MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 1761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008386	TG	3	6	830	835	0 %	50 %	50 %	0 %	115345531
2	NC_008386	TGC	2	6	840	845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
3	NC_008386	ACG	2	6	868	873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345531
4	NC_008386	GCC	2	6	891	896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345531
5	NC_008386	GGT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345531
6	NC_008386	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345531
7	NC_008386	GCAAC	2	10	967	976	40 %	0 %	20 %	40 %	115345531
8	NC_008386	TGCC	2	8	980	987	0 %	25 %	25 %	50 %	115345531
9	NC_008386	TTG	2	6	989	994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345531
10	NC_008386	CTG	2	6	1099	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
11	NC_008386	CT	3	6	1127	1132	0 %	50 %	0 %	50 %	115345531
12	NC_008386	TGC	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
13	NC_008386	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345531
14	NC_008386	GC	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	115345531
15	NC_008386	GGC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345531
16	NC_008386	TGC	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
17	NC_008386	CGG	2	6	1532	1537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345531
18	NC_008386	TTGGA	2	10	1571	1580	20 %	40 %	40 %	0 %	115345531
19	NC_008386	TCG	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
20	NC_008386	GTT	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345531
21	NC_008386	TGGG	2	8	1775	1782	0 %	25 %	75 %	0 %	115345531
22	NC_008386	TTGG	2	8	1830	1837	0 %	50 %	50 %	0 %	115345531
23	NC_008386	CAT	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345531
24	NC_008386	TGC	2	6	1890	1895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345531
25	NC_008386	AGC	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345531
26	NC_008386	TCAA	2	8	1951	1958	50 %	25 %	0 %	25 %	115345531
27	NC_008386	GC	3	6	1992	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	115345531
28	NC_008386	GCG	2	6	2058	2063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345531
29	NC_008386	A	6	6	2144	2149	100 %	0 %	0 %	0 %	115345532
30	NC_008386	GCA	2	6	2164	2169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
31	NC_008386	TGC	2	6	2186	2191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345532
32	NC_008386	CGA	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
33	NC_008386	CG	3	6	2303	2308	0 %	0 %	50 %	50 %	115345532
34	NC_008386	GAAT	2	8	2323	2330	50 %	25 %	25 %	0 %	115345532
35	NC_008386	GAC	2	6	2342	2347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
36	NC_008386	CAG	2	6	2354	2359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
37	NC_008386	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345532
38	NC_008386	GCCC	2	8	2374	2381	0 %	0 %	25 %	75 %	115345532
39	NC_008386	TCA	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345532
40	NC_008386	ACA	2	6	2454	2459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345532
41	NC_008386	TGC	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345532
42	NC_008386	ACAA	2	8	2550	2557	75 %	0 %	0 %	25 %	115345532
43	NC_008386	CAA	3	9	2561	2569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345532
44	NC_008386	CCAGC	2	10	2600	2609	20 %	0 %	20 %	60 %	115345532
45	NC_008386	CGCA	2	8	2636	2643	25 %	0 %	25 %	50 %	115345532
46	NC_008386	GGT	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345532
47	NC_008386	TCAA	2	8	2739	2746	50 %	25 %	0 %	25 %	115345532
48	NC_008386	AACCA	2	10	2783	2792	60 %	0 %	0 %	40 %	115345532
49	NC_008386	GCT	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345532
50	NC_008386	CCG	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345532
51	NC_008386	GCA	3	9	2971	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
52	NC_008386	CAAAAG	2	12	2993	3004	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115345532
53	NC_008386	C	6	6	3020	3025	0 %	0 %	0 %	100 %	115345532
54	NC_008386	A	6	6	3068	3073	100 %	0 %	0 %	0 %	115345532
55	NC_008386	AGTA	2	8	3081	3088	50 %	25 %	25 %	0 %	115345532
56	NC_008386	CATC	2	8	3097	3104	25 %	25 %	0 %	50 %	115345532
57	NC_008386	TCA	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345532
58	NC_008386	AACC	2	8	3135	3142	50 %	0 %	0 %	50 %	115345532
59	NC_008386	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345532
60	NC_008386	TGT	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345532
61	NC_008386	A	6	6	3239	3244	100 %	0 %	0 %	0 %	115345532
62	NC_008386	GAC	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345532
63	NC_008386	GCG	3	9	3349	3357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345533
64	NC_008386	ATC	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345533
65	NC_008386	TCT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345534
66	NC_008386	GC	3	6	3484	3489	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
67	NC_008386	GACAAA	2	12	3516	3527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115345534
68	NC_008386	CGA	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345534
69	NC_008386	CGA	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345534
70	NC_008386	TGG	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345534
71	NC_008386	CAG	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345534
72	NC_008386	TGG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345534
73	NC_008386	GAT	2	6	3879	3884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345534
74	NC_008386	CG	3	6	3952	3957	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
75	NC_008386	CCA	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345534
76	NC_008386	A	6	6	4047	4052	100 %	0 %	0 %	0 %	115345534
77	NC_008386	TCA	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345534
78	NC_008386	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115345534
