MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008384	TGC	2	6	544078	544083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255704
11002	NC_008384	CG	3	6	544085	544090	0 %	0 %	50 %	50 %	116255704
11003	NC_008384	CACGA	2	10	544100	544109	40 %	0 %	20 %	40 %	116255704
11004	NC_008384	GGCG	2	8	544122	544129	0 %	0 %	75 %	25 %	116255704
11005	NC_008384	CGT	2	6	544207	544212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255704
11006	NC_008384	GCAT	2	8	544233	544240	25 %	25 %	25 %	25 %	116255704
11007	NC_008384	GCC	2	6	544265	544270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255704
11008	NC_008384	GGCC	2	8	544273	544280	0 %	0 %	50 %	50 %	116255704
11009	NC_008384	CG	3	6	544382	544387	0 %	0 %	50 %	50 %	116255704
11010	NC_008384	CGC	2	6	544418	544423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255704
11011	NC_008384	CGT	2	6	544441	544446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255704
11012	NC_008384	CTGC	2	8	544516	544523	0 %	25 %	25 %	50 %	116255704
11013	NC_008384	CGGC	2	8	544542	544549	0 %	0 %	50 %	50 %	116255704
11014	NC_008384	GCC	2	6	544660	544665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255705
11015	NC_008384	TTCC	2	8	544805	544812	0 %	50 %	0 %	50 %	116255705
11016	NC_008384	GCG	2	6	544827	544832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255705
11017	NC_008384	CGT	2	6	544838	544843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11018	NC_008384	CGA	2	6	544894	544899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11019	NC_008384	TCG	2	6	544924	544929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11020	NC_008384	GCC	2	6	544959	544964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255705
11021	NC_008384	TCA	2	6	544972	544977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255705
11022	NC_008384	TGC	2	6	544984	544989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11023	NC_008384	GCT	2	6	545018	545023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11024	NC_008384	GC	4	8	545034	545041	0 %	0 %	50 %	50 %	116255705
11025	NC_008384	GC	3	6	545093	545098	0 %	0 %	50 %	50 %	116255705
11026	NC_008384	CTG	3	9	545142	545150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11027	NC_008384	TGC	2	6	545167	545172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11028	NC_008384	GCC	2	6	545187	545192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255705
11029	NC_008384	TCTGC	2	10	545201	545210	0 %	40 %	20 %	40 %	116255705
11030	NC_008384	ATC	2	6	545217	545222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255705
11031	NC_008384	GGCG	2	8	545239	545246	0 %	0 %	75 %	25 %	116255705
11032	NC_008384	GCA	2	6	545259	545264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11033	NC_008384	TCA	2	6	545267	545272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255705
11034	NC_008384	GC	3	6	545287	545292	0 %	0 %	50 %	50 %	116255705
11035	NC_008384	GGT	2	6	545300	545305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255705
11036	NC_008384	CGC	2	6	545308	545313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255705
11037	NC_008384	TCG	2	6	545443	545448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11038	NC_008384	GTC	2	6	545460	545465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255705
11039	NC_008384	TCA	3	9	545467	545475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255705
11040	NC_008384	GCC	2	6	545520	545525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255705
11041	NC_008384	CAT	2	6	545531	545536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255705
11042	NC_008384	ATC	2	6	545628	545633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255705
11043	NC_008384	CCGG	2	8	545672	545679	0 %	0 %	50 %	50 %	116255705
11044	NC_008384	GC	3	6	545689	545694	0 %	0 %	50 %	50 %	116255705
11045	NC_008384	GC	3	6	545731	545736	0 %	0 %	50 %	50 %	116255705
11046	NC_008384	GCC	2	6	545745	545750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255705
11047	NC_008384	CTC	2	6	545820	545825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255705
11048	NC_008384	AGTA	2	8	545855	545862	50 %	25 %	25 %	0 %	116255705
11049	NC_008384	GTG	2	6	545994	545999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255706
11050	NC_008384	CG	3	6	546031	546036	0 %	0 %	50 %	50 %	116255706
11051	NC_008384	TCG	2	6	546085	546090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255706
11052	NC_008384	CGTCC	2	10	546116	546125	0 %	20 %	20 %	60 %	116255706
11053	NC_008384	GC	3	6	546141	546146	0 %	0 %	50 %	50 %	116255706
11054	NC_008384	ATC	2	6	546156	546161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255706
11055	NC_008384	CG	3	6	546178	546183	0 %	0 %	50 %	50 %	116255706
11056	NC_008384	GCC	2	6	546211	546216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255706
11057	NC_008384	GC	3	6	546218	546223	0 %	0 %	50 %	50 %	116255706
11058	NC_008384	GC	4	8	546259	546266	0 %	0 %	50 %	50 %	116255706
11059	NC_008384	CAG	2	6	546339	546344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255706
11060	NC_008384	GCT	2	6	546368	546373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255706
11061	NC_008384	GGC	2	6	546411	546416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255706
11062	NC_008384	TC	3	6	546423	546428	0 %	50 %	0 %	50 %	116255706
11063	NC_008384	GCA	2	6	546525	546530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255706
11064	NC_008384	CGG	3	9	546596	546604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255706
