MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 14086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008384	GAT	2	6	355145	355150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255519
7002	NC_008384	CATCC	2	10	355159	355168	20 %	20 %	0 %	60 %	116255519
7003	NC_008384	CGG	2	6	355176	355181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255519
7004	NC_008384	GAT	2	6	355226	355231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255519
7005	NC_008384	AGC	2	6	355576	355581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7006	NC_008384	GTC	2	6	355640	355645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7007	NC_008384	AAG	2	6	355722	355727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255520
7008	NC_008384	AAG	2	6	355844	355849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255520
7009	NC_008384	T	7	7	355918	355924	0 %	100 %	0 %	0 %	116255520
7010	NC_008384	CGG	2	6	355952	355957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255520
7011	NC_008384	CTG	2	6	355988	355993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7012	NC_008384	TCG	2	6	356031	356036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7013	NC_008384	CGC	3	9	356080	356088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255520
7014	NC_008384	CTTG	2	8	356128	356135	0 %	50 %	25 %	25 %	116255520
7015	NC_008384	CAA	2	6	356180	356185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255520
7016	NC_008384	GTC	2	6	356249	356254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7017	NC_008384	AGGC	2	8	356326	356333	25 %	0 %	50 %	25 %	116255520
7018	NC_008384	GGGC	2	8	356364	356371	0 %	0 %	75 %	25 %	116255520
7019	NC_008384	AGG	2	6	356388	356393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255520
7020	NC_008384	AGC	2	6	356466	356471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7021	NC_008384	GCT	2	6	356509	356514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255520
7022	NC_008384	CCGG	2	8	356748	356755	0 %	0 %	50 %	50 %	116255521
7023	NC_008384	ACG	2	6	356804	356809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255521
7024	NC_008384	CG	3	6	356863	356868	0 %	0 %	50 %	50 %	116255521
7025	NC_008384	TCG	2	6	356912	356917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255521
7026	NC_008384	CG	4	8	356916	356923	0 %	0 %	50 %	50 %	116255521
7027	NC_008384	GCC	2	6	356935	356940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255521
7028	NC_008384	CGGCC	2	10	357002	357011	0 %	0 %	40 %	60 %	116255521
7029	NC_008384	GGC	2	6	357662	357667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255522
7030	NC_008384	CTA	2	6	357691	357696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255522
7031	NC_008384	TGC	2	6	357718	357723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255522
7032	NC_008384	T	6	6	357832	357837	0 %	100 %	0 %	0 %	116255522
7033	NC_008384	GGC	2	6	357947	357952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255522
7034	NC_008384	CTATTC	2	12	357967	357978	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	116255522
7035	NC_008384	TGC	2	6	358020	358025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255522
7036	NC_008384	GTC	3	9	358169	358177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255522
7037	NC_008384	CG	3	6	358543	358548	0 %	0 %	50 %	50 %	116255523
7038	NC_008384	AGC	2	6	358574	358579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7039	NC_008384	GCC	2	6	358603	358608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255523
7040	NC_008384	GAC	2	6	358609	358614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7041	NC_008384	TGC	2	6	358682	358687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7042	NC_008384	TCA	2	6	358718	358723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255523
7043	NC_008384	CCA	2	6	358760	358765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255523
7044	NC_008384	GTC	2	6	358795	358800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7045	NC_008384	TGC	2	6	358854	358859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7046	NC_008384	GTT	2	6	358998	359003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116255523
7047	NC_008384	GAG	2	6	359173	359178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255523
7048	NC_008384	TCG	2	6	359288	359293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7049	NC_008384	CAT	3	9	359301	359309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255523
7050	NC_008384	CAT	2	6	359427	359432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255523
7051	NC_008384	GCC	2	6	359563	359568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255523
7052	NC_008384	CTG	2	6	359572	359577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7053	NC_008384	TTA	2	6	359636	359641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116255523
7054	NC_008384	TCG	2	6	359648	359653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255523
7055	NC_008384	TGG	2	6	359666	359671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255523
7056	NC_008384	ATG	2	6	359674	359679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255523
7057	NC_008384	GGT	2	6	359682	359687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255523
7058	NC_008384	TTC	2	6	359737	359742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255523
7059	NC_008384	GCC	2	6	359749	359754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255523
7060	NC_008384	ATGGCG	2	12	359764	359775	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255523
7061	NC_008384	GCA	2	6	359890	359895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255524
7062	NC_008384	GCCT	2	8	359907	359914	0 %	25 %	25 %	50 %	116255524
7063	NC_008384	AGA	2	6	359919	359924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255524
7064	NC_008384	CAA	2	6	359938	359943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116255524
7065	NC_008384	CGC	2	6	359955	359960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255524
7066	NC_008384	CAT	2	6	360029	360034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255524
7067	NC_008384	TGCCG	2	10	360035	360044	0 %	20 %	40 %	40 %	116255524
7068	NC_008384	GGC	2	6	360082	360087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255524
7069	NC_008384	GTG	2	6	360147	360152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255524
7070	NC_008384	GC	3	6	360220	360225	0 %	0 %	50 %	50 %	116255525
7071	NC_008384	TCG	2	6	360257	360262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255525
7072	NC_008384	CTT	2	6	360265	360270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255525
7073	NC_008384	CGG	2	6	360316	360321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255525
