MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB1

Total Repeats: 1761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008386	AGG	2	6	90977	90982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345620
1502	NC_008386	TG	3	6	91189	91194	0 %	50 %	50 %	0 %	115345621
1503	NC_008386	A	6	6	91198	91203	100 %	0 %	0 %	0 %	115345621
1504	NC_008386	TCT	2	6	91223	91228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345621
1505	NC_008386	CCGC	2	8	91244	91251	0 %	0 %	25 %	75 %	115345621
1506	NC_008386	CCAC	2	8	91287	91294	25 %	0 %	0 %	75 %	115345621
1507	NC_008386	TGA	2	6	91296	91301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345621
1508	NC_008386	TGCC	2	8	91365	91372	0 %	25 %	25 %	50 %	115345621
1509	NC_008386	GCA	2	6	91413	91418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345621
1510	NC_008386	GC	3	6	91444	91449	0 %	0 %	50 %	50 %	115345621
1511	NC_008386	CAT	2	6	91450	91455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345621
1512	NC_008386	ACCCAA	2	12	91488	91499	50 %	0 %	0 %	50 %	115345621
1513	NC_008386	TCAT	2	8	91574	91581	25 %	50 %	0 %	25 %	115345621
1514	NC_008386	GCA	2	6	91671	91676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345621
1515	NC_008386	CTG	2	6	91699	91704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345621
1516	NC_008386	CCG	2	6	91712	91717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345621
1517	NC_008386	GCG	2	6	91740	91745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345621
1518	NC_008386	GCA	2	6	91865	91870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345622
1519	NC_008386	TCG	2	6	91900	91905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345622
1520	NC_008386	TGG	2	6	91925	91930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345622
1521	NC_008386	CCG	2	6	91948	91953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345622
1522	NC_008386	AAAT	2	8	91963	91970	75 %	25 %	0 %	0 %	115345622
1523	NC_008386	AGT	2	6	91979	91984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345622
1524	NC_008386	GCGCG	2	10	92048	92057	0 %	0 %	60 %	40 %	115345622
1525	NC_008386	C	6	6	92095	92100	0 %	0 %	0 %	100 %	115345622
1526	NC_008386	GCA	2	6	92107	92112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345622
1527	NC_008386	TCC	2	6	92128	92133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345622
1528	NC_008386	GCA	2	6	92149	92154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345622
1529	NC_008386	GCC	2	6	92157	92162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345622
1530	NC_008386	CCGT	2	8	92188	92195	0 %	25 %	25 %	50 %	115345622
1531	NC_008386	GCC	2	6	92239	92244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345622
1532	NC_008386	GC	4	8	92262	92269	0 %	0 %	50 %	50 %	115345622
1533	NC_008386	CCA	2	6	92345	92350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345622
1534	NC_008386	CG	3	6	92513	92518	0 %	0 %	50 %	50 %	115345622
1535	NC_008386	GTA	2	6	92586	92591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345622
1536	NC_008386	GGT	2	6	92594	92599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345622
1537	NC_008386	GAA	2	6	92661	92666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345622
1538	NC_008386	TGC	2	6	92677	92682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345622
1539	NC_008386	GTG	2	6	92706	92711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345622
1540	NC_008386	GCG	2	6	92752	92757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345622
1541	NC_008386	AGA	2	6	92770	92775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345622
1542	NC_008386	AGA	2	6	92791	92796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345622
1543	NC_008386	CAA	2	6	92803	92808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345622
1544	NC_008386	GC	3	6	92905	92910	0 %	0 %	50 %	50 %	115345623
1545	NC_008386	GAG	3	9	92966	92974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345623
1546	NC_008386	CTT	2	6	92987	92992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345623
1547	NC_008386	CAC	2	6	92998	93003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345623
1548	NC_008386	CCT	2	6	93021	93026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345623
1549	NC_008386	GCG	2	6	93041	93046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345623
1550	NC_008386	AC	3	6	93102	93107	50 %	0 %	0 %	50 %	115345623
1551	NC_008386	TTG	2	6	93213	93218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345623
1552	NC_008386	ACCC	2	8	93285	93292	25 %	0 %	0 %	75 %	115345623
1553	NC_008386	CCA	2	6	93303	93308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345623
1554	NC_008386	ATG	2	6	93429	93434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345623
1555	NC_008386	TGC	3	9	93558	93566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345623
1556	NC_008386	GAA	2	6	93608	93613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345623
1557	NC_008386	CTA	2	6	93655	93660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345623
1558	NC_008386	TTG	2	6	93687	93692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345623
1559	NC_008386	TTC	2	6	93707	93712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345623
1560	NC_008386	CGG	2	6	93889	93894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345624
1561	NC_008386	GCA	2	6	93971	93976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345624
1562	NC_008386	GC	3	6	93985	93990	0 %	0 %	50 %	50 %	115345624
1563	NC_008386	GGT	2	6	94032	94037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345624
1564	NC_008386	CTC	2	6	94122	94127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345624
1565	NC_008386	CT	3	6	94175	94180	0 %	50 %	0 %	50 %	115345624
1566	NC_008386	CT	3	6	94279	94284	0 %	50 %	0 %	50 %	115345624
1567	NC_008386	TCC	2	6	94334	94339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	115345624
1568	NC_008386	GT	4	8	94377	94384	0 %	50 %	50 %	0 %	115345624
1569	NC_008386	AAG	2	6	94386	94391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345624
1570	NC_008386	CAG	2	6	94406	94411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345624
1571	NC_008386	GCC	2	6	94417	94422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345624
