MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008384	ATC	2	6	23425	23430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255217
502	NC_008384	CG	3	6	23459	23464	0 %	0 %	50 %	50 %	116255217
503	NC_008384	CTG	2	6	23503	23508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
504	NC_008384	TCGC	2	8	23536	23543	0 %	25 %	25 %	50 %	116255217
505	NC_008384	CGT	2	6	23577	23582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
506	NC_008384	TTG	2	6	23600	23605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255217
507	NC_008384	TCC	2	6	23633	23638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255217
508	NC_008384	TCG	2	6	23642	23647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
509	NC_008384	CGA	2	6	23712	23717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255217
510	NC_008384	CGA	2	6	23721	23726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255217
511	NC_008384	CGG	2	6	23784	23789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255217
512	NC_008384	TCG	2	6	23795	23800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255217
513	NC_008384	GGC	2	6	23823	23828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255217
514	NC_008384	CTT	2	6	24151	24156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
515	NC_008384	CTGC	2	8	24218	24225	0 %	25 %	25 %	50 %	116255218
516	NC_008384	ATA	2	6	24258	24263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116255218
517	NC_008384	CTT	2	6	24289	24294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
518	NC_008384	CGG	2	6	24460	24465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
519	NC_008384	GCC	2	6	24467	24472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
520	NC_008384	CG	3	6	24486	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	116255218
521	NC_008384	GCC	2	6	24524	24529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
522	NC_008384	GCT	2	6	24541	24546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
523	NC_008384	TCT	2	6	24555	24560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
524	NC_008384	GCG	2	6	24621	24626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
525	NC_008384	CGC	2	6	24646	24651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
526	NC_008384	CGG	2	6	24699	24704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
527	NC_008384	GCAGCG	2	12	24711	24722	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255218
528	NC_008384	GGC	2	6	24739	24744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
529	NC_008384	CTG	2	6	24752	24757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
530	NC_008384	CGG	2	6	24793	24798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255218
531	NC_008384	CTT	2	6	24913	24918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
532	NC_008384	GGCT	2	8	24938	24945	0 %	25 %	50 %	25 %	116255218
533	NC_008384	GTC	2	6	25010	25015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
534	NC_008384	GGT	2	6	25021	25026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255218
535	NC_008384	CGA	2	6	25107	25112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255218
536	NC_008384	TCG	2	6	25160	25165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255218
537	NC_008384	CGC	2	6	25192	25197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
538	NC_008384	TCT	2	6	25221	25226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255218
539	NC_008384	CCG	2	6	25236	25241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
540	NC_008384	GCC	2	6	25250	25255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
541	NC_008384	GCC	2	6	25308	25313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
542	NC_008384	GCC	2	6	25316	25321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
543	NC_008384	CGC	3	9	25324	25332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255218
544	NC_008384	CGA	2	6	25480	25485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255219
545	NC_008384	CTT	2	6	25645	25650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
546	NC_008384	GC	3	6	25704	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	116255219
547	NC_008384	CGA	2	6	25779	25784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255219
548	NC_008384	CTT	2	6	25828	25833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
549	NC_008384	CGG	2	6	25945	25950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255219
550	NC_008384	TGC	2	6	25953	25958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
551	NC_008384	CTT	2	6	26047	26052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
552	NC_008384	CGGC	2	8	26062	26069	0 %	0 %	50 %	50 %	116255219
553	NC_008384	ATG	2	6	26091	26096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255219
554	NC_008384	CG	3	6	26187	26192	0 %	0 %	50 %	50 %	116255219
555	NC_008384	TGC	2	6	26193	26198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
556	NC_008384	CAT	2	6	26311	26316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255219
557	NC_008384	GCC	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
558	NC_008384	CTG	2	6	26426	26431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
559	NC_008384	GCC	2	6	26486	26491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
560	NC_008384	GCCT	2	8	26523	26530	0 %	25 %	25 %	50 %	116255219
561	NC_008384	GCG	2	6	26558	26563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255219
562	NC_008384	GCC	2	6	26570	26575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
563	NC_008384	TCGG	2	8	26582	26589	0 %	25 %	50 %	25 %	116255219
564	NC_008384	CGG	2	6	26596	26601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255219
