NC_008435	CGG	2	6	237247	237252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5557	NC_008435	CGG	2	6	237278	237283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5558	NC_008435	GC	3	6	237369	237374	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5559	NC_008435	GCG	2	6	237397	237402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5560	NC_008435	CGAG	2	8	237403	237410	25 %	0 %	50 %	25 %	115522241
5561	NC_008435	CCG	2	6	237420	237425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
5562	NC_008435	TGC	2	6	237442	237447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5563	NC_008435	CG	3	6	237448	237453	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5564	NC_008435	GCC	2	6	237498	237503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
5565	NC_008435	TGG	2	6	237509	237514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522241
5566	NC_008435	CGA	2	6	237533	237538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5567	NC_008435	TGAC	2	8	237571	237578	25 %	25 %	25 %	25 %	115522241
5568	NC_008435	GAC	3	9	237576	237584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5569	NC_008435	CCG	2	6	237620	237625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
5570	NC_008435	CG	3	6	237624	237629	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5571	NC_008435	GTT	2	6	237645	237650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522241
5572	NC_008435	TCA	2	6	237658	237663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522241
5573	NC_008435	CCGG	2	8	237677	237684	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5574	NC_008435	GCC	2	6	237697	237702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522241
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5576	NC_008435	GCG	2	6	237743	237748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522241
5577	NC_008435	GCCG	2	8	237773	237780	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5578	NC_008435	TGC	2	6	237794	237799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5579	NC_008435	CGGCG	2	10	237854	237863	0 %	0 %	60 %	40 %	115522241
5580	NC_008435	GCCG	2	8	237950	237957	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5581	NC_008435	CCGG	2	8	237973	237980	0 %	0 %	50 %	50 %	115522241
5582	NC_008435	AGC	2	6	238009	238014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5583	NC_008435	GTC	2	6	238015	238020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522241
5584	NC_008435	ATC	2	6	238339	238344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522242
5585	NC_008435	GAT	2	6	238377	238382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522242
5586	NC_008435	CGT	2	6	238448	238453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522242
5587	NC_008435	GC	3	6	238585	238590	0 %	0 %	50 %	50 %	115522242
5588	NC_008435	TTG	2	6	238614	238619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522242
5589	NC_008435	GCA	2	6	238646	238651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522242
5590	NC_008435	CAC	2	6	238653	238658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522242
5591	NC_008435	TAG	2	6	238693	238698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522242
5592	NC_008435	CGG	2	6	238715	238720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522242
5593	NC_008435	TCG	2	6	238723	238728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522242
5594	NC_008435	GGCC	2	8	238754	238761	0 %	0 %	50 %	50 %	115522242
5595	NC_008435	TGCG	2	8	238825	238832	0 %	25 %	50 %	25 %	115522242
5596	NC_008435	CGC	2	6	239273	239278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522243
5597	NC_008435	CTT	2	6	239321	239326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522243
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5599	NC_008435	ACC	2	6	239473	239478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522244
5600	NC_008435	CAC	2	6	239484	239489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115522244
5601	NC_008435	GGTCTT	2	12	239490	239501	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	115522244
5602	NC_008435	GCT	2	6	239514	239519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522244
5603	NC_008435	TCC	2	6	239534	239539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115522244
5604	NC_008435	CAAAGC	2	12	239550	239561	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	115522244
5605	NC_008435	AGG	2	6	239594	239599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115522244
5606	NC_008435	CAA	2	6	239697	239702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522244
5607	NC_008435	GTC	2	6	239703	239708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522244
5608	NC_008435	AG	3	6	239719	239724	50 %	0 %	50 %	0 %	115522244
5609	NC_008435	CGT	2	6	239790	239795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522244
5610	NC_008435	GAC	2	6	239827	239832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522244
5611	NC_008435	ACGA	2	8	239850	239857	50 %	0 %	25 %	25 %	115522244
5612	NC_008435	CT	3	6	239858	239863	0 %	50 %	0 %	50 %	115522244
5613	NC_008435	CTT	2	6	239921	239926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522245
5614	NC_008435	ATG	2	6	239940	239945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522245
5615	NC_008435	CCG	2	6	239953	239958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522245
5616	NC_008435	CCG	2	6	239968	239973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522245
5617	NC_008435	CGG	2	6	240031	240036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522245
5618	NC_008435	CGG	2	6	240052	240057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522245
5619	NC_008435	GC	3	6	240118	240123	0 %	0 %	50 %	50 %	115522245
5620	NC_008435	TGC	2	6	240167	240172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522245
5621	NC_008435	GC	3	6	240203	240208	0 %	0 %	50 %	50 %	115522245
5622	NC_008435	TTC	2	6	240221	240226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115522245
5623	NC_008435	T	6	6	240265	240270	0 %	100 %	0 %	0 %	115522245
5624	NC_008435	GGCGTC	2	12	240278	240289	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522245
5625	NC_008435	TCA	2	6	240361	240366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115522245
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5627	NC_008435	GTT	2	6	240455	240460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115522245
5628	NC_008435	TGC	2	6	240495	240500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522245
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5630	NC_008435	CG	3	6	240654	240659	0 %	0 %	50 %	50 %	115522245
5631	NC_008435	GAT	2	6	240716	240721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522245
5632	NC_008435	CTG	2	6	240722	240727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522245
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5644	NC_008435	GATC	2	8	241282	241289	25 %	25 %	25 %	25 %	115522246
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5652	NC_008435	TGC	2	6	241462	241467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522246
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5743	NC_008435	GAT	2	6	246813	246818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522249
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5850	NC_008435	GCC	2	6	251700	251705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522252
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5853	NC_008435	TGGCGG	2	12	251778	251789	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	115522252
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5859	NC_008435	GGC	2	6	251892	251897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115522252
5860	NC_008435	GGCT	2	8	251911	251918	0 %	25 %	50 %	25 %	115522252
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5983	NC_008435	GGCTCG	2	12	257629	257640	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	115522257
5984	NC_008435	CAA	2	6	257696	257701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115522257
5985	NC_008435	GGT	2	6	257723	257728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522257
5986	NC_008435	CGCT	2	8	257943	257950	0 %	25 %	25 %	50 %	115522258
5987	NC_008435	TCG	2	6	257956	257961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115522258
5988	NC_008435	GAC	2	6	257964	257969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522258
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5990	NC_008435	ATG	2	6	258043	258048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115522258
5991	NC_008435	GGT	2	6	258086	258091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522258
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5993	NC_008435	GC	4	8	258159	258166	0 %	0 %	50 %	50 %	115522258
5994	NC_008435	CGA	2	6	258257	258262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115522258
5995	NC_008435	GTG	2	6	258264	258269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115522258
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5999	NC_008435	CCG	2	6	258416	258421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115522258
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