MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008384	AAC	2	6	114147	114152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255297
2502	NC_008384	GGCCAT	2	12	114216	114227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255297
2503	NC_008384	GCG	2	6	114255	114260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255297
2504	NC_008384	GAG	2	6	114333	114338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255297
2505	NC_008384	GCA	2	6	114366	114371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255297
2506	NC_008384	GGC	2	6	114374	114379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255297
2507	NC_008384	AAC	2	6	114508	114513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255298
2508	NC_008384	CTGA	2	8	114535	114542	25 %	25 %	25 %	25 %	116255298
2509	NC_008384	ACG	2	6	114602	114607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2510	NC_008384	CCA	2	6	114701	114706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255298
2511	NC_008384	TCA	2	6	114714	114719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255298
2512	NC_008384	ACG	2	6	114787	114792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2513	NC_008384	ATT	2	6	114868	114873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255298
2514	NC_008384	CGA	2	6	114891	114896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2515	NC_008384	CGC	2	6	114988	114993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255298
2516	NC_008384	CCGAT	2	10	115010	115019	20 %	20 %	20 %	40 %	116255298
2517	NC_008384	CAT	2	6	115023	115028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255298
2518	NC_008384	GGC	2	6	115030	115035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255298
2519	NC_008384	TGA	2	6	115095	115100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255298
2520	NC_008384	GCT	2	6	115305	115310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2521	NC_008384	TGG	2	6	115362	115367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255298
2522	NC_008384	CAAC	2	8	115380	115387	50 %	0 %	0 %	50 %	116255298
2523	NC_008384	AGC	2	6	115425	115430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2524	NC_008384	GAC	2	6	115491	115496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255298
2525	NC_008384	CAA	2	6	115800	115805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255299
2526	NC_008384	CTT	2	6	115834	115839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255299
2527	NC_008384	ATC	2	6	115888	115893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255299
2528	NC_008384	AT	3	6	115914	115919	50 %	50 %	0 %	0 %	116255299
2529	NC_008384	GGT	2	6	115977	115982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255299
2530	NC_008384	GAC	3	9	116067	116075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255299
2531	NC_008384	CAT	2	6	116109	116114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255299
2532	NC_008384	ATCC	2	8	116203	116210	25 %	25 %	0 %	50 %	116255299
2533	NC_008384	GGA	2	6	116258	116263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255299
2534	NC_008384	AAC	2	6	116292	116297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255299
2535	NC_008384	AC	3	6	116296	116301	50 %	0 %	0 %	50 %	116255299
2536	NC_008384	TCA	2	6	116365	116370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255299
2537	NC_008384	ATT	2	6	116394	116399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255299
2538	NC_008384	GAT	2	6	116478	116483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255299
2539	NC_008384	TGC	2	6	116557	116562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255299
2540	NC_008384	CTGG	2	8	116630	116637	0 %	25 %	50 %	25 %	116255299
2541	NC_008384	GA	3	6	116662	116667	50 %	0 %	50 %	0 %	116255299
2542	NC_008384	CGGGAG	2	12	116670	116681	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116255299
2543	NC_008384	TCAA	2	8	116709	116716	50 %	25 %	0 %	25 %	116255299
2544	NC_008384	A	6	6	116865	116870	100 %	0 %	0 %	0 %	116255299
2545	NC_008384	GCA	2	6	116919	116924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255299
2546	NC_008384	GAT	2	6	117031	117036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255300
2547	NC_008384	GCG	3	9	117066	117074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255300
2548	NC_008384	GAA	2	6	117095	117100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255300
2549	NC_008384	TC	3	6	117156	117161	0 %	50 %	0 %	50 %	116255300
2550	NC_008384	TGT	2	6	117204	117209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255300
2551	NC_008384	CCG	2	6	117325	117330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255300
2552	NC_008384	GAA	2	6	117433	117438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255300
2553	NC_008384	ACCA	2	8	117452	117459	50 %	0 %	0 %	50 %	116255300
2554	NC_008384	CGG	2	6	117488	117493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255300
2555	NC_008384	CAT	2	6	117532	117537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255300
2556	NC_008384	GAA	2	6	117544	117549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255300
2557	NC_008384	CCA	2	6	117567	117572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255300
2558	NC_008384	CT	4	8	117619	117626	0 %	50 %	0 %	50 %	116255300
2559	NC_008384	TGG	2	6	117645	117650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255300
2560	NC_008384	CG	3	6	117667	117672	0 %	0 %	50 %	50 %	116255300
