MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_008384	GCC	2	6	679968	679973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255830
14002	NC_008384	TAT	2	6	679991	679996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255830
14003	NC_008384	GCC	2	6	680067	680072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255830
14004	NC_008384	CG	3	6	680117	680122	0 %	0 %	50 %	50 %	116255830
14005	NC_008384	CGGC	2	8	680128	680135	0 %	0 %	50 %	50 %	116255830
14006	NC_008384	CGC	2	6	680188	680193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255830
14007	NC_008384	GAC	2	6	680198	680203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255830
14008	NC_008384	CTG	2	6	680221	680226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255830
14009	NC_008384	CCCTG	2	10	680243	680252	0 %	20 %	20 %	60 %	116255830
14010	NC_008384	CTC	2	6	680258	680263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255830
14011	NC_008384	GAA	2	6	680333	680338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255830
14012	NC_008384	CGC	2	6	680512	680517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255831
14013	NC_008384	GCCG	3	12	680559	680570	0 %	0 %	50 %	50 %	116255831
14014	NC_008384	CGG	2	6	680582	680587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255831
14015	NC_008384	ATG	2	6	680615	680620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255831
14016	NC_008384	CGG	2	6	680622	680627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255831
14017	NC_008384	CGT	2	6	680694	680699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14018	NC_008384	CAG	2	6	680732	680737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14019	NC_008384	AGA	2	6	680820	680825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255831
14020	NC_008384	GTC	2	6	680954	680959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14021	NC_008384	ATA	2	6	680965	680970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255831
14022	NC_008384	CAG	2	6	680998	681003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14023	NC_008384	CGA	2	6	681009	681014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14024	NC_008384	TTGCCG	2	12	681020	681031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14025	NC_008384	CCCTG	2	10	681033	681042	0 %	20 %	20 %	60 %	116255831
14026	NC_008384	GC	3	6	681080	681085	0 %	0 %	50 %	50 %	116255831
14027	NC_008384	GAG	2	6	681100	681105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255831
14028	NC_008384	GTC	2	6	681152	681157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255831
14029	NC_008384	GGCCT	2	10	681161	681170	0 %	20 %	40 %	40 %	116255832
14030	NC_008384	GGC	2	6	681186	681191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255832
14031	NC_008384	GCC	2	6	681207	681212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
14032	NC_008384	GCCG	2	8	681215	681222	0 %	0 %	50 %	50 %	116255832
14033	NC_008384	CCG	2	6	681278	681283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
14034	NC_008384	CGA	2	6	681287	681292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255832
14035	NC_008384	CGC	2	6	681315	681320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
14036	NC_008384	CGGT	2	8	681368	681375	0 %	25 %	50 %	25 %	116255832
14037	NC_008384	GCC	2	6	681399	681404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
14038	NC_008384	GGC	3	9	681429	681437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255832
14039	NC_008384	CG	3	6	681458	681463	0 %	0 %	50 %	50 %	116255832
14040	NC_008384	AGA	2	6	681563	681568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255832
14041	NC_008384	CG	3	6	681593	681598	0 %	0 %	50 %	50 %	116255832
14042	NC_008384	CGG	2	6	681614	681619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255832
14043	NC_008384	GCC	2	6	681637	681642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255832
14044	NC_008384	ATCGC	2	10	681751	681760	20 %	20 %	20 %	40 %	116255832
14045	NC_008384	ATTCCT	2	12	681787	681798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116255832
14046	NC_008384	AGGC	2	8	681840	681847	25 %	0 %	50 %	25 %	116255833
14047	NC_008384	TTG	2	6	681870	681875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255833
14048	NC_008384	CT	3	6	681897	681902	0 %	50 %	0 %	50 %	116255833
14049	NC_008384	GCA	2	6	681951	681956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255833
14050	NC_008384	CCG	2	6	681985	681990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255833
14051	NC_008384	GGTCAG	2	12	681995	682006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255833
14052	NC_008384	GCCG	2	8	682008	682015	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
14053	NC_008384	CG	3	6	682014	682019	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
14054	NC_008384	GC	3	6	682100	682105	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
14055	NC_008384	AGCCGC	2	12	682132	682143	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	116255833
14056	NC_008384	CGGCGC	2	12	682144	682155	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
14057	NC_008384	GGC	2	6	682157	682162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
14058	NC_008384	GCG	2	6	682191	682196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
14059	NC_008384	GCG	2	6	682212	682217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
14060	NC_008384	CTG	2	6	682240	682245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255833
14061	NC_008384	GAA	2	6	682259	682264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255833
14062	NC_008384	CGC	2	6	682424	682429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255833
14063	NC_008384	CCAT	2	8	682452	682459	25 %	25 %	0 %	50 %	116255833
14064	NC_008384	CTGCC	2	10	682509	682518	0 %	20 %	20 %	60 %	116255833
14065	NC_008384	CGA	2	6	682648	682653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255833
14066	NC_008384	CGG	2	6	682663	682668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
14067	NC_008384	GAT	2	6	682703	682708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255833
14068	NC_008384	TGC	2	6	682759	682764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255833
14069	NC_008384	GCG	2	6	682822	682827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
14070	NC_008384	CGG	2	6	682864	682869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255833
14071	NC_008384	CCGG	2	8	683019	683026	0 %	0 %	50 %	50 %	116255833
14072	NC_008384	GCGCC	2	10	683085	683094	0 %	0 %	40 %	60 %	116255833
14073	NC_008384	CCG	2	6	683107	683112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255833
14074	NC_008384	CGCCT	2	10	683129	683138	0 %	20 %	20 %	60 %	116255833
14075	NC_008384	TCGC	2	8	683145	683152	0 %	25 %	25 %	50 %	116255833
14076	NC_008384	GCCGT	2	10	683296	683305	0 %	20 %	40 %	40 %	116255834
14077	NC_008384	AGA	2	6	683403	683408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255834
14078	NC_008384	TCG	2	6	683423	683428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255834
14079	NC_008384	CGA	2	6	683532	683537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255834
14080	NC_008384	TGGC	2	8	683555	683562	0 %	25 %	50 %	25 %	116255834
14081	NC_008384	GAT	2	6	683641	683646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255834
14082	NC_008384	CTC	2	6	683704	683709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255834
14083	NC_008384	GCCG	3	12	683830	683841	0 %	0 %	50 %	50 %	116255834
14084	NC_008384	CCG	2	6	683866	683871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255834
14085	NC_008384	TGCCGA	2	12	683979	683990	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255834
14086	NC_008384	TGATAT	2	12	683991	684002	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116255834

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.