MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_008384	CGATG	2	10	498418	498427	20 %	20 %	40 %	20 %	116255662
10002	NC_008384	TCG	2	6	498564	498569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255662
10003	NC_008384	ATT	3	9	498715	498723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255663
10004	NC_008384	CGG	2	6	498731	498736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255663
10005	NC_008384	GCC	2	6	498740	498745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255663
10006	NC_008384	GCT	2	6	498755	498760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255663
10007	NC_008384	CAC	2	6	498779	498784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255663
10008	NC_008384	CG	3	6	498802	498807	0 %	0 %	50 %	50 %	116255663
10009	NC_008384	TGAC	2	8	498814	498821	25 %	25 %	25 %	25 %	116255663
10010	NC_008384	TTC	2	6	498835	498840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255663
10011	NC_008384	TC	3	6	498869	498874	0 %	50 %	0 %	50 %	116255663
10012	NC_008384	CGG	3	9	498932	498940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255663
10013	NC_008384	CCGG	2	8	498947	498954	0 %	0 %	50 %	50 %	116255663
10014	NC_008384	TCG	2	6	498985	498990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255663
10015	NC_008384	TGCGC	2	10	499031	499040	0 %	20 %	40 %	40 %	116255663
10016	NC_008384	CGG	2	6	499063	499068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255663
10017	NC_008384	CGG	2	6	499091	499096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255663
10018	NC_008384	AGG	2	6	499138	499143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255663
10019	NC_008384	GCC	2	6	499157	499162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255663
10020	NC_008384	GAC	2	6	499232	499237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255663
10021	NC_008384	AAGGC	2	10	499360	499369	40 %	0 %	40 %	20 %	116255663
10022	NC_008384	GTCGAG	2	12	499395	499406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255663
10023	NC_008384	CGG	2	6	499457	499462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255663
10024	NC_008384	CCGG	2	8	499465	499472	0 %	0 %	50 %	50 %	116255663
10025	NC_008384	CAG	2	6	499585	499590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255664
10026	NC_008384	CGA	2	6	499656	499661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255664
10027	NC_008384	GCG	2	6	499745	499750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255664
10028	NC_008384	GGC	2	6	499823	499828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255664
10029	NC_008384	GC	3	6	499858	499863	0 %	0 %	50 %	50 %	116255664
10030	NC_008384	TC	3	6	499879	499884	0 %	50 %	0 %	50 %	116255664
10031	NC_008384	TGA	2	6	499961	499966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255664
10032	NC_008384	GAC	2	6	499967	499972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255664
10033	NC_008384	ATC	2	6	500000	500005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255664
10034	NC_008384	TGA	2	6	500084	500089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255665
10035	NC_008384	A	7	7	500101	500107	100 %	0 %	0 %	0 %	116255665
10036	NC_008384	AAG	2	6	500204	500209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255665
10037	NC_008384	GGA	2	6	500397	500402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255665
10038	NC_008384	ATG	2	6	500416	500421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255665
10039	NC_008384	CG	3	6	500433	500438	0 %	0 %	50 %	50 %	116255665
10040	NC_008384	AAG	2	6	500440	500445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255665
10041	NC_008384	AGA	2	6	500450	500455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255665
10042	NC_008384	GGC	2	6	500480	500485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255666
10043	NC_008384	TGCT	2	8	500657	500664	0 %	50 %	25 %	25 %	116255666
10044	NC_008384	CGA	2	6	500689	500694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255666
10045	NC_008384	CGG	2	6	500728	500733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255666
10046	NC_008384	GTC	2	6	500744	500749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255666
10047	NC_008384	TGC	2	6	501386	501391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255667
10048	NC_008384	T	6	6	501400	501405	0 %	100 %	0 %	0 %	116255667
10049	NC_008384	CGG	3	9	501413	501421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255667
10050	NC_008384	GGC	2	6	501523	501528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255667
10051	NC_008384	CTC	2	6	501597	501602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255667
10052	NC_008384	CGG	2	6	501677	501682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255667
10053	NC_008384	TGG	2	6	501764	501769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255667
10054	NC_008384	TGT	2	6	501770	501775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255667
10055	NC_008384	TCG	2	6	501892	501897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255667
10056	NC_008384	TCT	2	6	501901	501906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255667
10057	NC_008384	TCG	2	6	502006	502011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255667
10058	NC_008384	GGC	2	6	502025	502030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255667
10059	NC_008384	GTG	2	6	502263	502268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255668
10060	NC_008384	CAG	2	6	502330	502335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255668
10061	NC_008384	T	6	6	502340	502345	0 %	100 %	0 %	0 %	116255668
10062	NC_008384	GCC	2	6	502443	502448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255668
10063	NC_008384	TTG	2	6	502457	502462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255668
10064	NC_008384	CTC	2	6	502478	502483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255668
10065	NC_008384	TC	3	6	502489	502494	0 %	50 %	0 %	50 %	116255668
10066	NC_008384	CGGAT	2	10	502499	502508	20 %	20 %	40 %	20 %	116255668
10067	NC_008384	AAT	2	6	502645	502650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255668
10068	NC_008384	CGG	2	6	502705	502710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255668
10069	NC_008384	CAAG	2	8	502735	502742	50 %	0 %	25 %	25 %	116255668