2561	NC_008384	GAA	2	6	117695	117700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255300
2562	NC_008384	CGGT	2	8	117716	117723	0 %	25 %	50 %	25 %	116255300
2563	NC_008384	GCT	2	6	117775	117780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2564	NC_008384	CA	4	8	117968	117975	50 %	0 %	0 %	50 %	116255300
2565	NC_008384	CTG	2	6	117992	117997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2566	NC_008384	CGG	2	6	118009	118014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255300
2567	NC_008384	ACCCT	2	10	118044	118053	20 %	20 %	0 %	60 %	116255300
2568	NC_008384	CTGA	2	8	118061	118068	25 %	25 %	25 %	25 %	116255300
2569	NC_008384	CGA	2	6	118156	118161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2570	NC_008384	GCT	2	6	118171	118176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2571	NC_008384	CGG	2	6	118189	118194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255300
2572	NC_008384	CAC	2	6	118204	118209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255300
2573	NC_008384	GAG	2	6	118238	118243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255300
2574	NC_008384	CCA	2	6	118366	118371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255300
2575	NC_008384	CCT	2	6	118395	118400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255300
2576	NC_008384	CGC	2	6	118582	118587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255300
2577	NC_008384	TGG	2	6	118665	118670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255300
2578	NC_008384	GCA	2	6	118697	118702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2579	NC_008384	TCG	2	6	118707	118712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2580	NC_008384	GCC	2	6	118770	118775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255300
2581	NC_008384	TCG	2	6	118803	118808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2582	NC_008384	CGATGA	2	12	118831	118842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116255300
2583	NC_008384	CAA	2	6	118912	118917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255300
2584	NC_008384	GCG	3	9	118918	118926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255300
2585	NC_008384	CGA	2	6	118927	118932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2586	NC_008384	AAGG	2	8	118948	118955	50 %	0 %	50 %	0 %	116255300
2587	NC_008384	TGCA	2	8	119018	119025	25 %	25 %	25 %	25 %	116255300
2588	NC_008384	ATGT	2	8	119030	119037	25 %	50 %	25 %	0 %	116255300
2589	NC_008384	GTC	2	6	119120	119125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2590	NC_008384	CCA	2	6	119142	119147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255300
2591	NC_008384	CTC	2	6	119225	119230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255300
2592	NC_008384	GCA	2	6	119353	119358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2593	NC_008384	AGG	2	6	119385	119390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255300
2594	NC_008384	TGA	2	6	119467	119472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255300
2595	NC_008384	CGC	2	6	119473	119478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255300
2596	NC_008384	TTC	2	6	119501	119506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255300
2597	NC_008384	AGC	2	6	119583	119588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2598	NC_008384	TCG	2	6	119619	119624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2599	NC_008384	AGA	2	6	119697	119702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255300
2600	NC_008384	A	6	6	119735	119740	100 %	0 %	0 %	0 %	116255300
2601	NC_008384	CTG	2	6	119741	119746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2602	NC_008384	GGA	2	6	119812	119817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255300
2603	NC_008384	ATGCCA	2	12	119835	119846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255300
2604	NC_008384	GAT	2	6	119860	119865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255300
2605	NC_008384	GCC	2	6	119900	119905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255300
2606	NC_008384	GGA	2	6	119938	119943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255300
2607	NC_008384	GCA	2	6	120067	120072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2608	NC_008384	CCG	2	6	120137	120142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255300
2609	NC_008384	AGG	2	6	120153	120158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255300
2610	NC_008384	GCT	2	6	120187	120192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255300
2611	NC_008384	CAA	2	6	120214	120219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255300
2612	NC_008384	CCT	2	6	120246	120251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255301
2613	NC_008384	GGT	2	6	120274	120279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255301
2614	NC_008384	CG	3	6	120311	120316	0 %	0 %	50 %	50 %	116255301
2615	NC_008384	TGA	2	6	120346	120351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255301
2616	NC_008384	CGC	2	6	120373	120378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255301
2617	NC_008384	CAG	2	6	120389	120394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255301
2618	NC_008384	GTC	3	9	120401	120409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255301
2619	NC_008384	GGC	2	6	120512	120517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255301
2620	NC_008384	CCG	2	6	120534	120539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255301