11065	NC_008384	CAA	2	6	546656	546661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255706
11066	NC_008384	ATC	2	6	546681	546686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255706
11067	NC_008384	GCCG	2	8	546749	546756	0 %	0 %	50 %	50 %	116255706
11068	NC_008384	GAG	2	6	546789	546794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255706
11069	NC_008384	CGA	2	6	546803	546808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255706
11070	NC_008384	GGC	2	6	546831	546836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255706
11071	NC_008384	CTGG	2	8	546851	546858	0 %	25 %	50 %	25 %	116255706
11072	NC_008384	CGG	2	6	546932	546937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255706
11073	NC_008384	TGA	2	6	547033	547038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255706
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11080	NC_008384	CCGAT	2	10	547384	547393	20 %	20 %	20 %	40 %	116255707
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11084	NC_008384	CGA	2	6	547633	547638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255707
11085	NC_008384	GAA	2	6	547721	547726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255707
11086	NC_008384	GC	3	6	547730	547735	0 %	0 %	50 %	50 %	116255707
11087	NC_008384	GCGA	2	8	547758	547765	25 %	0 %	50 %	25 %	116255707
11088	NC_008384	CGGA	2	8	547786	547793	25 %	0 %	50 %	25 %	116255707
11089	NC_008384	GGC	3	9	547799	547807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255707
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11091	NC_008384	GACC	2	8	547978	547985	25 %	0 %	25 %	50 %	116255707
11092	NC_008384	GTC	2	6	548007	548012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255707
11093	NC_008384	AG	3	6	548038	548043	50 %	0 %	50 %	0 %	116255707
11094	NC_008384	GGC	2	6	548400	548405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255708
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11098	NC_008384	CAT	2	6	548465	548470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255708
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11101	NC_008384	CGG	2	6	548668	548673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255708
11102	NC_008384	CTG	2	6	548682	548687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255708
11103	NC_008384	GAA	2	6	548691	548696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255708
11104	NC_008384	TTC	2	6	548721	548726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255708
11105	NC_008384	GGA	2	6	548742	548747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255708
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11107	NC_008384	GCTC	2	8	548774	548781	0 %	25 %	25 %	50 %	116255708
11108	NC_008384	GCG	2	6	548789	548794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255708
11109	NC_008384	GGC	2	6	548852	548857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255708
11110	NC_008384	GT	3	6	548911	548916	0 %	50 %	50 %	0 %	116255708
11111	NC_008384	GC	3	6	548951	548956	0 %	0 %	50 %	50 %	116255708
11112	NC_008384	CAG	2	6	549014	549019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255708
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11115	NC_008384	CGAT	2	8	549284	549291	25 %	25 %	25 %	25 %	116255709
11116	NC_008384	GCCT	2	8	549307	549314	0 %	25 %	25 %	50 %	116255709
11117	NC_008384	GC	3	6	549342	549347	0 %	0 %	50 %	50 %	116255709
11118	NC_008384	AGGA	2	8	549365	549372	50 %	0 %	50 %	0 %	116255709
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11120	NC_008384	AAG	2	6	549419	549424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255709
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11222	NC_008384	CCAG	2	8	554141	554148	25 %	0 %	25 %	50 %	116255713
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11226	NC_008384	TTCG	2	8	554206	554213	0 %	50 %	25 %	25 %	116255713
11227	NC_008384	GACT	2	8	554217	554224	25 %	25 %	25 %	25 %	116255713
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11229	NC_008384	CG	3	6	554384	554389	0 %	0 %	50 %	50 %	116255714
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11238	NC_008384	TCGCC	2	10	554952	554961	0 %	20 %	20 %	60 %	116255714
11239	NC_008384	GCGG	2	8	554962	554969	0 %	0 %	75 %	25 %	116255714
11240	NC_008384	GCC	2	6	554998	555003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255714
11241	NC_008384	GC	3	6	555019	555024	0 %	0 %	50 %	50 %	116255714
11242	NC_008384	ATG	2	6	555026	555031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255714
11243	NC_008384	GTC	2	6	555041	555046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255714
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11245	NC_008384	ACA	2	6	555176	555181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255714
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11247	NC_008384	CGA	2	6	555314	555319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255715
11248	NC_008384	TGA	2	6	555383	555388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255715
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11250	NC_008384	CGT	2	6	555468	555473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255715
11251	NC_008384	ATG	3	9	555484	555492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255715
11252	NC_008384	CGATG	2	10	555572	555581	20 %	20 %	40 %	20 %	116255715
11253	NC_008384	CGA	2	6	555593	555598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255715