10070	NC_008384	TGA	2	6	502750	502755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255668
10071	NC_008384	CGC	2	6	502903	502908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255668
10072	NC_008384	CATG	2	8	502921	502928	25 %	25 %	25 %	25 %	116255668
10073	NC_008384	CTTT	2	8	502943	502950	0 %	75 %	0 %	25 %	116255668
10074	NC_008384	TTCG	2	8	502997	503004	0 %	50 %	25 %	25 %	116255668
10075	NC_008384	GCA	2	6	503144	503149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255668
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10078	NC_008384	TGC	2	6	503337	503342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255669
10079	NC_008384	GCG	2	6	503355	503360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255669
10080	NC_008384	GGTGC	2	10	503447	503456	0 %	20 %	60 %	20 %	116255669
10081	NC_008384	CCG	2	6	503535	503540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255669
10082	NC_008384	TGA	2	6	503572	503577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255669
10083	NC_008384	CG	3	6	503990	503995	0 %	0 %	50 %	50 %	116255670
10084	NC_008384	CTGGT	2	10	504009	504018	0 %	40 %	40 %	20 %	116255670
10085	NC_008384	GGC	2	6	504033	504038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255670
10086	NC_008384	GCG	2	6	504135	504140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255671
10087	NC_008384	GAC	2	6	504152	504157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255671
10088	NC_008384	TCC	2	6	504176	504181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255671
10089	NC_008384	CG	3	6	504192	504197	0 %	0 %	50 %	50 %	116255671
10090	NC_008384	ATG	2	6	504199	504204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255671
10091	NC_008384	CGG	2	6	504210	504215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255671
10092	NC_008384	TCT	2	6	504218	504223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255671
10093	NC_008384	CCTG	2	8	504242	504249	0 %	25 %	25 %	50 %	116255671
10094	NC_008384	TCA	2	6	504322	504327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255671
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10099	NC_008384	TCG	2	6	504772	504777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255671
10100	NC_008384	GGAT	2	8	504818	504825	25 %	25 %	50 %	0 %	116255671
10101	NC_008384	TCGG	2	8	504859	504866	0 %	25 %	50 %	25 %	116255671
10102	NC_008384	CGA	2	6	504902	504907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255671
10103	NC_008384	CAC	2	6	504924	504929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255671
10104	NC_008384	ATCA	2	8	505058	505065	50 %	25 %	0 %	25 %	116255672
10105	NC_008384	GCA	2	6	505088	505093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255672
10106	NC_008384	CCG	2	6	505111	505116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255672
10107	NC_008384	CGGT	2	8	505133	505140	0 %	25 %	50 %	25 %	116255672
10108	NC_008384	GGC	2	6	505335	505340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255672
10109	NC_008384	CG	3	6	505492	505497	0 %	0 %	50 %	50 %	116255672
10110	NC_008384	GAGC	2	8	505609	505616	25 %	0 %	50 %	25 %	116255672
10111	NC_008384	AGC	2	6	505623	505628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255672
10112	NC_008384	CG	3	6	505630	505635	0 %	0 %	50 %	50 %	116255672
10113	NC_008384	CCT	2	6	505636	505641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255672
10114	NC_008384	ACC	2	6	505681	505686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255672
10115	NC_008384	GCC	2	6	505710	505715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255672
10116	NC_008384	TCA	2	6	505762	505767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255672
10117	NC_008384	TCG	3	9	505848	505856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255672
10118	NC_008384	GCTG	2	8	505865	505872	0 %	25 %	50 %	25 %	116255672
10119	NC_008384	TGACGC	2	12	505891	505902	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255672
10120	NC_008384	GCGCAG	2	12	505951	505962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255672
10121	NC_008384	GCA	2	6	505978	505983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255672
10122	NC_008384	ACG	2	6	506049	506054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255672
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10124	NC_008384	GCGG	2	8	506089	506096	0 %	0 %	75 %	25 %	116255672
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10128	NC_008384	AGC	2	6	506274	506279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255672
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10130	NC_008384	TCC	2	6	506358	506363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255672
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10132	NC_008384	CG	3	6	506458	506463	0 %	0 %	50 %	50 %	116255672
10133	NC_008384	GCC	2	6	506486	506491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255672
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10139	NC_008384	CG	3	6	506773	506778	0 %	0 %	50 %	50 %	116255672
10140	NC_008384	GTC	2	6	506905	506910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255673
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10154	NC_008384	CCG	2	6	507897	507902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255674
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10223	NC_008384	CGA	2	6	511196	511201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255677
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10228	NC_008384	CCGA	2	8	511357	511364	25 %	0 %	25 %	50 %	116255677
10229	NC_008384	ATC	2	6	511375	511380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255677
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10232	NC_008384	ACG	2	6	511567	511572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255677
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10234	NC_008384	CGT	2	6	511610	511615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255677
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10354	NC_008384	ACC	2	6	516463	516468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255682
10355	NC_008384	GCT	2	6	516498	516503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255682