1572	NC_008386	CTG	2	6	94503	94508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345624
1573	NC_008386	CAA	2	6	94598	94603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	115345624
1574	NC_008386	TGC	2	6	94615	94620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345624
1575	NC_008386	GCC	2	6	94650	94655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345624
1576	NC_008386	CTT	2	6	96032	96037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345625
1577	NC_008386	GCG	2	6	96126	96131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345625
1578	NC_008386	T	6	6	96146	96151	0 %	100 %	0 %	0 %	115345625
1579	NC_008386	TCA	2	6	96185	96190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345625
1580	NC_008386	ATC	2	6	96218	96223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345625
1581	NC_008386	ATC	2	6	96254	96259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345625
1582	NC_008386	GAA	2	6	96564	96569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345625
1583	NC_008386	TGC	2	6	96957	96962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345626
1584	NC_008386	TGC	2	6	97002	97007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345626
1585	NC_008386	ATT	2	6	97431	97436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345627
1586	NC_008386	GTG	2	6	97492	97497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345627
1587	NC_008386	GC	3	6	97590	97595	0 %	0 %	50 %	50 %	115345627
1588	NC_008386	TGCG	2	8	97632	97639	0 %	25 %	50 %	25 %	115345627
1589	NC_008386	CTA	2	6	97667	97672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345627
1590	NC_008386	GATCA	2	10	97764	97773	40 %	20 %	20 %	20 %	115345627
1591	NC_008386	ATT	2	6	97789	97794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345627
1592	NC_008386	GCC	2	6	97808	97813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345627
1593	NC_008386	ATC	2	6	97878	97883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345627
1594	NC_008386	TAT	2	6	97905	97910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115345627
1595	NC_008386	CGC	2	6	97961	97966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345627
1596	NC_008386	TAC	2	6	97971	97976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115345627
1597	NC_008386	AGA	2	6	98035	98040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345627
1598	NC_008386	GCC	3	9	98202	98210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345627
1599	NC_008386	CCCCG	2	10	98304	98313	0 %	0 %	20 %	80 %	115345628
1600	NC_008386	GC	3	6	98320	98325	0 %	0 %	50 %	50 %	115345628
1601	NC_008386	ACC	2	6	98384	98389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345628
1602	NC_008386	TGC	2	6	98491	98496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345628
1603	NC_008386	GC	4	8	98512	98519	0 %	0 %	50 %	50 %	115345628
1604	NC_008386	GTG	2	6	98527	98532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115345628
1605	NC_008386	GGA	2	6	98545	98550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	115345628
1606	NC_008386	C	6	6	98577	98582	0 %	0 %	0 %	100 %	115345628
1607	NC_008386	CGA	2	6	98607	98612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345628
1608	NC_008386	CG	3	6	98736	98741	0 %	0 %	50 %	50 %	115345628
1609	NC_008386	CTTT	2	8	98797	98804	0 %	75 %	0 %	25 %	115345628
1610	NC_008386	AAG	2	6	98807	98812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345628
1611	NC_008386	GCCC	2	8	99008	99015	0 %	0 %	25 %	75 %	115345629
1612	NC_008386	CG	3	6	99035	99040	0 %	0 %	50 %	50 %	115345629
1613	NC_008386	ACC	2	6	99326	99331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345630
1614	NC_008386	CAG	2	6	99440	99445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345630
1615	NC_008386	GAT	2	6	99511	99516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345630
1616	NC_008386	GCT	2	6	99531	99536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115345630
1617	NC_008386	GAT	2	6	99671	99676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345630
1618	NC_008386	TCT	2	6	99717	99722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115345630
1619	NC_008386	CG	3	6	99789	99794	0 %	0 %	50 %	50 %	115345630
1620	NC_008386	CGG	2	6	99805	99810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345630
1621	NC_008386	T	6	6	99862	99867	0 %	100 %	0 %	0 %	115345630
1622	NC_008386	TTTG	2	8	99932	99939	0 %	75 %	25 %	0 %	115345630
1623	NC_008386	CAGC	2	8	99986	99993	25 %	0 %	25 %	50 %	115345631
1624	NC_008386	TGT	2	6	100014	100019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115345631
1625	NC_008386	TGGA	2	8	100043	100050	25 %	25 %	50 %	0 %	115345631
1626	NC_008386	GATA	2	8	100070	100077	50 %	25 %	25 %	0 %	115345631
1627	NC_008386	ATG	2	6	100156	100161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115345631
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1747	NC_008386	CGA	2	6	105668	105673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
1748	NC_008386	GGC	2	6	105701	105706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	115345635
1749	NC_008386	GAC	2	6	105726	105731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
1750	NC_008386	ACCCG	2	10	105761	105770	20 %	0 %	20 %	60 %	115345635
1751	NC_008386	GCCA	2	8	105788	105795	25 %	0 %	25 %	50 %	115345635
1752	NC_008386	ACC	2	6	105809	105814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345635
1753	NC_008386	CACCGG	2	12	105898	105909	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	115345635
1754	NC_008386	GC	3	6	105959	105964	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635
1755	NC_008386	AGC	2	6	105980	105985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
1756	NC_008386	AAG	2	6	105995	106000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	115345635
1757	NC_008386	CGA	2	6	106004	106009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	115345635
1758	NC_008386	GCC	3	9	106032	106040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	115345635
1759	NC_008386	ACC	2	6	106057	106062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	115345635
1760	NC_008386	AGCG	2	8	106084	106091	25 %	0 %	50 %	25 %	115345635
1761	NC_008386	GC	3	6	106101	106106	0 %	0 %	50 %	50 %	115345635

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