565	NC_008384	TCG	2	6	26604	26609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
566	NC_008384	CGT	2	6	26617	26622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
567	NC_008384	AGCG	2	8	26638	26645	25 %	0 %	50 %	25 %	116255219
568	NC_008384	GCA	2	6	26646	26651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255219
569	NC_008384	TTC	2	6	26666	26671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255219
570	NC_008384	GCC	2	6	26675	26680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255219
571	NC_008384	TGC	2	6	26686	26691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
572	NC_008384	CTG	2	6	26699	26704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
573	NC_008384	TCG	2	6	26709	26714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255219
574	NC_008384	TAT	2	6	27191	27196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255220
575	NC_008384	ATG	2	6	27207	27212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255220
576	NC_008384	CCG	2	6	27215	27220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255220
577	NC_008384	GGC	2	6	27249	27254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255220
578	NC_008384	GCA	2	6	27261	27266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255220
579	NC_008384	GC	3	6	27284	27289	0 %	0 %	50 %	50 %	116255220
580	NC_008384	GCTGG	2	10	27326	27335	0 %	20 %	60 %	20 %	116255220
581	NC_008384	TGC	2	6	27365	27370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255220
582	NC_008384	AGA	2	6	27373	27378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255220
583	NC_008384	TTC	2	6	27384	27389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255220
584	NC_008384	GAG	2	6	27390	27395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255220
585	NC_008384	CGG	2	6	27422	27427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255220
586	NC_008384	CGG	2	6	27457	27462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255220
587	NC_008384	GC	3	6	27510	27515	0 %	0 %	50 %	50 %	116255220
588	NC_008384	CCG	2	6	27517	27522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255220
589	NC_008384	GAA	2	6	27584	27589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255220
590	NC_008384	CACCAA	2	12	27776	27787	50 %	0 %	0 %	50 %	116255220
591	NC_008384	GAC	2	6	27807	27812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255220
592	NC_008384	ATG	2	6	27822	27827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255220
593	NC_008384	TAC	2	6	27864	27869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255220
594	NC_008384	ACC	2	6	27870	27875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255220
595	NC_008384	CAC	2	6	27917	27922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255220
596	NC_008384	CGC	2	6	28244	28249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255221
597	NC_008384	CGC	2	6	28285	28290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255221
598	NC_008384	CGG	2	6	28466	28471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255221
599	NC_008384	CGC	2	6	28495	28500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255221
600	NC_008384	TTG	2	6	28551	28556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255221
601	NC_008384	CGG	2	6	28633	28638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255221
602	NC_008384	CGG	2	6	28697	28702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255221
603	NC_008384	CG	3	6	28724	28729	0 %	0 %	50 %	50 %	116255221
604	NC_008384	GC	3	6	28777	28782	0 %	0 %	50 %	50 %	116255221
605	NC_008384	CGA	2	6	28784	28789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255221
606	NC_008384	TGC	2	6	28819	28824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255221
607	NC_008384	ACG	2	6	28845	28850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255221
608	NC_008384	TCAC	2	8	28861	28868	25 %	25 %	0 %	50 %	116255221
609	NC_008384	AGC	2	6	28880	28885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255221
610	NC_008384	TCGC	2	8	28971	28978	0 %	25 %	25 %	50 %	116255221
611	NC_008384	GA	3	6	28982	28987	50 %	0 %	50 %	0 %	116255221
612	NC_008384	ATTC	2	8	28997	29004	25 %	50 %	0 %	25 %	116255221
613	NC_008384	GC	3	6	29021	29026	0 %	0 %	50 %	50 %	116255221
614	NC_008384	CTG	2	6	29028	29033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255221
615	NC_008384	CCA	2	6	29118	29123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255222
616	NC_008384	CTGG	2	8	29156	29163	0 %	25 %	50 %	25 %	116255222
617	NC_008384	TCG	2	6	29172	29177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255222
618	NC_008384	GTG	2	6	29189	29194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255222
619	NC_008384	CGT	2	6	29242	29247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255222
620	NC_008384	GCT	2	6	29299	29304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255222
621	NC_008384	TCG	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255222
622	NC_008384	CTG	2	6	29348	29353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255222
623	NC_008384	ACG	2	6	29375	29380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255222
624	NC_008384	TCA	2	6	29412	29417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255222
625	NC_008384	ATC	2	6	29429	29434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255222
626	NC_008384	ATC	3	9	29486	29494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255222
627	NC_008384	CTT	2	6	29509	29514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255222
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753	NC_008384	GAC	2	6	34631	34636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255227
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