MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008384	GCC	2	6	142190	142195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255331
3002	NC_008384	AGA	2	6	142208	142213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255331
3003	NC_008384	GCC	2	6	142293	142298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255331
3004	NC_008384	CCG	2	6	142352	142357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255332
3005	NC_008384	ACG	2	6	142360	142365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255332
3006	NC_008384	TGC	2	6	142401	142406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255332
3007	NC_008384	CTG	2	6	142429	142434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255332
3008	NC_008384	CGC	2	6	142452	142457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255332
3009	NC_008384	ACC	2	6	142479	142484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255332
3010	NC_008384	CCG	2	6	142501	142506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255332
3011	NC_008384	ACG	2	6	142526	142531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255332
3012	NC_008384	CGG	2	6	142532	142537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255332
3013	NC_008384	TCCC	2	8	142562	142569	0 %	25 %	0 %	75 %	116255332
3014	NC_008384	ATG	2	6	142602	142607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255332
3015	NC_008384	GAT	2	6	142669	142674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255332
3016	NC_008384	GCC	2	6	142722	142727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255332
3017	NC_008384	CGGAA	2	10	142837	142846	40 %	0 %	40 %	20 %	116255332
3018	NC_008384	AG	3	6	142853	142858	50 %	0 %	50 %	0 %	116255332
3019	NC_008384	CCA	2	6	142867	142872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255332
3020	NC_008384	ACTC	2	8	142888	142895	25 %	25 %	0 %	50 %	116255332
3021	NC_008384	AAT	2	6	142898	142903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255332
3022	NC_008384	TCG	2	6	142904	142909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255332
3023	NC_008384	CAA	2	6	143251	143256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255333
3024	NC_008384	GCC	2	6	143278	143283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255333
3025	NC_008384	CG	3	6	143377	143382	0 %	0 %	50 %	50 %	116255333
3026	NC_008384	CGC	2	6	143430	143435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255333
3027	NC_008384	CGG	2	6	143457	143462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255333
3028	NC_008384	AG	3	6	143608	143613	50 %	0 %	50 %	0 %	116255333
3029	NC_008384	CGC	2	6	143679	143684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255333
3030	NC_008384	GTC	2	6	143701	143706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255333
3031	NC_008384	GTC	2	6	143709	143714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255333
3032	NC_008384	CG	3	6	143760	143765	0 %	0 %	50 %	50 %	116255333
3033	NC_008384	GC	3	6	143942	143947	0 %	0 %	50 %	50 %	116255333
3034	NC_008384	TGAT	2	8	143969	143976	25 %	50 %	25 %	0 %	116255333
3035	NC_008384	CGA	2	6	143978	143983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255333
3036	NC_008384	GCG	2	6	144010	144015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255333
3037	NC_008384	TCA	2	6	144052	144057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255333
3038	NC_008384	GTT	2	6	144174	144179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255333
3039	NC_008384	TAA	2	6	144197	144202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255333
3040	NC_008384	GGAAG	2	10	144431	144440	40 %	0 %	60 %	0 %	116255334
3041	NC_008384	ACT	2	6	144443	144448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255334
3042	NC_008384	CCT	2	6	144515	144520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255334
3043	NC_008384	GAG	2	6	144651	144656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255334
3044	NC_008384	CCG	2	6	144712	144717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3045	NC_008384	GCC	2	6	144729	144734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3046	NC_008384	CG	3	6	144742	144747	0 %	0 %	50 %	50 %	116255334
3047	NC_008384	GAG	2	6	144801	144806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255334
3048	NC_008384	AAC	2	6	144816	144821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255334
3049	NC_008384	GAG	2	6	144855	144860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255334
3050	NC_008384	CAC	2	6	145009	145014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255334
3051	NC_008384	GC	3	6	145099	145104	0 %	0 %	50 %	50 %	116255334
3052	NC_008384	GCC	2	6	145161	145166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3053	NC_008384	CGC	2	6	145270	145275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3054	NC_008384	GCC	2	6	145283	145288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3055	NC_008384	TTG	2	6	145345	145350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255334