7074	NC_008384	GAC	2	6	360415	360420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255525
7075	NC_008384	CTC	2	6	360421	360426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255525
7076	NC_008384	GAA	2	6	360453	360458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255525
7077	NC_008384	CGT	2	6	360486	360491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255525
7078	NC_008384	GT	3	6	360500	360505	0 %	50 %	50 %	0 %	116255525
7079	NC_008384	GCC	2	6	360818	360823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255526
7080	NC_008384	GT	3	6	360834	360839	0 %	50 %	50 %	0 %	116255526
7081	NC_008384	CTG	2	6	360850	360855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255526
7082	NC_008384	CG	3	6	360857	360862	0 %	0 %	50 %	50 %	116255526
7083	NC_008384	GTC	2	6	360931	360936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255526
7084	NC_008384	GCG	2	6	360949	360954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255526
7085	NC_008384	CGT	2	6	361008	361013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255526
7086	NC_008384	CGA	2	6	361067	361072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255526
7087	NC_008384	CTG	2	6	361077	361082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255526
7088	NC_008384	GGCA	2	8	361132	361139	25 %	0 %	50 %	25 %	116255526
7089	NC_008384	CCG	3	9	361144	361152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255526
7090	NC_008384	CTG	2	6	361171	361176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255526
7091	NC_008384	CGAT	2	8	361184	361191	25 %	25 %	25 %	25 %	116255526
7092	NC_008384	CCG	2	6	361192	361197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255526
7093	NC_008384	TCC	2	6	361206	361211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255526
7094	NC_008384	CGC	2	6	361298	361303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255527
7095	NC_008384	TCC	2	6	361315	361320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255527
7096	NC_008384	CGA	2	6	361342	361347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255527
7097	NC_008384	GGC	2	6	361410	361415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255527
7098	NC_008384	ATG	2	6	361485	361490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255527
7099	NC_008384	GAT	2	6	361496	361501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255527
7100	NC_008384	GAA	2	6	361502	361507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255527
7101	NC_008384	CAC	2	6	361545	361550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116255527
7102	NC_008384	GTGG	2	8	361667	361674	0 %	25 %	75 %	0 %	116255527
7103	NC_008384	GCG	2	6	361802	361807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255528
7104	NC_008384	TGA	2	6	361835	361840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255528
7105	NC_008384	GCC	2	6	361994	361999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255528
7106	NC_008384	TGA	2	6	362136	362141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255529
7107	NC_008384	GAA	2	6	362158	362163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116255529
7108	NC_008384	GCT	2	6	362170	362175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255529
7109	NC_008384	CGT	2	6	362179	362184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255529
7110	NC_008384	CTTCC	2	10	362202	362211	0 %	40 %	0 %	60 %	116255529
7111	NC_008384	GCCG	2	8	362215	362222	0 %	0 %	50 %	50 %	116255529
7112	NC_008384	CGG	2	6	362223	362228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255529
7113	NC_008384	GGGC	2	8	362337	362344	0 %	0 %	75 %	25 %	116255529
7114	NC_008384	TC	3	6	362374	362379	0 %	50 %	0 %	50 %	116255529
7115	NC_008384	GGC	2	6	362398	362403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255529
7116	NC_008384	GGC	3	9	362779	362787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255530
7117	NC_008384	CTT	2	6	362789	362794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116255530
7118	NC_008384	CTC	2	6	362811	362816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116255530
7119	NC_008384	GAT	2	6	362817	362822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255530
7120	NC_008384	ATC	2	6	362838	362843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255530
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7233	NC_008384	GGC	2	6	369436	369441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255536
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7362	NC_008384	TGG	2	6	378042	378047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116255543
7363	NC_008384	CAT	2	6	378203	378208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255543
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7365	NC_008384	GGA	2	6	378300	378305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116255544
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7468	NC_008384	TC	3	6	386505	386510	0 %	50 %	0 %	50 %	116255555
7469	NC_008384	GACC	2	8	386559	386566	25 %	0 %	25 %	50 %	116255555
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7475	NC_008384	ATGCT	2	10	387416	387425	20 %	40 %	20 %	20 %	116255556
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7480	NC_008384	CAGC	2	8	387702	387709	25 %	0 %	25 %	50 %	116255556
7481	NC_008384	CGG	2	6	387720	387725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255556
7482	NC_008384	TGCGA	2	10	387774	387783	20 %	20 %	40 %	20 %	116255556
7483	NC_008384	TCA	2	6	387819	387824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255556
7484	NC_008384	GCG	2	6	387848	387853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255556
7485	NC_008384	CTTT	2	8	387868	387875	0 %	75 %	0 %	25 %	116255556
7486	NC_008384	TCA	2	6	388223	388228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255557
7487	NC_008384	CCG	2	6	388268	388273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255557
7488	NC_008384	GCC	2	6	388294	388299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255557
7489	NC_008384	CATC	2	8	388324	388331	25 %	25 %	0 %	50 %	116255557
7490	NC_008384	TGC	2	6	388347	388352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116255557
7491	NC_008384	TGA	2	6	388374	388379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116255557
7492	NC_008384	ATCCC	2	10	388392	388401	20 %	20 %	0 %	60 %	116255557
7493	NC_008384	GGGC	2	8	388402	388409	0 %	0 %	75 %	25 %	116255557
7494	NC_008384	CAG	2	6	388448	388453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255557
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7499	NC_008384	CGA	2	6	388905	388910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255558
7500	NC_008384	CGC	2	6	389113	389118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116255558

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