79	NC_008386	CGG	2	6	4268	4273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345534
80	NC_008386	C	6	6	4300	4305	0 %	0 %	0 %	100 %	115345534
81	NC_008386	GC	3	6	4416	4421	0 %	0 %	50 %	50 %	115345534
82	NC_008386	CAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345534
83	NC_008386	TTG	2	6	4572	4577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345534
84	NC_008386	ACA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345534
85	NC_008386	CGC	2	6	4671	4676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345534
86	NC_008386	GGTC	2	8	4714	4721	0 %	25 %	50 %	25 %	115345534
87	NC_008386	GGAT	2	8	4913	4920	25 %	25 %	50 %	0 %	115345534
88	NC_008386	TTTC	2	8	5166	5173	0 %	75 %	0 %	25 %	115345535
89	NC_008386	TGCG	2	8	5225	5232	0 %	25 %	50 %	25 %	115345535
90	NC_008386	TCG	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345535
91	NC_008386	AGT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345535
92	NC_008386	GCA	2	6	5520	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345535
93	NC_008386	CGG	3	9	5544	5552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345535
94	NC_008386	TCA	2	6	5717	5722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345535
95	NC_008386	CTT	3	9	5728	5736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345535
96	NC_008386	GCC	2	6	5770	5775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345535
97	NC_008386	TCC	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345535
98	NC_008386	AGAT	2	8	5844	5851	50 %	25 %	25 %	0 %	115345535
99	NC_008386	ACC	2	6	5945	5950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345535
100	NC_008386	TCA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345535
101	NC_008386	CGG	2	6	6039	6044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345535
102	NC_008386	CG	3	6	6066	6071	0 %	0 %	50 %	50 %	115345535
103	NC_008386	GAT	2	6	6148	6153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345535
104	NC_008386	CTG	2	6	6418	6423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
105	NC_008386	CG	3	6	6424	6429	0 %	0 %	50 %	50 %	115345536
106	NC_008386	TCA	2	6	6458	6463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345536
107	NC_008386	AAC	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345536
108	NC_008386	GC	3	6	6734	6739	0 %	0 %	50 %	50 %	115345536
109	NC_008386	CAC	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345536
110	NC_008386	CGC	2	6	6763	6768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345536
111	NC_008386	ACC	2	6	6820	6825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345536
112	NC_008386	TGC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
113	NC_008386	TGC	2	6	6968	6973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
114	NC_008386	GGC	2	6	7103	7108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345536
115	NC_008386	CCA	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345536
116	NC_008386	GCT	2	6	7163	7168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345536
117	NC_008386	AAGC	2	8	7214	7221	50 %	0 %	25 %	25 %	115345536
118	NC_008386	GCA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345536
119	NC_008386	AAC	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345536
120	NC_008386	CGC	2	6	7775	7780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
121	NC_008386	GCC	2	6	7785	7790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
122	NC_008386	CCAGGG	2	12	7898	7909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	115345537
123	NC_008386	ATGG	2	8	7923	7930	25 %	25 %	50 %	0 %	115345537
124	NC_008386	ATTG	2	8	7956	7963	25 %	50 %	25 %	0 %	115345537
125	NC_008386	CGC	2	6	7988	7993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
126	NC_008386	GCT	2	6	8034	8039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345537
127	NC_008386	CAG	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
128	NC_008386	GGCG	2	8	8052	8059	0 %	0 %	75 %	25 %	115345537
129	NC_008386	GCG	2	6	8111	8116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345537
130	NC_008386	AGC	2	6	8176	8181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
131	NC_008386	CG	3	6	8183	8188	0 %	0 %	50 %	50 %	115345537
132	NC_008386	GTG	2	6	8191	8196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345537
133	NC_008386	CCG	2	6	8215	8220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345537
134	NC_008386	CAG	2	6	8426	8431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
135	NC_008386	GAT	2	6	8495	8500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345537
136	NC_008386	TTC	2	6	8515	8520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345537
137	NC_008386	GAC	3	9	8637	8645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
138	NC_008386	GCA	2	6	8684	8689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345537
139	NC_008386	CAA	2	6	8740	8745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345538
140	NC_008386	GAT	2	6	8777	8782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345538
141	NC_008386	GGC	2	6	8784	8789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345538
142	NC_008386	GGT	2	6	8819	8824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345538
143	NC_008386	TCG	2	6	8835	8840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345538
144	NC_008386	CGC	2	6	8998	9003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
145	NC_008386	CCG	2	6	9009	9014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
146	NC_008386	CGAC	2	8	9163	9170	25 %	0 %	25 %	50 %	115345538
147	NC_008386	GAT	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345538
148	NC_008386	TGC	2	6	9271	9276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345538
149	NC_008386	CCG	2	6	9384	9389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
150	NC_008386	CGCGG	2	10	9431	9440	0 %	0 %	60 %	40 %	115345538
151	NC_008386	CG	4	8	9441	9448	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