3056	NC_008384	CGT	2	6	145360	145365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3057	NC_008384	GAC	2	6	145389	145394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3058	NC_008384	AT	3	6	145414	145419	50 %	50 %	0 %	0 %	116255334
3059	NC_008384	GTC	2	6	145420	145425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3060	NC_008384	CTG	2	6	145524	145529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3061	NC_008384	CCA	2	6	145559	145564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255334
3062	NC_008384	GCC	2	6	145572	145577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3063	NC_008384	GGA	2	6	145610	145615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255334
3064	NC_008384	GCC	3	9	145671	145679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3065	NC_008384	TCG	2	6	145735	145740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3066	NC_008384	GAA	2	6	145833	145838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255334
3067	NC_008384	GGTC	2	8	145844	145851	0 %	25 %	50 %	25 %	116255334
3068	NC_008384	CGT	2	6	145853	145858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3069	NC_008384	GAA	2	6	145905	145910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255334
3070	NC_008384	CGAG	2	8	145924	145931	25 %	0 %	50 %	25 %	116255334
3071	NC_008384	CAA	2	6	145961	145966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255334
3072	NC_008384	TGG	2	6	146068	146073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255334
3073	NC_008384	GT	3	6	146087	146092	0 %	50 %	50 %	0 %	116255334
3074	NC_008384	GC	3	6	146138	146143	0 %	0 %	50 %	50 %	116255334
3075	NC_008384	CGG	2	6	146218	146223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255334
3076	NC_008384	GC	3	6	146472	146477	0 %	0 %	50 %	50 %	116255334
3077	NC_008384	GGT	2	6	146502	146507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255334
3078	NC_008384	AGGTTC	2	12	146514	146525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255334
3079	NC_008384	CGC	5	15	146600	146614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3080	NC_008384	ACT	2	6	146735	146740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255334
3081	NC_008384	GCT	2	6	146788	146793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3082	NC_008384	CTG	2	6	146805	146810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3083	NC_008384	CTT	2	6	146844	146849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255334
3084	NC_008384	GCCTC	2	10	146929	146938	0 %	20 %	20 %	60 %	116255334
3085	NC_008384	GC	4	8	146958	146965	0 %	0 %	50 %	50 %	116255334
3086	NC_008384	T	6	6	147051	147056	0 %	100 %	0 %	0 %	116255334
3087	NC_008384	CAG	2	6	147117	147122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255334
3088	NC_008384	TCGT	2	8	147164	147171	0 %	50 %	25 %	25 %	116255334
3089	NC_008384	CGGG	2	8	147176	147183	0 %	0 %	75 %	25 %	116255334
3090	NC_008384	CCG	2	6	147250	147255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255334
3091	NC_008384	ACC	2	6	147430	147435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255335
3092	NC_008384	CGG	2	6	147518	147523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255335
3093	NC_008384	AGC	2	6	147550	147555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255335
3094	NC_008384	TCAAGA	2	12	147572	147583	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116255335
3095	NC_008384	CGCC	2	8	147600	147607	0 %	0 %	25 %	75 %	116255335
3096	NC_008384	GTC	2	6	147646	147651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255335
3097	NC_008384	GGC	2	6	147712	147717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255335
3098	NC_008384	GGC	2	6	147721	147726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255335
3099	NC_008384	GCA	2	6	147808	147813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255335
3100	NC_008384	GTTG	2	8	147849	147856	0 %	50 %	50 %	0 %	116255335
3101	NC_008384	CGC	2	6	147861	147866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255335
3102	NC_008384	GCGG	2	8	147901	147908	0 %	0 %	75 %	25 %	116255335
3103	NC_008384	GAG	2	6	148039	148044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255335
3104	NC_008384	CGGG	2	8	148061	148068	0 %	0 %	75 %	25 %	116255335
3105	NC_008384	GTC	2	6	148081	148086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255335
3106	NC_008384	CGG	2	6	148098	148103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255335
3107	NC_008384	TGC	2	6	148116	148121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255335
3108	NC_008384	CGT	2	6	148149	148154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255335
3109	NC_008384	CG	3	6	148258	148263	0 %	0 %	50 %	50 %	116255335
3110	NC_008384	CTC	2	6	148319	148324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255335
3111	NC_008384	CGC	2	6	148336	148341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255335
3112	NC_008384	ACCGC	2	10	148385	148394	20 %	0 %	20 %	60 %	116255335