10356	NC_008384	GAT	2	6	516504	516509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255682
10357	NC_008384	GC	3	6	516592	516597	0 %	0 %	50 %	50 %	116255682
10358	NC_008384	GGC	2	6	516635	516640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255682
10359	NC_008384	TCC	2	6	516685	516690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255682
10360	NC_008384	GAT	2	6	516704	516709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255682
10361	NC_008384	ACG	2	6	516718	516723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255682
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10364	NC_008384	GTC	3	9	516838	516846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255682
10365	NC_008384	GAA	2	6	516849	516854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255682
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10369	NC_008384	TCC	2	6	516982	516987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255682
10370	NC_008384	AAG	2	6	517041	517046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255682
10371	NC_008384	GCT	2	6	517118	517123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255682
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10373	NC_008384	GACT	2	8	517144	517151	25 %	25 %	25 %	25 %	116255682
10374	NC_008384	TCG	2	6	517178	517183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255682
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10382	NC_008384	AAC	2	6	517523	517528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255683
10383	NC_008384	CCGA	2	8	517595	517602	25 %	0 %	25 %	50 %	116255683
10384	NC_008384	GGC	2	6	517608	517613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255683
10385	NC_008384	GAT	2	6	517626	517631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255683
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10394	NC_008384	CGC	2	6	517906	517911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255683
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10420	NC_008384	CTG	2	6	519087	519092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255684
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10422	NC_008384	GGCG	2	8	519153	519160	0 %	0 %	75 %	25 %	116255684
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10453	NC_008384	GGTC	2	8	521301	521308	0 %	25 %	50 %	25 %	116255686
10454	NC_008384	TCGA	2	8	521383	521390	25 %	25 %	25 %	25 %	116255686
10455	NC_008384	CTT	2	6	521424	521429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255686
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10459	NC_008384	GGAT	2	8	521635	521642	25 %	25 %	50 %	0 %	116255686
10460	NC_008384	ATC	2	6	521677	521682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255686
10461	NC_008384	TCG	2	6	521699	521704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255686
10462	NC_008384	CCG	2	6	521763	521768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255686
10463	NC_008384	CAT	2	6	521775	521780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255686
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10465	NC_008384	CAA	2	6	521850	521855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255686
10466	NC_008384	GGT	2	6	521856	521861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255686
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10468	NC_008384	GCGA	2	8	521920	521927	25 %	0 %	50 %	25 %	116255686
10469	NC_008384	CTG	2	6	521929	521934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255686
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10471	NC_008384	CGA	2	6	522069	522074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255686
10472	NC_008384	GAG	2	6	522098	522103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255686
10473	NC_008384	AAG	2	6	522124	522129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255687
10474	NC_008384	CTT	3	9	522152	522160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255687
10475	NC_008384	TCG	2	6	522186	522191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255687
10476	NC_008384	TC	3	6	522217	522222	0 %	50 %	0 %	50 %	116255687
10477	NC_008384	ACC	2	6	522248	522253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255687
10478	NC_008384	TCA	2	6	522309	522314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255687
10479	NC_008384	TTC	2	6	522335	522340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255687
10480	NC_008384	GCAT	2	8	522377	522384	25 %	25 %	25 %	25 %	116255687
10481	NC_008384	GCC	2	6	522433	522438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255687
10482	NC_008384	GAT	2	6	522502	522507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255687
10483	NC_008384	TGC	2	6	522516	522521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255687
10484	NC_008384	TCG	2	6	522534	522539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255687
10485	NC_008384	ATC	2	6	522590	522595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255687
10486	NC_008384	GGC	2	6	522640	522645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255687
10487	NC_008384	ATCCA	2	10	522647	522656	40 %	20 %	0 %	40 %	116255687
10488	NC_008384	GCC	2	6	522677	522682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255687
10489	NC_008384	GCCG	2	8	522695	522702	0 %	0 %	50 %	50 %	116255687
10490	NC_008384	CCG	2	6	522715	522720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255687
10491	NC_008384	ATC	2	6	522749	522754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255687
10492	NC_008384	CAT	2	6	522799	522804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255687
10493	NC_008384	GGGC	2	8	522820	522827	0 %	0 %	75 %	25 %	116255687
10494	NC_008384	GCG	2	6	522831	522836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255687
10495	NC_008384	GAC	3	9	522838	522846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255687
10496	NC_008384	GAT	2	6	522847	522852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255687
10497	NC_008384	A	6	6	522884	522889	100 %	0 %	0 %	0 %	116255687
10498	NC_008384	GC	4	8	522905	522912	0 %	0 %	50 %	50 %	116255687
10499	NC_008384	CGC	2	6	522968	522973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255687
10500	NC_008384	GC	3	6	522988	522993	0 %	0 %	50 %	50 %	116255687

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