2621	NC_008384	CCT	2	6	120712	120717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255301
2622	NC_008384	TTG	2	6	120840	120845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255301
2623	NC_008384	CGT	2	6	120853	120858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255301
2624	NC_008384	ATA	2	6	120878	120883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255301
2625	NC_008384	CCTT	2	8	120891	120898	0 %	50 %	0 %	50 %	116255301
2626	NC_008384	GAC	2	6	120905	120910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255301
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2629	NC_008384	GCC	2	6	121016	121021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255301
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2647	NC_008384	CAGGG	2	10	122739	122748	20 %	0 %	60 %	20 %	116255304
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2650	NC_008384	CCA	2	6	122867	122872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255304
2651	NC_008384	TGC	2	6	122879	122884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255304
2652	NC_008384	CAT	2	6	122958	122963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255304
2653	NC_008384	TCA	2	6	122999	123004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255304
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2655	NC_008384	GCGG	2	8	123096	123103	0 %	0 %	75 %	25 %	116255304
2656	NC_008384	CGA	2	6	123114	123119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255304
2657	NC_008384	ATC	2	6	123136	123141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255304
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2661	NC_008384	TCG	2	6	123416	123421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255304
2662	NC_008384	AGGTG	2	10	123451	123460	20 %	20 %	60 %	0 %	116255304
2663	NC_008384	GGC	2	6	124246	124251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255305
2664	NC_008384	CCGG	2	8	124270	124277	0 %	0 %	50 %	50 %	116255305
2665	NC_008384	CGT	2	6	124384	124389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255305
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2722	NC_008384	ACG	2	6	127533	127538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255311
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2726	NC_008384	GAAC	2	8	127725	127732	50 %	0 %	25 %	25 %	116255311
2727	NC_008384	TGCGGC	2	12	127776	127787	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255311
2728	NC_008384	CGT	2	6	127826	127831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255311
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2730	NC_008384	CAT	2	6	127887	127892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255311
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2732	NC_008384	GCG	2	6	127909	127914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255311
2733	NC_008384	CGC	2	6	127983	127988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255311
2734	NC_008384	GGT	2	6	128055	128060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255311
2735	NC_008384	CAAG	2	8	128088	128095	50 %	0 %	25 %	25 %	116255311
2736	NC_008384	GTC	2	6	128232	128237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255311
2737	NC_008384	CGC	2	6	128244	128249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255311
2738	NC_008384	ACGG	2	8	128302	128309	25 %	0 %	50 %	25 %	116255311
2739	NC_008384	CGG	2	6	128327	128332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255311
2740	NC_008384	TAT	2	6	128362	128367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255311
2741	NC_008384	AGC	2	6	128414	128419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255311
2742	NC_008384	CGA	2	6	128420	128425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255311
2743	NC_008384	TGA	2	6	128502	128507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255311
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2755	NC_008384	CGG	3	9	129216	129224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255312
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2852	NC_008384	CCCGT	2	10	135252	135261	0 %	20 %	20 %	60 %	116255320
2853	NC_008384	CGC	2	6	135315	135320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255320
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2857	NC_008384	CAG	2	6	135486	135491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255320
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2861	NC_008384	TCT	2	6	135838	135843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255321
2862	NC_008384	TCG	2	6	135844	135849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255321
2863	NC_008384	TCC	2	6	135897	135902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255321
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2981	NC_008384	GCC	2	6	140972	140977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255329
2982	NC_008384	ATCA	2	8	141040	141047	50 %	25 %	0 %	25 %	116255329
2983	NC_008384	TGC	2	6	141063	141068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255329
2984	NC_008384	GC	3	6	141075	141080	0 %	0 %	50 %	50 %	116255329
2985	NC_008384	CGG	2	6	141087	141092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255329
2986	NC_008384	CCAA	2	8	141213	141220	50 %	0 %	0 %	50 %	116255329
2987	NC_008384	AG	3	6	141222	141227	50 %	0 %	50 %	0 %	116255329
2988	NC_008384	GCG	2	6	141388	141393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255330
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