152	NC_008386	CGG	2	6	9514	9519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345538
153	NC_008386	GC	4	8	9522	9529	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
154	NC_008386	TGT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345538
155	NC_008386	CTC	2	6	9584	9589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345538
156	NC_008386	GGCG	2	8	9595	9602	0 %	0 %	75 %	25 %	115345538
157	NC_008386	TGT	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345538
158	NC_008386	TCG	2	6	9760	9765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345538
159	NC_008386	TCTG	2	8	9786	9793	0 %	50 %	25 %	25 %	115345538
160	NC_008386	GC	3	6	9888	9893	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
161	NC_008386	AGC	2	6	9909	9914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345538
162	NC_008386	CAG	2	6	9923	9928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345538
163	NC_008386	CGC	2	6	9943	9948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345538
164	NC_008386	CG	3	6	10018	10023	0 %	0 %	50 %	50 %	115345538
165	NC_008386	ATC	2	6	10040	10045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345538
166	NC_008386	TCC	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345539
167	NC_008386	GGT	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345539
168	NC_008386	CAC	2	6	10087	10092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345539
169	NC_008386	GCTCGC	2	12	10131	10142	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	115345539
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171	NC_008386	A	6	6	10280	10285	100 %	0 %	0 %	0 %	115345539
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173	NC_008386	AT	3	6	10303	10308	50 %	50 %	0 %	0 %	115345539
174	NC_008386	CG	3	6	10373	10378	0 %	0 %	50 %	50 %	115345539
175	NC_008386	GCA	2	6	10388	10393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345539
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199	NC_008386	GGC	2	6	11775	11780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345541
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203	NC_008386	GAC	2	6	11880	11885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345541
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224	NC_008386	G	6	6	12849	12854	0 %	0 %	100 %	0 %	115345542
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239	NC_008386	ATC	2	6	13686	13691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345543
240	NC_008386	GTG	2	6	13788	13793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345543
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242	NC_008386	CCAT	2	8	14055	14062	25 %	25 %	0 %	50 %	115345544
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246	NC_008386	GCC	2	6	14301	14306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345544
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248	NC_008386	GAT	2	6	14324	14329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345544
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252	NC_008386	ATC	2	6	14415	14420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345544
253	NC_008386	TCA	2	6	14437	14442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345544
254	NC_008386	GCG	2	6	14487	14492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345544
255	NC_008386	CAT	2	6	14564	14569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345544
256	NC_008386	AGCC	2	8	14611	14618	25 %	0 %	25 %	50 %	115345544
257	NC_008386	CGT	2	6	14627	14632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345544
258	NC_008386	CAT	2	6	14666	14671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345544
259	NC_008386	GGC	2	6	14790	14795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345544
260	NC_008386	CAG	2	6	14849	14854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345544
261	NC_008386	CGGT	2	8	14870	14877	0 %	25 %	50 %	25 %	115345544
262	NC_008386	GAT	2	6	14955	14960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345544
263	NC_008386	CAG	2	6	14988	14993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345544
264	NC_008386	GC	3	6	15152	15157	0 %	0 %	50 %	50 %	115345544
265	NC_008386	GGC	2	6	15222	15227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345544
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378	NC_008386	GC	3	6	23244	23249	0 %	0 %	50 %	50 %	115345552
379	NC_008386	GCT	2	6	23256	23261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345552
380	NC_008386	TC	3	6	23303	23308	0 %	50 %	0 %	50 %	115345552
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382	NC_008386	ACTA	2	8	23393	23400	50 %	25 %	0 %	25 %	115345552
383	NC_008386	CAACT	2	10	23401	23410	40 %	20 %	0 %	40 %	115345552
384	NC_008386	ACC	2	6	23459	23464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345552
385	NC_008386	ACC	2	6	23471	23476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345552
386	NC_008386	AACG	2	8	23542	23549	50 %	0 %	25 %	25 %	115345552
387	NC_008386	ATGCTG	2	12	23568	23579	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115345552
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390	NC_008386	CAG	2	6	23709	23714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345552
391	NC_008386	GCC	2	6	23733	23738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345552
392	NC_008386	CGG	2	6	23792	23797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345552
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495	NC_008386	CG	3	6	29877	29882	0 %	0 %	50 %	50 %	115345562
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497	NC_008386	CAC	2	6	30010	30015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345562
498	NC_008386	GGGA	2	8	30089	30096	25 %	0 %	75 %	0 %	115345562
499	NC_008386	TGGC	2	8	30157	30164	0 %	25 %	50 %	25 %	115345562
500	NC_008386	TTC	2	6	30235	30240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345562

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