3113	NC_008384	CGC	2	6	148419	148424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255335
3114	NC_008384	AGG	2	6	148427	148432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255335
3115	NC_008384	CGTAAA	2	12	148470	148481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116255336
3116	NC_008384	TCG	2	6	148484	148489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255336
3117	NC_008384	GTC	2	6	148582	148587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255336
3118	NC_008384	TGGC	2	8	148617	148624	0 %	25 %	50 %	25 %	116255336
3119	NC_008384	CGG	2	6	148629	148634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255336
3120	NC_008384	TTG	2	6	148660	148665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255336
3121	NC_008384	TCCAAA	2	12	148675	148686	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	116255336
3122	NC_008384	TCG	2	6	148691	148696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255336
3123	NC_008384	GCCGCG	2	12	148735	148746	0 %	0 %	50 %	50 %	116255336
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3125	NC_008384	CTG	2	6	148882	148887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255337
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3230	NC_008384	CCG	2	6	155039	155044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255343
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3232	NC_008384	AGC	2	6	155123	155128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255343
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3234	NC_008384	TCGC	2	8	155182	155189	0 %	25 %	25 %	50 %	116255343
3235	NC_008384	CGCC	2	8	155260	155267	0 %	0 %	25 %	75 %	116255343
3236	NC_008384	CTCAT	2	10	155273	155282	20 %	40 %	0 %	40 %	116255343
3237	NC_008384	CAC	2	6	155329	155334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255344
3238	NC_008384	GCA	2	6	155359	155364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255344
3239	NC_008384	GCATC	2	10	155372	155381	20 %	20 %	20 %	40 %	116255344
3240	NC_008384	GCC	2	6	155454	155459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255344
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3242	NC_008384	GAT	2	6	155559	155564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255344
3243	NC_008384	GAA	2	6	156605	156610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255345
3244	NC_008384	CTG	2	6	156611	156616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255345
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3247	NC_008384	TGAA	2	8	156756	156763	50 %	25 %	25 %	0 %	116255345
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3251	NC_008384	CG	3	6	156880	156885	0 %	0 %	50 %	50 %	116255345
3252	NC_008384	GCTG	2	8	156994	157001	0 %	25 %	50 %	25 %	116255345
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3349	NC_008384	GACA	2	8	163086	163093	50 %	0 %	25 %	25 %	116255351
3350	NC_008384	GCG	2	6	163127	163132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255351
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3352	NC_008384	GTCGA	2	10	163339	163348	20 %	20 %	40 %	20 %	116255351
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3354	NC_008384	GAT	2	6	163464	163469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255351
3355	NC_008384	G	6	6	163475	163480	0 %	0 %	100 %	0 %	116255351
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3358	NC_008384	AGCA	2	8	163542	163549	50 %	0 %	25 %	25 %	116255351
3359	NC_008384	CCAG	2	8	163552	163559	25 %	0 %	25 %	50 %	116255351
3360	NC_008384	CAT	2	6	163703	163708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255352
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3363	NC_008384	GGGCG	2	10	164090	164099	0 %	0 %	80 %	20 %	116255352
3364	NC_008384	GGC	2	6	164154	164159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255352
3365	NC_008384	ACG	2	6	164269	164274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255352
3366	NC_008384	CTT	2	6	164321	164326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255352
3367	NC_008384	AACGAC	2	12	164346	164357	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116255352
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3485	NC_008384	TGGG	2	8	171409	171416	0 %	25 %	75 %	0 %	116255358
3486	NC_008384	ACT	2	6	171444	171449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255358
3487	NC_008384	GTC	2	6	171479	171484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255358
3488	NC_008384	TTC	2	6	171546	171551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255359
3489	NC_008384	GCC	2	6	171563	171568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255359
3490	NC_008384	CAA	2	6	171596	171601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255359
3491	NC_008384	CTG	2	6	171630	171635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255359
3492	NC_008384	GTCC	2	8	171690	171697	0 %	25 %	25 %	50 %	116255359
3493	NC_008384	A	6	6	171759	171764	100 %	0 %	0 %	0 %	116255359
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