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11269	NC_008384	CGT	2	6	556334	556339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255716
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11352	NC_008384	TCAG	2	8	560327	560334	25 %	25 %	25 %	25 %	116255719
11353	NC_008384	TGA	2	6	560348	560353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255719
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11355	NC_008384	CGT	2	6	560418	560423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255719
11356	NC_008384	TCC	2	6	560425	560430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255719
11357	NC_008384	TTCG	2	8	560431	560438	0 %	50 %	25 %	25 %	116255719
11358	NC_008384	CCG	2	6	560495	560500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255719
11359	NC_008384	CGG	2	6	560523	560528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255719
11360	NC_008384	TCGA	2	8	560530	560537	25 %	25 %	25 %	25 %	116255719
11361	NC_008384	CTCG	2	8	560589	560596	0 %	25 %	25 %	50 %	116255719
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11365	NC_008384	TCGA	2	8	560746	560753	25 %	25 %	25 %	25 %	116255719
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11384	NC_008384	CTG	2	6	561774	561779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255720
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11453	NC_008384	GATGT	2	10	566331	566340	20 %	40 %	40 %	0 %	116255725
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11455	NC_008384	TCA	3	9	566398	566406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255725
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11458	NC_008384	CAT	2	6	566462	566467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255725
11459	NC_008384	TCAA	2	8	566551	566558	50 %	25 %	0 %	25 %	116255725
11460	NC_008384	TTG	2	6	566831	566836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255726
11461	NC_008384	CAA	2	6	566853	566858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255726
11462	NC_008384	TCC	2	6	566900	566905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255726
11463	NC_008384	CA	3	6	566949	566954	50 %	0 %	0 %	50 %	116255726
11464	NC_008384	CGT	3	9	567405	567413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255727
11465	NC_008384	GCA	2	6	567432	567437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255727
11466	NC_008384	GC	3	6	567466	567471	0 %	0 %	50 %	50 %	116255727
11467	NC_008384	GTT	2	6	567487	567492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255727
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11469	NC_008384	GGCA	2	8	567553	567560	25 %	0 %	50 %	25 %	116255727
11470	NC_008384	AAT	2	6	567592	567597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255727
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11472	NC_008384	CTT	2	6	567630	567635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255727
11473	NC_008384	GAA	2	6	567646	567651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255727
11474	NC_008384	TCT	2	6	567734	567739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255727
11475	NC_008384	CCG	2	6	568001	568006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255727
11476	NC_008384	GAA	2	6	568051	568056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255727
11477	NC_008384	CGC	2	6	568445	568450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255728
11478	NC_008384	CGA	2	6	568540	568545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255728
11479	NC_008384	CGC	2	6	568581	568586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255728
11480	NC_008384	CGG	2	6	568591	568596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255728
11481	NC_008384	GTCG	2	8	568598	568605	0 %	25 %	50 %	25 %	116255728
11482	NC_008384	CGG	2	6	568621	568626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255728
11483	NC_008384	CGA	2	6	568689	568694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255728
11484	NC_008384	CCTC	2	8	568782	568789	0 %	25 %	0 %	75 %	116255728
11485	NC_008384	TGA	2	6	568866	568871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255728
11486	NC_008384	ATC	2	6	568902	568907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255728
11487	NC_008384	TGA	2	6	568941	568946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255728
11488	NC_008384	GCGA	2	8	569051	569058	25 %	0 %	50 %	25 %	116255728
11489	NC_008384	CGA	2	6	569065	569070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255728
11490	NC_008384	CGG	2	6	569111	569116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255728
11491	NC_008384	CTT	2	6	569188	569193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255728
11492	NC_008384	CGC	2	6	569203	569208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255728
11493	NC_008384	ATC	2	6	569211	569216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255728
11494	NC_008384	GACA	2	8	569266	569273	50 %	0 %	25 %	25 %	116255728
11495	NC_008384	CCG	2	6	569280	569285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255728
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11497	NC_008384	CTG	2	6	569315	569320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255728
11498	NC_008384	TGC	2	6	569326	569331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255728
11499	NC_008384	CGGAG	2	10	569382	569391	20 %	0 %	60 %	20 %	116255728
11500	NC_008384	CTT	2	6	569417	569422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255728

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